PDB: 2866 件ウェブページステータス検索Chemie searchBIRD

---

6DBT	Cryo-EM structure of RAG in complex with 12-RSS and 23-RSS substrate DNAs 分子名称: CALCIUM ION, Forward strand of 12-RSS substrate DNA, Forward strand of 23-RSS substrate DNA, ... 著者 Wu, H, Liao, M, Ru, H, Mi, W. 登録日 2018-05-03 公開日 2018-08-01 最終更新日 2024-03-13 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.3 Å) 主引用文献 DNA melting initiates the RAG catalytic pathway. Nat. Struct. Mol. Biol., 25, 2018
6DBU	Cryo-EM structure of RAG in complex with 12-RSS and 23-RSS substrate DNAs 分子名称: CALCIUM ION, Forward strand RSS substrate DNA, Recombination activating gene 1 - MBP chimera, ... 著者 Wu, H, Liao, M, Ru, H, Mi, W. 登録日 2018-05-03 公開日 2018-08-01 最終更新日 2024-03-13 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.9 Å) 主引用文献 DNA melting initiates the RAG catalytic pathway. Nat. Struct. Mol. Biol., 25, 2018
6DBV	Cryo-EM structure of RAG in complex with 12-RSS and 23-RSS substrate DNAs 分子名称: CALCIUM ION, Forward strand of 12-RSS substrate DNA, Forward strand of 23-RSS substrate DNA, ... 著者 Wu, H, Liao, M, Ru, H, Mi, W. 登録日 2018-05-03 公開日 2018-08-01 最終更新日 2024-11-06 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.29 Å) 主引用文献 DNA melting initiates the RAG catalytic pathway. Nat. Struct. Mol. Biol., 25, 2018
6DBO	Cryo-EM structure of RAG in complex with 12-RSS and 23-RSS substrate DNAs 分子名称: CALCIUM ION, Forward strand of substrate RSS DNA, Recombination activating gene 1 - MBP chimera, ... 著者 Wu, H, Liao, M, Ru, H, Mi, W. 登録日 2018-05-03 公開日 2018-08-01 最終更新日 2024-03-13 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.4 Å) 主引用文献 DNA melting initiates the RAG catalytic pathway. Nat. Struct. Mol. Biol., 25, 2018
6DBW	Cryo-EM structure of RAG in complex with 12-RSS substrate DNA 分子名称: CALCIUM ION, Forward strand of 12-RSS substrate DNA, Recombination activating gene 1 - MBP chimera, ... 著者 Wu, H, Liao, M, Ru, H, Mi, W. 登録日 2018-05-03 公開日 2018-08-01 最終更新日 2024-03-13 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.7 Å) 主引用文献 DNA melting initiates the RAG catalytic pathway. Nat. Struct. Mol. Biol., 25, 2018
6DBX	Cryo-EM structure of RAG in complex with 12-RSS substrate DNA 分子名称: CALCIUM ION, Forward strand of 12-RSS substrate DNA, Recombination activating gene 1 - MBP chimera, ... 著者 Wu, H, Liao, M, Ru, H, Mi, W. 登録日 2018-05-03 公開日 2018-08-01 最終更新日 2024-03-13 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.2 Å) 主引用文献 DNA melting initiates the RAG catalytic pathway. Nat. Struct. Mol. Biol., 25, 2018
7UPN	Maedi visna virus Vif in complex with CypA and E3 ubiquitin ligase 分子名称: Elongin-B, Elongin-C, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A, ... 著者 Hu, Y, Xiong, Y. 登録日 2022-04-16 公開日 2023-01-25 最終更新日 2024-06-12 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.5 Å) 主引用文献 Structural basis for recruitment of host CypA and E3 ubiquitin ligase by maedi-visna virus Vif. Sci Adv, 9, 2023
6CVP	Human Aprataxin (Aptx) R199H bound to RNA-DNA, AMP and Zn product complex 分子名称: ADENOSINE MONOPHOSPHATE, Aprataxin, DNA (5'-D(*GP*AP*AP*TP*CP*AP*TP*AP*AP*C)-3'), ... 著者 Schellenberg, M.J, Williams, R.S, Tumbale, P.S. 登録日 2018-03-28 公開日 2018-07-04 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.999 Å) 主引用文献 Mechanism of APTX nicked DNA sensing and pleiotropic inactivation in neurodegenerative disease. EMBO J., 37, 2018
6CVS	Human Aprataxin (Aptx) L248M bound to DNA, AMP and Zn product 分子名称: ADENOSINE MONOPHOSPHATE, Aprataxin, BETA-MERCAPTOETHANOL, ... 著者 Schellenberg, M.J, Tumbale, P.S, Williams, R.S. 登録日 2018-03-28 公開日 2018-07-04 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.11 Å) 主引用文献 Mechanism of APTX nicked DNA sensing and pleiotropic inactivation in neurodegenerative disease. EMBO J., 37, 2018
6CVR	Human Aprataxin (Aptx) S242N bound to RNA-DNA, AMP and Zn product complex 分子名称: ADENOSINE MONOPHOSPHATE, Aprataxin, DNA (5'-D(*GP*AP*AP*TP*CP*AP*TP*AP*AP*C)-3'), ... 著者 Schellenberg, M.J, Tumbale, P.S, Williams, R.S. 登録日 2018-03-28 公開日 2018-07-04 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.88 Å) 主引用文献 Mechanism of APTX nicked DNA sensing and pleiotropic inactivation in neurodegenerative disease. EMBO J., 37, 2018
6CVQ	Human Aprataxin (Aptx) H201Q bound to RNA-DNA, AMP and Zn product complex 分子名称: ADENOSINE MONOPHOSPHATE, Aprataxin, BETA-MERCAPTOETHANOL, ... 著者 Schellenberg, M.J, Tumbale, P.S, Williams, R.S. 登録日 2018-03-28 公開日 2018-07-04 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.65 Å) 主引用文献 Mechanism of APTX nicked DNA sensing and pleiotropic inactivation in neurodegenerative disease. EMBO J., 37, 2018
6CVO	Human Aprataxin (Aptx) bound to nicked RNA-DNA, AMP and Zn product complex 分子名称: ADENOSINE MONOPHOSPHATE, Aprataxin, BETA-MERCAPTOETHANOL, ... 著者 Schellenberg, M.J, Tumbale, P.P, Williams, R.S. 登録日 2018-03-28 公開日 2018-08-29 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.4 Å) 主引用文献 Mechanism of APTX nicked DNA sensing and pleiotropic inactivation in neurodegenerative disease. EMBO J., 37, 2018
6CVT	Human Aprataxin (Aptx) V263G bound to RNA-DNA, AMP and Zn product complex 分子名称: ADENOSINE MONOPHOSPHATE, Aprataxin, DNA (5'-D(*GP*AP*AP*TP*CP*AP*TP*AP*AP*C)-3'), ... 著者 Schellenberg, M.J, Tumbale, P.S, Williams, R.S. 登録日 2018-03-28 公開日 2018-07-04 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.941 Å) 主引用文献 Mechanism of APTX nicked DNA sensing and pleiotropic inactivation in neurodegenerative disease. EMBO J., 37, 2018
3U7F	Crystal structure of mPNKP catalytic fragment (D170A) bound to single-stranded DNA (TCCTCp) 分子名称: Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, DNA, GLYCEROL, ... 著者 Coquelle, N, Havali, Z, Bernstein, N, Green, R, Glover, J.N.M. 登録日 2011-10-13 公開日 2011-12-14 最終更新日 2024-11-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) 主引用文献 Structural basis for the phosphatase activity of polynucleotide kinase/phosphatase on single- and double-stranded DNA substrates. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 108, 2011
3U7G	Crystal structure of mPNKP catalytic fragment (D170A) bound to single-stranded DNA (TCCTAp) 分子名称: Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, DNA, GLYCEROL, ... 著者 Coquelle, N, Havali, Z, Bernstein, N, Green, R, Glover, J.N.M. 登録日 2011-10-13 公開日 2011-12-14 最終更新日 2024-11-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 Structural basis for the phosphatase activity of polynucleotide kinase/phosphatase on single- and double-stranded DNA substrates. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 108, 2011
3U7H	Crystal structure of mPNKP catalytic fragment (D170A) bound to single-stranded DNA (TCCTTp) 分子名称: Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, DNA, GLYCEROL, ... 著者 Coquelle, N, Havali, Z, Bernstein, N, Green, R, Glover, J.N.M. 登録日 2011-10-13 公開日 2011-12-14 最終更新日 2024-11-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2 Å) 主引用文献 Structural basis for the phosphatase activity of polynucleotide kinase/phosphatase on single- and double-stranded DNA substrates. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 108, 2011
4CI1	Structure of the DDB1-CRBN E3 ubiquitin ligase bound to thalidomide 分子名称: DNA DAMAGE-BINDING PROTEIN 1, PROTEIN CEREBLON, S-Thalidomide, ... 著者 Fischer, E.S, Boehm, K, Thoma, N.H. 登録日 2013-12-05 公開日 2014-07-16 最終更新日 2024-10-16 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.98 Å) 主引用文献 Structure of the Ddb1-Crbn E3 Ubiquitin Ligase in Complex with Thalidomide. Nature, 512, 2014
4M6F	Dimer of the G-Segment Invertase bound to a DNA substrate 分子名称: DNA-invertase, gix site analog 著者 Ritacco, C.J, Wang, J, Steitz, T.A. 登録日 2013-08-09 公開日 2014-03-12 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (4.99 Å) 主引用文献 Exploiting large non-isomorphous differences for phase determination of a G-segment invertase-DNA complex. Acta Crystallogr.,Sect.D, 70, 2014
4WHV	E3 ubiquitin-protein ligase RNF8 in complex with Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N and Polyubiquitin-B 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, Polyubiquitin-B, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, ... 著者 Hodge, C.D, Edwards, R.A, Glover, J.N.M. 登録日 2014-09-23 公開日 2015-09-30 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (8.3 Å) 主引用文献 RNF8 E3 Ubiquitin Ligase Stimulates Ubc13 E2 Conjugating Activity That Is Essential for DNA Double Strand Break Signaling and BRCA1 Tumor Suppressor Recruitment. J.Biol.Chem., 291, 2016
7LT3	NHEJ Long-range synaptic complex 分子名称: ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE, DNA (30-MER), DNA (31-MER), ... 著者 He, Y, Chen, S. 登録日 2021-02-18 公開日 2021-04-14 最終更新日 2024-03-06 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.6 Å) 主引用文献 Structural basis of long-range to short-range synaptic transition in NHEJ. Nature, 593, 2021
7KZV	Structure of the human fanconi anaemia Core-UBE2T-ID-DNA complex in closed state 分子名称: DNA (29-MER), E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, ... 著者 Wang, S.L, Pavletich, N.P. 登録日 2020-12-10 公開日 2021-03-10 最終更新日 2021-03-24 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.2 Å) 主引用文献 Structure of the FA core ubiquitin ligase closing the ID clamp on DNA. Nat.Struct.Mol.Biol., 28, 2021
7KZT	Structure of the human fanconi anaemia Core-UBE2T-ID-DNA complex in intermediate state 分子名称: DNA (22-MER), E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, ... 著者 Wang, S.L, Pavletich, N.P. 登録日 2020-12-10 公開日 2021-03-10 最終更新日 2024-10-23 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.2 Å) 主引用文献 Structure of the FA core ubiquitin ligase closing the ID clamp on DNA. Nat.Struct.Mol.Biol., 28, 2021
7KZS	Structure of the human fanconi anaemia Core-UBE2T-ID-DNA complex in open state 分子名称: DNA (25-MER), E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, ... 著者 Wang, S.L, Pavletich, N.P. 登録日 2020-12-10 公開日 2021-03-10 最終更新日 2024-10-16 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (4.2 Å) 主引用文献 Structure of the FA core ubiquitin ligase closing the ID clamp on DNA. Nat.Struct.Mol.Biol., 28, 2021
2ZO2	Mouse NP95 SRA domain non-specific DNA complex 分子名称: DNA (5'-D(*DAP*DAP*DCP*DTP*DGP*DCP*DGP*DCP*DAP*DGP*DTP*DT)-3'), E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, PHOSPHATE ION 著者 Hashimoto, H, Horton, J.R, Cheng, X. 登録日 2008-05-05 公開日 2008-09-09 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.09 Å) 主引用文献 The SRA domain of UHRF1 flips 5-methylcytosine out of the DNA helix Nature, 455, 2008
2ZO0	mouse NP95 SRA domain DNA specific complex 1 分子名称: DNA (5'-D(*DGP*DTP*DCP*DAP*DGP*(5CM)P*DGP*DCP*DAP*DAP*DTP*DGP*DG)-3'), DNA (5'-D(*DTP*DCP*DCP*DAP*DTP*DGP*DCP*DGP*DCP*DTP*DGP*DAP*DC)-3'), E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 著者 Hashimoto, H, Horton, J.R, Cheng, X. 登録日 2008-05-05 公開日 2008-09-09 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.19 Å) 主引用文献 The SRA domain of UHRF1 flips 5-methylcytosine out of the DNA helix Nature, 455, 2008

<45678910111213141516171819>