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- EMDB-31211: Human Mediator (deletion of MED1-IDR) in a Tail-bent conformation... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-31211
タイトルHuman Mediator (deletion of MED1-IDR) in a Tail-bent conformation (MED-B)
マップデータ
試料
  • 複合体: Structure of the human Mediator complex
    • タンパク質・ペプチド: x 26種
  • リガンド: x 1種
キーワードMediator complex / TRANSCRIPTION
機能・相同性
機能・相同性情報


positive regulation of T cell extravasation / negative regulation of smooth muscle cell differentiation / enucleate erythrocyte development / positive regulation of type II interferon-mediated signaling pathway / regulation of RNA biosynthetic process / androgen biosynthetic process / positive regulation of G0 to G1 transition / retinal pigment epithelium development / mammary gland branching involved in thelarche / G0 to G1 transition ...positive regulation of T cell extravasation / negative regulation of smooth muscle cell differentiation / enucleate erythrocyte development / positive regulation of type II interferon-mediated signaling pathway / regulation of RNA biosynthetic process / androgen biosynthetic process / positive regulation of G0 to G1 transition / retinal pigment epithelium development / mammary gland branching involved in thelarche / G0 to G1 transition / thyroid hormone receptor signaling pathway / core mediator complex / regulation of vitamin D receptor signaling pathway / ventricular trabecula myocardium morphogenesis / thyroid hormone generation / nuclear retinoic acid receptor binding / mediator complex / positive regulation of keratinocyte differentiation / Generic Transcription Pathway / embryonic heart tube development / cellular response to thyroid hormone stimulus / positive regulation of hepatocyte proliferation / embryonic hindlimb morphogenesis / nuclear vitamin D receptor binding / peroxisome proliferator activated receptor binding / limb development / lens development in camera-type eye / positive regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway / embryonic hemopoiesis / nuclear thyroid hormone receptor binding / megakaryocyte development / histone acetyltransferase binding / cellular response to steroid hormone stimulus / cellular response to hepatocyte growth factor stimulus / cortical actin cytoskeleton / termination of RNA polymerase II transcription / RSV-host interactions / LBD domain binding / epithelial cell proliferation involved in mammary gland duct elongation / fat cell differentiation / skeletal muscle cell differentiation / mammary gland branching involved in pregnancy / somatic stem cell population maintenance / monocyte differentiation / blastocyst development / general transcription initiation factor binding / negative regulation of neuron differentiation / hematopoietic stem cell differentiation / embryonic placenta development / negative regulation of keratinocyte proliferation / positive regulation of transcription initiation by RNA polymerase II / animal organ regeneration / erythrocyte development / nuclear receptor-mediated steroid hormone signaling pathway / negative regulation of fibroblast proliferation / ubiquitin ligase complex / RNA polymerase II preinitiation complex assembly / keratinocyte differentiation / cellular response to epidermal growth factor stimulus / peroxisome proliferator activated receptor signaling pathway / RORA activates gene expression / lactation / Regulation of lipid metabolism by PPARalpha / BMAL1:CLOCK,NPAS2 activates circadian gene expression / Activation of gene expression by SREBF (SREBP) / positive regulation of erythrocyte differentiation / nuclear receptor coactivator activity / liver development / promoter-specific chromatin binding / nuclear estrogen receptor binding / nuclear receptor binding / transcription initiation at RNA polymerase II promoter / positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II / transcription coregulator activity / Heme signaling / mRNA transcription by RNA polymerase II / Transcriptional activation of mitochondrial biogenesis / cell morphogenesis / brain development / PPARA activates gene expression / Cytoprotection by HMOX1 / chromatin DNA binding / transcription coactivator binding / DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity / Transcriptional regulation of white adipocyte differentiation / Nuclear Receptor transcription pathway / protein import into nucleus / transcription corepressor activity / ubiquitin protein ligase activity / Circadian Clock / actin binding / angiogenesis / DNA-binding transcription factor binding / Estrogen-dependent gene expression / transcription regulator complex / transcription by RNA polymerase II / transcription coactivator activity / nuclear body / protein ubiquitination / RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
類似検索 - 分子機能
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類似検索 - ドメイン・相同性
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類似検索 - 構成要素
生物種Homo sapiens (ヒト)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 4.4 Å
データ登録者Yin X / Li J
引用ジャーナル: Science / 年: 2021
タイトル: Structures of the human Mediator and Mediator-bound preinitiation complex.
著者: Xizi Chen / Xiaotong Yin / Jiabei Li / Zihan Wu / Yilun Qi / Xinxin Wang / Weida Liu / Yanhui Xu /
要旨: The 1.3-megadalton transcription factor IID (TFIID) is required for preinitiation complex (PIC) assembly and RNA polymerase II (Pol II)-mediated transcription initiation on almost all genes. The 26- ...The 1.3-megadalton transcription factor IID (TFIID) is required for preinitiation complex (PIC) assembly and RNA polymerase II (Pol II)-mediated transcription initiation on almost all genes. The 26-subunit Mediator stimulates transcription and cyclin-dependent kinase 7 (CDK7)-mediated phosphorylation of the Pol II C-terminal domain (CTD). We determined the structures of human Mediator in the Tail module-extended (at near-atomic resolution) and Tail-bent conformations and structures of TFIID-based PIC-Mediator (76 polypeptides, ~4.1 megadaltons) in four distinct conformations. PIC-Mediator assembly induces concerted reorganization (Head-tilting and Middle-down) of Mediator and creates a Head-Middle sandwich, which stabilizes two CTD segments and brings CTD to CDK7 for phosphorylation; this suggests a CTD-gating mechanism favorable for phosphorylation. The TFIID-based PIC architecture modulates Mediator organization and TFIIH stabilization, underscoring the importance of TFIID in orchestrating PIC-Mediator assembly.
履歴
登録2021年4月17日-
ヘッダ(付随情報) 公開2021年5月19日-
マップ公開2021年5月19日-
更新2024年6月5日-
現状2024年6月5日処理サイト: PDBj / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.03
  • UCSF Chimeraによる作画
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  • 原子モデル: PDB-7enj
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_31211.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_31211.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 64 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
ボクセルのサイズX=Y=Z: 2.108 Å
密度
表面レベル登録者による: 0.025 / ムービー #1: 0.03
最小 - 最大-0.19444914 - 0.4518145
平均 (標準偏差)0.00016031876 (±0.008563838)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ256256256
Spacing256256256
セルA=B=C: 539.648 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z2.1082.1082.108
M x/y/z256256256
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z539.648539.648539.648
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ512512512
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS256256256
D min/max/mean-0.1940.4520.000

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : Structure of the human Mediator complex

全体名称: Structure of the human Mediator complex
要素
  • 複合体: Structure of the human Mediator complex
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1
    • タンパク質・ペプチド: Unknown Chain
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7
    • タンパク質・ペプチド: Isoform 2 of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 10
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 24
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 26
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30
    • タンパク質・ペプチド: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31
  • リガンド: ZINC ION

+
超分子 #1: Structure of the human Mediator complex

超分子名称: Structure of the human Mediator complex / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#26
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)

+
分子 #1: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1
タイプ: protein_or_peptide / ID: 1 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 168.697328 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MKAQGETEES EKLSKMSSLL ERLHAKFNQN RPWSETIKLV RQVMEKRVVM SSGGHQHLVS CLETLQKALK VTSLPAMTDR LESIARQNG LGSHLSASGT ECYITSDMFY VEVQLDPAGQ LCDVKVAHHG ENPVSCPELV QQLREKNFDE FSKHLKGLVN L YNLPGDNK ...文字列:
MKAQGETEES EKLSKMSSLL ERLHAKFNQN RPWSETIKLV RQVMEKRVVM SSGGHQHLVS CLETLQKALK VTSLPAMTDR LESIARQNG LGSHLSASGT ECYITSDMFY VEVQLDPAGQ LCDVKVAHHG ENPVSCPELV QQLREKNFDE FSKHLKGLVN L YNLPGDNK LKTKMYLALQ SLEQDLSKMA IMYWKATNAG PLDKILHGSV GYLTPRSGGH LMNLKYYVSP SDLLDDKTAS PI ILHENNV SRSLGMNASV TIEGTSAVYK LPIAPLIMGS HPVDNKWTPS FSSITSANSV DLPACFFLKF PQPIPVSRAF VQK LQNCTG IPLFETQPTY APLYELITQF ELSKDPDPIP LNHNMRFYAA LPGQQHCYFL NKDAPLPDGR SLQGTLVSKI TFQH PGRVP LILNLIRHQV AYNTLIGSCV KRTILKEDSP GLLQFEVCPL SESRFSVSFQ HPVNDSLVCV VMDVQDSTHV SCKLY KGLS DALICTDDFI AKVVQRCMSI PVTMRAIRRK AETIQADTPA LSLIAETVED MVKKNLPPAS SPGYGMTTGN NPMSGT TTP TNTFPGGPIT TLFNMSMSIK DRHESVGHGE DFSKVSQNPI LTSLLQITGN GGSTIGSSPT PPHHTPPPVS SMAGNTK NH PMLMNLLKDN PAQDFSTLYG SSPLERQNSS SGSPRMEICS GSNKTKKKKS SRLPPEKPKH QTEDDFQREL FSMDVDSQ N PIFDVNMTAD TLDTPHITPA PSQCSTPPTT YPQPVPHPQP SIQRMVRLSS SDSIGPDVTD ILSDIAEEAS KLPSTSDDC PAIGTPLRDS SSSGHSQSTL FDSDVFQTNN NENPYTDPAD LIADAAGSPS SDSPTNHFFH DGVDFNPDLL NSQSQSGFGE EYFDESSQS GDNDDFKGFA SQALNTLGVP MLGGDNGETK FKGNNQADTV DFSIISVAGK ALAPADLMEH HSGSQGPLLT T GDLGKEKT QKRVKEGNGT SNSTLSGPGL DSKPGKRSRT PSNDGKSKDK PPKRKKADTE GKSPSHSSSN RPFTPPTSTG GS KSPGSAG RSQTPPGVAT PPIPKITIQI PKGTVMVGKP SSHSQYTSSG SVSSSGSKSH HSHSSSSSSS ASTSGKMKSS KSE GSSSSK LSSSMYSSQG SSGSSQSKNS SQSGGKPGSS PITKHGLSSG SSSTKMKPQG KPSSLMNPSL SKPNISPSHS RPPG GSDKL ASPMKPVPGT PPSSKAKSPI SSGSGGSHMS GTSSSSGMKS SSGLGSSGSL SQKTPPSSNS CTASSSSFSS SGSSM SSSQ NQHGSSKGKS PSRNKKPSLT AVIDKLKHGV VTSGPGGEDP LDGQMGVSTN SSSHPMSSKH NMSGGEFQGK REKSDK DKS KVSTSGSSVD SSKKTSESKN VGSTGVAKII ISKHDGGSPS IKAKVTLQKP GESSGEGLRP QMASSKNYGS PLISGST PK HERGSPSHSK SPAYTPQNLD SESESGSSIA EKSYQNSPSS DDGIRPLPEY STEKHKKHKK EKKKVKDKDR DRDRDKDR D KKKSHSIKPE SWSKSPISSD QSLSMTSNTI LSADRPSRLS PDFMIGEEDD DLMDVALIGN

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1

+
分子 #2: Unknown Chain

分子名称: Unknown Chain / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 1.720111 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)

+
分子 #3: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4
タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 29.781424 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MAASSSGEKE KERLGGGLGV AGGNSTRERL LSALEDLEVL SRELIEMLAI SRNQKLLQAG EENQVLELLI HRDGEFQELM KLALNQGKI HHEMQVLEKE VEKRDSDIQQ LQKQLKEAEQ ILATAVYQAK EKLKSIEKAR KGAISSEEII KYAHRISASN A VCAPLTWV ...文字列:
MAASSSGEKE KERLGGGLGV AGGNSTRERL LSALEDLEVL SRELIEMLAI SRNQKLLQAG EENQVLELLI HRDGEFQELM KLALNQGKI HHEMQVLEKE VEKRDSDIQQ LQKQLKEAEQ ILATAVYQAK EKLKSIEKAR KGAISSEEII KYAHRISASN A VCAPLTWV PGDPRRPYPT DLEMRSGLLG QMNNPSTNGV NGHLPGDALA AGRLPDVLAP QYPWQSNDMS MNMLPPNHSS DF LLEPPGH NKENEDDVEI MSTDSSSSSS ESD

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4

+
分子 #4: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6
タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 28.464627 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MAAVDIRDNL LGISWVDSSW IPILNSGSVL DYFSERSNPF YDRTCNNEVV KMQRLTLEHL NQMVGIEYIL LHAQEPILFI IRKQQRQSP AQVIPLADYY IIAGVIYQAP DLGSVINSRV LTAVHGIQSA FDEAMSYCRY HPSKGYWWHF KDHEEQDKVR P KAKRKEEP ...文字列:
MAAVDIRDNL LGISWVDSSW IPILNSGSVL DYFSERSNPF YDRTCNNEVV KMQRLTLEHL NQMVGIEYIL LHAQEPILFI IRKQQRQSP AQVIPLADYY IIAGVIYQAP DLGSVINSRV LTAVHGIQSA FDEAMSYCRY HPSKGYWWHF KDHEEQDKVR P KAKRKEEP SSIFQRQRVD ALLLDLRQKF PPKFVQLKPG EKPVPVDQTK KEAEPIPETV KPEEKETTKN VQQTVSAKGP PE KRMRLQ

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6

+
分子 #5: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7
タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 27.285281 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MGEPQQVSAL PPPPMQYIKE YTDENIQEGL APKPPPPIKD SYMMFGNQFQ CDDLIIRPLE SQGIERLHPM QFDHKKELRK LNMSILINF LDLLDILIRS PGSIKREEKL EDLKLLFVHV HHLINEYRPH QARETLRVMM EVQKRQRLET AERFQKHLER V IEMIQNCL ...文字列:
MGEPQQVSAL PPPPMQYIKE YTDENIQEGL APKPPPPIKD SYMMFGNQFQ CDDLIIRPLE SQGIERLHPM QFDHKKELRK LNMSILINF LDLLDILIRS PGSIKREEKL EDLKLLFVHV HHLINEYRPH QARETLRVMM EVQKRQRLET AERFQKHLER V IEMIQNCL ASLPDDLPHS EAGMRVKTEP MDADDSNNCT GQNEHQRENS GHRRDQIIEK DAALCVLIDE MNERP

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 7

+
分子 #6: Isoform 2 of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8

分子名称: Isoform 2 of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8
タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 29.112906 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MQREEKQLEA SLDALLSQVA DLKNSLGSFI CKLENEYGRL TWPSVLDSFA LLSGQLNTLN KVLKHEKTPL FRNQVIIPLV LSPDRDEDL MRQTEGRVPV FSHEVVPDHL RTKPDPEVEE QEKQLTTDAA RIGADAAQKQ IQSLNKMCSN LLEKISKEER E SESGGLRP ...文字列:
MQREEKQLEA SLDALLSQVA DLKNSLGSFI CKLENEYGRL TWPSVLDSFA LLSGQLNTLN KVLKHEKTPL FRNQVIIPLV LSPDRDEDL MRQTEGRVPV FSHEVVPDHL RTKPDPEVEE QEKQLTTDAA RIGADAAQKQ IQSLNKMCSN LLEKISKEER E SESGGLRP NKQTFNPTDT NALVAAVAFG KGLSNWRPSG SSGPGQAGQP GAGTILAGTS GLQQVQMAGA PSQQQPMLSG VQ MAQAGQP GKMPSGIKTN IKSASMHPYQ R

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8

+
分子 #7: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9
タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 16.42275 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列:
MASAGVAAGR QAEDVLPPTS DQPLPDTKPL PPPQPPPVPA PQPQQSPAPR PQSPARAREE ENYSFLPLVH NIIKCMDKDS PEVHQDLNA LKSKFQEMRK LISTMPGIHL SPEQQQQQLQ SLREQVRTKN ELLQKYKSLC MFEIPKE

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9

+
分子 #8: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 10

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 10
タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 15.710969 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列:
MAEKFDHLEE HLEKFVENIR QLGIIVSDFQ PSSQAGLNQK LNFIVTGLQD IDKCRQQLHD ITVPLEVFEY IDQGRNPQLY TKECLERAL AKNEQVKGKI DTMKKFKSLL IQELSKVFPE DMAKYRSIRG EDHPPS

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 10

+
分子 #9: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11
タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 13.145829 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列:
MATYSLANER LRALEDIERE IGAILQNAGT VILELSKEKT NERLLDRQAA AFTASVQHVE AELSAQIRYL TQVATGQPHE GSSYSSRKD CQMALKRVDY ARLKLSDVAR TCEQMLEN

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11

+
分子 #10: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14
タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 160.787594 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MAPVQLENHQ LVPPGGGGGG SGGPPSAPAP PPPGAAVAAA AAAAASPGYR LSTLIEFLLH RAYSELMVLT DLLPRKSDVE RKIEIVQFA SRTRQLFVRL LALVKWANNA GKVEKCAMIS SFLDQQAILF VDTADRLASL ARDALVHARL PSFAIPYAID V LTTGSYPR ...文字列:
MAPVQLENHQ LVPPGGGGGG SGGPPSAPAP PPPGAAVAAA AAAAASPGYR LSTLIEFLLH RAYSELMVLT DLLPRKSDVE RKIEIVQFA SRTRQLFVRL LALVKWANNA GKVEKCAMIS SFLDQQAILF VDTADRLASL ARDALVHARL PSFAIPYAID V LTTGSYPR LPTCIRDKII PPDPITKIEK QATLHQLNQI LRHRLVTTDL PPQLANLTVA NGRVKFRVEG EFEATLTVMG DD PDVPWRL LKLEILVEDK ETGDGRALVH SMQISFIHQL VQSRLFADEK PLQDMYNCLH SFCLSLQLEV LHSQTLMLIR ERW GDLVQV ERYHAGKCLS LSVWNQQVLG RKTGTASVHK VTIKIDENDV SKPLQIFHDP PLPASDSKLV ERAMKIDHLS IEKL LIDSV HARAHQKLQE LKAILRGFNA NENSSIETAL PALVVPILEP CGNSECLHIF VDLHSGMFQL MLYGLDQATL DDMEK SVND DMKRIIPWIQ QLKFWLGQQR CKQSIKHLPT ISSETLQLSN YSTHPIGNLS KNKLFIKLTR LPQYYIVVEM LEVPNK PTQ LSYKYYFMSV NAADREDSPA MALLLQQFKE NIQDLVFRTK TGKQTRTNAK RKLSDDPCPV ESKKTKRAGE MCAFNKV LA HFVAMCDTNM PFVGLRLELS NLEIPHQGVQ VEGDGFSHAI RLLKIPPCKG ITEETQKALD RSLLDCTFRL QGRNNRTW V AELVFANCPL NGTSTREQGP SRHVYLTYEN LLSEPVGGRK VVEMFLNDWN SIARLYECVL EFARSLPDIP AHLNIFSEV RVYNYRKLIL CYGTTKGSSI SIQWNSIHQK FHISLGTVGP NSGCSNCHNT ILHQLQEMFN KTPNVVQLLQ VLFDTQAPLN AINKLPTVP MLGLTQRTNT AYQCFSILPQ SSTHIRLAFR NMYCIDIYCR SRGVVAIRDG AYSLFDNSKL VEGFYPAPGL K TFLNMFVD SNQDARRRSV NEDDNPPSPI GGDMMDSLIS QLQPPPQQQP FPKQPGTSGA YPLTSPPTSY HSTVNQSPSM MH TQSPGNL HAASSPSGAL RAPSPASFVP TPPPSSHGIS IGPGASFASP HGTLDPSSPY TMVSPSGRAG NWPGSPQVSG PSP AARMPG MSPANPSLHS PVPDASHSPR AGTSSQTMPT NMPPPRKLPQ RSWAASIPTI LTHSALNILL LPSPTPGLVP GLAG SYLCS PLERFLGSVI MRRHLQRIIQ QETLQLINSN EPGVIMFKTD ALKCRVALSP KTNQTLQLKV TPENAGQWKP DELQV LEKF FETRVAGPPF KANTLIAFTK LLGAPTHILR DCVHIMKLEL FPDQATQLKW NVQFCLTIPP SAPPIAPPGT PAVVLK SKM LFFLQLTQKT SVPPQEPVSI IVPIIYDMAS GTTQQADIPR QQNSSVAAPM MVSNILKRFA EMNPPRQGEC TIFAAVR DL MANLTLPPGG RP

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 14

+
分子 #11: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15
タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 86.830102 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MDVSGQETDW RSTAFRQKLV SQIEDAMRKA GVAHSKSSKD MESHVFLKAK TRDEYLSLVA RLIIHFRDIH NKKSQASVSD PMNALQSLT GGPAAGAAGI GMPPRGPGQS LGGMGSLGAM GQPMSLSGQP PPGTSGMAPH SMAVVSTATP QTQLQLQQVA L QQQQQQQQ ...文字列:
MDVSGQETDW RSTAFRQKLV SQIEDAMRKA GVAHSKSSKD MESHVFLKAK TRDEYLSLVA RLIIHFRDIH NKKSQASVSD PMNALQSLT GGPAAGAAGI GMPPRGPGQS LGGMGSLGAM GQPMSLSGQP PPGTSGMAPH SMAVVSTATP QTQLQLQQVA L QQQQQQQQ FQQQQQAALQ QQQQQQQQQQ FQAQQSAMQQ QFQAVVQQQQ QLQQQQQQQQ HLIKLHHQNQ QQIQQQQQQL QR IAQLQLQ QQQQQQQQQQ QQQQQALQAQ PPIQQPPMQQ PQPPPSQALP QQLQQMHHTQ HHQPPPQPQQ PPVAQNQPSQ LPP QSQTQP LVSQAQALPG QMLYTQPPLK FVRAPMVVQQ PPVQPQVQQQ QTAVQTAQAA QMVAPGVQMI TEALAQGGMH IRAR FPPTT AVSAIPSSSI PLGRQPMAQV SQSSLPMLSS PSPGQQVQTP QSMPPPPQPS PQPGQPSSQP NSNVSSGPAP SPSSF LPSP SPQPSQSPVT ARTPQNFSVP SPGPLNTPVN PSSVMSPAGS SQAEEQQYLD KLKQLSKYIE PLRRMINKID KNEDRK KDL SKMKSLLDIL TDPSKRCPLK TLQKCEIALE KLKNDMAVPT PPPPPVPPTK QQYLCQPLLD AVLANIRSPV FNHSLYR TF VPAMTAIHGP PITAPVVCTR KRRLEDDERQ SIPSVLQGEV ARLDPKFLVN LDPSHCSNNG TVHLICKLDD KDLPSVPP L ELSVPADYPA QSPLWIDRQW QYDANPFLQS VHRCMTSRLL QLPDKHSVTA LLNTWAQSVH QACLSAA

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 15

+
分子 #12: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16
タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 96.908055 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MCDLRRPAAG GMMDLAYVCE WEKWSKSTHC PSVPLACAWS CRNLIAFTMD LRSDDQDLTR MIHILDTEHP WDLHSIPSEH HEAITCLEW DQSGSRLLSA DADGQIKCWS MADHLANSWE SSVGSLVEGD PIVALSWLHN GVKLALHVEK SGASSFGEKF S RVKFSPSL ...文字列:
MCDLRRPAAG GMMDLAYVCE WEKWSKSTHC PSVPLACAWS CRNLIAFTMD LRSDDQDLTR MIHILDTEHP WDLHSIPSEH HEAITCLEW DQSGSRLLSA DADGQIKCWS MADHLANSWE SSVGSLVEGD PIVALSWLHN GVKLALHVEK SGASSFGEKF S RVKFSPSL TLFGGKPMEG WIAVTVSGLV TVSLLKPSGQ VLTSTESLCR LRGRVALADI AFTGGGNIVV ATADGSSASP VQ FYKVCVS VVSEKCRIDT EILPSLFMRC TTDLNRKDKF PAITHLKFLA RDMSEQVLLC ASSQTSSIVE CWSLRKEGLP VNN IFQQIS PVVGDKQPTI LKWRILSATN DLDRVSAVAL PKLPISLTNT DLKVASDTQF YPGLGLALAF HDGSVHIVHR LSLQ TMAVF YSSAAPRPVD EPAMKRPRTA GPAVHLKAMQ LSWTSLALVG IDSHGKLSVL RLSPSMGHPL EVGLALRHLL FLLEY CMVT GYDWWDILLH VQPSMVQSLV EKLHEEYTRQ TAALQQVLST RILAMKASLC KLSPCTVTRV CDYHTKLFLI AISSTL KSL LRPHFLNTPD KSPGDRLTEI CTKITDVDID KVMINLKTEE FVLDMNTLQA LQQLLQWVGD FVLYLLASLP NQGSLLR PG HSFLRDGTSL GMLRELMVVI RIWGLLKPSC LPVYTATSDT QDSMSLLFRL LTKLWICCRD EGPASEPDEA LVDECCLL P SQLLIPSLDW LPASDGLVSR LQPKQPLRLQ FGRAPTLPGS AATLQLDGLA RAPGQPKIDH LRRLHLGACP TEECKACTR CGCVTMLKSP NRTTAVKQWE QRWIKNCLAV EGRGPDACVT SRASEEAPAF VQLGPQSTHH SPRTPRSLDH LHPEDRP

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16

+
分子 #13: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17
タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 72.984047 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MSGVRAVRIS IESACEKQVH EVGLDGTETY LPPLSMSQNL ARLAQRIDFS QGSGSEEEEA AGTEGDAQEW PGAGSSADQD DEEGVVKFQ PSLWPWDSVR NNLRSALTEM CVLYDVLSIV RDKKFMTLDP VSQDALPPKQ NPQTLQLISK KKSLAGAAQI L LKGAERLT ...文字列:
MSGVRAVRIS IESACEKQVH EVGLDGTETY LPPLSMSQNL ARLAQRIDFS QGSGSEEEEA AGTEGDAQEW PGAGSSADQD DEEGVVKFQ PSLWPWDSVR NNLRSALTEM CVLYDVLSIV RDKKFMTLDP VSQDALPPKQ NPQTLQLISK KKSLAGAAQI L LKGAERLT KSVTENQENK LQRDFNSELL RLRQHWKLRK VGDKILGDLS YRSAGSLFPH HGTFEVIKNT DLDLDKKIPE DY CPLDVQI PSDLEGSAYI KVSIQKQAPD IGDLGTVNLF KRPLPKSKPG SPHWQTKLEA AQNVLLCKEI FAQLSREAVQ IKS QVPHIV VKNQIISQPF PSLQLSISLC HSSNDKKSQK FATEKQCPED HLYVLEHNLH LLIREFHKQT LSSIMMPHPA SAPF GHKRM RLSGPQAFDK NEINSLQSSE GLLEKIIKQA KHIFLRSRAA ATIDSLASRI EDPQIQAHWS NINDVYESSV KVLIT SQGY EQICKSIQLQ LNIGVEQIRV VHRDGRVITL SYQEQELQDF LLSQMSQHQV HAVQQLAKVM GWQVLSFSNH VGLGPI ESI GNASAITVAS PSGDYAISVR NGPESGSKIM VQFPRNQCKD LPKSDVLQDN KWSHLRGPFK EVQWNKMEGR NFVYKME LL MSALSPCLL

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17

+
分子 #14: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18
タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 23.69373 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MEAPPVTMMP VTGGTINMME YLLQGSVLDH SLESLIHRLR GLCDNMEPET FLDHEMVFLL KGQQASPFVL RARRSMDRAG APWHLRYLG QPEMGDKNRH ALVRNCVDIA TSENLTDFLM EMGFRMDHEF VAKGHLFRKG IMKIMVYKIF RILVPGNTDS T EALSLSYL ...文字列:
MEAPPVTMMP VTGGTINMME YLLQGSVLDH SLESLIHRLR GLCDNMEPET FLDHEMVFLL KGQQASPFVL RARRSMDRAG APWHLRYLG QPEMGDKNRH ALVRNCVDIA TSENLTDFLM EMGFRMDHEF VAKGHLFRKG IMKIMVYKIF RILVPGNTDS T EALSLSYL VELSVVAPAG QDMVSDDMKN FAEQLKPLVH LEKIDPKRLM

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18

+
分子 #15: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19
タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 26.321146 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MENFTALFGA QADPPPPPTA LGFGPGKPPP PPPPPAGGGP GTAPPPTAAT APPGADKSGA GCGPFYLMRE LPGSTELTGS TNLITHYNL EQAYNKFCGK KVKEKLSNFL PDLPGMIDLP GSHDNSSLRS LIEKPPILSS SFNPITGTML AGFRLHTGPL P EQCRLMHI ...文字列:
MENFTALFGA QADPPPPPTA LGFGPGKPPP PPPPPAGGGP GTAPPPTAAT APPGADKSGA GCGPFYLMRE LPGSTELTGS TNLITHYNL EQAYNKFCGK KVKEKLSNFL PDLPGMIDLP GSHDNSSLRS LIEKPPILSS SFNPITGTML AGFRLHTGPL P EQCRLMHI QPPKKKNKHK HKQSRTQDPV PPETPSDSDH KKKKKKKEED PDRKRKKKEK KKKKNRHSPD HPGMGSSQAS SS SSLR

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 19

+
分子 #16: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20
タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 23.243762 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MGVTCVSQMP VAEGKSVQQT VELLTRKLEM LGAEKQGTFC VDCETYHTAA STLGSQGQTG KLMYVMHNSE YPLSCFALFE NGPCLIADT NFDVLMVKLK GFFQSAKASK IETRGTRYQY CDFLVKVGTV TMGPSARGIS VEVEYGPCVV ASDCWSLLLE F LQSFLGSH ...文字列:
MGVTCVSQMP VAEGKSVQQT VELLTRKLEM LGAEKQGTFC VDCETYHTAA STLGSQGQTG KLMYVMHNSE YPLSCFALFE NGPCLIADT NFDVLMVKLK GFFQSAKASK IETRGTRYQY CDFLVKVGTV TMGPSARGIS VEVEYGPCVV ASDCWSLLLE F LQSFLGSH TPGAPAVFGN RHDAVYGPAD TMVQYMELFN KIRKQQQVPV AGIR

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20

+
分子 #17: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21
タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 15.575234 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列:
MADRLTQLQD AVNSLADQFC NAIGVLQQCG PPASFNNIQT AINKDQPANP TEEYAQLFAA LIARTAKDID VLIDSLPSEE STAALQAAS LYKLEEENHE AATCLEDVVY RGDMLLEKIQ SALADIAQSQ LKTRSGTHSQ SLPDS

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21

+
分子 #18: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22
タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 22.243713 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MAQQRALPQS KETLLQSYNK RLKDDIKSIM DNFTEIIKTA KIEDETQVSR ATQGEQDNYE MHVRAANIVR AGESLMKLVS DLKQFLILN DFPSVNEAID QRNQQLRTLQ EECDRKLITL RDEISIDLYE LEEEYYSSSS SLCEANDLPL CEAYGRLDLD T DSADGLSA ...文字列:
MAQQRALPQS KETLLQSYNK RLKDDIKSIM DNFTEIIKTA KIEDETQVSR ATQGEQDNYE MHVRAANIVR AGESLMKLVS DLKQFLILN DFPSVNEAID QRNQQLRTLQ EECDRKLITL RDEISIDLYE LEEEYYSSSS SLCEANDLPL CEAYGRLDLD T DSADGLSA PLLASPEPSA GPLQVAAPAH SHAGGPGPTE HA

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22

+
分子 #19: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23
タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 156.652156 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: METQLQSIFE EVVKTEVIEE AFPGMFMDTP EDEKTKLISC LGAFRQFWGG LSQESHEQCI QWIVKFIHGQ HSPKRISFLY DCLAMAVET GLLPPRLVCE SLINSDTLEW ERTQLWALTF KLVRKIIGGV DYKGVRDLLK VILEKILTIP NTVSSAVVQQ L LAAREVIA ...文字列:
METQLQSIFE EVVKTEVIEE AFPGMFMDTP EDEKTKLISC LGAFRQFWGG LSQESHEQCI QWIVKFIHGQ HSPKRISFLY DCLAMAVET GLLPPRLVCE SLINSDTLEW ERTQLWALTF KLVRKIIGGV DYKGVRDLLK VILEKILTIP NTVSSAVVQQ L LAAREVIA YILERNACLL PAYFAVTEIR KLYPEGKLPH WLLGNLVSDF VDTFRPTARI NSICGRCSLL PVVNNSGAIC NS WKLDPAT LRFPLKGLLP YDKDLFEPQT ALLRYVLEQP YSRDMVCNML GLNKQHKQRC PVLEDQLVDL VVYAMERSET EEK FDDGGT SQLLWQHLSS QLIFFVLFQF ASFPHMVLSL HQKLAGRGLI KGRDHLMWVL LQFISGSIQK NALADFLPVM KLFD LLYPE KEYIPVPDIN KPQSTHAFAM TCIWIHLNRK AQNDNSKLQI PIPHSLRLHH EFLQQSLRNK SLQMNDYKIA LLCNA YSTN SECFTLPMGA LVETIYGNGI MRIPLPGTNC MASGSITPLP MNLLDSLTVH AKMSLIHSIA TRVIKLAHAK SSVALA PAL VETYSRLLVY MEIESLGIKG FISQLLPTVF KSHAWGILHT LLEMFSYRMH HIQPHYRVQL LSHLHTLAAV AQTNQNQ LH LCVESTALRL ITALGSSEVQ PQFTRFLSDP KTVLSAESEE LNRALILTLA RATHVTDFFT GSDSIQGTWC KDILQTIM S FTPHNWASHT LSCFPGPLQA FFKQNNVPQE SRFNLKKNVE EEYRKWKSMS NENDIITHFS MQGSPPLFLC LLWKMLLET DHINQIGYRV LERIGARALV AHVRTFADFL VYEFSTSAGG QQLNKCIEIL NDMVWKYNIV TLDRLILCLA MRSHEGNEAQ VCYFIIQLL LLKPNDFRNR VSDFVKENSP EHWLQNDWHT KHMNYHKKYP EKLYFEGLAE QVDPPVQIQS PYLPIYFGNV C LRFLPVFD IVIHRFLELL PVSKSLETLL DHLGGLYKFH DRPVTYLYNT LHYYEMHLRD RAFLKRKLVH AIIGSLKDNR PQ GWCLSDT YLKCAMNARE ENPWVPDDTY YCRLIGRLVD TMAGKSPGPF PNCDWRFNEF PNPAAHALHV TCVELMALAV SGK EVGNAL LNVVLKSQPL VPRENITAWM NAIGLIITAL PEPYWIVLHD RIVSVISSPS LTSETEWVGY PFRLFDFTAC HQSY SEMSC SYTLALAHAV WHHSSIGQLS LIPKFLTEVL LPIVKTEFQL LYVYHLVGPF LQRFQQERTR CMIEIGVAFY DMLLN VDQC STHLNYMDPI CDFLYHMKYM FTGDSVKEQV EKIICNLKPA LKLRLRFITH ISKMEPAAVP PQAMNSGSPA PQSNQV PVS LPVTQ

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23

+
分子 #20: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 24

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 24
タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 110.430164 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MKVVNLKQAI LQAWKERWSD YQWAINMKKF FPKGATWDIL NLADALLEQA MIGPSPNPLI LSYLKYAISS QMVSYSSVLT AISKFDDFS RDLCVQALLD IMDMFCDRLS CHGKAEECIG LCRALLSALH WLLRCTAASA ERLREGLEAG TPAAGEKQLA M CLQRLEKT ...文字列:
MKVVNLKQAI LQAWKERWSD YQWAINMKKF FPKGATWDIL NLADALLEQA MIGPSPNPLI LSYLKYAISS QMVSYSSVLT AISKFDDFS RDLCVQALLD IMDMFCDRLS CHGKAEECIG LCRALLSALH WLLRCTAASA ERLREGLEAG TPAAGEKQLA M CLQRLEKT LSSTKNRALL HIAKLEEASS WTAIEHSLLK LGEILANLSN PQLRSQAEQC GTLIRSIPTM LSVHAEQMHK TG FPTVHAV ILLEGTMNLT GETQSLVEQL TMVKRMQHIP TPLFVLEIWK ACFVGLIESP EGTEELKWTA FTFLKIPQVL VKL KKYSHG DKDFTEDVNC AFEFLLKLTP LLDKADQRCN CDCTNFLLQE CGKQGLLSEA SVNNLMAKRK ADREHAPQQK SGEN ANIQP NIQLILRAEP TVTNILKTMD ADHSKSPEGL LGVLGHMLSG KSLDLLLAAA AATGKLKSFA RKFINLNEFT TYGSE ESTK PASVRALLFD ISFLMLCHVA QTYGSEVILS ESRTGAEVPF FETWMQTCMP EEGKILNPDH PCFRPDSTKV ESLVAL LNN SSEMKLVQMK WHEACLSISA AILEILNAWE NGVLAFESIQ KITDNIKGKV CSLAVCAVAW LVAHVRMLGL DEREKSL QM IRQLAGPLFS ENTLQFYNER VVIMNSILER MCADVLQQTA TQIKFPSTGV DTMPYWNLLP PKRPIKEVLT DIFAKVLE K GWVDSRSIHI FDTLLHMGGV YWFCNNLIKE LLKETRKEHT LRAVELLYSI FCLDMQQVTL VLLGHILPGL LTDSSKWHS LMDPPGTALA KLAVWCALSS YSSHKGQAST RQKKRHREDI EDYISLFPLD DVQPSKLMRL LSSNEDDANI LSSPTDRSMS SSLSASQLH TVNMRDPLNR VLANLFLLIS SILGSRTAGP HTQFVQWFME ECVDCLEQGG RGSVLQFMPF TTVSELVKVS A MSSPKVVL AITDLSLPLG RQVAAKAIAA L

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 24

+
分子 #21: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 26

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 26
タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 65.544438 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MTAAPASPQQ IRDRLLQAID PQSNIRNMVA VLEVISSLEK YPITKEALEE TRLGKLINDV RKKTKNEELA KRAKKLLRSW QKLIEPAHQ HEAALRGLAG ATGSANGGAH NCRPEVGAAG PPRSIHDLKS RNDLQRLPGQ RLDRLGSRKR RGDQRDLGHP G PPPKVSKA ...文字列:
MTAAPASPQQ IRDRLLQAID PQSNIRNMVA VLEVISSLEK YPITKEALEE TRLGKLINDV RKKTKNEELA KRAKKLLRSW QKLIEPAHQ HEAALRGLAG ATGSANGGAH NCRPEVGAAG PPRSIHDLKS RNDLQRLPGQ RLDRLGSRKR RGDQRDLGHP G PPPKVSKA SHDPLVPNSS PLPTNGISGS PESFASSLDG SGHAGPEGSR LERDENDKHS GKIPVNAVRP HTSSPGLGKP PG PCLQPKA SVLQQLDRVD ETPGPPHPKG PPRCSFSPRN SRHEGSFARQ QSLYAPKGSV PSPSPRPQAL DATQVPSPLP LAQ PSTPPV RRLELLPSAE SPVCWLEQPE SHQRLAGPGC KAGLSPAEPL LSRAGFSPDS SKADSDAASS GGSDSKKKKR YRPR DYTVN LDGQVAEAGV KPVRLKERKL TFDPMTRQIK PLTQKEPVRA DSPVHMEQQS RTELDKQEAK ASLQSPFEQT NWKEL SRNE IIQSYLSRQS SLLSSSGAQT PGAHHFMSEY LKQEESTRQG ARQLHVLVPQ SPPTDLPGLT REVTQDDLDR IQASQW PGV NGCQDTQGNW YDWTQCISLD PHGDDGRLNI LPYVCLD

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 26

+
分子 #22: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27
タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 35.478742 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MADVINVSVN LEAFSQAISA IQALRSSVSR VFDCLKDGMR NKETLEGREK AFIAHFQDNL HSVNRDLNEL ERLSNLVGKP SENHPLHNS GLLSLDPVQD KTPLYSQLLQ AYKWSNKLQY HAGLASGLLN QQSLKRSANQ MGVSAKRRPK AQPTTLVLPP Q YVDDVISR ...文字列:
MADVINVSVN LEAFSQAISA IQALRSSVSR VFDCLKDGMR NKETLEGREK AFIAHFQDNL HSVNRDLNEL ERLSNLVGKP SENHPLHNS GLLSLDPVQD KTPLYSQLLQ AYKWSNKLQY HAGLASGLLN QQSLKRSANQ MGVSAKRRPK AQPTTLVLPP Q YVDDVISR IDRMFPEMSI HLSRPNGTSA MLLVTLGKVL KVIVVMRSLF IDRTIVKGYN ENVYTEDGKL DIWSKSNYQV FQ KVTDHAT TALLHYQLPQ MPDVVVRSFM TWLRSYIKLF QAPCQRCGKF LQDGLPPTWR DFRTLEAFHD TCRQ

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27

+
分子 #23: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28
タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 19.540107 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列:
MAAPLGGMFS GQPPGPPQAP PGLPGQASLL QAAPGAPRPS SSTLVDELES SFEACFASLV SQDYVNGTDQ EEIRTGVDQC IQKFLDIAR QTECFFLQKR LQLSVQKPEQ VIKEDVSELR NELQRKDALV QKHLTKLRHW QQVLEDINVQ HKKPADIPQG S LAYLEQAS ANIPAPLKPT

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28

+
分子 #24: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29
タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 21.089801 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列: MAASQQQASA ASSAAGVSGP SSAGGPGPQQ QPQPPAQLVG PAQSGLLQQQ QQDFDPVQRY KMLIPQLKES LQTLMKVAAQ NLIQNTNID NGQKSSDGPI QRFDKCLEEF YALCDQLELC LRLAHECLSQ SCDSAKHSPT LVPTATKPDA VQPDSLPYPQ Y LAVIKAQI ...文字列:
MAASQQQASA ASSAAGVSGP SSAGGPGPQQ QPQPPAQLVG PAQSGLLQQQ QQDFDPVQRY KMLIPQLKES LQTLMKVAAQ NLIQNTNID NGQKSSDGPI QRFDKCLEEF YALCDQLELC LRLAHECLSQ SCDSAKHSPT LVPTATKPDA VQPDSLPYPQ Y LAVIKAQI SCAKDIHTAL LDCANKVTGK TPAPPAGPGG TL

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29

+
分子 #25: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30
タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 20.301229 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列:
MSTPPLAASG MAPGPFAGPQ AQQAAREVNT ASLCRIGQET VQDIVYRTME IFQLLRNMQL PNGVTYHTGT YQDRLTKLQD NLRQLSVLF RKLRLVYDKC NENCGGMDPI PVEQLIPYVE EDGSKNDDRA GPPRFASEER REIAEVNKKL KQKNQQLKQI M DQLRNLIW DINAMLAMRN

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30

+
分子 #26: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31

分子名称: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31
タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Homo sapiens (ヒト)
分子量理論値: 15.826116 KDa
組換発現生物種: Homo sapiens (ヒト)
配列文字列:
MAAAVAMETD DAGNRLRFQL ELEFVQCLAN PNYLNFLAQR GYFKDKAFVN YLKYLLYWKD PEYAKYLKYP QCLHMLELLQ YEHFRKELV NAQCAKFIDE QQILHWQHYS RKRMRLQQAL AEQQQQNNTS GK

UniProtKB: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31

+
分子 #27: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 27 / コピー数: 1 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 8
グリッドモデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: GOLD / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: HOLEY
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

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電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
特殊光学系エネルギーフィルター - スリット幅: 20 eV
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: SUPER-RESOLUTION / 平均電子線量: 50.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系C2レンズ絞り径: 70.0 µm / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD / Cs: 2.7 mm
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

初期モデルモデルのタイプ: OTHER
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 4.4 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 62871
初期 角度割当タイプ: OTHER
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD

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原子モデル構築 1

精密化空間: REAL / プロトコル: RIGID BODY FIT
得られたモデル

PDB-7enj:
Human Mediator (deletion of MED1-IDR) in a Tail-bent conformation (MED-B)

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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