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6D4P	Ube2D1 in complex with ubiquitin variant Ubv.D1.1 分子名称: Ubiquitin Variant Ubv.D1.1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1 著者 Ceccarelli, D.F, Garg, P, Sidhu, S, Sicheri, F. 登録日 2018-04-18 公開日 2019-07-17 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.11 Å) 主引用文献 Structural and Functional Analysis of Ubiquitin-based Inhibitors That Target the Backsides of E2 Enzymes. J.Mol.Biol., 432, 2020
6D68	Ube2G1 in complex with ubiquitin variant Ubv.G1.1 分子名称: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 G1, Ubv.G1.1 著者 Ceccarelli, D.F, Garg, P, Sidhu, S, Sicheri, F. 登録日 2018-04-20 公開日 2019-07-17 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.36 Å) 主引用文献 Structural and Functional Analysis of Ubiquitin-based Inhibitors That Target the Backsides of E2 Enzymes. J.Mol.Biol., 432, 2020
6D6I	Ube2V1 in complex with ubiquitin variant Ubv.V1.1 and Ube2N/Ubc13 分子名称: Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, Ubv.V1.1 著者 Ceccarelli, D.F, Garg, P, Keszei, A, Sidhu, S, Sicheri, F. 登録日 2018-04-21 公開日 2019-07-17 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.551 Å) 主引用文献 Structural and Functional Analysis of Ubiquitin-based Inhibitors That Target the Backsides of E2 Enzymes. J.Mol.Biol., 432, 2020
6DJW	Crystal Structure of pParkin (REP and RING2 deleted)-pUb-UbcH7 complex 分子名称: RBR-type E3 ubiquitin transferase,RBR-type E3 ubiquitin transferase, Ubiquitin, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, ... 著者 Sauve, V, Sung, G, Trempe, J.F, Gehring, K. 登録日 2018-05-26 公開日 2018-07-04 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.801 Å) 主引用文献 Mechanism of parkin activation by phosphorylation. Nat. Struct. Mol. Biol., 25, 2018
8EAZ	HOIL-1/E2-Ub/Ub transthiolation complex 分子名称: RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, Ubiquitin, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, ... 著者 Wang, X.S, Cotton, T.R, Lechtenberg, B.C. 登録日 2022-08-30 公開日 2023-01-18 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.08 Å) 主引用文献 The unifying catalytic mechanism of the RING-between-RING E3 ubiquitin ligase family. Nat Commun, 14, 2023
8EB0	RNF216/E2-Ub/Ub transthiolation complex 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase RNF216, SULFATE ION, Ubiquitin, ... 著者 Cotton, T.R, Wang, X.S, Lechtenberg, B.C. 登録日 2022-08-30 公開日 2023-01-18 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.03 Å) 主引用文献 The unifying catalytic mechanism of the RING-between-RING E3 ubiquitin ligase family. Nat Commun, 14, 2023
8E2F	Cryo-EM structure of N-terminal arm of BIRC6 (from local refinement 2) 分子名称: Baculoviral IAP repeat-containing protein 6 著者 Hunkeler, M, Fischer, E.S. 登録日 2022-08-15 公開日 2023-02-15 最終更新日 2024-06-12 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (2.47 Å) 主引用文献 Structures of BIRC6-client complexes provide a mechanism of SMAC-mediated release of caspases. Science, 379, 2023
8E2E	Cryo-EM structure of helical arch of BIRC6 (from local refinement 1) 分子名称: Baculoviral IAP repeat-containing protein 6 著者 Hunkeler, M, Fischer, E.S. 登録日 2022-08-15 公開日 2023-02-15 最終更新日 2024-06-12 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (1.98 Å) 主引用文献 Structures of BIRC6-client complexes provide a mechanism of SMAC-mediated release of caspases. Science, 379, 2023
8E2D	Cryo-EM structure of BIRC6 (consensus) 分子名称: Baculoviral IAP repeat-containing protein 6 著者 Hunkeler, M, Fischer, E.S. 登録日 2022-08-15 公開日 2023-02-15 最終更新日 2024-06-12 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (2.07 Å) 主引用文献 Structures of BIRC6-client complexes provide a mechanism of SMAC-mediated release of caspases. Science, 379, 2023
8E2K	Cryo-EM structure of BIRC6/HtrA2-S306A 分子名称: Baculoviral IAP repeat-containing protein 6, Serine protease HTRA2, mitochondrial 著者 Hunkeler, M, Fischer, E.S. 登録日 2022-08-15 公開日 2023-02-15 最終更新日 2024-06-12 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.21 Å) 主引用文献 Structures of BIRC6-client complexes provide a mechanism of SMAC-mediated release of caspases. Science, 379, 2023
8E2H	Cryo-EM structure of C-terminal arm of BIRC6 (from local refinement 4) 分子名称: Baculoviral IAP repeat-containing protein 6 著者 Hunkeler, M, Fischer, E.S. 登録日 2022-08-15 公開日 2023-02-15 最終更新日 2024-06-12 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (2.3 Å) 主引用文献 Structures of BIRC6-client complexes provide a mechanism of SMAC-mediated release of caspases. Science, 379, 2023
8E2G	Cryo-EM structure of N-terminal arm (aa68-966) of BIRC6 (from local refinement 3) 分子名称: Baculoviral IAP repeat-containing protein 6 著者 Hunkeler, M, Fischer, E.S. 登録日 2022-08-15 公開日 2023-02-15 最終更新日 2024-06-12 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (2.99 Å) 主引用文献 Structures of BIRC6-client complexes provide a mechanism of SMAC-mediated release of caspases. Science, 379, 2023
8E2I	Cryo-EM structure of BIRC6/Smac 分子名称: Baculoviral IAP repeat-containing protein 6, Diablo IAP-binding mitochondrial protein 著者 Hunkeler, M, Fischer, E.S. 登録日 2022-08-15 公開日 2023-02-15 最終更新日 2024-06-12 実験手法 ELECTRON MICROSCOPY (3.04 Å) 主引用文献 Structures of BIRC6-client complexes provide a mechanism of SMAC-mediated release of caspases. Science, 379, 2023
6DJX	Crystal Structure of pParkin-pUb-UbcH7 complex 分子名称: RBR-type E3 ubiquitin transferase,RBR-type E3 ubiquitin transferase, Ubiquitin, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, ... 著者 Sauve, V, Sung, G, Trempe, J.F, Gehring, K. 登録日 2018-05-27 公開日 2018-07-04 最終更新日 2023-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (4.801 Å) 主引用文献 Mechanism of parkin activation by phosphorylation. Nat. Struct. Mol. Biol., 25, 2018
2Y9M	Pex4p-Pex22p structure 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, PEROXISOME ASSEMBLY PROTEIN 22, UBIQUITIN-CONJUGATING ENZYME E2-21 KDA 著者 Williams, C, van den Berg, M, Panjikar, S, Distel, B, Wilmanns, M. 登録日 2011-02-15 公開日 2011-10-26 最終更新日 2017-12-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.6 Å) 主引用文献 Insights Into Ubiquitin-Conjugating Enzyme/ Co-Activator Interactions from the Structure of the Pex4P:Pex22P Complex. Embo J., 31, 2011
7BXG	MavC-UBE2N-Ub complex 分子名称: MavC, Polyubiquitin-C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N 著者 Gao, P, Wang, Y. 登録日 2020-04-19 公開日 2020-05-20 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.705 Å) 主引用文献 Insights into catalysis and regulation of non-canonical ubiquitination and deubiquitination by bacterial deamidase effectors. Nat Commun, 11, 2020
7BBF	Crystal structure of ubiquitin charged Ube2N (Ube2N~Ub) in complex with Ube2V2 分子名称: Polyubiquitin-C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2 著者 Kiss, L, Neuhaus, D, James, L.C. 登録日 2020-12-17 公開日 2021-01-27 最終更新日 2024-05-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.54 Å) 主引用文献 RING domains act as both substrate and enzyme in a catalytic arrangement to drive self-anchored ubiquitination. Nat Commun, 12, 2021
5ULH	Structure of RNF165 in complex with a UbcH5b~Ub conjugate 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, GLYCEROL, THIOCYANATE ION, ... 著者 Middleton, A.J, Day, C.L, Wright, J.D. 登録日 2017-01-24 公開日 2017-06-07 最終更新日 2024-03-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.95 Å) 主引用文献 Discovery of new non-covalent ubiquitin binding sites on UbcH5 To be published
5ULK	Crystal Structure of RNF165 in complex with a UbcH5b~Ub conjugate 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, Ubiquitin, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, ... 著者 Middleton, A.J, Day, C.L, Wright, J.D. 登録日 2017-01-24 公開日 2017-06-07 最終更新日 2024-03-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.38 Å) 主引用文献 Discovery of new non-covalent ubiquitin binding sites on UbcH5 To be published
2LXP	NMR structure of two domains in ubiquitin ligase gp78, RING and G2BR, bound to its conjugating enzyme Ube2g 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 G2, ZINC ION 著者 Das, R, Linag, Y, Mariano, J, Li, J, Huang, T, King, A, Weissman, A, Ji, X, Byrd, R. 登録日 2012-08-30 公開日 2013-08-28 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Allosteric regulation of E2:E3 interactions promote a processive ubiquitination machine. Embo J., 32, 2013
5VZW	TRIM23 RING domain in complex with UbcH5-Ub 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, Ubiquitin, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, ... 著者 Pornillos, O, Dawidziak, D. 登録日 2017-05-29 公開日 2017-08-09 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.278 Å) 主引用文献 Structure and catalytic activation of the TRIM23 RING E3 ubiquitin ligase. Proteins, 85, 2017
2XWU	CRYSTAL STRUCTURE OF IMPORTIN 13 - UBC9 COMPLEX 分子名称: IMPORTIN13, SUMO-CONJUGATING ENZYME UBC9 著者 Gruenwald, M, Bono, F. 登録日 2010-11-05 公開日 2010-12-29 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å) 主引用文献 Structure of Importin13-Ubc9 Complex: Nuclear Import and Release of a Key Regulator of Sumoylation. Embo J., 30, 2011
2YHO	The IDOL-UBE2D complex mediates sterol-dependent degradation of the LDL receptor 分子名称: ACETATE ION, E3 UBIQUITIN-PROTEIN LIGASE MYLIP, UBIQUITIN-CONJUGATING ENZYME E2 D1, ... 著者 Fairall, L, Goult, B.T, Millard, C.J, Tontonoz, P, Schwabe, J.W.R. 登録日 2011-05-04 公開日 2011-06-29 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 The Idol-Ube2D Complex Mediates Sterol-Dependent Degradation of the Ldl Receptor. Genes Dev., 25, 2011
5TUT	UbcH5a-Ub isopeptide conjugate 分子名称: Ubiquitin, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1 著者 Sanchez, J.G, Wagner, J.M, Pornillos, O. 登録日 2016-11-07 公開日 2017-11-08 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.604 Å) 主引用文献 UbcH5a-Ub isopeptide conjugate To be Published
3A4S	The crystal structure of the SLD2:Ubc9 complex 分子名称: NFATC2-interacting protein, SUMO-conjugating enzyme UBC9 著者 Sekiyama, N, Arita, K, Ikeda, Y, Ariyoshi, M, Tochio, H, Saitoh, H, Shirakawa, M. 登録日 2009-07-14 公開日 2010-02-02 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.7 Å) 主引用文献 Structural basis for regulation of poly-SUMO chain by a SUMO-like domain of Nip45 Proteins, 78, 2009

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