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- EMDB-11902: Staphylococcus aureus 70S after 30 minutes incubation at 37C -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-11902
タイトルStaphylococcus aureus 70S after 30 minutes incubation at 37C
マップデータ
試料
  • 複合体: 70S
    • RNA: x 3種
    • タンパク質・ペプチド: x 44種
キーワードRibosome / H68 / translation / protein synthesis
機能・相同性
機能・相同性情報


large ribosomal subunit / small ribosomal subunit / ribosomal large subunit assembly / tRNA binding / rRNA binding / ribosome / structural constituent of ribosome / ribonucleoprotein complex / translation / mRNA binding ...large ribosomal subunit / small ribosomal subunit / ribosomal large subunit assembly / tRNA binding / rRNA binding / ribosome / structural constituent of ribosome / ribonucleoprotein complex / translation / mRNA binding / zinc ion binding / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Ribosomal protein L31 type B / Type-1 KH domain profile. / : / Ribosomal protein S14, type Z / Ribosomal protein L31 signature. / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L31 superfamily / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L16 signature 1. / : ...Ribosomal protein L31 type B / Type-1 KH domain profile. / : / Ribosomal protein S14, type Z / Ribosomal protein L31 signature. / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L31 superfamily / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L16 signature 1. / : / Ribosomal protein L6, conserved site / Ribosomal protein L6 signature 1. / Ribosomal protein L16, conserved site / Ribosomal protein L16 signature 2. / Ribosomal protein L17 signature. / Ribosomal protein L36 signature. / Ribosomal protein L28/L24 superfamily / : / : / Ribosomal protein L28 / Ribosomal protein L33, conserved site / Ribosomal protein L33 signature. / Ribosomal protein L5, bacterial-type / Ribosomal protein L6, bacterial-type / Ribosomal protein S14/S29 / Ribosomal protein S3, bacterial-type / Ribosomal protein S6, conserved site / Ribosomal protein S6 signature. / Ribosomal protein S19, bacterial-type / Ribosomal protein S13, bacterial-type / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L36 superfamily / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein S7, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein S11, bacterial-type / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein S20 superfamily / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein L20 signature. / Ribosomal protein S9, bacterial/plastid / Ribosomal protein L27, conserved site / Ribosomal protein L27 signature. / Ribosomal protein S4, bacterial-type / 30S ribosomal protein S17 / Ribosomal protein S5, bacterial-type / Ribosomal protein L14P, bacterial-type / Ribosomal protein S6, plastid/chloroplast / Ribosomal protein L34, conserved site / Ribosomal L28 family / Ribosomal protein L34 signature. / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein L28/L24 / Ribosomal protein L33 superfamily / Ribosomal protein L30, bacterial-type / Ribosomal protein S18, conserved site / Ribosomal protein S18 signature. / Ribosomal protein L16 / L28p-like / Ribosomal protein L20 / Ribosomal protein S15, bacterial-type / Ribosomal protein L20 / Ribosomal protein L20, C-terminal / Ribosomal protein L21 / Ribosomal protein L27 / Ribosomal L27 protein / Ribosomal protein S6 / Ribosomal protein S6 / Ribosomal proteins 50S L24/mitochondrial 39S L24 / Ribosomal protein L17 / Ribosomal protein L17 superfamily / Ribosomal protein L17 / Ribosomal protein S6 superfamily / Ribosomal protein L21-like / L21-like superfamily / Ribosomal prokaryotic L21 protein / Ribosomal protein S12, bacterial-type / Ribosomal protein L24 / Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 / Ribosomal protein L13, bacterial-type / Ribosomal protein L3, bacterial/organelle-type / Ribosomal protein S18 / Ribosomal protein S18 / Ribosomal protein L15, bacterial-type / Ribosomal protein S18 superfamily / 50S ribosomal protein uL4 / K Homology domain / K homology RNA-binding domain / Ribosomal protein L34 / Ribosomal protein L34 / Ribosomal protein S3, conserved site / Ribosomal protein S3 signature. / Ribosomal protein S14, conserved site / Ribosomal protein S14 signature. / Ribosomal protein L5, conserved site / Ribosomal protein L5 signature. / KH domain / Type-2 KH domain profile. / K Homology domain, type 2 / Ribosomal protein S3, C-terminal
類似検索 - ドメイン・相同性
Large ribosomal subunit protein bL17 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein bL36 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Large ribosomal subunit protein bL27 / Large ribosomal subunit protein bL28 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Small ribosomal subunit protein bS18 ...Large ribosomal subunit protein bL17 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein bL36 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Large ribosomal subunit protein bL27 / Large ribosomal subunit protein bL28 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Small ribosomal subunit protein bS18 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Large ribosomal subunit protein bL33 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein bL20 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Small ribosomal subunit protein uS9 / : / : / : / : / : / : / : / Large ribosomal subunit protein bL21 / Small ribosomal subunit protein bS6 / Large ribosomal subunit protein bL34 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Large ribosomal subunit protein bL31B / Large ribosomal subunit protein uL23 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Small ribosomal subunit protein uS5 / Large ribosomal subunit protein uL13 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Small ribosomal subunit protein bS20
類似検索 - 構成要素
生物種Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.11 Å
データ登録者Cimicata G / Bashan A / Yonath A
資金援助1件
OrganizationGrant number国
European Research Council (ERC)322581
引用ジャーナル: To Be Published
タイトル: Staphylococcus aureus 70S after 30 minutes incubation a 37C
著者: Cimicata G / Bashan A / Yonath A
履歴
登録2020年10月27日-
ヘッダ(付随情報) 公開2021年11月17日-
マップ公開2021年11月17日-
更新2024年10月23日-
現状2024年10月23日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.0052
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.0052
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-7aso
  • 表面レベル: 0.0052
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_11902.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_11902.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 282.6 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
0.86 Å/pix.
x 420 pix.
= 361.2 Å		0.86 Å/pix.
x 420 pix.
= 361.2 Å		0.86 Å/pix.
x 420 pix.
= 361.2 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 0.86 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.0052 / ムービー #1: 0.0052
最小 - 最大-0.015758734 - 0.03910529
平均 (標準偏差)0.0002529819 (±0.0021330114)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ420420420
Spacing420420420
セルA=B=C: 361.2 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z0.860.860.86
M x/y/z420420420
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z361.200361.200361.200
α/β/γ90.00090.00090.000
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS420420420
D min/max/mean-0.0160.0390.000

-
添付データ

-
追加マップ: #1

ファイルemd_11902_additional_1.map
投影像・断面図
軸ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

-
試料の構成要素

+
全体 : 70S

全体名称: 70S
要素
  • 複合体: 70S
    • RNA: 5S
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S3
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S4
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S5
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S6
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S7
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S8
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S9
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S10
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S11
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S12
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S13
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S14 type Z
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S15
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S16
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S17
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S18
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S19
    • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S20
    • RNA: 16S
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L4
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L5
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L6
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L13
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L14
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L15
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L16
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L17
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L18
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L20
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L21
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L22
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L23
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L24
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L25
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L27
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L28
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L29
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L30
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomalprotein L32p
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L33
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L34
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L35
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L36
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L31 type B
    • RNA: 23S

+
超分子 #1: 70S

超分子名称: 70S / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#47
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)

+
分子 #1: 5S

分子名称: 5S / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 36.692801 KDa
配列文字列:
UCUGGUGACU AUAGCAAGGA GGUCACACCU GUUCCCAUGC CGAACACAGA AGUUAAGGUC UUUAGCGACG AUGGUAGCCA ACUUACGUU CCGCUAGAGU AGAACGUUGC CAGGC

+
分子 #20: 16S

分子名称: 16S / タイプ: rna / ID: 20
詳細: ...詳細: UUUAUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAUACAUGCAAGUCGAGCGAACGGACGAGAAGCUUGCUUCUCUGAUGUUAGCGGCGGACGGGUGAGUAACACGUGGAUAACCUACCUAUAAGACUGGGAUAACUUCGGGAAACCGGAGCUAAUACCGGAUAAUAUUUUGAACCGCAUGGUUCAAAAGUGAAAGACGGUCUUGCUGUCACUUAUAGAUGGAUCCGCGCUGCAUUAGCUAGUUGGUAAGGUAACGGCUUACCAAGGCAACGAUACGUAGCCGACCUGAGAGGGUGAUCGGCCACACUGGAACUGAGACACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUAGGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCAACGCCGCGUGAGUGAUGAAGGUCUUCGGAUCGUAAAACUCUGUUAUUAGGGAAGAACAUAUGUGUAAGUAACUGUGCACAUCUUGACGGUACCUAAUCAGAAAGCCACGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAGGUGGCAAGCGUUAUCCGGAAUUAUUGGGCGUAAAGCGCGCGUAGGCGGUUUUUUAAGUCUGAUGUGAAAGCCCACGGCUCAACCGUGGAGGGUCAUUGGAAACUGGAAAACUUGAGUGCAGAAGAGGAAAGUGGAAUUCCAUGUGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAGAUAUGGAGGAACACCAGUGGCGAAGGCGACUUUCUGGUCUGUAACUGACGCUGAUGUGCGAAAGCGUGGGGAUCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGAGUGCUAAGUGUUAGGGGGUUUCCGCCCCUUAGUGCUGCAGCUAACGCAUUAAGCACUCCGCCUGGGGAGUACGACCGCAAGGUUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGACCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAAAUCUUGACAUCCUUUGACAACUCUAGAGAUAGAGCCUUCCCCUUCGGGGGACAAAGUGACAGGUGGUGCAUGGUUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAAGCUUAGUUGCCAUCAUUAAGUUGGGCACUCUAAGUUGACUGCCGGUGACAAACCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAAUCAUCAUGCCCCUUAUGAUUUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGACAAUACAAAGGGCAGCGAAACCGCGAGGUCAAGCAAAUCCCAUAAAGUUGUUCUCAGUUCGGAUUGUAGUCUGCAACUCGACUACAUGAAGCUGGAAUCGCUAGUAAUCGUAGAUCAGCAUGCUACGGUGAAUACGUUCCCGGGUAUUGUACACACCGCCCGUCACACCACGAGAGUUUGUAACACCCGAAGCCGGUGGAGUAACCUUUUAGGAGCUAGCCGUCGAAGGUGGGACAAAUGAUUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAUCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU
コピー数: 1
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 458.188688 KDa
配列文字列: AUGGAGAGUU UGAUCCUGGC UCAGGAUGAA CGCUGGCGGC GUGCCUAAUA CAUGCAAGUC GAGCGAACGU UAGCGGCGGA CGGGUGAGU AACACGUGGA UAACCUACCU AUAAGACUGG GAUAACUUCG GGAAACCGUA GCUAAUACCG GAUAAUAUAG U GAAAGACA ...文字列:
AUGGAGAGUU UGAUCCUGGC UCAGGAUGAA CGCUGGCGGC GUGCCUAAUA CAUGCAAGUC GAGCGAACGU UAGCGGCGGA CGGGUGAGU AACACGUGGA UAACCUACCU AUAAGACUGG GAUAACUUCG GGAAACCGUA GCUAAUACCG GAUAAUAUAG U GAAAGACA CUUAUAGAUG GAUCCGCGCU GCAUUAGCUA GUUGGUAAGG UAACGGCUUA CCAAGGCAAC GAUGCAUAGC CG ACCUGAG AGGGUGAUCG GCCACACUGG AACUGAGACA CGGUCCAGAC UCCUACGGGA GGCAGCAGUA GGGAAUCUUC CGC AAUGGG CGAAAGCCUG ACGGAGCAAC GCCGCGUGAG UGAUGAAGGU CUAUCGUAAA ACUCUGUUAU UAGGGAGAAC AUAU GUCAC AUCUUGACGU ACCUAAUCAG AAAGCCACGG CUAACUACGU GCCAGCAGCC GCGGUAAUAC GUAGGUGGCA AGCGU UAUC CGGAAUUAUU GGGCGUAAAG CGCGCGUAGG CGGUUUUUUA AGUCUGAUGU GAAAGCCCAC GGCUCAACCG UGGAGG GUC AUUGGAAACU GGAAAACUUG AGUGCAGAAG AGGAAAGUGG AAUUCCAUGU GUAGCGGUGA AAUGCGCGAG AUAUGGA GG AACACCAGUG GCGAAGGCGA CUUUCUGGUC UGUAACUGAC GCUGAUGUGC GAAAGCGUGG GGAUCAAACA GGAUUAGA U ACCCUGGUAG UCCACGCCGU AAACGAUGAG UGCUAAGUGU UAGGGGGUGC CCCUUAGUGC UGCAGCUAAC GCAUUAAGC ACUCCGCCUG GGGAGUACGA CCGCAAGGUU GAAACUCAAA GGAAUUGACG GGGACCCGCA CAAGCGGUGG AGCAUGUGGU UUAAUUCGA AGCAACGCGA AGAACCUUAC CAAAUCUUGA CAUCACAAAG UGACAGGUGG UGCAUGGUUG UCGUCAGCUC G UGUCGUGA GAUGUUGGGU UAAGUCCCGC AACGAGCGCA ACCCUUAAGC UUAGUUGCCA UCAUUAAGUU GGGCACUCUA AG UUGACUG CCGGUGACAA ACCGGAGGAA GGUGGGGAUG ACGUCAAAUC AUCAUGCCCC UUAUGAUUUG GGCUACACAC GUG CUACAA UGGACAAUAC AAAGGGCAGC GAAACCGCGA GGUCAAGCAA UCCCAUAAAG UUGUUCUCAG UUCGGAUUGU AGUC UGCAA CUCGACUACA UGAAGCUGGA AUCGCUAGUA AUCGUAGAUC AGCAUGCUAC GGUGAAUACG UUCCCGGGUC UUGUA CACA CCGCCCGUCA CACCACGAGG UUUGUAACAC CCGAAGCCGG UGGAGUAACC UUUUAGGAGC UAGCCGUCGA AGGUGG GAC AAAUGGGGGU GAAGUCGUAA CAAGGUAGCC GUAUCGGAAG GUGCGGCUGG AU

+
分子 #47: 23S

分子名称: 23S / タイプ: rna / ID: 47
詳細: GAUUAAGUUAUUAAGGGCGCACGGUGGAUGCCUUGGCACUAGAAGCCGAUGAAGGACGUUACUAACGACGAUAUGCUUUGGGGAGCUGUAAGCUUUGAUCCAGAGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGCAUGAGUUA ...詳細: GAUUAAGUUAUUAAGGGCGCACGGUGGAUGCCUUGGCACUAGAAGCCGAUGAAGGACGUUACUAACGACGAUAUGCUUUGGGGAGCUGUAAGCUUUGAUCCAGAGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGCAUGAGUUA UGUCAUGUUAUCGAUAUGUGAAUACAUAGCAUAUCAGAAGGCACACCCGGAGAACUGAAACAUCUUAGUA CCCGGAGGAAGAGAAAGAAAAUUCGAUUCCCUUAGUAGCGGCGAGCGAAACGGGAAGAGCCCAAACCAAC AAGCUUGCUUGUUGGGGUUGUAGGACACUCUGUACGGAGUUACAAAGGACGACAUUAGACGAAUCAUCUG GAAAGAUGAAUCAAAGAAGGUAAUAAUCCUGUAGUCGAAAAUGUUGUCUCUCUUGAGUGGAUCCUGAGUA CGACGGAGCACGUGAAAUUCCGUCGGAAUCUGGGAGGACCAUCUCCUAAGGCUAAAUACUCUCUAGUGAC CGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGCACCCCGGAAGGGGAGUGAAAUAGAACCUGAAA CCGUGUGCUUACAAGUAGUCAGAGCCCGUUAAUGGGUGAUGGCGUGCCUUUUGUAGAAUGAACCGGCGAG UUACGAUUUGAUGCAAGGUUAAGCAGUAAAUGUGGAGCCGUAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGUUUA GUAUUUGGUCGUAGACCCGAAACCAGGUGAUCUACCCUUGGUCAGGUUGAAGUUCAGGUAACACUGAAUG GAGGACCGAACCGACUUACGUUGAAAAGUGAGCGGAUGAACUGAGGGUAGCGGAGAAAUUCCAAUCGAAC CUGGAGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGCUUUAGGGCUAGCCUCAAGUGAUGAUUAUUGGAGGUAGAGC ACUGUUUGGACGAGGGGCCCCUCUCGGGUUACCGAAUUCAGACAAACUCCGAAUGCCAAUUAAUUUAACU UGGGAGUCAGAACAUGGGUGAUAAGGUCCGUGUUCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCACCAGCUAAGGUCC CAAAAUAUAUGUUAAGUGGAAAAGGAUGUGGCGUUGCCCAGACAACUAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCC AUCAUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUAGUCGAGUGACACUGCGCCGAAAAUGUACCGGGGCUAAACA UAUUACCGAAGCUGUGGAUUGUCCUUUGGACAAUGGUAGGAGAGCGUUCUAAGGGCGUUGAAGCAUGAUC GUAAGGACAUGUGGAGCGCUUAGAAGUGAGAAUGCCGGUGUGAGUAGCGAAAGACGGGUGAGAAUCCCGU CCACCGAUUGACUAAGGUUUCCAGAGGAAGGCUCGUCCGCUCUGGGUUAGUCGGGUCCUAAGCUGAGGCC GACAGGCGUAGGCGAUGGAUAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCACCUAUAAUCGUUUUAAUCGAUGGGGGG ACGCAGUAGGAUAGGCGAAGCGUGCGAUUGGAUUGCACGUCUAAGCAGUAAGGCUGAGUAUUAGGCAAAU CCGGUACUCGUUAAGGCUGAGCUGUGAUGGGGAGAAGACAUUGAGUCUUCGAGUCGUUGAUUUCACACUG CCGAGAAAAGCCUCUAGAUAGAAAAUAGGUGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGUCAAGAUGAGAAU UCUAAGGUGAGCGAGCGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGGUAACUUCGGGAGAAGGGGU GCUCUUUAGGGUUAACGCCCAGAAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAAGCGACUGUUUAUCAAAAACACAGG UCUCUGCUAAACCGUAAGGUGAUGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGUGG UUAGCUUCUGCGAAGCUACGAAUCGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAG CGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGUAACGAUUUGGGCACUGUCUCAACGAGA GACUCGGUGAAAUCAUAGUACCUGUGAAGAUGCAGGUUACCCGCGACAGGACGGAAAGACCCCGUGGAGC UUUACUGUAGCCUGAUAUUGAAAUUCGGCACAGCUUGUACAGGAUAGGUAGGAGCCUUUGAAACGUGAGC GCUAGCUUACGUGGAGGCGCUGGUGGGAUACUACCCUAGCUGUGUUGGCUUUCUAACCCGCACCACUUAU CGUGGUGGGAGACAGUGUCAAGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGC UCAAAGGUUCCCUCAGAAUGGUUGGAAAUCAUUCAUAGAGUGUAAAGGCAUAAGGGAGCUUGACUGCGAG ACCUACAAGUCGAGCAGGGUCGAAAGACGGACUUAGUGAUCCGGUGGUUCCGCAUGGAAGGGCCAUCGCU CAACGGAUAAAAGCUACCCCGGGGAUAACAGGCUUAUCUCCCCCAAGAGUUCACAUCGACGGGGAGGUUU GGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGUAGUCGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUU AAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCGUCGUGGGCGUAGGAA AUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACAUACCUCUGGUGUACCAGUUGUCGUGC CAACGGCAUAGCUGGGUAGCUAUGUGUGGACGGGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCAUGAAGCCCCCCU CAAGAUGAGAUUUCCCAACUUCGGUUAUAAGAUCCCUCAAAGAUGAUGAGGUUAAUAGGUUCGAGGUGGA AGCAUGGUGACAUGUGGAGCUGACGAAUACUAAUCGAUCGAAGACUUAAUCAA
コピー数: 1
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 881.281938 KDa
配列文字列: UUAAGUUAUU AAGGGCGCAC GGUGGAUGCC UUGGCACUAG AAGCCAAUGA AGGACGUUAC UAACGACGAU AUGCUUUGGG GAGCUGUAA GUAAGCUUUG AUCCAGAGAU UUCCGAAUGG GGAAACCCAG CAUGAGUUAU GUCAUGUUAU CGAUAUGUGA A UACAUAGC ...文字列:
UUAAGUUAUU AAGGGCGCAC GGUGGAUGCC UUGGCACUAG AAGCCAAUGA AGGACGUUAC UAACGACGAU AUGCUUUGGG GAGCUGUAA GUAAGCUUUG AUCCAGAGAU UUCCGAAUGG GGAAACCCAG CAUGAGUUAU GUCAUGUUAU CGAUAUGUGA A UACAUAGC AUAUCAGAAG GCACACCCGG AGAACUGAAA CAUCUUAGUA CCCGGAGGAA GAGAAAGAAA AUUCGAUUCC CU UAGUAGC GGCGAGCGAA ACGGGAAGAG CCCAAACCAA CAAGCUUGCU UGUUGGGGUU GUAGGACACU CUAGAGUUAC AAA GGACGA CAUUAGACGA AUCAUCUGGA AAGAUGAAUC AAAGAAGGUA AUAAUCCUGU AGUCGAAAAU GUUGUCUCUC UUGA GUGGA UCCUGAGUAC GACGGAGCAC GUGAAAUUCC GUCGGAAUCU GGGAGGACCA UCUCCUAAGG CUAAAUACUC UCUAG UGAC CGAUAGUGAA CCAGUACCGU GAGGGAAAGG UGAAAAGCAC CCCGGAAGGG GAGUGAAAUA GAACCUGAAA CCGUGU GCU UACAAGUAGU CAGAGCCCGU UAAUGGGUGA UGGCGUGCCU UUUGUAGAAU GAACCGGCGA GUUACGAUUU GAUGCAA GG UUAAGCAGUA AAUGUGGAGC CGUAGCGAAA GCGAGUCUGA AUAGGGCGUU UAGUAUUUGG UCGUAGACCC GAAACCAG G UGAUCUACCC UUGGUCAGGU UGAAGUUCAG UGAAUGGAGG ACCGAACCGA CUUACGUUGA AAAGUGAGCG GAUGAACUG AGGGUAGCGG AGAAAUUCCA AUCGAACCUG GAGAUAGCUG GUUCUCUCCG AAAUAGCUUU AGGGCUAGCC UCAAGUGAUG AUUAUUGGA GGUAGAGCAC UGUUUGGACG AGGCCGAAUU CAGACAAACU CCGAAUGCCA AUUAAUUUAA CUUGGGAGUC A GAACAUGG GUGAUAAGGU CCGUGUUCGA AAGGGAAACA GCCCAGACCA CCAGCUAAGG UCCCAAAAUA UAUGUUAAGU GG AAAAGGA UGUGGCGUUG CCACAACUAG AGUCGAGUGA CACUGCGCCG AAAAUGUACC GGGGCUAAAC AUAUUACCGA AGC UGUGGA UUGUCCUUGG ACAAUGGUAG GAGAGCGUUC UAAGGGCGUU GAAGCAUGAU CGUAAGGACA UGUGGAGCGC UUAG AAGUG AGAAUGCCGG UGUGAGUAGC GAAAGACGGG UGAGAAUCCC GUCCACCGAU UGACUAAGGU UUCCAGAGGA AGGCU CGUC CGCUCUGGGU UAGUCGGGUC CUAAGCUGAG GCCGACAGGC GUAGGCGAUG GAUAACAGGU UGAUAUUCCU GUACCA CCU AUAAUCGAUG GGGGGACGCA GUAGGAUAGG GAAGCGUUGG AUUGCACGUC UAAGCAGUAA GGCUGAGUAA UCCGGUA CU CGGGCUGAGC UGUGAUGGGG AGAAGACCGA GUCGUUGAUU UCACACUGCC GAGAAAAGCC UCUAGAUAGA AAAUAGGU G CCCGUACCGC AAACCGACAC AGGUAGUCAA GAUGAGAAUU CUAAGGUGAG CGAGCGAACU CUCGUUAAGG AACUCGGCA AAAUGACCCC GUAACUUCGG GAGAAGGGGU GCUCUUUAGG GUUAACGCCC AGAAGAGCCG CAGUGAAUAG GCCCAAGCGA CUGUUUAUC AAAAACACAG GUCUCUGCUA AACCGUAAGG UGAUGUAUAG GGGCUGACGC CUGCCCGGUG CUGGAAGGUU A AGAGGAGU GGUUAGCUUC UGCGAAGCUA CGAAUCGAAG CCCCAGUAAA CGGCGGCCGU AACGGUCCUA AGGUAGCGAA AU UCCUUGU CGGGUAAGUU CCGACCCGCA CGAAAGGCGU AACGAUUUGG GCACUGUCUC AACGAGAGAC UCGGUGAAAU CAU AGUACC UGUGAAGAUG CAGGUUACCC GCGACAGGAC GGAAAGACCC CGUGGAGCUU UACUGUAGCC UGAUAUUGAA AUUC GGCAC AGCUAGCUGU GUUGGCUUUC UAACCCGCAC CACUUACGUG GUGGGAGACA GUGUCAAGCG GGCAGUUUGA CUGGG GCGG UCGCCUCCUA AAAGGUAACG GAGGCGCUCA AAGGUUCCCU CAGAAUGGUU GGAAAUCAUU CAUAGAGUGU AAAGGC AUA AGGGAGCUUG ACUGCGAGAC CUACAAGUCG AGCAGGGUCG AAAGACGGAC UUAGUGAUCC GGUGGUUCCG CAUGGAA GG GCCAUCGCUC AACGGAUAAA AGCUACCCCG GGGAUAACAG GCUUAUCUCC CCCAAGAGUU CACAUCGACG GGGAGGUU U GGCACCUCGA UGUCGGCUCA UCGCAUCCUG GGGCUGUAGU CGGUCCCAAG GGUUGGGCUG UUCGCCCAUU AAAGCGGUA CGCGAGCUGG GUUCAGAACG UCGUGAGACA GUUCGGUCCC UAUCCGUCGU GGGCGUAGGA AAUUUGAGAG GAGCUGUCCU UAGUACGAG AGGACCGGGA UGGACAUACC UCUGGUGUAC CAGUUGUCGU GCCAACGGCA UAGCUGGGUA GCUAUGUGUG G ACGGGAUA AGUGCUGAAA GCAUCUAAGC AUGAAGCCCC CCUCAAGAUG AGAUUUCCCA ACUCGGUUAU AAGAUCCCUC AA AGAUGAU GAGGUUAAUA GGUUCGAGGU GGAAGCAUGG UGACAUGUGG AGCUGACGAA UACUAAUCGA UCGAAGACUU AAU

+
分子 #2: 30S ribosomal protein S3

分子名称: 30S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 22.684201 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列: GQKINPIGLR VGIIRDWEAK WYAEKDFASL LHEDLKIRKF IDNELKEASV SHVEIERAAN RINIAIHTGK PGMVIGKGGS EIEKLRNKL NALTDKKVHI NVIEIKKVDL DARLVAENIA RQLENRASFR RVQKQAITRA MKLGAKGIKT QVSGRLGGAD I ARAEQYSE ...文字列:
GQKINPIGLR VGIIRDWEAK WYAEKDFASL LHEDLKIRKF IDNELKEASV SHVEIERAAN RINIAIHTGK PGMVIGKGGS EIEKLRNKL NALTDKKVHI NVIEIKKVDL DARLVAENIA RQLENRASFR RVQKQAITRA MKLGAKGIKT QVSGRLGGAD I ARAEQYSE GTVPLHTLRA DIDYAHAEAD TTYGKLGVKV WIYR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3

+
分子 #3: 30S ribosomal protein S4

分子名称: 30S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 22.849145 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列: RFRGSNWKKS RRLGISLSGT GKELEKRPYA PGQHGPNQRK KLSEYGLQLR EKQKLRYLYG MTERQFRNTF DIAGKKFGVH GENFMILLA SRLDAVVYSL GLARTRRQAR QLVNHGHILV DGKRVDIPSY SVKPGQTISV REKSQKLNII VESVEINNFV P EYLNFDAD ...文字列:
RFRGSNWKKS RRLGISLSGT GKELEKRPYA PGQHGPNQRK KLSEYGLQLR EKQKLRYLYG MTERQFRNTF DIAGKKFGVH GENFMILLA SRLDAVVYSL GLARTRRQAR QLVNHGHILV DGKRVDIPSY SVKPGQTISV REKSQKLNII VESVEINNFV P EYLNFDAD SLTGTFVRLP ERSELPAEIN EQLIVEYYSR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4

+
分子 #4: 30S ribosomal protein S5

分子名称: 30S ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 16.522119 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
EFEERVVTIN RVAKVVKGGR RFRFTALVVV GDKNGRVGFG TGKAQEVPEA IKKAVEAAKK DLVVVPRVEG TTPHTITGRY GSGSVFMKP AAPGTGVIAG GPVRAVLELA GITDILSKSL GSNTPINMVR ATIDGLQNLK NAEDVAKLRG KTVEELY

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS5

+
分子 #5: 30S ribosomal protein S6

分子名称: 30S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 11.239766 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
MRTYEVMYIV RPNIEEDAKK ALVERFNGIL ATEGAEVLEA KDWGKRRLAY EINDFKDGFY NIVRVKSDNN KATDEFQRLA KISDDIIRY MVIRED

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS6

+
分子 #6: 30S ribosomal protein S7

分子名称: 30S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 17.695357 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
PRKGSVPKRD VLPDPIHNSK LVTKLINKIM LDGKRGTAQR ILYSAFDLVE QRSGRDALEV FEEAINNIMP VLEVKARRVG GSNYQVPVE VRPERRTTLG LRWLVNYARL RGEKTMEDRL ANEILDAANN TGGAVKKRED THKMAEANKA FAHYRW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7

+
分子 #7: 30S ribosomal protein S8

分子名称: 30S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 14.622014 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
MTDPIADMLT RVRNANMVRH EKLELPASNI KKEIAEILKS EGFIKNVEYV EDDKQGVLRL FLKYGQNDER VITGLKRISK PGLRVYAKA SEMPKVLNGL GIALVSTSEG VITDKEARKR NVGGEIIAYV W

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8

+
分子 #8: 30S ribosomal protein S9

分子名称: 30S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 14.312321 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
VEYRGTGRRK NSVARVRLVP GEGNITVNNR DVREYLPFES LILDLNQPFD VTETKGNYDV LVNVHGGGFT GQAQAIRHGI ARALLEADP EYRGSLKRAG LLTRDPRMKE RKKPGLKAAR RSPQFSKR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9

+
分子 #9: 30S ribosomal protein S10

分子名称: 30S ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 9.24361 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
IRIRLKAYDH RVIDQSAEKI VETAKRSGAD VSGPIPLPTE KSVYTIIRAV HKYKDSREQF EQRTHKRLID IVNPTPKTVD

UniProtKB: UNIPROTKB: A0A6H0HKY4

+
分子 #10: 30S ribosomal protein S11

分子名称: 30S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 12.047609 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
NIENGVAHIR STFNNTIVTI TDEFGNALSW SSAGALGFKG SKKSTPFAAQ MASETASKSA MEHGLKTVEV TVKGPGPGRE SAIRALQSA GLEVTAIRDV TPVPHNGCRP PKRRR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS11

+
分子 #11: 30S ribosomal protein S12

分子名称: 30S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 15.189673 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
PTINQLVRKP RQSKIKKSDS PALNKGFNSK KKKFTDLNSP QKRGVCTRVG TMTPKKPNSA LRKYARVRLS NNIEINAYIP GIGHNLQEH SVVLVRGGRV KDLPGVRYHI VRGALDTSGV DGRRQGRSLY GTKKPKN

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS12

+
分子 #12: 30S ribosomal protein S13

分子名称: 30S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 12.843768 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
ARIAGVDIPR EKRVVISLTY IYGIGTSTAQ KILEEANVSA DTRVKDLTDD ELGRIREVVD GYKVEGDLRR ETNLNIKRLM EISSYRGIR HRRGLPVRGQ KTKNNARTRK GPVK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13

+
分子 #13: 30S ribosomal protein S14 type Z

分子名称: 30S ribosomal protein S14 type Z / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 7.186573 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
AKTSMVAKQQ KKQKYAVREY TRCERCGRPH SVYRKFKLCR ICFRELAYKG QIPGVRKASW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14

+
分子 #14: 30S ribosomal protein S15

分子名称: 30S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 10.503135 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
AISQERKNEI IKEYRVHETD TGSPEVQIAV LTAEINAVNE HLRTHKKDHH SRRGLLKMVG RRRHLLNYLR SKDIQRYREL IKSLGIRR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15

+
分子 #15: 30S ribosomal protein S16

分子名称: 30S ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 9.291743 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
AVKIRLTRLG SKRNPFYRIV VADARSPRDG RIIEQIGTYN PTSANAPEIK VDEALALKWL NDGAKPTDTV HNILSKEGIM KKF

UniProtKB: UNIPROTKB: A0A6K3WEJ9

+
分子 #16: 30S ribosomal protein S17

分子名称: 30S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 9.36686 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
NDRKVYVGKV VSDKMDKTIT VLVETYKTHK LYGKRVKYSK KYKTHDENNS AKLGDIVKIQ ETRPLSATKR FRLVEIVEES

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17

+
分子 #17: 30S ribosomal protein S18

分子名称: 30S ribosomal protein S18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 6.574833 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
GITHIDYKDT ELLKRFISER GKILPRRVTG TSAKYQRMLT TAIKRSRHMA LLPYVK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS18

+
分子 #18: 30S ribosomal protein S19

分子名称: 30S ribosomal protein S19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 9.010406 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
SIKKGPFVDE HLMKKVEAQE GSEKKQVIKT WSRRSTIFPN FIGHTFAVYD GRKHVPVYVT EDMVGHKLGE FAPTRTFK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19

+
分子 #19: 30S ribosomal protein S20

分子名称: 30S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 8.480758 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
KSAIKRVKTT EKAEARNISQ KSAMRTAVKN AKTAVSNNAD NKNELVSLAV KLVDKAAQSN LIHSNKADRI KSQLMTAN

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS20

+
分子 #21: 50S ribosomal protein L3

分子名称: 50S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 23.199545 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列: TKGILGRKIG MTQVFGENGE LIPVTVVEAK ENVVLQKKTV EVDGYNAIQV GFEDKKAYKK DAKSNKYANK PAEGHAKKAD AAPKRFIRE FRNVDVDAYE VGQEVSVDTF VAGDVIDVTG VSKGKGFQGA IKRHGQSRGP MSHGSHFHRA PGSVGMASDA S RVFKGQKM ...文字列:
TKGILGRKIG MTQVFGENGE LIPVTVVEAK ENVVLQKKTV EVDGYNAIQV GFEDKKAYKK DAKSNKYANK PAEGHAKKAD AAPKRFIRE FRNVDVDAYE VGQEVSVDTF VAGDVIDVTG VSKGKGFQGA IKRHGQSRGP MSHGSHFHRA PGSVGMASDA S RVFKGQKM PGRMGGNTVT VQNLEVVQVD TENKVILVKG NVPGPKKGLV EIRTSIK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3

+
分子 #22: 50S ribosomal protein L4

分子名称: 50S ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 22.293424 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列: NYDVLKLDGT KSGSIELSDA VFGIEPNNSV LFEAINLQRA SLRQGTHAVK NRSAVSGGGR KPWKQKGTGR ARQGTIRAPQ WRGGGIVFG PTPRSYAYKM PKKMRRLALR SALSFKAQEN GLTVVDAFNF EAPKTKEFKN VLSTLEQPKK VLVVTENEDV N VELSARNI ...文字列:
NYDVLKLDGT KSGSIELSDA VFGIEPNNSV LFEAINLQRA SLRQGTHAVK NRSAVSGGGR KPWKQKGTGR ARQGTIRAPQ WRGGGIVFG PTPRSYAYKM PKKMRRLALR SALSFKAQEN GLTVVDAFNF EAPKTKEFKN VLSTLEQPKK VLVVTENEDV N VELSARNI PGVQVTTAQG LNVLDITNAD SLVITEAAAK KVEEVLG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4

+
分子 #23: 50S ribosomal protein L5

分子名称: 50S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 18.644643 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
RLKEKFNTEV TENLMKKFNY SSVMEVPKID KIVVNMGVGD AVQNSKVLDN AVEELELITG QKPLVTKAKK SIATFRLREG MPIGAKVTL RGERMYEFLD KLISVSLPRV RDFQGVSKKA FDGRGNYTLG VKEQLIFPEI DYDKVSKVRG MDIVIVTTAN T DEEAR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5

+
分子 #24: 50S ribosomal protein L6

分子名称: 50S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 19.400051 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
SRVGKKIIDI PSDVTVTFDG NHVTVKGPKG ELSRTLNERM TFKQEENTIE VVRPSDSKED RTNHGTTRAL LNNMVQGVSQ GYVKVLELV GVGYRAQMQG KDLILNVGYS HPVEIKAEEN ITFSVEKNTV VKVEGISKEQ VGALASNIRS VRPPEPYKGK G IRYQGEYV RRKEGK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6

+
分子 #25: 50S ribosomal protein L13

分子名称: 50S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 16.359427 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
MRQTFMANES NIERKWYVID AEGQTLGRLS SEVASILRGK NKVTYTPHVD TGDYVIVINA SKIEFTGNKE TDKVYYRHSN HPGGIKSIT AGELRRTNPE RLIENSIKGM LPSTRLGEKQ GKKLFVYGGA EHPHAAQQPE NYELRG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL13

+
分子 #26: 50S ribosomal protein L14

分子名称: 50S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 13.157342 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
MIQQETRLKV ADNSGAREVL TIKVLGGSGR KTANIGDVIV CTVKNATPGG VVKKGDVVKA VIVRTKSGVR RNDGSYIKFD ENACVIIRD DKGPRGTRIF GPVARELREG NFMKIVSLAP EVL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14

+
分子 #27: 50S ribosomal protein L15

分子名称: 50S ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 15.515731 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
MKLHELKPAE GSRKERNRVG RGVATGNGKT SGRGHKGQKA RSGGGVRPGF EGGQLPLFRR LPKRGFTNIN RKEYAIVNLD QLNKFEDGT EVTPALLVES GVVKNEKSGI KILGNGSLDK KLTVKAHKFS ASAAEAIDAK GGAHEV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15

+
分子 #28: 50S ribosomal protein L16

分子名称: 50S ribosomal protein L16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 15.486276 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
MLLPKRVKYR RQHRPKTTGR SKGGNYVTFG EFGLQATTTS WITSRQIESA RIAMTRYMKR GGKVWIKIFP HTPYTKKPLE VRMGAGKGA VEGWIAVVKP GRILFEVAGV SEEVAREALR LASHKLPVKT KFVKREE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16

+
分子 #29: 50S ribosomal protein L17

分子名称: 50S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 13.42035 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
RKLGRTSDQR KAMLRDLATS LIISERIETT EARAKEVRSV VEKLITLGKK GDLASRRNAA KTLRNVEILN EDETTQTALQ KLFGEIAER YTERQGGYTR ILKQGPRRGD GAESVIIELV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL17

+
分子 #30: 50S ribosomal protein L18

分子名称: 50S ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 12.461404 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
MISKIDKNKV RLKRHARVRT NLSGTAEKPR LNVYRSNKHI YAQIIDDNKG VTLAQASSKD SDIATTATKV ELATKVGEAI AKKAADKGI KEIVFDRGGY LYHGRVKALA EAAR

UniProtKB: UNIPROTKB: A0A6K6IAA8

+
分子 #31: 50S ribosomal protein L20

分子名称: 50S ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 13.459919 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
PRVKGGTVTR ARRKKTIKLA KGYFGSKHTL YKVAKQQVMK SGQYAFRDRR QRKRDFRKLW ITRINAAARQ HEMSYSRLMN GLKKAGIDI NRKMLSEIAI SDEKAFAQLV TKAKDAL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL20

+
分子 #32: 50S ribosomal protein L21

分子名称: 50S ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 11.354081 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
MFAIIETGGK QIKVEEGQEI FVEKLDVNEG DTFTFDKVLF VGGDSVKVGA PTVEGATVTA TVNKQGRGKK ITVFTYKRRK NSKRKKGHR QPYTKLTIDK INA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21

+
分子 #33: 50S ribosomal protein L22

分子名称: 50S ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 12.328358 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
MEAKAVARTI RIAPRKVRLV LDLIRGKNAA EAIAILKLTN KASSPVIEKV LMSALANAEH NYDMNTDELV VKEAYANEGP TLKRFRPRA QGRASAINKR TSHITIVVSD GKE

UniProtKB: UNIPROTKB: A0A6I4H7Y4

+
分子 #34: 50S ribosomal protein L23

分子名称: 50S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 10.3801 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
EARDILKRPV ITEKSSEAMA EDKYTFDVDT RVNKTQVKMA VEEIFNVKVA SVNIMNYKPK KKRMGRYQGY TNKRRKAIVT LKEGSIDLF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23

+
分子 #35: 50S ribosomal protein L24

分子名称: 50S ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 11.316205 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
HIKKGDNVKV IAGKDKGKEG KVIATLPKKD RVVVEGVNIM KKHQKPTQLN PEGGILETEA AIHVSNVQLL DPKTNEPTRV GYKFVDGKK VRIAKKSGEE IKSN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24

+
分子 #36: 50S ribosomal protein L25

分子名称: 50S ribosomal protein L25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 10.391122 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
SLKSIIRQGK QTRSDLKQLR KSGKVPAVVY GYGTKNVSVK VDEVEFIKVI REVGRNGVIE LGVGSKTIKV MVADYQFDPL KNQITHIDF LAIN

UniProtKB: UNIPROTKB: A0A6H3X640

+
分子 #37: 50S ribosomal protein L27

分子名称: 50S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 8.911099 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
KKGVSSTKNG RDSESKRLGA KRADGQFVTG GSILYRQRGT KIYPGENVGR GGDDTLFAKI DGVVKFERKG RDKKQVSVYA VA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL27

+
分子 #38: 50S ribosomal protein L28

分子名称: 50S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 5.499432 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
ASTGNRRSHA LNSTKRRWNA NLQKVRILVD GKPKKVWVSA RALKSGKVT

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL28

+
分子 #39: 50S ribosomal protein L29

分子名称: 50S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 7.331325 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
EIRDLTTSEI EEQIKSSKEE LFNLRFQLAT GQLEETARIR TVRKTIARLK TVAREREIEQ SK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29

+
分子 #40: 50S ribosomal protein L30

分子名称: 50S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 6.305308 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
AKLQITLTRS VIGRPETQRK TVEALGLKKT NSSVVVEDNP AIRGQINKVK HLVTVEE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30

+
分子 #41: 50S ribosomalprotein L32p

分子名称: 50S ribosomalprotein L32p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 5.406392 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
AVPKRRTSKT RKNKRRTHFK ISVPGMTECP NCGEYKLSHR VCKNCGS

UniProtKB: UNIPROTKB: A0A6K0ZQ16

+
分子 #42: 50S ribosomal protein L33

分子名称: 50S ribosomal protein L33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 5.684561 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
RVNVTLACTE CGDRNYITTK NKRNNPERIE MKKYCPRLNK YTLHRET

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL33

+
分子 #43: 50S ribosomal protein L34

分子名称: 50S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 5.252369 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
VKRTYQPNKR KHSKVHGFRK RMSTKNGRKV LARRRRKGRK VLS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL34

+
分子 #44: 50S ribosomal protein L35

分子名称: 50S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 6.985402 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
PKMKTHRGAA KRVKRTASGQ LKRSRAFTSH LFANKSTKQK RQLRKARLVS KSDMKRVKQL

UniProtKB: UNIPROTKB: A0A6J8FVP5

+
分子 #45: 50S ribosomal protein L36

分子名称: 50S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 4.318422 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
MKVRPSVKPI CEKCKVIKRK GKVMVICENP KHKQRQG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL36

+
分子 #46: 50S ribosomal protein L31 type B

分子名称: 50S ribosomal protein L31 type B / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
分子量理論値: 8.603602 KDa
組換発現生物種: Staphylococcus aureus (黄色ブドウ球菌)
配列文字列:
MKQGIHPEYH QVIFLDTTTN FKFLSGSTKT SSEMMEWEDG KEYPVIRLDI SSDSHPFYTG RQKFAAADGR VERF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL31B

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実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.6
グリッドモデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: COPPER / メッシュ: 200
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
平均電子線量: 47.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

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画像解析

粒子像選択選択した数: 494375
初期モデルモデルのタイプ: PDB ENTRY
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.11 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 123520
初期 角度割当タイプ: NOT APPLICABLE
最終 角度割当タイプ: NOT APPLICABLE

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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