登録情報 データベース : PDB / ID : 5tth 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Heterodimeric SpyCatcher/SpyTag-fused zebrafish TRAP1 in ATP/ADP-hybrid state 要素C-terminal SpyCatcher fusion of wildtype zebrafish TNF receptor-associated protein 1 C-terminal Spytag fusion of R417A zebrafish TNF receptor-associated protein 1 詳細キーワード CHAPERONE / Hsp90 / ATP / Trap1 / Structural Genomics / PSI-2 / Protein Structure Initiative / Northeast Structural Genomics Consortium / NESG機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
Citric acid cycle (TCA cycle) / ATP-dependent protein folding chaperone / unfolded protein binding / protein folding / mitochondrial inner membrane / calcium ion binding / protein kinase binding / magnesium ion binding / ATP hydrolysis activity / ATP binding / identical protein binding 類似検索 - 分子機能 Heat shock protein 90, C-terminal domain / Fibronectin binding repeat / Collagen-binding surface protein Cna-like, B-type domain / Fibronectin binding repeat / Cna protein B-type domain / Rossmann fold - #11260 / Uncharacterised domain CHP03934, TQXA / Thioester domain / Thioester domain / Ribosomal Protein S5; domain 2 - #80 ... Heat shock protein 90, C-terminal domain / Fibronectin binding repeat / Collagen-binding surface protein Cna-like, B-type domain / Fibronectin binding repeat / Cna protein B-type domain / Rossmann fold - #11260 / Uncharacterised domain CHP03934, TQXA / Thioester domain / Thioester domain / Ribosomal Protein S5; domain 2 - #80 / Prealbumin-like fold domain / Prealbumin-like fold domain / Ribosomal Protein S5; domain 2 / HSP90, C-terminal domain / Heat shock protein Hsp90, N-terminal / Heat shock protein Hsp90 family / Hsp90 protein / Histidine kinase-, DNA gyrase B-, and HSP90-like ATPase / Histidine kinase-like ATPase, C-terminal domain / Heat Shock Protein 90 / Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) / Histidine kinase-like ATPases / Histidine kinase/HSP90-like ATPase / Histidine kinase/HSP90-like ATPase superfamily / Ribosomal protein S5 domain 2-type fold / Immunoglobulins / Immunoglobulin-like fold / Up-down Bundle / Immunoglobulin-like / Sandwich / Rossmann fold / 2-Layer Sandwich / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Beta / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION / Heat shock protein 75 kDa, mitochondrial / Fibronectin binding protein 類似検索 - 構成要素生物種 Danio rerio (ゼブラフィッシュ)Streptococcus pyogenes (化膿レンサ球菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 3.2 Å 詳細データ登録者 Elnatan, D. / Betegon, M. / Liu, Y. / Agard, D.A. / Northeast Structural Genomics Consortium (NESG) 資金援助 米国, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) U01 GM098254. 米国
引用ジャーナル : Elife / 年 : 2017タイトル : Symmetry broken and rebroken during the ATP hydrolysis cycle of the mitochondrial Hsp90 TRAP1.著者 : Elnatan, D. / Betegon, M. / Liu, Y. / Ramelot, T. / Kennedy, M.A. / Agard, D.A. 履歴 登録 2016年11月3日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2017年8月23日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2017年9月20日 Group : Author supporting evidence / カテゴリ : pdbx_audit_support / Item : _pdbx_audit_support.funding_organization改定 1.2 2019年5月8日 Group : Data collection / Database references / カテゴリ : citation_author / Item : _citation_author.identifier_ORCID改定 1.3 2020年1月1日 Group : Author supporting evidence / カテゴリ : pdbx_audit_support / Item : _pdbx_audit_support.funding_organization改定 1.4 2023年10月4日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id
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