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検索結果

検索 (著者・登録者: yutaro & s)の結果93件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-49839:
ATPase Hybrid F1 with the ancestral core domains Binding Dwell
手法: 単粒子 / : Stewart AG, Noji H, Sobti M, Suzuki AK

EMDB-49840:
ATPase Hybrid F1 with the ancestral core domains Catalytic Dwell
手法: 単粒子 / : Stewart AG, Noji H, Sobti M, Suzuki AK

EMDB-49841:
ATPase hybrid F1 with the ancestral core domains Hexamer without stalk Binding dwell
手法: 単粒子 / : Stewart AG, Noji H, Sobti M, Suzuki AK

EMDB-49842:
ATPase hybrid F1 with the ancestral core domains Tetramer with stalk Binding Dwell
手法: 単粒子 / : Stewart AG, Noji H, Sobti M, Suzuki AK

EMDB-49843:
ATPase hybrid F1 with the ancestral core domains Tetramer no stalk Binding Dwell
手法: 単粒子 / : Stewart AG, Noji H, Sobti M, Suzuki AK

PDB-9nvl:
ATPase Hybrid F1 with the ancestral core domains Binding Dwell
手法: 単粒子 / : Stewart AG, Noji H, Sobti M, Suzuki AK

PDB-9nvm:
ATPase Hybrid F1 with the ancestral core domains Catalytic Dwell
手法: 単粒子 / : Stewart AG, Noji H, Sobti M, Suzuki AK

EMDB-60764:
Local refinement structure of sEGFR and 528 Fv (from HL-type bispecific diabody Ex3) complex
手法: 単粒子 / : Sato K, Uehara S, Tsugita A, Matsui T, Asano R, Makabe K, Yokoyama T, Tanaka Y

EMDB-60765:
HL-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (closed conformation)
手法: 単粒子 / : Sato K, Uehara S, Tsugita A, Matsui T, Asano R, Makabe K, Yokoyama T, Tanaka Y

EMDB-60766:
HL-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (middle conformation)
手法: 単粒子 / : Sato K, Uehara S, Tsugita A, Matsui T, Asano R, Makabe K, Yokoyama T, Tanaka Y

EMDB-60767:
HL-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (open conformation)
手法: 単粒子 / : Sato K, Uehara S, Tsugita A, Matsui T, Asano R, Makabe K, Yokoyama T, Tanaka Y

EMDB-60768:
Local refinement structure of sEGFR and 528 Fv (from LH-type bispecific diabody Ex3) complex
手法: 単粒子 / : Sato K, Uehara S, Tsugita A, Matsui T, Asano R, Makabe K, Yokoyama T, Tanaka Y

EMDB-60769:
LH-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (closed conformation)
手法: 単粒子 / : Sato K, Uehara S, Tsugita A, Matsui T, Asano R, Makabe K, Yokoyama T, Tanaka Y

EMDB-60770:
LH-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (middle conformation)
手法: 単粒子 / : Sato K, Uehara S, Tsugita A, Matsui T, Asano R, Makabe K, Yokoyama T, Tanaka Y

EMDB-60771:
LH-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (open conformation)
手法: 単粒子 / : Sato K, Uehara S, Tsugita A, Matsui T, Asano R, Makabe K, Yokoyama T, Tanaka Y

PDB-9ip7:
Local refinement structure of sEGFR and 528 Fv (from HL-type bispecific diabody Ex3) complex
手法: 単粒子 / : Sato K, Uehara S, Tsugita A, Matsui T, Asano R, Makabe K, Yokoyama T, Tanaka Y

PDB-9ip8:
Poly-alanine model for HL-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (closed conformation)
手法: 単粒子 / : Sato K, Uehara S, Tsugita A, Matsui T, Asano R, Makabe K, Yokoyama T, Tanaka Y

PDB-9ip9:
Poly-alanine model for HL-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (middle conformation)
手法: 単粒子 / : Sato K, Uehara S, Tsugita A, Matsui T, Asano R, Makabe K, Yokoyama T, Tanaka Y

PDB-9ipa:
Poly-alanine model for HL-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (open conformation)
手法: 単粒子 / : Sato K, Uehara S, Tsugita A, Matsui T, Asano R, Makabe K, Yokoyama T, Tanaka Y

PDB-9ipb:
Local refinement structure of sEGFR and 528 Fv (from LH-type bispecific diabody Ex3) complex
手法: 単粒子 / : Sato K, Uehara S, Tsugita A, Matsui T, Asano R, Makabe K, Yokoyama T, Tanaka Y

PDB-9ipc:
Poly-alanine model for LH-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (closed conformation)
手法: 単粒子 / : Sato K, Uehara S, Tsugita A, Matsui T, Asano R, Makabe K, Yokoyama T, Tanaka Y

PDB-9ipd:
Poly-alanine model for LH-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (middle conformation)
手法: 単粒子 / : Sato K, Uehara S, Tsugita A, Matsui T, Asano R, Makabe K, Yokoyama T, Tanaka Y

PDB-9ipe:
Poly-alanine model for LH-type bispecific diabody Ex3 composed of 528 and OKT3 Fvs in ternary complex with sEGFR and CD3gamma-epsilon (open conformation)
手法: 単粒子 / : Sato K, Uehara S, Tsugita A, Matsui T, Asano R, Makabe K, Yokoyama T, Tanaka Y

EMDB-39431:
Structure of Cas9-sgRNA ribonucleoprotein bound to nucleosome
手法: 単粒子 / : Nagamura R, Kujirai T, Kusakizako T, Hirano H, Kurumizaka H, Nureki O

PDB-8yny:
Structure of Cas9-sgRNA ribonucleoprotein bound to nucleosome
手法: 単粒子 / : Nagamura R, Kujirai T, Kusakizako T, Hirano H, Kurumizaka H, Nureki O

EMDB-39306:
SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (termination) overall map
手法: 単粒子 / : Shuto O, Nakagawa R, Mizuki H, Satoshi NO, Hisato H, Yuzuru I, Nureki O

EMDB-39307:
SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (termination) focused map
手法: 単粒子 / : Shuto Y, Nakagawa R, Mizuki H, Satoshi NO, Hisato H, Yuzuru I, Nureki O

EMDB-39308:
SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (initiation) overall map
手法: 単粒子 / : Shuto Y, Nakagawa R, Mizuki H, Satoshi NO, Hisato H, Yuzuru I, Nureki O

EMDB-39309:
SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (initiation) focused map
手法: 単粒子 / : Shuto Y, Nakagawa R, Mizuki H, Satoshi NO, Hisato H, Yuzuru I, Nureki O

EMDB-39314:
SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (elongation 16-nt) overall map
手法: 単粒子 / : Yutaro S, Ryoya N, Mizuki H, Satoshi NO, Hisato H, Yuzuru I, Osamu N

EMDB-39315:
SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (elongation 16-nt) focused map
手法: 単粒子 / : Shuto Y, Nakagawa R, Mizuki H, Satoshi NO, Hisato H, Yuzuru I, Nureki O

EMDB-39316:
SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (elongation 28-nt) overall map
手法: 単粒子 / : Shuto Y, Nakagawa R, Mizuki H, Satoshi NO, Hisato H, Yuzuru I, Nureki O

EMDB-39317:
SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (elongation 28-nt) focused map
手法: 単粒子 / : Shuto Y, Nakagawa R, Mizuki H, Satoshi NO, Hisato H, Yuzuru I, Nureki O

EMDB-37858:
SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (termination)
手法: 単粒子 / : Shuto Y, Nakagawa R, Hoki M, Omura SN, Hirano H, Itoh Y, Nureki O

EMDB-37859:
SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (initiation)
手法: 単粒子 / : Shuto Y, Nakagawa R, Hoki M, Omura SN, Hirano H, Itoh Y, Nureki O

EMDB-37860:
SpCas9-pegRNA-target DNA complex (pre-initiation)
手法: 単粒子 / : Shuto Y, Nakagawa R, Hoki M, Omura SN, Hirano H, Itoh Y, Nureki O

EMDB-37861:
SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (elongation 16-nt)
手法: 単粒子 / : Shuto Y, Nakagawa R, Hoki M, Omura SN, Hirano H, Itoh Y, Nureki O

EMDB-39253:
SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (elongation 28-nt)
手法: 単粒子 / : Shuto Y, Nakagawa R, Hoki M, Omura SN, Hirano H, Itoh Y, Nureki O

PDB-8wus:
SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (termination)
手法: 単粒子 / : Shuto Y, Nakagawa R, Hoki M, Omura SN, Hirano H, Itoh Y, Nureki O

PDB-8wut:
SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (initiation)
手法: 単粒子 / : Shuto Y, Nakagawa R, Hoki M, Omura SN, Hirano H, Itoh Y, Nureki O

PDB-8wuu:
SpCas9-pegRNA-target DNA complex (pre-initiation)
手法: 単粒子 / : Shuto Y, Nakagawa R, Hoki M, Omura SN, Hirano H, Itoh Y, Nureki O

PDB-8wuv:
SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (elongation 16-nt)
手法: 単粒子 / : Shuto Y, Nakagawa R, Hoki M, Omura SN, Hirano H, Itoh Y, Nureki O

PDB-8ygj:
SpCas9-MMLV RT-pegRNA-target DNA complex (elongation 28-nt)
手法: 単粒子 / : Shuto Y, Nakagawa R, Hoki M, Omura SN, Hirano H, Itoh Y, Nureki O

EMDB-42149:
S1V2-72 Fab bound to EHA2 from influenza B/Malaysia/2506/2004
手法: 単粒子 / : Finney J, Kong S, Walsh Jr RM, Harrison SC, Kelsoe G

PDB-8udg:
S1V2-72 Fab bound to EHA2 from influenza B/Malaysia/2506/2004
手法: 単粒子 / : Finney J, Kong S, Walsh Jr RM, Harrison SC, Kelsoe G

EMDB-34741:
SARS-CoV-2 spike in complex with neutralizing antibody NIV-11
手法: 単粒子 / : Moriyama S, Anraku Y, Muranishi S, Adachi Y, Kuroda D, Higuchi Y, Kotaki R, Tonouchi K, Yumoto K, Suzuki T, Kita S, Someya T, Fukuhara H, Kuroda Y, Yamamoto T, Onodera T, Fukushi S, Maeda K, Nakamura-Uchiyama F, Hashiguchi T, Hoshino A, Maenaka K, Takahashi Y

EMDB-34742:
SARS-CoV-2 spike in complex with neutralizing antibody NIV-11 focused on RBD and NIV-11 interface
手法: 単粒子 / : Moriyama S, Anraku Y, Muranishi S, Adachi Y, Kuroda D, Higuchi Y, Kotaki R, Tonouchi K, Yumoto K, Suzuki T, Kita S, Someya T, Fukuhara H, Kuroda Y, Yamamoto T, Onodera T, Fukushi S, Maeda K, Nakamura-Uchiyama F, Hashiguchi T, Hoshino A, Maenaka K, Takahashi Y

PDB-8hgl:
SARS-CoV-2 spike in complex with neutralizing antibody NIV-11
手法: 単粒子 / : Moriyama S, Anraku Y, Muranishi S, Adachi Y, Kuroda D, Higuchi Y, Kotaki R, Tonouchi K, Yumoto K, Suzuki T, Kita S, Someya T, Fukuhara H, Kuroda Y, Yamamoto T, Onodera T, Fukushi S, Maeda K, Nakamura-Uchiyama F, Hashiguchi T, Hoshino A, Maenaka K, Takahashi Y

PDB-8hgm:
Structure of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with neutralizing antibody NIV-11
手法: 単粒子 / : Moriyama S, Anraku Y, Muranishi S, Adachi Y, Kuroda D, Higuchi Y, Kotaki R, Tonouchi K, Yumoto K, Suzuki T, Kita S, Someya T, Fukuhara H, Kuroda Y, Yamamoto T, Onodera T, Fukushi S, Maeda K, Nakamura-Uchiyama F, Hashiguchi T, Hoshino A, Maenaka K, Takahashi Y

EMDB-33820:
SARS-CoV-2 spike in complex with neutralizing antibody NIV-8 focused on RBD and NIV-8 interface
手法: 単粒子 / : Moriyama S, Anraku Y, Muranishi S, Adachi Y, Kuroda D, Higuchi Y, Kotaki R, Tonouchi K, Yumoto K, Suzuki T, Kita S, Someya T, Fukuhara H, Kuroda Y, Yamamoto T, Onodera T, Fukushi S, Maeda K, Nakamura-Uchiyama F, Hashiguchi T, Hoshino A, Maenaka K, Takahashi Y

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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