PDB-4wjz: Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4wjz

タイトル

Crystal structure of beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase (FabG)(G141A) from Vibrio cholerae

要素

3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG

キーワード

OXIDOREDUCTASE / STRUCTURAL GENOMICS / CENTER FOR STRUCTURAL GENOMICS OF INFECTIOUS DISEASES / CSGID / Vibrio cholerae / FabG / beta-ketoacyl-acyl carrier protein reductase

機能・相同性

機能・相同性情報

3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADPH) activity / 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase / fatty acid elongation / oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor / NAD binding / NADP binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 (コレラ菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.4 Å

データ登録者

Hou, J. / Zheng, H. / Anderson, W.F. / Minor, W. / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

資金援助

米国, 3件

組織	認可番号	国
National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)	HHSN272200700058C	米国
National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)	HHSN272201200026C	米国
Department of Energy (DOE, United States)	DE-AC02-06CH11357	米国

引用

ジャーナル: J.Bacteriol. / 年: 2015
タイトル: Dissecting the Structural Elements for the Activation of beta-Ketoacyl-(Acyl Carrier Protein) Reductase from Vibrio cholerae.
著者: Hou, J. / Zheng, H. / Chruszcz, M. / Zimmerman, M.D. / Shumilin, I.A. / Osinski, T. / Demas, M. / Grimshaw, S. / Minor, W.

履歴

登録	2014年10月1日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2014年11月12日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2015年8月26日	Group: Data collection
改定 1.2	2015年11月25日	Group: Database references
改定 1.3	2016年2月3日	Group: Database references
改定 1.4	2017年9月27日	Group: Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: citation / pdbx_struct_oper_list / software Item: _citation.journal_id_CSD / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _software.name
改定 1.5	2020年1月1日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support
改定 1.6	2022年4月13日	Group: Database references / Structure summary / カテゴリ: audit_author / citation_author / database_2 Item: _audit_author.identifier_ORCID / _citation_author.identifier_ORCID ..._audit_author.identifier_ORCID / _citation_author.identifier_ORCID / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession
改定 1.7	2023年12月27日	Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / struct_ncs_dom_lim Item: _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id ..._struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4wjz.cif.gz	321 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4wjz.ent.gz	260 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4wjz.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	4wjz_validation.pdf.gz	459.1 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4wjz_full_validation.pdf.gz	461.7 KB	表示
XML形式データ	4wjz_validation.xml.gz	30.4 KB	表示
CIF形式データ	4wjz_validation.cif.gz	42.9 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/wj/4wjz ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/wj/4wjz	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	3op4C 3rroC 3rshC 3tzcC 3tzkC 3u09C 4i08C 4wk6C 5endC 3tzh C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	3tzc-d 3out-d 5bn3-d 4iqn-d 6gpx-d 5nn5-d 4v2e-d 2ht1-d 3lx6-d 4beb-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#90 - 2007年6月脂肪酸合成酵素 (Fatty Acid Synthase) 類似性 (5) #77 - 2006年5月ブドウ糖酸化酵素 (Glucose Oxidase) 類似性 (3) #188 - 2015年8月テトラヒドロビオプテリンの生合成 (Tetrahydrobiopterin Biosynthesis) 類似性 (2) #216 - 2017年12月生分解性プラスチック (Biodegradable Plastic) 類似性 (2)

登録構造単位

A: 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG

B: 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG

C: 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG

D: 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG

ヘテロ分子

106 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者が定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	61.825, 61.825, 384.704
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 120.000
Int Tables number	169
Space group name H-M	P6₁

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
1	2	A
2	2	C
1	3	A
2	3	D
1	4	B
2	4	C
1	5	B
2	5	D
1	6	C
2	6	D

NCSドメイン領域:

Component-ID: _ / End auth comp-ID: TYR / End label comp-ID: TYR / Refine code: _

Dom-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	SER	SER	A	A	2 - 246	5 - 249
2	1	SER	SER	B	B	2 - 246	5 - 249
1	2	ALA	ALA	A	A	0 - 246	3 - 249
2	2	ALA	ALA	C	C	0 - 246	3 - 249
1	3	MET	MET	A	A	1 - 246	4 - 249
2	3	MET	MET	D	D	1 - 246	4 - 249
1	4	SER	SER	B	B	2 - 246	5 - 249
2	4	SER	SER	C	C	2 - 246	5 - 249
1	5	SER	SER	B	B	2 - 246	5 - 249
2	5	SER	SER	D	D	2 - 246	5 - 249
1	6	MET	MET	C	C	1 - 246	4 - 249
2	6	MET	MET	D	D	1 - 246	4 - 249

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3
4
5
6

詳細

The biological assembly is a tetramer.

#1: タンパク質	3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase FabG / 3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase / Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase / Beta- ...3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase / Beta-Ketoacyl-acyl carrier protein reductase / Beta-ketoacyl-ACP reductase 分子量: 26372.141 Da / 分子数: 4 / 変異: G141A / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Vibrio cholerae O1 biovar El Tor str. N16961 (コレラ菌) 遺伝子: fabG, VC_2021 / プラスミド: pMCSG7 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21-CodonPlus(DE3)-RIL 参照: UniProt: Q9KQH7, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase
#2: 化合物	ChemComp-PO4 / PHOSPHATE ION 分子量: 94.971 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: PO₄
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 87 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.01 Å³/Da / 溶媒含有率: 38.9 %
結晶化	温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 / 詳細: 2.4M Ammonium phosphate, 0.1M Tris-HCl

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 21-ID-G / 波長: 0.9786 Å

検出器

タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2014年8月25日 / 詳細: Beyllium Lenses

放射

モノクロメーター: Diamond 111 CHANNEL / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.9786 Å / 相対比: 1

Reflection

冗長度: 5.8 % / 数: 185974 / R_merge(I) obs: 0.091 / Χ²: 0.88 / D res high: 2.4 Å / D res low: 27 Å / Num. obs: 32068 / % possible obs: 98.6

Diffraction reflection shell

最高解像度 (Å)	最低解像度 (Å)	ID	R_merge(I) obs	Chi squared	Redundancy
6.49	27	1	0.034	0.606	4.3
5.16	6.49	1	0.051	0.8	5.9
4.51	5.16	1	0.054	1.013	5.5
4.1	4.51	1	0.055	0.978	5.5
3.81	4.1	1	0.06	0.949	5.9
3.58	3.81	1	0.068	1.021	6
3.4	3.58	1	0.079	1.092	6.1
3.26	3.4	1	0.095	0.929	6.2
3.13	3.26	1	0.124	0.889	6.4
3.02	3.13	1	0.147	0.854	6.3
2.93	3.02	1	0.163	0.849	6.3
2.85	2.93	1	0.201	0.844	6.3
2.77	2.85	1	0.24	0.806	6.3
2.7	2.77	1	0.266	0.812	6.3
2.64	2.7	1	0.353	0.878	6.3
2.59	2.64	1	0.386	0.835	6.2
2.53	2.59	1	0.47	0.833	5.7
2.49	2.53	1	0.485	0.793	5.2
2.44	2.49	1	0.518	0.792	4.8
2.4	2.44	1	0.565	0.833	4.1

Reflection twin

Crystal-ID	ID	Operator	Domain-ID	Fraction
1	1	H, K, L	1	0.758
1	1	K, H, -L	2	0.242

反射

解像度: 2.4→27 Å / Num. obs: 32068 / % possible obs: 98.6 % / 冗長度: 5.8 % / R_merge(I) obs: 0.091 / R_pim(I) all: 0.041 / R_rim(I) all: 0.1 / Χ²: 0.877 / Net I/av σ(I): 17.676 / Net I/σ(I): 8.1 / Num. measured all: 185974

反射シェル

Diffraction-ID: 1 / Rejects: _

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. unique all	CC_1/2	R_pim(I) all	R_rim(I) all	Χ²	% possible all
2.4-2.44	4.1	0.565	1553	0.604	0.307	0.647	0.833	97.2
2.44-2.49	4.8	0.518	1628	0.716	0.262	0.583	0.792	97.7
2.49-2.53	5.2	0.485	1574	0.776	0.232	0.539	0.793	99.1
2.53-2.59	5.7	0.47	1641	0.801	0.215	0.518	0.833	99.8
2.59-2.64	6.2	0.386	1605	0.875	0.166	0.421	0.835	99.9
2.64-2.7	6.3	0.353	1643	0.874	0.152	0.384	0.878	100
2.7-2.77	6.3	0.266	1574	0.924	0.114	0.29	0.812	99.9
2.77-2.85	6.3	0.24	1637	0.937	0.103	0.262	0.806	100
2.85-2.93	6.3	0.201	1644	0.954	0.086	0.219	0.844	100
2.93-3.02	6.3	0.163	1589	0.972	0.07	0.177	0.849	100
3.02-3.13	6.3	0.147	1628	0.976	0.063	0.16	0.854	99.8
3.13-3.26	6.4	0.124	1650	0.98	0.053	0.135	0.889	99.8
3.26-3.4	6.2	0.095	1589	0.987	0.041	0.103	0.929	99.9
3.4-3.58	6.1	0.079	1630	0.988	0.034	0.087	1.092	99.4
3.58-3.81	6	0.068	1612	0.99	0.03	0.074	1.021	99.3
3.81-4.1	5.9	0.06	1614	0.992	0.027	0.066	0.949	98.4
4.1-4.51	5.5	0.055	1585	0.99	0.025	0.061	0.978	98.7
4.51-5.16	5.5	0.054	1619	0.991	0.024	0.059	1.013	97.8
5.16-6.49	5.9	0.051	1580	0.991	0.023	0.056	0.8	98.6
6.49-27	4.3	0.034	1473	0.993	0.018	0.038	0.606	87.5

-
位相決定

位相決定	手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
HKL-3000		データ削減
REFMAC	5.8.0073	精密化
PDB_EXTRACT	3.15	データ抽出
HKL-3000		データスケーリング
MOLREP		位相決定
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.4→26.94 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.913 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.886 / WR_factor R_free: 0.2295 / WR_factor R_work: 0.1946 / FOM work R set: 0.7991 / SU B: 18.038 / SU ML: 0.21 / SU R Cruickshank DPI: 0.1223 / SU R_free: 0.0575 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.122 / ESU R Free: 0.058 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
詳細: U VALUES : WITH TLS ADDED HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2393	1504	4.8 %	RANDOM
R_work	0.1985	29885	-	-
obs	0.2004	32068	97.12 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso max: 113.71 Å² / B_iso mean: 37.804 Å² / B_iso min: 13.96 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-7.94 Å²	-0 Å²	-0 Å²
2-	-	-7.94 Å²	-0 Å²
3-	-	-	15.89 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.4→26.94 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	6237	0	10	87	6334
B_iso mean	-	-	49.84	31.71	-
残基数	-	-	-	-	886

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.012	0.019	6294
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.006	0.02	6122
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.404	1.966	8507
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	1.125	3	13973
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	5.723	5	870
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	40.595	24.502	211
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	14.272	15	1010
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	12.882	15	37
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.077	0.2	1040
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.007	0.02	7243
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.005	0.02	1302
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	1.935	2.559	3528
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	1.935	2.559	3527
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	3.053	3.817	4382

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / タイプ: interatomic distance / Weight position: 0.05

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Rms dev position (Å)
1	1	A	11330	0.08
1	2	B	11330	0.08
2	1	A	11919	0.06
2	2	C	11919	0.06
3	1	A	11131	0.08
3	2	D	11131	0.08
4	1	B	11336	0.08
4	2	C	11336	0.08
5	1	B	11724	0.06
5	2	D	11724	0.06
6	1	C	11154	0.08
6	2	D	11154	0.08

LS精密化シェル

解像度: 2.4→2.462 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.288	98	-
R_work	0.217	1845	-
all	-	1943	-
obs	-	-	80.79 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.789	0.1911	0.2794	1.5914	0.4424	1.9601	0.0197	0.1357	-0.0877	-0.0608	0.0566	0.0039	0.0555	0.0054	-0.0763	0.0823	-0.0001	-0.0055	0.1503	-0.0239	0.0126	-5.3264	17.6827	-18.8349
2	8.5303	-2.7439	-2.5063	1.7696	1.0345	0.796	0.0134	0.2695	0.1518	-0.0055	0.0271	-0.0403	-0.0109	-0.0517	-0.0405	0.0658	-0.0217	-0.0057	0.1343	-0.0052	0.0053	7.0254	28.2165	-20.4222
3	2.6482	-0.2147	0.4299	0.5435	0.8905	1.7408	0.0955	0.1375	0.0476	-0.0509	-0.0187	-0.0383	-0.0708	0.1141	-0.0768	0.1003	-0.0348	-0.0057	0.2138	-0.0029	0.0489	4.4561	29.9822	-10.2384
4	0.8026	-0.1503	0.4157	0.759	-0.1621	0.5614	0.12	0.0999	-0.056	-0.0428	-0.1384	0.0381	0.0914	0.1	0.0183	0.1018	-0.0038	-0.0074	0.1453	-0.0185	0.0167	6.0523	16.1678	-3.4625
5	2.4711	-0.5442	0.3156	0.4101	-0.3626	2.2002	-0.0073	-0.1353	-0.0349	0.0589	-0.0285	0.0725	-0.0819	0.0882	0.0357	0.1041	-0.052	0.0308	0.1168	-0.0024	0.0276	-8.3815	17.1056	20.0323
6	0.6749	0.6283	-0.9896	7.0969	2.0694	2.8256	0.0926	-0.1209	-0.0136	0.2682	-0.0015	-0.2449	-0.0476	0.2219	-0.0912	0.0544	-0.0254	-0.0308	0.1425	0.0007	0.0352	6.2129	16.0343	21.7663
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9	1.0146	-0.0081	0.5558	1.8618	0.0093	1.8507	-0.105	-0.1728	0.0946	0.1125	0.1651	-0.2105	0.0473	-0.103	-0.0601	0.1223	0.0228	-0.0492	0.1444	-0.0207	0.0457	2.8768	-13.2541	18.9479
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11	2.9323	0.3227	0.5015	0.0936	0.0083	1.0035	-0.0968	0.0632	0.1528	0.1083	0.0474	0.0099	0.1278	-0.234	0.0494	0.3262	-0.0178	-0.0094	0.1847	-0.0211	0.0115	-12.23	-14.7008	9.7824
12	0.724	-0.9524	0.0757	3.2028	0.8005	0.527	0.0085	0.0396	-0.0176	0.2357	-0.0112	-0.0134	0.0596	0.019	0.0027	0.1066	-0.031	-0.0157	0.147	0.0134	0.008	-0.7767	-24.8859	3.0077
13	1.4968	0.0449	0.4224	0.9246	-0.2184	0.6727	-0.0336	-0.0288	0.0547	-0.1158	0.0283	0.0189	-0.0154	-0.0304	0.0053	0.1117	-0.0296	-0.0082	0.1298	0.0065	0.0029	3.3677	-14.0901	-19.6175
14	0.4596	0.2134	-0.138	0.0995	-0.0593	0.2073	-0.0175	0.1753	-0.0648	-0.0094	0.0712	-0.0313	0.0047	-0.1334	-0.0537	0.1258	-0.0031	-0.0276	0.194	-0.0044	0.0554	-6.5211	-22.8258	-12.3909
15	3.2286	-4.8782	-0.4351	7.4024	0.2524	5.367	0.1011	-0.2036	0.1955	-0.1229	0.396	-0.25	-0.6009	-1.1667	-0.4971	0.1702	0.1277	-0.0446	0.3511	0.0696	0.1624	-18.485	1.6923	-9.859
16	0.9649	-0.3691	-0.0496	0.2704	0.1408	0.3341	-0.048	0.0203	0.0197	-0.1232	-0.0042	0.0395	-0.1169	0.0627	0.0522	0.163	-0.0261	-0.0531	0.1625	0.0103	0.0182	-5.707	-12.0224	-4.4762

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	-1 - 93
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	94 - 134
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	135 - 177
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	178 - 246
5	X-RAY DIFFRACTION	5	B	2 - 107
6	X-RAY DIFFRACTION	6	B	108 - 134
7	X-RAY DIFFRACTION	7	B	135 - 209
8	X-RAY DIFFRACTION	8	B	210 - 246
9	X-RAY DIFFRACTION	9	C	0 - 94
10	X-RAY DIFFRACTION	10	C	95 - 134
11	X-RAY DIFFRACTION	11	C	135 - 181
12	X-RAY DIFFRACTION	12	C	182 - 246
13	X-RAY DIFFRACTION	13	D	1 - 155
14	X-RAY DIFFRACTION	14	D	156 - 188
15	X-RAY DIFFRACTION	15	D	189 - 207
16	X-RAY DIFFRACTION	16	D	208 - 246

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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