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- EMDB-10973: The structure of the large subunit of the mitoribosome from Neuro... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-10973
タイトルThe structure of the large subunit of the mitoribosome from Neurospora crassa
マップデータComposite map of LSU generated from the maps of LSU core, CP and L10 region.
試料
  • 複合体: Mitoribosome of Neurospora crassa
    • RNA: x 1種
    • タンパク質・ペプチド: x 44種
  • リガンド: x 5種
キーワードNeurospora crassa / translating Mitoribosomes / tRNA / mRNA / mL108 / TRANSLATION
機能・相同性
機能・相同性情報


mitochondrial genome maintenance / ribonuclease III activity / fungal-type vacuole / DNA strand exchange activity / mitochondrial large ribosomal subunit / mitochondrial translation / RNA processing / large ribosomal subunit / double-stranded RNA binding / single-stranded DNA binding ...mitochondrial genome maintenance / ribonuclease III activity / fungal-type vacuole / DNA strand exchange activity / mitochondrial large ribosomal subunit / mitochondrial translation / RNA processing / large ribosomal subunit / double-stranded RNA binding / single-stranded DNA binding / transferase activity / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / cytoplasmic translation / rRNA binding / negative regulation of translation / ribosome / structural constituent of ribosome / ribonucleoprotein complex / translation / mRNA binding / mitochondrion / RNA binding
類似検索 - 分子機能
54S ribosomal protein L44, mitochondrial / : / Mitochondrial ribosomal protein subunit L20 / Ribosomal protein L31p, N-terminal / Ribosomal protein L20, mitochondrial / Mitochondrial homologous recombination protein 1 / 54S ribosomal protein L25 / 54S ribosomal protein L15, mitochondrial / MRPL25 domain / 54S ribosomal protein L3, double-stranded RNA binding domain ...54S ribosomal protein L44, mitochondrial / : / Mitochondrial ribosomal protein subunit L20 / Ribosomal protein L31p, N-terminal / Ribosomal protein L20, mitochondrial / Mitochondrial homologous recombination protein 1 / 54S ribosomal protein L25 / 54S ribosomal protein L15, mitochondrial / MRPL25 domain / 54S ribosomal protein L3, double-stranded RNA binding domain / Transcriptional regulation of mitochondrial recombination / Mitochondrial ribosomal protein mL59 / 54S ribosomal protein L28, mitochondrial / Ribosomal protein L31, mitochondrial / 54S ribosomal protein L36, yeast / Mitochondrial ribosomal protein L31 / Ribonuclease-III-like / 28S ribosomal protein S25, mitochondrial / Ribonuclease III family domain profile. / Ribonuclease III family / Ribonuclease III domain / Ribosomal protein L37, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L37 / Ribosomal protein L53, mitochondrial / 39S ribosomal protein L53/MRP-L53 / Ribosomal protein L49/IMG2 / Mitochondrial large subunit ribosomal protein (Img2) / Ribosomal protein L46, N-terminal / 39S mitochondrial ribosomal protein L46 / Ribosomal protein L50, mitochondria / Ribosomal protein L27/L41, mitochondrial / Mitochondrial ribosomal protein L27 / Ribosomal subunit 39S / 39S ribosomal protein L46, mitochondrial / 39S ribosomal protein L43/54S ribosomal protein L51 / Ribosomal protein L47, mitochondrial / MRP-L47 superfamily, mitochondrial / Mitochondrial 39-S ribosomal protein L47 (MRP-L47) / Phosphatidylethanolamine-binding protein / Phosphatidylethanolamine-binding protein / Phosphatidylethanolamine-binding protein, eukaryotic / PEBP-like superfamily / Double-stranded RNA binding motif / Double-stranded RNA binding motif / Ribonuclease III, endonuclease domain superfamily / Double-stranded RNA-binding domain / : / NUDIX domain / Ribosomal protein/NADH dehydrogenase domain / Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain / Mitochondrial ribosomal protein L51 / S25 / CI-B8 domain / NUDIX hydrolase domain / Ribosomal protein L1, 3-layer alpha/beta-sandwich / NUDIX hydrolase-like domain superfamily / Ribosomal protein L1-like / Ribosomal protein L1/ribosomal biogenesis protein / Ribosomal protein L1p/L10e family / Ribosomal protein L11, bacterial-type / Ribosomal protein L10-like domain superfamily / : / Ribosomal protein L6, conserved site / Ribosomal protein L6 signature 1. / Ribosomal protein L16, conserved site / Ribosomal protein L16 signature 2. / Ribosomal protein L17 signature. / Ribosomal protein L11, N-terminal / Ribosomal protein L11, N-terminal domain / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L11, C-terminal / Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11, RNA binding domain / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L28/L24 superfamily / Ribosomal protein L9, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L9 / Ribosomal protein L9, N-terminal / Ribosomal protein L9, N-terminal domain / Ribosomal protein L6, bacterial-type / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L36 superfamily / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / Ribosomal protein L14P, bacterial-type / Ribosomal protein L2, bacterial/organellar-type / Ribosomal L28 family / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein L28/L24 / Ribosomal protein L33 superfamily / Ribosomal protein L30, bacterial-type / : / Ribosomal protein L16 / L28p-like / Ribosomal protein L27 / Ribosomal L27 protein / Ribosomal protein L19 / Ribosomal protein L19 superfamily / Ribosomal protein L19 / Ribosomal protein L17
類似検索 - ドメイン・相同性
Ribosomal protein L15 / Large ribosomal subunit protein mL59 domain-containing protein / Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein uL16m / Large ribosomal subunit protein bL32m / Large ribosomal subunit protein uL1m / Large ribosomal subunit protein uL5m / Large ribosomal subunit protein mL58 / Large ribosomal subunit protein bL27m / Large ribosomal subunit protein bL31m ...Ribosomal protein L15 / Large ribosomal subunit protein mL59 domain-containing protein / Uncharacterized protein / Large ribosomal subunit protein uL16m / Large ribosomal subunit protein bL32m / Large ribosomal subunit protein uL1m / Large ribosomal subunit protein uL5m / Large ribosomal subunit protein mL58 / Large ribosomal subunit protein bL27m / Large ribosomal subunit protein bL31m / Large ribosomal subunit protein bL17m / Large ribosomal subunit protein uL3m / Large ribosomal subunit protein uL30m / Large ribosomal subunit protein mL61 / Large ribosomal subunit protein uL11m / Large ribosomal subunit protein uL24m / Large ribosomal subunit protein mL38 / Large ribosomal subunit protein mL67 / Large ribosomal subunit protein bL19m / Large ribosomal subunit protein uL10m / Large ribosomal subunit protein uL6m / Large ribosomal subunit protein bL9m / Large ribosomal subunit protein mL57 / Large ribosomal subunit protein mL46 / Large ribosomal subunit protein mL43 / Large ribosomal subunit protein bL36m / Large ribosomal subunit protein mL49 / Large ribosomal subunit protein uL22m / Large ribosomal subunit protein mL41 / Large ribosomal subunit protein mL50 / Large ribosomal subunit protein uL29m / Large ribosomal subunit protein uL23m / Large ribosomal subunit protein mL44 / Large ribosomal subunit protein uL14m / Large ribosomal subunit protein uL13m / Large ribosomal subunit protein bL28m / Large ribosomal subunit protein uL2m / Large ribosomal subunit protein mL54 / Large ribosomal subunit protein bL21m / Large ribosomal subunit protein mL53 / Related to ribosomal protein L34, mitochondrial / Large ribosomal subunit protein mL60 / Large ribosomal subunit protein bL33m / Large ribosomal subunit protein uL4m
類似検索 - 構成要素
生物種Neurospora crassa OR74A (菌類)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.74 Å
データ登録者Amunts A / Itoh Y
資金援助 スウェーデン, European Union, 4件
OrganizationGrant number
Swedish Research CouncilNT_2015-04107 スウェーデン
European Research Council (ERC)(ERC-2018-StG-805230European Union
Knut and Alice Wallenberg Foundation2018.0080 スウェーデン
European Molecular Biology Organization (EMBO)H2020-MSCA-IF-2017European Union
引用ジャーナル: Nat Commun / : 2020
タイトル: Analysis of translating mitoribosome reveals functional characteristics of translation in mitochondria of fungi.
著者: Yuzuru Itoh / Andreas Naschberger / Narges Mortezaei / Johannes M Herrmann / Alexey Amunts /
要旨: Mitoribosomes are specialized protein synthesis machineries in mitochondria. However, how mRNA binds to its dedicated channel, and tRNA moves as the mitoribosomal subunit rotate with respect to each ...Mitoribosomes are specialized protein synthesis machineries in mitochondria. However, how mRNA binds to its dedicated channel, and tRNA moves as the mitoribosomal subunit rotate with respect to each other is not understood. We report models of the translating fungal mitoribosome with mRNA, tRNA and nascent polypeptide, as well as an assembly intermediate. Nicotinamide adenine dinucleotide (NAD) is found in the central protuberance of the large subunit, and the ATPase inhibitory factor 1 (IF) in the small subunit. The models of the active mitoribosome explain how mRNA binds through a dedicated protein platform on the small subunit, tRNA is translocated with the help of the protein mL108, bridging it with L1 stalk on the large subunit, and nascent polypeptide paths through a newly shaped exit tunnel involving a series of structural rearrangements. An assembly intermediate is modeled with the maturation factor Atp25, providing insight into the biogenesis of the mitoribosomal large subunit and translation regulation.
履歴
登録2020年4月30日-
ヘッダ(付随情報) 公開2020年11月11日-
マップ公開2020年11月11日-
更新2024年5月22日-
現状2024年5月22日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図(断面を密度値に従い着色)
  • 表面レベル: 3.35
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図(高さに従い着色)
  • 表面レベル: 3.35
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-6yws
  • 表面レベル: 3.35
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_10973.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 244.1 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
注釈Composite map of LSU generated from the maps of LSU core, CP and L10 region.
ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.06 Å
密度
表面レベル登録者による: 3.35 / ムービー #1: 3.35
最小 - 最大-22.612130000000001 - 41.787785
平均 (標準偏差)0.0037323164 (±1.1046822)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderZYX
Origin000
サイズ400400400
Spacing400400400
セルA=B=C: 423.99997 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.061.061.06
M x/y/z400400400
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z424.000424.000424.000
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ400400400
MAP C/R/S321
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS400400400
D min/max/mean-22.61241.7880.004

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添付データ

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マスク #1

ファイルemd_10973_msk_1.map
投影像・断面図
ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

-
追加マップ: Consensus map LSU.

ファイルemd_10973_additional_1.map
注釈Consensus map LSU.
投影像・断面図
ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

-
ハーフマップ: #2

ファイルemd_10973_half_map_1.map
投影像・断面図
ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

-
ハーフマップ: #1

ファイルemd_10973_half_map_2.map
投影像・断面図
ZYX

投影像

断面 (1/2)
密度ヒストグラム

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試料の構成要素

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全体 : Mitoribosome of Neurospora crassa

全体名称: Mitoribosome of Neurospora crassa
要素
  • 複合体: Mitoribosome of Neurospora crassa
    • RNA: RNA (2820-MER)
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L2
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L4, variant
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L5
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L6
    • タンパク質・ペプチド: RIBOSOMAL_L9 domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L19
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L13
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L14
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein L15
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L16
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L17
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein
    • タンパク質・ペプチド: Aconitate hydratase
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial large ribosomal subunit
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein subunit L23
    • タンパク質・ペプチド: KOW domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L24
    • タンパク質・ペプチド: 54S ribosomal protein L4, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L30
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein subunit L32
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein
    • タンパク質・ペプチド: Related to ribosomal protein L34, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Ribosomal protein
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial large ribosomal subunit YmL35
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L43
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L3
    • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal subunit L30
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein
    • タンパク質・ペプチド: Mitochondrial ribosomal protein L44
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein
    • タンパク質・ペプチド: RNase III domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L20
    • タンパク質・ペプチド: Mitoc_mL59 domain-containing protein
    • タンパク質・ペプチド: 54S ribosomal protein L31, mitochondrial
    • タンパク質・ペプチド: Uncharacterized protein
    • タンパク質・ペプチド: 60S ribosomal protein L1
    • タンパク質・ペプチド: L51_S25_CI-B8 domain-containing protein
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: SPERMINE
  • リガンド: POTASSIUM ION
  • リガンド: ZINC ION
  • リガンド: NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE

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超分子 #1: Mitoribosome of Neurospora crassa

超分子名称: Mitoribosome of Neurospora crassa / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#45
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)

+
分子 #1: RNA (2820-MER)

分子名称: RNA (2820-MER) / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 1.114857375 MDa
配列文字列: AAAUGUAAUG GAUAUAAAGC UUAUGUUUAU AUAUAUAGAC AUAUAUAAGU AUAUAAAGAG ACUACUACCA AUAGCUACAC UAUGUAUUA AGGAGAGUAU AACUUAAUUU AUGUUUAUGA UUUUAUCAUA CCCCUAAAAA UGACACCGAG GAGCAAGGGU C GGGUUAGC ...文字列:
AAAUGUAAUG GAUAUAAAGC UUAUGUUUAU AUAUAUAGAC AUAUAUAAGU AUAUAAAGAG ACUACUACCA AUAGCUACAC UAUGUAUUA AGGAGAGUAU AACUUAAUUU AUGUUUAUGA UUUUAUCAUA CCCCUAAAAA UGACACCGAG GAGCAAGGGU C GGGUUAGC AUCCUGGUUC GUACACCUUG GUGACCUAGG CUAGUACCAG GUCCCCCUCU AAGGGACUUG UCCCCCUCUA AG GGACUUG CGUCGGUCCU AUCCUAGGCC GAAUAGGUGA AUAAAUACUU ACGGACGGCC UUGGUCUGUC CUAGAGGUUA UCA ACAUAU GAACUCUUAG AGAAAUUACU UAAUAAACGA AGUGAAUUGA AAUAUCUUAU UAACUUCAGG AAAAGAAAUC AAAC GAGAU UCUAUGAUUA GUGUGAACGA AAAUAGAGCA GCCUAUUAAA AUAAGUAAAA UGGCUUUAAA GCUGUUUGAA UAUUG UGGG GAACCUUCCU CAAAGGCUAA AUAUAAUACA UGAGUUACAG AGAAAAGUAC CGUGAGGGAA AGCUUUGAAA UAGUAG UUU UAUAAGCAGC UCAAGCAAUA AGAAAGCGAG AGCGUACCUU UUGCAUAAUG GGUCACCAAG UUAAUUUUAG AUGCGAG CG AAUUUAUUUA UGUUUUUACU GAUUAAACAA UAUAAUGAAU CAUAAUUAUU UUUGUAACGA GUAUUAGUAU UAAAUCUU A AUUUAAUAUU AGUAUAAGUU UUCAGUAUGG CGGCUACAUA GCAUAAUCUA UGCAGCCAGC CAAUAAUUGG AUUUCCAAU CCAAUUUCGG UAAUAAAUAG AUGUGCAUAG UUAAACCGAU CAUUAAAAUA AUGAAUAGUG UCUAAAGUUA GACCCGAAGC CUGGUGAUC UUACUAUAGU CAGGACUAUA AAGGUCCGAA CGGGUUAUCG UUGCAAAGAU AUCCGAAGAA CUAUGGUAAG C GAGUGAAA GACAACACUG ACUAGGAUAG CUGGUUUUCU GCGAAACCUA UAAUAGUAGG CAAUUUAAGU AACAUCUUAG UA GGUACAG AACUUAAUCU CAGACAAGAU GUAGAUUUUC AUACCUAUGU UUAGGUAUGA AAUGCAUUUU UUUUUGUAUA CAU CGGGGG AUCGUGAAGA UUUUAUCGGU GAGUAUGUAG ACUCGGAAUG ACAAAGAUGA AUCUUGAAUA AUCAGACAUA GAAU GAUAA GGUUGUAUGU CAAAAGGGAA ACAGCCCAGA ACAAGAGUUA AGGUUCCAAA AUUAUUAUUA AGUGAAAUAA AGAAA GUUU UUAUAUAAGU CGACAAGAAG AUGGGCUUGG AAGCAGCCAU AAUUUAAAGA UCUCGUAACA GAGCACUUGU UAAAUC UUA AAAGCAUCGA AAAUUUAACG GAUCUAAAUA AUAUACCGAA ACCUUGUCCA UAUGUAACAU UAGUAAUAAU AUGCUAU UA AUGUUAUUUG AUGGGGUAGC AGAACGUUGA GUGAAUCUUA GAUUUUUUUU UUAUAACUAA AUAUAGAUGA UAACUCAA G UGAGAAUGGU GACAUGAGUA ACAAAAAAGA GUUUAAGGUA CCUAAAAGGU AUCUUAGAGU CUCGCCUAAA GCUUAUGGC UACGUCAAGU AACGGCCUCU AAGUUUAUAA UCUGAAGAUU AUGACGAUGA GAAAAUAACG CGCAGAAGUG CGCUGCUUUG AUACUUAUG GUACCAACAU UUAAAAGUGA AAAUUGUGCA GGAAGGAUCA GUAUCCUUUC AUUCUUAUGU GGGGGAGUGG A CAAAACUG AACAGAGUGU AUCUGAACAC AGAUGAGUCC ACACCCCCCC CCAUGUAAUG AAUGAAUGAC AAACCGUACC UA GAAUCUG AAACAAGUAA GCUAGUAGAG AAUACGAAGG CGUGAAUGAG AUAACAAUCA UAAAGGAACU CGGCAAACUA ACU ACCGUA ACUUAGGGAU AAGGAGAGCU CAUUAGUCUC GAUUAAUACG AGUAAAAAGG AAGAAGCAUG GAAUAUUGUU GUAC GACUG UUUAAUUAAA ACAAAGCACU UUGCAAAAAG ACGAUAAGUC UAAGUAUUGA GUGUGAUUUC UGCCCGAUGC CGGCU GGUU AACGAAUUUU CUAAAUUGAA AAAAAAUUUG GUUUCAGAGG AACCCCCGGU UAAUGGCGGC CUUAGCGUGA GGGUCC UAA GGUAGCGAAA UGCCUUGGCC GUUAAAUGCG GUCUUGCAUG AAUGAUGUAA CGAUACAACA GCUGUCUCUA UGAUUGA CU CAGUGAAAUU GGAAUAACUG UGCAGAUACA GUUUACCUCU AGUUAGACGA GAAGACCCUA UGCAGCUUUA CUGUUACU A AUUAUUGAAU ACGAUUCUGA AAAUUUCCAG UGUAAAAGGU AAUCGAUAAG AUAUAAUUGA AACACCUUUA UUUUUCUAU CGUAUUAUUA AACCUUAAAU UAAGGAACAA UUGUUAGAAG ACAGUUUAUG CGGGGCACAG GCCCCAUAAA GAGUAAAUGG GUGUGUCUA AAAUUUAUAA AUUUAUGUUU GCAAUUUUUU AUAGUGAUUA UAUAUCAAAU CAUCUUUAUG CUAUUCAUAG A GUGUAUUU AUUAUAUUCC UUGGGUACAG UAUAAAAAUU AUAUAUGUAU UAAUUUACAU AUAUUUUUUC UAAGAAAUUA GG UAAGAUU UUGUUUAUAG AGAAAUUAGA UGUAAAAAAA AAAUCUUAUG AGGGCGGUAU UUAAUAAUCC GCUUCUAAUA UUU UUUUGU AGUUAUUAUU AUAAAUUUAA UAAUAAUCAU GUUUAUUACU UAAAAAGCUU AAUGGCUUAA UCUUGCCUUA CUGU UUGAU UAACAACAAA UCUUACAGUC GCGUAAGCGG GGCAUAGGAU CACAAGAUAC AAAAAGGAAA GAUCUUGGAU UUUUG GAAA AGCUACGCUA GGGAUAACAG GCUAAUUUGC GCAAGAGUGU ACAAAAUGAG UGCGCGGUUU GGCACCUCGA UGUCGG CUU GACUAAUCCU CAUGGAUGCA GAAACUAUGU AGGGUACGAC UGUUCGUCGA UUAAAAAGUU ACAUGAGCUG GGUUAAA UA CGUCGUGAGA CAGUAUGGUU UCUAUCUUCU AGAGGGAAUU AGAAUAUAAU AAGGAUUAAC CUUUGUACGA AAGGAACA U GGGGUACUAU UGUUAUACCU AGUUGUAUAA CAGUUUUAUU AACCUCUGGU UUACCUGUUG UUUAUGUGCC UUAUAUUAA UUUCAUGUGU GAUGCUCCGC AAGGAUAUUA CAGGGAUGUU ACCGUCACUU GAGUAAAUAC AAUAGCAUAA GCAUGGCAGG AAAGCUAAG UUAGUCAAAA AUAAGUGCUG AAAGCAUAUA GGCACGAAAU UUACCUUAAG AUAUUUCUUA AAUAUACGUA A GAAAAUAU UACGUUAAUA GGCUUAGUUU GUAAUAAUCU AGAGAUUUUA AGGAACUAAG UACUAAUUUU AUAAAAAACU GA AUGAUUA AUAUAUCUUA CAUUUUC

+
分子 #2: 60S ribosomal protein L2

分子名称: 60S ribosomal protein L2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 42.260766 KDa
配列文字列: MLQPQFRPLL AGTASFAQTV LGRTVARCYA TKAATQSASS TSTSNTSKDA KAKIVTPYVR DAGMMRTYKP HTPGIRHLKR PINDHLWKG RPYLPLTFPK KGQSKGGRNH SGRVTVRHRG GGHKRRIRMV DFERWIPGPH TVLRIEYDPG RSAHIALVKE E ATGRKSYI ...文字列:
MLQPQFRPLL AGTASFAQTV LGRTVARCYA TKAATQSASS TSTSNTSKDA KAKIVTPYVR DAGMMRTYKP HTPGIRHLKR PINDHLWKG RPYLPLTFPK KGQSKGGRNH SGRVTVRHRG GGHKRRIRMV DFERWIPGPH TVLRIEYDPG RSAHIALVKE E ATGRKSYI VAADGMRAGD VVQSYRSGLP QDLLDSMGGV VDPGILAART CWRGNCLPVS MIPVGTQIYC VGSRPDGKAV FC RSAGTYA TIISKEEETR EDGTKVMTGK FVNVRLQSGE IRRVSKDACA TVGIASNIMH HYRQLGKAGR SRWLNIRPTV RGL AMNAND HPHGGGRGKS KGNRHPVSPW GTPAKGGYKT RRKSNVNKWV VTPRVRNMGV RRNKKTT

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2m

+
分子 #3: 60S ribosomal protein L3

分子名称: 60S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 41.262527 KDa
配列文字列: MAPRLPARCW RQLSLVERSA THTTTTAAAS SLLLAGRTTP TFSASSPSTV FPSLLPQITK RGVKYGWSTL PKRSRPTRFN QVTQGLPAP TSGPAAALKR REKTTPLRTG VLAVKKGMTV FMGRTGARIP CTVLQLDRVQ VVANKTRAKN GYWAVQVGLG E RRAENVGA ...文字列:
MAPRLPARCW RQLSLVERSA THTTTTAAAS SLLLAGRTTP TFSASSPSTV FPSLLPQITK RGVKYGWSTL PKRSRPTRFN QVTQGLPAP TSGPAAALKR REKTTPLRTG VLAVKKGMTV FMGRTGARIP CTVLQLDRVQ VVANKTRAKN GYWAVQVGLG E RRAENVGA PQLGYYEAKG IPPKQTLAEF KVRNQDGLLP VGVQLFPDWF HVGQVVDVRG ITRGMGFAGG MKRHGFAGQE AS HGNSLNH RTIGSVGGSQ GSGSRVLPGK KMPGRMGAQQ HTVQNLPILM VDNELGIVVV KGAVAGHKGA VVKVQDAVKK APP PEEFVE ATKQLLNERF PDAEEKLQAA RKLHLELKEA RRQGLIDSLI KNGLTEKADG NAAVEASA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3m

+
分子 #4: 60S ribosomal protein L4, variant

分子名称: 60S ribosomal protein L4, variant / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 36.402785 KDa
配列文字列: MAGKGLKSLN EAMNALSIAS KSCRALPMRQ SSILPCRRSM ASVATPPAAN ITRSVSEPWQ PITNVPVTVY SFPELEPRSL ESYSARHLH LPLRRDILHL AVIYEGDSTR RGMASTKTRY EVHGSHKKMS PQKGTGNARR GTRQSPLMKG GGKTFGPKPR D FSTKLNKK ...文字列:
MAGKGLKSLN EAMNALSIAS KSCRALPMRQ SSILPCRRSM ASVATPPAAN ITRSVSEPWQ PITNVPVTVY SFPELEPRSL ESYSARHLH LPLRRDILHL AVIYEGDSTR RGMASTKTRY EVHGSHKKMS PQKGTGNARR GTRQSPLMKG GGKTFGPKPR D FSTKLNKK VYDLAWRTAL SYRYKRGELI VTEDGLDLPL PNDFLWLAGG GKLSRELEDG YVRKWVHEFM TSLNWGKEAG RT TFITGDK RPNLFTGFEL AGAEGRALEL WDVDVKDLLE TGRIVIERSA LKEMIEDHQS DLVTRVAVQG LRQKGPNLGE VLV RAPRY

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4m

+
分子 #5: 50S ribosomal protein L5

分子名称: 50S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 39.170875 KDa
配列文字列: MASLRGVSRS ARALQPFSAQ FAVRRCASTQ TGAGAAAATP KSNIPDLAEL ETRSALDAPI PSEEDKKEFR PWKRAADRKA RLPSSRYQY HPPKYNRGPL HPIQSPPSSD PIARDFVPGP FNMPRLKETF RTVMASDLMT LAYIHTPPGT PKKEPTERLR A WEGDSPYF ...文字列:
MASLRGVSRS ARALQPFSAQ FAVRRCASTQ TGAGAAAATP KSNIPDLAEL ETRSALDAPI PSEEDKKEFR PWKRAADRKA RLPSSRYQY HPPKYNRGPL HPIQSPPSSD PIARDFVPGP FNMPRLKETF RTVMASDLMT LAYIHTPPGT PKKEPTERLR A WEGDSPYF ANRARRAPRG APELPIRERD ISFRNIPEIK EITVSTFVPL GLKNPDLLIV ARAVLLAMTG TMPEMTRSKN NV VQWQLQA NKPAGCKTTI YGNAAWEFMD RLIHLVLPRI KDWKGVPAST GDGSGNVQFG LNPEDVQLFP EVECNYDMYP AKM IPGCHI AIKTTATSDR QAKLLLQSLG VPFYSN

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5m

+
分子 #6: 60S ribosomal protein L6

分子名称: 60S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 28.629158 KDa
配列文字列: MFAPSRRRVL EAVASSSSSP VVTLPGFLVP AFQQTAGAAA RRNFSATTTR PSKLGRTPLS IPPGVEITIG EPFVKRDMTQ WKQQPKRKI TVQGPLGQLE MDIPDFIKID HDAEARRATL SVANRDEKEQ REMWGTTWAY LNRFIMGVSE GHTAVLRLVG I GYRATIDT ...文字列:
MFAPSRRRVL EAVASSSSSP VVTLPGFLVP AFQQTAGAAA RRNFSATTTR PSKLGRTPLS IPPGVEITIG EPFVKRDMTQ WKQQPKRKI TVQGPLGQLE MDIPDFIKID HDAEARRATL SVANRDEKEQ REMWGTTWAY LNRFIMGVSE GHTAVLRLVG I GYRATIDT RPEKEEYPGQ QFVCLKLGFS HPVEMGVPKG MKASTPQPTR ILLEGINREQ VMTFAADIRR WRVPEPYKGK GI FVNGETI KLKQKKIK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6m

+
分子 #7: RIBOSOMAL_L9 domain-containing protein

分子名称: RIBOSOMAL_L9 domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 33.173176 KDa
配列文字列: MTASALSKWP TCLACLRRLA QPFGTSAARH GEPRARAVPV IRPIVHTQTR AASHRMRLQD QGVVVRLLED IPKFGRKHAI FRIERGRMR NEWFPKNKAE YMTPARFQEL GLTRDAIGEV DRSFVIMSAL EAATRPKPEE QKTEEPVPEV QISQVNVPDV T PETAHALL ...文字列:
MTASALSKWP TCLACLRRLA QPFGTSAARH GEPRARAVPV IRPIVHTQTR AASHRMRLQD QGVVVRLLED IPKFGRKHAI FRIERGRMR NEWFPKNKAE YMTPARFQEL GLTRDAIGEV DRSFVIMSAL EAATRPKPEE QKTEEPVPEV QISQVNVPDV T PETAHALL SELIPNTLTF HREPVPIPIS QPKPALEPKI SPLIARHVPA STPETPSTGE ARRAIFGSVS SSDILNQIKA LV SGHEEAS RIVLGPSSVK IVGLAEDNDR IRHLGRWEIE IAVARAGGLD PVRKSVEILP SAQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL9m

+
分子 #8: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 37.363766 KDa
配列文字列: MSLRLSRPAV RGLGSAIKSS RISSRSAALL VPSTSTSAFS TASPQRAAAA GHLRLPDDYV PPTQPPSARP VDTRKSQLLR TYTSMLRST PLMLIFQHNN LTAIEWAAIR RELSLALSNV PVPEGAPDIT SKIHLQVVRT RIFDVALKTV EFFDPSTVEP T TATTATGT ...文字列:
MSLRLSRPAV RGLGSAIKSS RISSRSAALL VPSTSTSAFS TASPQRAAAA GHLRLPDDYV PPTQPPSARP VDTRKSQLLR TYTSMLRST PLMLIFQHNN LTAIEWAAIR RELSLALSNV PVPEGAPDIT SKIHLQVVRT RIFDVALKTV EFFDPSTVEP T TATTATGT KVPATYNHDL SKHAWKAVKE ATKNTEAVEK TVYGQLAPLL VGPVAILTLP SVSPAHLGAA LSVLAPSPPA FP APSRKKN PGYYDLTCQS GLQKLLLVGG RIEGKAFDYD GIKWVGGIEN GIEGLRAQLV HMLQSAGMGL TSVLEGAGKS LWL TMESRR SVLEEEQNPK KEGEGEEEKK E

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL10m

+
分子 #9: 60S ribosomal protein L19

分子名称: 60S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 16.629375 KDa
配列文字列:
MSKAAKGGAG GVEQVVKLIV GAGQASPSPP VGPALGSKGI KSMDFCKEFN ARTAHINTGT PMPVRVTVRP DRSFHFDVRT PHTSWLLLN AAEAPIGKGG KRKGASNPGK EVVGTVSLKH VYEIAKIKQS ELRLSGLPLE GLCRAVIYQA RSIGINVIP

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL11m

+
分子 #10: Ribosomal protein L13

分子名称: Ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 20.334576 KDa
配列文字列:
MSQTVGATRL AYSRVWHHIS AVTPHPTLST IKAPSEAITP PSLGRLASRI ATILMGKHKP IWDPSTDCGD YVVVTNCAGL YTTGHKKWR KTYYRHNTRP GSLQAITMDA LMEKHGGAEV LRKAVSGMLP KNRLRDKRLA RLKAFEGDAH PYKENLVRFG G KVVGAPGW EEAVKAIREA DMERL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL13m

+
分子 #11: 50S ribosomal protein L14

分子名称: 50S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 14.13563 KDa
配列文字列:
MIQLKTMLNC IDNSGAALVE CAMVVGQKRH ASIGDRIVVV VQKQRGADSA GMAASSAATK VKRGDIRHAV VVRTKQKVQR RDGSVVRFD DNACVLINKA GDPIGSRING VVGQELRKKK WSKILSMAPM QA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14m

+
分子 #12: Ribosomal protein L15

分子名称: Ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 33.951125 KDa
配列文字列: MPPRLPLAQA ARCCQASLTA RPSVPASSPT SSLISLFAAL SVQTRSASIL ASLSDNRGAY HKRIRKGRGP SSGYGKTAGR GTKGQKAHG HVKPWFQGGQ TPLIVSHGRK GFVNQFAADM SELNLEKLQE WIEAGRIDPT KPITPKEIIK SGIIGSSIKD G IKLLGRGK ...文字列:
MPPRLPLAQA ARCCQASLTA RPSVPASSPT SSLISLFAAL SVQTRSASIL ASLSDNRGAY HKRIRKGRGP SSGYGKTAGR GTKGQKAHG HVKPWFQGGQ TPLIVSHGRK GFVNQFAADM SELNLEKLQE WIEAGRIDPT KPITPKEIIK SGIIGSSIKD G IKLLGRGK ESFKIPVTIT VSRASASAIE AIEAAGGKIV TRFYTKESLK RLVEGKSLHT DKPLPVGKEH VEEILAQARS LK KKYYRLP DPTSRWDIEY YRDPAHRGYL SHQLAPGESP SLYFKVPTGG EKVKVVRADK VKASKTGDVA SEKLF

UniProtKB: Ribosomal protein L15

+
分子 #13: 60S ribosomal protein L16

分子名称: 60S ribosomal protein L16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 27.443828 KDa
配列文字列: MKHNASSALL SAFQGLRISS SATPFRAASL ATSAVRRPIA PTPVSVASHV RLFSATAIQA GSWLEPNLNR KKKMMKGRPR VPTGGSTKG TTVVWGDYGL RMRDHHRRIS AQQLKLAEDT IKQRLRGQKY RLYKRVACNV GVYVSGNEMR MGKGKGSFDH W ATRVAVNQ ...文字列:
MKHNASSALL SAFQGLRISS SATPFRAASL ATSAVRRPIA PTPVSVASHV RLFSATAIQA GSWLEPNLNR KKKMMKGRPR VPTGGSTKG TTVVWGDYGL RMRDHHRRIS AQQLKLAEDT IKQRLRGQKY RLYKRVACNV GVYVSGNEMR MGKGKGSFDH W ATRVAVNQ IIFEIRGQLH EQVIRDAFRL AGHKLPGLYE FVKKGDPPVV GITKLEDGLT VEDLKNPRKK LLMPEITQSA AS TSSTAAP PS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16m

+
分子 #14: 50S ribosomal protein L17

分子名称: 50S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 22.181545 KDa
配列文字列: MAGAHVKYRH LSRSSAHRQA LLRNLVTSLI KNETIHTTYP KAKEAQRLAE KLITLSKRDT ETARRSAQGI LYTPDQLLPK LFGEIRERY ANRPGGYTRV LRTEPKDQYS QAPSAILELV DGPKDMRFAM TAATVARDRE QKTESTDLTK KNMDKVTRFR K DGMRAFED ...文字列:
MAGAHVKYRH LSRSSAHRQA LLRNLVTSLI KNETIHTTYP KAKEAQRLAE KLITLSKRDT ETARRSAQGI LYTPDQLLPK LFGEIRERY ANRPGGYTRV LRTEPKDQYS QAPSAILELV DGPKDMRFAM TAATVARDRE QKTESTDLTK KNMDKVTRFR K DGMRAFED MVASLRDMKF TAGAINPKEW KKLDR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL17m

+
分子 #15: Mitochondrial ribosomal protein

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 28.235305 KDa
配列文字列: MNVTASLSRR PLGCLKAGLC QSLIRGYATA VAASTTQSTG ALPDHNFFRI ADKHTKKTRT AFAVFTPPKS PTTLPPSSVV TKSKAFKIA NSKLPPLMTK PPSDPMPLLT QQQIARMDPT GARTALFSKA RHAARVGDVL MVTHRRGGEP FAGVCLAIRR S GIDTAILL ...文字列:
MNVTASLSRR PLGCLKAGLC QSLIRGYATA VAASTTQSTG ALPDHNFFRI ADKHTKKTRT AFAVFTPPKS PTTLPPSSVV TKSKAFKIA NSKLPPLMTK PPSDPMPLLT QQQIARMDPT GARTALFSKA RHAARVGDVL MVTHRRGGEP FAGVCLAIRR S GIDTAILL RNHLGKVGVE MWYKIYNKNV AGIEIIKRRA KRARRAKLMY MRQPKHDMGS VEQYVFAWKK MRKVLSSKGL TG GVGGGGG KQKGQESKKK N

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL19m

+
分子 #16: Aconitate hydratase

分子名称: Aconitate hydratase / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 23.953027 KDa
配列文字列: MSRALLRSVL ELRTPVTRLP PSFLLPFRPA ARFLHQTAQQ VEPTSQSDAA AAAATLLKAS PPKVTTATTP EAPAAVPTST PFSQQPPIS QQVKELLPVL AAQPGHYTTI HIHGKPYLVT EGDTVKLPFK MPGVAPGDVL RLNRASVIGS RDLTLQGAPY V DERLFECR ...文字列:
MSRALLRSVL ELRTPVTRLP PSFLLPFRPA ARFLHQTAQQ VEPTSQSDAA AAAATLLKAS PPKVTTATTP EAPAAVPTST PFSQQPPIS QQVKELLPVL AAQPGHYTTI HIHGKPYLVT EGDTVKLPFK MPGVAPGDVL RLNRASVIGS RDLTLQGAPY V DERLFECR AIVMGTESEP MRVMIKKKRR CRKKKHVFSK HKYTVLRINQ LKINDVSSL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21m

+
分子 #17: Mitochondrial large ribosomal subunit

分子名称: Mitochondrial large ribosomal subunit / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 41.565996 KDa
配列文字列: MSLNVPSRRL LKSAPSSANA LVPALQSLSI NTRSIHTTPS QQWSLFGWGK QKVEERNKVK EELKQSELAR TRKPTQEEIF ERVRGRLEG DSIFADTTPS SQLAAEQDKH KDWATASAEK KLAAAHAKDQ TPTGISLKKD HLVRVVDPDP RSRVRWERKM V IRKLQRGT ...文字列:
MSLNVPSRRL LKSAPSSANA LVPALQSLSI NTRSIHTTPS QQWSLFGWGK QKVEERNKVK EELKQSELAR TRKPTQEEIF ERVRGRLEG DSIFADTTPS SQLAAEQDKH KDWATASAEK KLAAAHAKDQ TPTGISLKKD HLVRVVDPDP RSRVRWERKM V IRKLQRGT DPWSVEPKAE RIARTERKLV YKTGYLPTSV KKLVHLSRQI RGKTVSEALV QMQFSKKKMA KEVKTELLRA EA KAIVTRG MGLGKAAAAA AQKETGAEPV KIQTKDGKHL EIRDPTRIYV AETFVNKGFT RGVELDYRAR GRVFKMNKPT TTM TVVLKE EKTRIREHQE RVAKKLRQGP WVHLPDRPVT SQRQFYSW

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22m

+
分子 #18: Mitochondrial ribosomal protein subunit L23

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein subunit L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 26.005465 KDa
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MASVAKTGAE ALRNAPFRVG KKQIFLPNHV ITFVRPLPKQ PPNLATFIVP LEFNKLDLRD YLYHVYNVEV TGVRSFVNQR MHEQRHGDV GNWRRPKSQK MMIAELAKPF VWPKPPAEDA REAFDYAMWK KQKTAQEQDT KFQGIRAQGE VVPPSQFEVT K DRKAIKAR QSKFLSGEET WAPGKVNAFL NSKIVPEEEG WSEVEENLPL DESAESAAEE SSSKGSETRQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23m

+
分子 #19: KOW domain-containing protein

分子名称: KOW domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 45.460117 KDa
配列文字列: MDKLLRRVRM AEGMVARRAQ RKNALLKRIT ERKQNKKNGE AFTEAIQQRK AAVEARNEDW MLGPLAPRRE LDEITLSNGN FFGSLSPTR ALLESEVSEE ERKARVAWCG SPKFLCIAPG DRVVVIEGHH KDLIGTIEKL NTRNMTVEIQ SEKLKTNTTV P QFMQNDAD ...文字列:
MDKLLRRVRM AEGMVARRAQ RKNALLKRIT ERKQNKKNGE AFTEAIQQRK AAVEARNEDW MLGPLAPRRE LDEITLSNGN FFGSLSPTR ALLESEVSEE ERKARVAWCG SPKFLCIAPG DRVVVIEGHH KDLIGTIEKL NTRNMTVEIQ SEKLKTNTTV P QFMQNDAD KPVTQIYARL PISSVRLVHP LKDPQTGEYR DVIIRELRPR NIVHDRPTRT RSMRRFVPGE NIIIPWPKQE PI KREDQPA DTLRIDVDEK TFVPTLFRPP APQQVLDELR NKYSIFRTRH TPEYIAKKEQ EEQEKEAKKS AAKAMLTPVQ EYN RKQREL RRARGQPALT EEMLAKIGEV VARNKLGHHQ APKVKEETVA QIEKAVEQLS LGGGQEDAAT TTSPEQPKVV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24m

+
分子 #20: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 49.549199 KDa
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MHLAQLRQPL TRAAANSCHS VCRLPTTHSS VSATAILSEQ FAHLRIGPSS SNVAVEGRRY ASVKAQGAYR LKPKRTIPKK LGAKKTGDQ YVIPGNIIYK QRGTLWHPGE NTIMGRDHTI HAAVAGYVKY YRDPQLHPDR QYIGVVFNRN DKLPYPKDAP R KRKLGLVA VPRKVEEVEK PTMSASGLPL FVTRHETIEI PPPAVTTPAA AGKAVKGQGA RVSASGAAAV PASSSTISAS AS SNSNNGG SSVIAELIKE KLAARAEYNA RQSALRKLQQ QKMLARRGTR VLRLMNNYSY RETNWEIGRL IGDPGSVPGT EKV GSRKAK FRARRRRRNT FLLGIKERKL AKADRREEYR RRVREKREQR LVQRKEFLAK QREAKKAREG GAAAEKSEKK EVKA EKPAA AAPKVEKPKA PEAAKKESKP KVEEKKAAAA EPKKDSKTEK KD

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL27m

+
分子 #21: 50S ribosomal protein L24

分子名称: 50S ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 31.501131 KDa
配列文字列: MSSFLVRPFC LRATTTTTTT TTTTALVQQQ LRALTTTTAL TYHQPRVPSS AIPIPNVSGR VPLPDSTPVP EDFKIEIPSY PYGPRRVYH QSNTGLYGSA LIRFGNNVSK RNEIKTRRKW RPNVQQKRLW SKSLGVFVRT RVTTRVLRTI DKVGGLDEYL L GHKAARVK ...文字列:
MSSFLVRPFC LRATTTTTTT TTTTALVQQQ LRALTTTTAL TYHQPRVPSS AIPIPNVSGR VPLPDSTPVP EDFKIEIPSY PYGPRRVYH QSNTGLYGSA LIRFGNNVSK RNEIKTRRKW RPNVQQKRLW SKSLGVFVRT RVTTRVLRTI DKVGGLDEYL L GHKAARVK ELGPWGWMLR WRIMQTPEIR ERFAKEREAL GLPPRREEDE EKSLEEQLRE FQVAGIQFAE GKAPKTKGQL KE EADRLIK KSETEEFGLG QEEDLFMKEE PKPTKMA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL28m

+
分子 #22: 54S ribosomal protein L4, mitochondrial

分子名称: 54S ribosomal protein L4, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 29.64526 KDa
配列文字列: MASPAALRPS MGAIMQTCRS AATAPKVAVA VPVRALSTSA ALLKRHKYPT ARVTRDNSKQ RGESALRKSG TRWKLSVSDE PLPEPVPRE ELPPIQVDEN HGLWDFFYDR ETVAMAPLEH TKHGRAWTVS ELRKKSWDDL HRLWWVCVKE RNRIATANWE R TKSELGFG ...文字列:
MASPAALRPS MGAIMQTCRS AATAPKVAVA VPVRALSTSA ALLKRHKYPT ARVTRDNSKQ RGESALRKSG TRWKLSVSDE PLPEPVPRE ELPPIQVDEN HGLWDFFYDR ETVAMAPLEH TKHGRAWTVS ELRKKSWDDL HRLWWVCVKE RNRIATANWE R TKSELGFG LAEANERDRN VKQTMRGIKH VLTERFYAWE DAVKLAEQDP EIDLSNPENP YTPSTFLEAE ETAEGAEASE TQ STTTEID PTTIPSSKSQ AEAPRV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29m

+
分子 #23: 50S ribosomal protein L30

分子名称: 50S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 18.196393 KDa
配列文字列:
MSFFRITLHR SAIGLPKRTH GVLAALGLRR RNQTVFHPVE PQFAGMLMKV KELVRVEEVP HRLTKRELKD ERKPDAGFVV EKQVRRFIP GVGVQDEVDF SKVVEELKAQ KVENVEGVEK MVVEGGAVVR DGKRAGDLGV RTRSDWEVIG KMKSVLPKVK A L

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30m

+
分子 #24: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 23.766729 KDa
配列文字列: MSSKLPTTLL RRPSALPSTT TYTAYSASRP TPPSCTAHGA QGQQIRNATF VPRHRRPYQF TQLVQLSDGS TFTVRTTMPT ALYKSAKDS RNHLLWQPSD KSLKNVELDE AGKLAAFRER YGRGWDLDAK MTPEEEAAAA AALAAGGGAG VPGGKAAKKA A EEALLAKK ...文字列:
MSSKLPTTLL RRPSALPSTT TYTAYSASRP TPPSCTAHGA QGQQIRNATF VPRHRRPYQF TQLVQLSDGS TFTVRTTMPT ALYKSAKDS RNHLLWQPSD KSLKNVELDE AGKLAAFRER YGRGWDLDAK MTPEEEAAAA AALAAGGGAG VPGGKAAKKA A EEALLAKK KKEEEEAAKK AAEAEEADPF DSLTDLISGY ATENMNPGLN FKETRHYGKK K

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL31m

+
分子 #25: Mitochondrial ribosomal protein subunit L32

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein subunit L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 14.114779 KDa
配列文字列:
MAAMTAAAAA PAMRLFNPST FFQTLRTQRF GVPALNFAVP AAAISLLPSI PSLLEDIWEG ILRAVPKKKT SHMKKRHRQM AGKALKDVT HLNRCPACGN LKRMHHLCST CLGKLKGFMD RNGGSNAKAY

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL32m

+
分子 #26: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 7.027574 KDa
配列文字列:
MAKKAKSRII NVRLISMAMT GYFYTFTRPR TSLPMSMLKY DPIVRRKVLF LEQKRKGRS

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL33m

+
分子 #27: Related to ribosomal protein L34, mitochondrial

分子名称: Related to ribosomal protein L34, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 14.853288 KDa
配列文字列:
MSRIFSSALQ AVFKPSAFLP KTATRSFSIL PSLRPATLSS TPSTIFRAPN AITAPSASPS ATTGIDGEVL DLLSASSLIS SHPALSGLG SQIRCGPRPT MSGATRLVQK RRHGFLSRVK TKNGQKTLKR RLAKGRLRLS A

UniProtKB: Related to ribosomal protein L34, mitochondrial

+
分子 #28: Ribosomal protein

分子名称: Ribosomal protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 13.960405 KDa
配列文字列:
MSNLFRSLAS SMRALSLAAP RATAVNTTKT VVSTHQTRCL SQGLLSRHIC TPMCSHNRPV AVCQSAKNGL QSKQQSRGMK VHSAIKKRC EHCKVVRRKA NKRQNGYLYI ICPANPRHKQ RQGYR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL36m

+
分子 #29: Mitochondrial large ribosomal subunit YmL35

分子名称: Mitochondrial large ribosomal subunit YmL35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 50.749188 KDa
配列文字列: MSTCQQVARP LVRCLRQTGP GAATCSTRSV AVAAVRPFSS TPMRKEEGAT TTTTTSPVDS TTTPPPLPSA TEAKATVADT VVGGPELGS RRRRAALATT GNLPFEQLPY QCFQDARKIL QQDRAAKIAQ IVKETEKIKL IEARDASEFE GGEAAKQTRI K SLRKYIEE ...文字列:
MSTCQQVARP LVRCLRQTGP GAATCSTRSV AVAAVRPFSS TPMRKEEGAT TTTTTSPVDS TTTPPPLPSA TEAKATVADT VVGGPELGS RRRRAALATT GNLPFEQLPY QCFQDARKIL QQDRAAKIAQ IVKETEKIKL IEARDASEFE GGEAAKQTRI K SLRKYIEE LKILADINDP EVKRRFEDGR GDMTKPVYRF MAERRWRSMD YKIIAQRISQ FHVVPDLLPA FDPTMDVKLS FR GYQVSPG AILDSRVTEV APTLRMQVFD KGERLLTVVV IDSDVPDVTH DNFKRRCHFL AANIPWDPSK TVLSLRSVGD RVE GDVGKP WLPPFAQKGS PYHRLNVFVL EQKPGAKIDG EALKKHLENR ENFSLKGFRE KFDLEPVGFN LFRSEWDEGT AEVM ERHGI PGAEVEFKRQ KFASLKPPRK ARGWEAKRQK PKYKSLWKYV KRIA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL38

+
分子 #30: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 41.496336 KDa
配列文字列: MVSATKKPVS AMSAKNSTRH RKVSHKVTKT IATAKSQVIS NKAMKIRTKS WKDMPSPKRR RRINAMVDEL RLQGNVKMPK PGKSTYKAG GGERVRLVKA ASTLPTPPLT PPVLSKPTGS ASQSKGDLKP KRPTPEKKRS VSKRDVERFF LSTQTSTRRR E NTPIHAPI ...文字列:
MVSATKKPVS AMSAKNSTRH RKVSHKVTKT IATAKSQVIS NKAMKIRTKS WKDMPSPKRR RRINAMVDEL RLQGNVKMPK PGKSTYKAG GGERVRLVKA ASTLPTPPLT PPVLSKPTGS ASQSKGDLKP KRPTPEKKRS VSKRDVERFF LSTQTSTRRR E NTPIHAPI MSSTFTSLRG LATRLFAGGA RPSPSSLLLP NKPATAALPT AIQHQQTASY ASKGKSGPPA GMFSGQKAGS KK SKGPKQV DPRIINILRH FAVLSPKRIP PPLRFGRNRY LRHWTIHRAW LLFRRQQREQ RERILMQQHQ SMSNACEELR NTE GPGTRE TGYLYRVAML KNGVYGLKSI PIEYASRALV ETPGRQAWNH EWKR

UniProtKB: Uncharacterized protein

+
分子 #31: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 11.796603 KDa
配列文字列:
MQPTRILQGL KYRKLRLTTK DVNKGFYKGN RTGSMGTHTS YGTYKIDYTK VRTYVCPDLT GFKLTPFVSK TIRPVHDQFP GDKLGPKNP ATYLARWKSE NGLD

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL41

+
分子 #32: Mitochondrial ribosomal protein L43

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L43 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 15.126693 KDa
配列文字列:
MTVKALTQIS SAGRNGVGAF VLQCKKLDIH YSDWAGSSRG MNGFIKSLLP KFAAANPQIE FVVSPRPAKH PILMGHYING RTKAICVRN MEPLEILKKA ELLRDASGEK PQKFKKPVTS TNPSVRGVWS PYHGQGMAV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL43

+
分子 #33: 60S ribosomal protein L3

分子名称: 60S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 48.106484 KDa
配列文字列: MKRIATPSLT SRLLVAARSG VSPATAAIRS RSAISVRSQS TAALAQHDAS HDLNNDRFPP LEPLPPAAES LPSPLPERAL TSAKLAALH ARLNLSPKIP LQTLARTLVD ASADENPQFN NANLAFVGQT LINYHIAEWL LCKYPRLPQG ILFSAMKAYA G PKPLLQIA ...文字列:
MKRIATPSLT SRLLVAARSG VSPATAAIRS RSAISVRSQS TAALAQHDAS HDLNNDRFPP LEPLPPAAES LPSPLPERAL TSAKLAALH ARLNLSPKIP LQTLARTLVD ASADENPQFN NANLAFVGQT LINYHIAEWL LCKYPRLPQG ILFSAMKAYA G PKPLLQIA RSWGVDTAAV PGGEVDPGLL QFDALKPGVA ITNFGYKRTE LAYLEKFKWR RGMASRVVLD DDFGDVVRSD PK VAADLEK AMEEQDQDKT PDEEEAEMVA NEQDQDVSYD RYGNPDTRAA AERAHAYFVR AVVGAIYAHC GREAAKAFVK AHI MSRTLD IAKLFEFKYP TRELAALCAR EDFEPPVARL LSETGRQSRT PVFVVGIYSG SDKLGEGAAS SLDHARFKAA MNAL KAWYL YSPGENPRVP SDMLEEGAKP WTPAYIDMGE VISR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL44

+
分子 #34: 50S ribosomal subunit L30

分子名称: 50S ribosomal subunit L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 41.322074 KDa
配列文字列: MSASSRGAAL LRSQQRSICL QCRNQTRVLA PAGVTSAPRR FYSAEASATA TATATATTTT TLPPPHPPVT TSTGTHAATS TSSQIYRIK SGVILTRPPL LTRDLTPFEE SFYFYQKRLN ERLTAPFRKD FYFKKDTAAD LDWRIKLKER HGVPAKDIGR Y NPRGRMAW ...文字列:
MSASSRGAAL LRSQQRSICL QCRNQTRVLA PAGVTSAPRR FYSAEASATA TATATATTTT TLPPPHPPVT TSTGTHAATS TSSQIYRIK SGVILTRPPL LTRDLTPFEE SFYFYQKRLN ERLTAPFRKD FYFKKDTAAD LDWRIKLKER HGVPAKDIGR Y NPRGRMAW NDEVLVGSQT SSRKHMVEKL LADAEMRVSE DGEEIPAEDR VPVEKPMPRR TEADEKGDVK RLDRALDKTL YL VVKKKAD KEGEEAKWMF PTGVVPTDEG LHETAARILA ESAGVNMNTW IVGRVPVAHH VVRPVFGQKD GALLKKGEKI FFL KGRIMA GQADLTDNLH DLVDFKWLTQ EELRSTLAEE YFHSVKGMFA ER

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL46

+
分子 #35: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 18.180738 KDa
配列文字列:
MFRSTFFGLS RAIVQPATPL TVRAAFQSRF YSAAAAASQP TTTATTTTPL QQQQQQQPTT QPTTPIQTQT GAAPTESTKP VAKPYLVGR AWTQRLPVYH LAKRGGNKKL TQIKKVQGDG QALRRDLAQF LGLEVKEVRV KVPTGHLEVD GHRREEIVKF L DGLGF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL49

+
分子 #36: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 49.748516 KDa
配列文字列: MRRIPRIPST ASALCSSSSS VASTSAAPLR TLRAAADSSS ICQSCSFSTQ TSATRNRVWQ NTVQTQRRCA STVTETTPEA PVAAAAAET ATESTETVEQ QRKRKGGFFE TQRQVNLVLP GQPTRADAPE KIRDPNYEPA TSGAGLQEIG GMSDWWSKPE H FRDGGKQF ...文字列:
MRRIPRIPST ASALCSSSSS VASTSAAPLR TLRAAADSSS ICQSCSFSTQ TSATRNRVWQ NTVQTQRRCA STVTETTPEA PVAAAAAET ATESTETVEQ QRKRKGGFFE TQRQVNLVLP GQPTRADAPE KIRDPNYEPA TSGAGLQEIG GMSDWWSKPE H FRDGGKQF EYQGFAPQEK ITDPRLLKVI LRRALAEGLA LKKFGANPKN PADMASIIGN GDHWQRTVSV EMCRGENGEL SL KNESDLQ KVWILMRNAA EKTYYQREWQ EEINRLRSLG EKEQAKQLLE EGKKLGYRLK SEEGSLVKLT VDEAVELRKS WNN DWKEAI IRDPVVKFYA AKRIQKMTGH ILSDGKLTSI QTVANFMDAL VTPPKPKKLA EQIEQSSILP ELPNVKVYPR RVTP VDKER MVGRWKVIQK ELQKRELPVL GTGNHGKYVE LKWLGSKQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL50

+
分子 #37: Mitochondrial ribosomal protein L44

分子名称: Mitochondrial ribosomal protein L44 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 11.128777 KDa
配列文字列:
MLTRFITDVS TRFNPFSAKA KAARLFLSFL PPNARSNGMN ITTQLLPRNS TETPLLYVKF KDGKEMNLDV ENMGIKSIVE EVDRHSRIL QKQADLNDG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL53

+
分子 #38: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 23.179602 KDa
配列文字列: MICRTCLRRA SGFARPAAAA ATRPMVAASS RAAFSTTFSV CTPPAATPAA AAPATSTAEA GLAPVPGAAT TEQAKAAISS CPAGTKLNG LNYFKNKADP VALPDEEYPE WLWRCLEVQK KTDDAADADA GDEFSKSKKQ RRLAMKRARA QEAKILASGD L EALAPKIP ...文字列:
MICRTCLRRA SGFARPAAAA ATRPMVAASS RAAFSTTFSV CTPPAATPAA AAPATSTAEA GLAPVPGAAT TEQAKAAISS CPAGTKLNG LNYFKNKADP VALPDEEYPE WLWRCLEVQK KTDDAADADA GDEFSKSKKQ RRLAMKRARA QEAKILASGD L EALAPKIP LQKQSVNLPG AVNGGVQDAV LADEKREELR KAMRKERKAK IKESNYLKAM

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL54

+
分子 #39: RNase III domain-containing protein

分子名称: RNase III domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 29.625195 KDa
配列文字列: MAALTPSRSV FASTCKTIAQ QCSRRPVAVQ QLAAVPVARQ VSSSSAVQQE QDASGTSSSQ QPRPRWSYTP ERMKGPGFSL NLVKDPRRK QWMVNSDPAK LDAFYDAFLG QGGSRMLSEE TKWLAVTHKS FDYGRRGYNT RLAFLGRQII ALETTRSILT S PVLNEPIV ...文字列:
MAALTPSRSV FASTCKTIAQ QCSRRPVAVQ QLAAVPVARQ VSSSSAVQQE QDASGTSSSQ QPRPRWSYTP ERMKGPGFSL NLVKDPRRK QWMVNSDPAK LDAFYDAFLG QGGSRMLSEE TKWLAVTHKS FDYGRRGYNT RLAFLGRQII ALETTRSILT S PVLNEPIV DKYGRTPYNH AALANIDKLI YTQPLDIMDK TKIARMGIDF GLLTVMRWKP RMPEDLESSG VVVVLNSTLF AI IGAISLE KGAAVAQRIV REKILKRLGA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL57

+
分子 #40: 60S ribosomal protein L20

分子名称: 60S ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 25.439018 KDa
配列文字列: MEASLSLFRP VATCCRRVAL SSSSSSSQKA AAVAGISVRY QSTANRTKRM LNIPPHESFL NVPVEGDRII FNPPSSEASV YHTPFKFLP RSDPRRRANI YKLFKPPQAP ITTPESSSTD AAAADQHGDL PPVLYNPTKS YNVTPEQVEE IRELRAKDPK K YSVTYLSN ...文字列:
MEASLSLFRP VATCCRRVAL SSSSSSSQKA AAVAGISVRY QSTANRTKRM LNIPPHESFL NVPVEGDRII FNPPSSEASV YHTPFKFLP RSDPRRRANI YKLFKPPQAP ITTPESSSTD AAAADQHGDL PPVLYNPTKS YNVTPEQVEE IRELRAKDPK K YSVTYLSN KYNCTKVFIM MCTQAPREHQ EQHKLARART AENWGPRRAA AKLDARRRKE MLHRGEI

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL58

+
分子 #41: Mitoc_mL59 domain-containing protein

分子名称: Mitoc_mL59 domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 18.745025 KDa
配列文字列:
AATVKQHVQL ALSLPPRLRT FLARYPPASI LPAGADPETH KTPYQEESPN PFMPTKHPIT GKWHNPKYSL RRQAELVKLA QEHGVEELL PFTRKLNEEK LRKRVELGLR VKGTGVGEKV KGHKHERTLV AKMEKRREAM LAMPDLIREW KKVGKRNWTK F PK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL59 domain-containing protein

+
分子 #42: 54S ribosomal protein L31, mitochondrial

分子名称: 54S ribosomal protein L31, mitochondrial / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 13.131485 KDa
配列文字列:
MFGAFRFTNP LSGGLLWKIP WRMSKFQKLR QRRRLRAVDN VVATIENALA KKGETVKAVE RWRAEMPTEA EMLPKDKYTI FDRKEKRYR KGIHKLPKWT RVSQRVNPPG Y

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL60

+
分子 #43: Uncharacterized protein

分子名称: Uncharacterized protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 32.516111 KDa
配列文字列: MNSVTTSTIG RLAFGVSRLS AVTNVAGAVR HASTHPTTAI PKPTTAVLKT SPLAEETAVE LKSPSRLQLK SEPGNKGNPK GHGDRIWAF HHIEQGQVIY STKPVISHQH LIRQQPFTGK NLVPRKIRKD YWRPLAMIEL AGKDQGAVGR SVYQKLREFK K RHELDWAN ...文字列:
MNSVTTSTIG RLAFGVSRLS AVTNVAGAVR HASTHPTTAI PKPTTAVLKT SPLAEETAVE LKSPSRLQLK SEPGNKGNPK GHGDRIWAF HHIEQGQVIY STKPVISHQH LIRQQPFTGK NLVPRKIRKD YWRPLAMIEL AGKDQGAVGR SVYQKLREFK K RHELDWAN EAEEGRKLMH KSKRERGQEL NDQKPNSVAD MAAVLAGAGK GNLMWQVSRL GSSSELVGEI KKASGAVEKG AV VDVKRQL RRATVYWTNE QDKFHAREWS DNVSHEVGIP GEAEKKRMPI RMSSE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL67

+
分子 #44: 60S ribosomal protein L1

分子名称: 60S ribosomal protein L1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 33.327664 KDa
配列文字列: MASTQQCLAS LARLSLSTPT RAALPTIPKF LVPSVAASQV RYATNNPNKG GAKKAPKKKK QYKFFKSWDL TGQQQFSLCD AMRYLRAVE VGQPPLSVKY EVHVKLRTKK NGPVVRDRVR LPTPVKTDTR IAVICPEGSA LQEEAKNLGA VMAGEETLFE A IRSGNFPF ...文字列:
MASTQQCLAS LARLSLSTPT RAALPTIPKF LVPSVAASQV RYATNNPNKG GAKKAPKKKK QYKFFKSWDL TGQQQFSLCD AMRYLRAVE VGQPPLSVKY EVHVKLRTKK NGPVVRDRVR LPTPVKTDTR IAVICPEGSA LQEEAKNLGA VMAGEETLFE A IRSGNFPF NKLLCHTESE GALRKANVGK LLGPKGLMPS GKTKTITNNL EATFRDMIGM DEYRERNGVV RMAVGQLGFT PK QLAENIR VFMAKIKSDI GKLDDTTPKM VEEVVLSTTH GPGMSLNAEF APTDDKIKPE DLESVM

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL1m

+
分子 #45: L51_S25_CI-B8 domain-containing protein

分子名称: L51_S25_CI-B8 domain-containing protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Neurospora crassa OR74A (菌類)
分子量理論値: 22.734252 KDa
配列文字列: MVGVIRRLNV VRELLNIRAG PGAALLPKEV TKVHMQFAHR IEEGHMGPRK FWRENLPKLK YWNPAVPMVI NRTTDQKGPA VMTIYFRDD KDAKPSSTPF PTSSADGSSP APKPAQGERI VTIDMKNRNS SVILKEFLDK TGAVAVQPTA KDEEEFREFE D LHRRSEID ...文字列:
MVGVIRRLNV VRELLNIRAG PGAALLPKEV TKVHMQFAHR IEEGHMGPRK FWRENLPKLK YWNPAVPMVI NRTTDQKGPA VMTIYFRDD KDAKPSSTPF PTSSADGSSP APKPAQGERI VTIDMKNRNS SVILKEFLDK TGAVAVQPTA KDEEEFREFE D LHRRSEID RERIRKMNDA KKREKAMLAK AMSDAQSIKA ASA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein mL61

+
分子 #46: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 46 / コピー数: 163 / : MG
分子量理論値: 24.305 Da

+
分子 #47: SPERMINE

分子名称: SPERMINE / タイプ: ligand / ID: 47 / コピー数: 1 / : SPM
分子量理論値: 202.34 Da
Chemical component information

ChemComp-SPM:
SPERMINE / スペルミン

+
分子 #48: POTASSIUM ION

分子名称: POTASSIUM ION / タイプ: ligand / ID: 48 / コピー数: 12 / : K
分子量理論値: 39.098 Da

+
分子 #49: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 49 / コピー数: 2 / : ZN
分子量理論値: 65.409 Da

+
分子 #50: NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE

分子名称: NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE / タイプ: ligand / ID: 50 / コピー数: 1 / : NAD
分子量理論値: 663.425 Da
Chemical component information

ChemComp-NAD:
NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE / NAD*YM

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.5
構成要素:
濃度名称
20.0 mMHEPES-KOH4-(2-hydroxyethyl)-1-piperazineethanesulfonic acid-KOH
15.0 mMKClPotassium chloride
15.0 mMMg(C2H3O2)2Magnesium acetate
0.05 %DDMn-Dodecyl B-D-maltoside
0.0075 %Cardiolipin1,3-bis(sn-3-phosphatidyl)-sn-glycerol
2.0 mMDTTDithiothreitol
グリッドモデル: Quantifoil R2/2 / 材質: COPPER / 支持フィルム - 材質: CARBON / 支持フィルム - トポロジー: CONTINUOUS / 支持フィルム - Film thickness: 2.7
凍結凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI TITAN KRIOS
特殊光学系エネルギーフィルター - 名称: GIF Quantum LS / エネルギーフィルター - スリット幅: 20 eV
撮影フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)
検出モード: COUNTING / デジタル化 - 画像ごとのフレーム数: 1-20 / 実像数: 3172 / 平均電子線量: 35.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系C2レンズ絞り径: 70.0 µm / 倍率(補正後): 130000 / 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD
試料ステージ試料ホルダーモデル: FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
ホルダー冷却材: NITROGEN
実験機器
モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

初期モデルモデルのタイプ: EMDB MAP
EMDB ID:
最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.74 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION / 使用した粒子像数: 131806
初期 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING / ソフトウェア - 名称: RELION
最終 角度割当タイプ: PROJECTION MATCHING / ソフトウェア - 名称: RELION
最終 3次元分類ソフトウェア - 名称: RELION
FSC曲線 (解像度の算出)

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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