登録情報 | データベース: PDB / ID: 3utb |
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タイトル | Crystal Structure of Nucleosome Core Particle Assembled with the 146b Alpha-Satellite Sequence (NCP146b) |
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要素 | - 146-mer DNA
- Histone H2A
- Histone H2B 1.1
- Histone H3.2
- Histone H4
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キーワード | STRUCTURAL PROTEIN/DNA / Nucleosome core particle / NCP / 146b DNA / STRUCTURAL PROTEIN-DNA complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
structural constituent of chromatin / nucleosome / nucleosome assembly / protein heterodimerization activity / DNA binding / nucleoplasm / nucleus類似検索 - 分子機能 Histone, subunit A / Histone, subunit A / Histone H2B signature. / Histone H2B / Histone H2B / Histone H2A conserved site / Histone H2A signature. / Histone H2A, C-terminal domain / C-terminus of histone H2A / Histone H2A ...Histone, subunit A / Histone, subunit A / Histone H2B signature. / Histone H2B / Histone H2B / Histone H2A conserved site / Histone H2A signature. / Histone H2A, C-terminal domain / C-terminus of histone H2A / Histone H2A / Histone 2A / Histone H4, conserved site / Histone H4 signature. / Histone H4 / Histone H4 / TATA box binding protein associated factor / TATA box binding protein associated factor (TAF), histone-like fold domain / CENP-T/Histone H4, histone fold / Centromere kinetochore component CENP-T histone fold / Histone H3 signature 1. / Histone H3 signature 2. / Histone H3 / Histone H3/CENP-A / Histone H2A/H2B/H3 / Core histone H2A/H2B/H3/H4 / Histone-fold / Orthogonal Bundle / Mainly Alpha類似検索 - ドメイン・相同性 : / DNA / DNA (> 10) / DNA (> 100) / Histone H2B 1.1 / Histone H2A type 1 / Histone H4 / Histone H3.2 / Histone H2A類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Xenopus laevis (アフリカツメガエル) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.2 Å |
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データ登録者 | Chua, E.Y.D. / Vasudevan, D. / Davey, G.E. / Wu, B. / Davey, C.A. |
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引用 | ジャーナル: Nucleic Acids Res. / 年: 2012 タイトル: The mechanics behind DNA sequence-dependent properties of the nucleosome 著者: Chua, E.Y.D. / Vasudevan, D. / Davey, G.E. / Wu, B. / Davey, C.A. |
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履歴 | 登録 | 2011年11月25日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2012年4月11日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2013年6月26日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2024年3月20日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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