7U76
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7U79
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4O3O
| Crystal structure of human polymerase eta inserting datp opposite an 8-oxog containing dna template | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(8OG)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... | 著者 | Patra, A, Egli, M. | 登録日 | 2013-12-18 | 公開日 | 2014-04-30 | 最終更新日 | 2023-09-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.698 Å) | 主引用文献 | Kinetics, Structure, and Mechanism of 8-Oxo-7,8-dihydro-2'-deoxyguanosine Bypass by Human DNA Polymerase eta J.Biol.Chem., 289, 2014
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5KFK
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5KG3
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5KFY
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7U84
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4ED2
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: AT crystal at pH 7.2 (Na+ HEPES) with 1 Ca2+ ion | 分子名称: | 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... | 著者 | Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. | 登録日 | 2012-03-26 | 公開日 | 2012-07-11 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.711 Å) | 主引用文献 | Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
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4ED7
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: TG crystal at pH 7.0 (K+ MES) with 1 Ca2+ ion | 分子名称: | 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*CP*AP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*G)-3'), ... | 著者 | Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. | 登録日 | 2012-03-27 | 公開日 | 2012-07-11 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.717 Å) | 主引用文献 | Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
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4O3S
| Crystal structure of human polymerase eta extending an 8-oxog dna lesion: post insertion of 8-oxog-dc pair | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*C)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*GP*(8OG)P*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... | 著者 | Patra, A, Egli, M. | 登録日 | 2013-12-18 | 公開日 | 2014-04-30 | 最終更新日 | 2023-09-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.717 Å) | 主引用文献 | Kinetics, Structure, and Mechanism of 8-Oxo-7,8-dihydro-2'-deoxyguanosine Bypass by Human DNA Polymerase eta J.Biol.Chem., 289, 2014
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5KFH
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4O3P
| Crystal structure of human polymerase eta inserting dctp opposite an 8-oxog containing dna template | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(8OG)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... | 著者 | Patra, A, Egli, M. | 登録日 | 2013-12-18 | 公開日 | 2014-04-30 | 最終更新日 | 2023-09-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.72 Å) | 主引用文献 | Kinetics, Structure, and Mechanism of 8-Oxo-7,8-dihydro-2'-deoxyguanosine Bypass by Human DNA Polymerase eta J.Biol.Chem., 289, 2014
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8V7I
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4O3Q
| Crystal structure of human polymerase eta inserting dgtp opposite an 8-oxog containing dna template | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*(8OG)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), ... | 著者 | Patra, A, Egli, M. | 登録日 | 2013-12-18 | 公開日 | 2014-04-30 | 最終更新日 | 2023-09-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.72 Å) | 主引用文献 | Kinetics, Structure, and Mechanism of 8-Oxo-7,8-dihydro-2'-deoxyguanosine Bypass by Human DNA Polymerase eta J.Biol.Chem., 289, 2014
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8E85
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8G8J
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4ECX
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: Reaction in the AT crystal at pH 7.0 for 300 sec | 分子名称: | 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... | 著者 | Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. | 登録日 | 2012-03-26 | 公開日 | 2012-07-11 | 最終更新日 | 2024-03-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.744 Å) | 主引用文献 | Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
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5KFR
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6D0Z
| Polymerase Eta cytarabine (AraC) extension ternary complex | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, DNA (5'-D(*CP*AP*TP*TP*GP*CP*AP*GP*TP*GP*CP*T)-3'), DNA polymerase eta, ... | 著者 | Rechkoblit, O, Aggarwal, A.K. | 登録日 | 2018-04-11 | 公開日 | 2018-09-05 | 最終更新日 | 2023-10-04 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.75 Å) | 主引用文献 | Structural basis for polymerase eta-promoted resistance to the anticancer nucleoside analog cytarabine. Sci Rep, 8, 2018
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5KG7
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7M85
| Human DNA Pol eta S113A with dA-ended primer and dATP: in crystallo reaction for 80 s | 分子名称: | 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*A)-3'), ... | 著者 | Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. | 登録日 | 2021-03-29 | 公開日 | 2021-06-02 | 最終更新日 | 2023-10-18 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.75 Å) | 主引用文献 | Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
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3MR3
| Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex with the 3'T of a CPD in the active site (TT1) | 分子名称: | 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, DNA (5'-D(*CP*AP*(TTD)P*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... | 著者 | Biertumpfel, C, Zhao, Y, Ramon-Maiques, S, Gregory, M.T, Lee, J.Y, Yang, W. | 登録日 | 2010-04-28 | 公開日 | 2010-06-30 | 最終更新日 | 2024-02-21 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.75 Å) | 主引用文献 | Structure and mechanism of human DNA polymerase eta. Nature, 465, 2010
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