6WLR
| SAM-IV riboswitch with SAM models, 4.8 Angstrom resolution | 分子名称: | RNA (119-MER) | 著者 | Kappel, K, Zhang, K, Su, Z, Watkins, A.M, Kladwang, W, Li, S, Pintilie, G, Topkar, V.V, Rangan, R, Zheludev, I.N, Yesselman, J.D, Chiu, W, Das, R. | 登録日 | 2020-04-20 | 公開日 | 2020-07-08 | 最終更新日 | 2024-03-06 | 実験手法 | ELECTRON MICROSCOPY (4.8 Å) | 主引用文献 | Accelerated cryo-EM-guided determination of three-dimensional RNA-only structures. Nat.Methods, 17, 2020
|
|
6WLS
| Tetrahymena ribozyme models, 6.8 Angstrom resolution | 分子名称: | RNA (388-MER) | 著者 | Kappel, K, Zhang, K, Su, Z, Watkins, A.M, Kladwang, W, Li, S, Pintilie, G, Topkar, V.V, Rangan, R, Zheludev, I.N, Yesselman, J.D, Chiu, W, Das, R. | 登録日 | 2020-04-20 | 公開日 | 2020-07-08 | 最終更新日 | 2024-03-06 | 実験手法 | ELECTRON MICROSCOPY (6.8 Å) | 主引用文献 | Accelerated cryo-EM-guided determination of three-dimensional RNA-only structures. Nat.Methods, 17, 2020
|
|
7EZ2
| Holo L-16 ScaI Tetrahymena ribozyme | 分子名称: | Holo L-16 ScaI Tetrahymena ribozyme, Holo L-16 ScaI Tetrahymena ribozyme S1, Holo L-16 ScaI Tetrahymena ribozyme S2, ... | 著者 | Su, Z, Zhang, K, Kappel, K, Luo, B, Das, R, Chiu, W. | 登録日 | 2021-06-01 | 公開日 | 2021-08-25 | 最終更新日 | 2022-02-16 | 実験手法 | ELECTRON MICROSCOPY (3.05 Å) | 主引用文献 | Cryo-EM structures of full-length Tetrahymena ribozyme at 3.1 angstrom resolution. Nature, 596, 2021
|
|
2LG0
| structure of the duplex containing (5'S)-8,5'-cyclo-2'-deoxyadenosine | 分子名称: | DNA (5'-D(*AP*CP*AP*AP*AP*CP*AP*TP*GP*CP*AP*C)-3'), DNA (5'-D(*GP*TP*GP*CP*(02I)P*TP*GP*TP*TP*TP*GP*T)-3') | 著者 | Huang, H, Das, R.S, Basu, A, Stone, M.P. | 登録日 | 2011-07-18 | 公開日 | 2012-06-27 | 最終更新日 | 2024-05-15 | 実験手法 | SOLUTION NMR | 主引用文献 | Structure of (5'S)-8,5'-cyclo-2'-deoxyguanosine in DNA. J.Am.Chem.Soc., 133, 2011
|
|
5WWP
| Crystal structure of Middle East respiratory syndrome coronavirus helicase (MERS-CoV nsp13) | 分子名称: | ORF1ab, SULFATE ION, ZINC ION | 著者 | Hao, W, Wojdyla, J.A, Zhao, R, Han, R, Das, R, Zlatev, I, Manoharan, M, Wang, M, Cui, S. | 登録日 | 2017-01-03 | 公開日 | 2017-07-05 | 最終更新日 | 2021-09-15 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (3 Å) | 主引用文献 | Crystal structure of Middle East respiratory syndrome coronavirus helicase PLoS Pathog., 13, 2017
|
|
2LVN
| Structure of the gp78 CUE domain | 分子名称: | E3 ubiquitin-protein ligase AMFR | 著者 | Liu, S, Chen, Y, Huang, T, Tarasov, S.G, King, A, Li, J, Weissman, A.M, Byrd, R.A, Das, R. | 登録日 | 2012-07-09 | 公開日 | 2012-11-21 | 最終更新日 | 2024-05-01 | 実験手法 | SOLUTION NMR | 主引用文献 | Promiscuous Interactions of gp78 E3 Ligase CUE Domain with Polyubiquitin Chains. Structure, 20, 2012
|
|
2LVP
| gp78CUE domain bound to the distal ubiquitin of K48-linked diubiquitin | 分子名称: | E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, Ubiquitin | 著者 | Liu, S, Chen, Y, Huang, T, Tarasov, S.G, King, A, Li, J, Weissman, A.M, Byrd, R.A, Das, R. | 登録日 | 2012-07-09 | 公開日 | 2012-11-21 | 最終更新日 | 2024-05-15 | 実験手法 | SOLUTION NMR | 主引用文献 | Promiscuous Interactions of gp78 E3 Ligase CUE Domain with Polyubiquitin Chains. Structure, 20, 2012
|
|
2LVQ
| gp78CUE domain bound to the proximal ubiquitin of K48-linked diubiquitin | 分子名称: | E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, Ubiquitin | 著者 | Liu, S, Chen, Y, Huang, T, Tarasov, S.G, King, A, Li, J, Weissman, A.M, Byrd, R.A, Das, R. | 登録日 | 2012-07-09 | 公開日 | 2012-11-21 | 最終更新日 | 2024-05-15 | 実験手法 | SOLUTION NMR | 主引用文献 | Promiscuous Interactions of gp78 E3 Ligase CUE Domain with Polyubiquitin Chains. Structure, 20, 2012
|
|
2M20
| EGFR transmembrane - juxtamembrane (TM-JM) segment in bicelles: MD guided NMR refined structure. | 分子名称: | Epidermal growth factor receptor | 著者 | Endres, N.F, Das, R, Smith, A, Arkhipov, A, Kovacs, E, Huang, Y, Pelton, J.G, Shan, Y, Shaw, D.E, Wemmer, D.E, Groves, J.T, Kuriyan, J. | 登録日 | 2012-12-11 | 公開日 | 2013-02-20 | 最終更新日 | 2024-05-01 | 実験手法 | SOLUTION NMR | 主引用文献 | Conformational Coupling across the Plasma Membrane in Activation of the EGF Receptor. Cell(Cambridge,Mass.), 152, 2013
|
|
2LVO
| Structure of the gp78CUE domain bound to monubiquitin | 分子名称: | E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, Ubiquitin | 著者 | Liu, S, Chen, Y, Huang, T, Tarasov, S.G, King, A, Li, J, Weissman, A.M, Byrd, R.A, Das, R. | 登録日 | 2012-07-09 | 公開日 | 2012-11-21 | 最終更新日 | 2024-05-15 | 実験手法 | SOLUTION NMR | 主引用文献 | Promiscuous Interactions of gp78 E3 Ligase CUE Domain with Polyubiquitin Chains. Structure, 20, 2012
|
|
7UPH
| Structure of a ribosome with tethered subunits | 分子名称: | 30S ribosomal protein S10, 30S ribosomal protein S11, 30S ribosomal protein S12, ... | 著者 | Kim, D.S, Watkins, A, Bidstrup, E, Lee, J, Topkar, V.V, Kofman, C, Schwarz, K.J, Liu, Y, Pintilie, G, Roney, E, Das, R, Jewett, M.C. | 登録日 | 2022-04-15 | 公開日 | 2022-08-17 | 最終更新日 | 2022-08-31 | 実験手法 | ELECTRON MICROSCOPY (4.18 Å) | 主引用文献 | Three-dimensional structure-guided evolution of a ribosome with tethered subunits. Nat.Chem.Biol., 18, 2022
|
|
7F0N
| |
2LFA
| Oligonucleotide duplex contaning (5'S)-8,5'-cyclo-2'-deoxyguansine | 分子名称: | DNA (5'-D(*AP*CP*AP*AP*AP*CP*AP*CP*GP*CP*AP*C)-3'), DNA (5'-D(*GP*TP*GP*CP*(2LF)P*TP*GP*TP*TP*TP*GP*T)-3') | 著者 | Huang, H, Das, R.S, Basu, A, Stone, M.P. | 登録日 | 2011-06-29 | 公開日 | 2012-01-04 | 最終更新日 | 2024-05-01 | 実験手法 | SOLUTION NMR | 主引用文献 | Structure of (5'S)-8,5'-Cyclo-2'-deoxyguanosine in DNA. J.Am.Chem.Soc., 133, 2011
|
|
3H8K
| Crystal structure of Ube2g2 complxed with the G2BR domain of gp78 at 1.8-A resolution | 分子名称: | Autocrine motility factor receptor, isoform 2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 G2 | 著者 | Kalathur, R.C, Das, R, Li, J, Byrd, R.A, Ji, X. | 登録日 | 2009-04-29 | 公開日 | 2009-07-14 | 最終更新日 | 2023-09-06 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) | 主引用文献 | Allosteric activation of E2-RING finger-mediated ubiquitylation by a structurally defined specific E2-binding region of gp78. Mol.Cell, 34, 2009
|
|
6DVK
| Computationally designed mini tetraloop-tetraloop receptor by the RNAMake program - construct 6 (miniTTR 6) | 分子名称: | COBALT (II) ION, MAGNESIUM ION, RNA (95-MER) | 著者 | Eiler, D.R, Yesselman, J.D, Costantino, D.A, Das, R, Kieft, J.S. | 登録日 | 2018-06-24 | 公開日 | 2019-06-26 | 最終更新日 | 2024-03-13 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.55 Å) | 主引用文献 | Computational design of three-dimensional RNA structure and function. Nat Nanotechnol, 14, 2019
|
|
5ZAU
| |
7EZ0
| Apo L-21 ScaI Tetrahymena ribozyme | 分子名称: | Apo L-21 ScaI Tetrahymena ribozyme, MAGNESIUM ION | 著者 | Su, Z, Zhang, K, Kappel, K, Luo, B, Das, R, Chiu, W. | 登録日 | 2021-06-01 | 公開日 | 2021-08-25 | 最終更新日 | 2022-02-16 | 実験手法 | ELECTRON MICROSCOPY (3.14 Å) | 主引用文献 | Cryo-EM structures of full-length Tetrahymena ribozyme at 3.1 angstrom resolution. Nature, 596, 2021
|
|
2MA2
| Solution structure of RasGRP2 EF hands bound to calcium | 分子名称: | RAS guanyl-releasing protein 2 | 著者 | Kuriyan, J, Iwig, J, Vercoulen, Y, Das, R, Barros, T, Limnander, A, Che, Y, Pelton, J, Wemmer, D, Roose, J. | 登録日 | 2013-06-24 | 公開日 | 2013-08-21 | 最終更新日 | 2024-05-01 | 実験手法 | SOLUTION NMR | 主引用文献 | Structural analysis of autoinhibition in the Ras-specific exchange factor RasGRP1. Elife, 2, 2013
|
|
2M7T
| Solution NMR Structure of Engineered Cystine Knot Protein 2.5D | 分子名称: | Cystine Knot Protein 2.5D | 著者 | Cochran, F.V, Das, R. | 登録日 | 2013-04-30 | 公開日 | 2014-05-07 | 最終更新日 | 2023-06-14 | 実験手法 | SOLUTION NMR | 主引用文献 | Challenging the state of the art in protein structure prediction: Highlights of experimental target structures for the 10th Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction Experiment CASP10. Proteins, 82 Suppl 2, 2014
|
|
5XFU
| Domain swapped dimer crystal structure of loop1 deletion mutant in Single-chain Monellin | 分子名称: | Monellin chain B,Monellin chain A | 著者 | Surana, P, Nandwani, N, Udgaonkar, J, Gosavi, S, Das, R. | 登録日 | 2017-04-11 | 公開日 | 2017-07-26 | 最終更新日 | 2023-11-22 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.611 Å) | 主引用文献 | Amino-acid composition after loop deletion drives domain swapping Protein Sci., 26, 2017
|
|
5YCU
| Domain swapped dimer of engineered hairpin loop1 mutant in Single-chain Monellin | 分子名称: | Single chain monellin | 著者 | Surana, P, Nandwani, N, Udgaonkar, J.B, Gosavi, S, Das, R. | 登録日 | 2017-09-08 | 公開日 | 2018-11-28 | 最終更新日 | 2023-11-22 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.32 Å) | 主引用文献 | A five-residue motif for the design of domain swapping in proteins. Nat Commun, 10, 2019
|
|
5YCW
| Double domain swapped dimer of engineered hairpin loop1 and loop3 mutant in Single-chain Monellin | 分子名称: | single chain monellin | 著者 | Surana, P, Nandwani, N, Udgaonkar, J.B, Gosavi, S, Das, R. | 登録日 | 2017-09-08 | 公開日 | 2018-11-28 | 最終更新日 | 2023-11-22 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.285 Å) | 主引用文献 | A five-residue motif for the design of domain swapping in proteins. Nat Commun, 10, 2019
|
|
5YCT
| Engineered hairpin loop3 mutant monomer in Single-chain Monellin | 分子名称: | Single chain Monellin | 著者 | Surana, P, Nandwani, N, Udgaonkar, J.B, Gosavi, S, Das, R. | 登録日 | 2017-09-08 | 公開日 | 2018-11-28 | 最終更新日 | 2023-11-22 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.851 Å) | 主引用文献 | A five-residue motif for the design of domain swapping in proteins. Nat Commun, 10, 2019
|
|
4LAD
| Crystal Structure of the Ube2g2:RING-G2BR complex | 分子名称: | E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, OXALATE ION, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 G2, ... | 著者 | Liang, Y.-H, Li, J, Das, R, Byrd, R.A, Ji, X. | 登録日 | 2013-06-19 | 公開日 | 2013-08-28 | 最終更新日 | 2023-09-20 | 実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) | 主引用文献 | Allosteric regulation of E2:E3 interactions promote a processive ubiquitination machine. Embo J., 32, 2013
|
|
2NBD
| |