[日本語] English
- 3次元電子顕微鏡データ検索 -

-
検索条件


キーワード
データベース /
Q: EM Navigatorの情報源は？
データエントリ / 週前
Q: データの更新はいつですか？
著者・登録者
解析手法
表示モード
並び順
エントリ数 / 1ページ
登録情報
文献
試料
実験
解析
データの最大数全データの場合は0
ファイル形式
  • CSV形式 (コンマ区切り, Excelなどに)
  • TSV形式 (タブ区切り)
  • JSON形式

万見検索

-
検索結果

検索 (著者・登録者: whelan & f)の結果79件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-51460:
Tomogram of aggregate in AgDD-sfGFP-expressing HEK293 cell 6 h post aggregation induction
手法: トモグラフィー / : Schaefer T, Fernandez-Busnadiego R

EMDB-51461:
Tomogram of aggregate in AgDD-sfGFP-expressing HEK293 cell 10 min post aggregation induction
手法: トモグラフィー / : Schaefer T, Fernandez-Busnadiego R

EMDB-43813:
VIR-7229 Fab fragment bound the SARS-CoV-2 BA.2.86 spike trimer (local refinement of the BA 2.86 RBD/VIR-7229 VHVL)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Tortorici MA, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID), Veesler D

EMDB-43842:
VIR-7229 Fab fragment bound the BA.2.86 spike trimer (global refinement)
手法: 単粒子 / : Tortorici MA, Park YJ, Veelser D, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID)

PDB-9asd:
VIR-7229 Fab fragment bound the SARS-CoV-2 BA.2.86 spike trimer (local refinement of the BA 2.86 RBD/VIR-7229 VHVL)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Tortorici MA, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID), Veesler D

PDB-9au2:
VIR-7229 Fab fragment bound the BA.2.86 spike trimer (global refinement)
手法: 単粒子 / : Tortorici MA, Park YJ, Veelser D, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID)

EMDB-25487:
SARS-CoV-2 Spike NTD in complex with neutralizing Fab SARS2-57 (local refinement)
手法: 単粒子 / : Adams LJ, Fremont DH

EMDB-25488:
SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing Fab SARS2-57 (three down conformation)
手法: 単粒子 / : Adams LJ, Fremont DH

PDB-7sww:
SARS-CoV-2 Spike NTD in complex with neutralizing Fab SARS2-57 (local refinement)
手法: 単粒子 / : Adams LJ, Fremont DH, Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID), Center for Structural Biology of Infectious Diseases (CSBID)

PDB-7swx:
SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing Fab SARS2-57 (three down conformation)
手法: 単粒子 / : Adams LJ, Fremont DH, Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID), Center for Structural Biology of Infectious Diseases (CSBID)

EMDB-28558:
SARS-CoV-2 BA.1 spike ectodomain trimer in complex with the S2X324 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the RBD and S2X324)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID), Veesler D

EMDB-28559:
SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike ectodomain trimer in complex with the S2X324 neutralizing antibody Fab fragment
手法: 単粒子 / : Park YJ, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID), Veesler D

PDB-8erq:
SARS-CoV-2 BA.1 spike ectodomain trimer in complex with the S2X324 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the RBD and S2X324)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID), Veesler D

PDB-8err:
SARS-CoV-2 Omicron BA.1 spike ectodomain trimer in complex with the S2X324 neutralizing antibody Fab fragment
手法: 単粒子 / : Park YJ, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID), Veesler D

EMDB-26507:
SARS-CoV-2 spike in complex with Multivalent miniprotein inhibitor FUS231-P24 (2RBDs open)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID), Veesler D

EMDB-26508:
SARS-CoV-2 spike in complex with multivalent miniprotein inhibitor FUS231-P24 (3RBDs open)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID), Veesler D

EMDB-26509:
SARS-CoV-2 spike in complex with multivalent miniprotein inhibitor FUS31-G10 (2RBDs open)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID), Veesler D

EMDB-26510:
SARS-CoV-2 spike in complex with multivalent miniprotein inhibitor FUS31-G10 (3RBDs open)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID), Veesler D

EMDB-26511:
SARS-CoV-2 spike in complex with AHB2-2GS-SB175 (local refinement of the RBD and AHB2)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID), Veesler D

EMDB-26512:
SARS-CoV-2 spike in complex with AHB2-2GS-SB175
手法: 単粒子 / : Park YJ, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID), Veesler D

PDB-7uhb:
SARS-CoV-2 spike in complex with AHB2-2GS-SB175 (local refinement of the RBD and AHB2)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID), Veesler D

PDB-7uhc:
SARS-CoV-2 spike in complex with AHB2-2GS-SB175
手法: 単粒子 / : Park YJ, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID), Veesler D

EMDB-25785:
SARS-CoV-2 spike in complex with the S2K146 neutralizing antibody Fab fragment (three receptor-binding domains open)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Veesler D

EMDB-25783:
SARS-CoV-2 spike in complex with the S2K146 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the RBD and S2K146)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Veesler D

EMDB-25784:
SARS-CoV-2 spike in complex with the S2K146 neutralizing antibody Fab fragment (two receptor-binding domains open)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID)

PDB-7tas:
SARS-CoV-2 spike in complex with the S2K146 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the RBD and S2K146)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Veesler D, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID)

PDB-7tat:
SARS-CoV-2 spike in complex with the S2K146 neutralizing antibody Fab fragment (two receptor-binding domains open)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID), Veesler D

EMDB-22748:
SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing Fab 2B04 (one up, two down conformation)
手法: 単粒子 / : Errico JM, Fremont DH

EMDB-22749:
SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with neutralizing Fab 2B04 (local refinement)
手法: 単粒子 / : Errico JM, Fremont DH

EMDB-22750:
SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing Fab 2H04 (three down conformation)
手法: 単粒子 / : Errico JM, Fremont DH

EMDB-22751:
SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with neutralizing Fab 2H04 (local refinement)
手法: 単粒子 / : Errico JM, Fremont DH

EMDB-22752:
SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing Fab 2B04 (two up, one down conformation)
手法: 単粒子 / : Errico JM, Fremont DH

EMDB-22753:
SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing Fab 2H04 (one up, two down conformation)
手法: 単粒子 / : Errico JM, Fremont DH

PDB-7k9h:
SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing Fab 2B04 (one up, two down conformation)
手法: 単粒子 / : Errico JM, Fremont DH, Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

PDB-7k9i:
SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with neutralizing Fab 2B04 (local refinement)
手法: 単粒子 / : Errico JM, Fremont DH, Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

PDB-7k9j:
SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing Fab 2H04 (three down conformation)
手法: 単粒子 / : Errico JM, Fremont DH, Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

PDB-7k9k:
SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with neutralizing Fab 2H04 (local refinement)
手法: 単粒子 / : Errico JM, Fremont DH, Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

EMDB-24347:
SARS-CoV-2 S glycoprotein in complex with S2X259 Fab
手法: 単粒子 / : Veesler D, Tortorici MA

EMDB-24365:
SARS-CoV-2 S bound to S2X259 Fab (local refinement of the RBD/S2X259 variable domains)
手法: 単粒子 / : Veesler D, Tortorici MA

PDB-7ra8:
SARS-CoV-2 S glycoprotein in complex with S2X259 Fab
手法: 単粒子 / : Veesler D, Tortorici MA, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID)

PDB-7ral:
SARS-CoV-2 S bound to S2X259 Fab (local refinement of the RBD/S2X259 variable domains)
手法: 単粒子 / : Veesler D, Tortorici MA, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID)

EMDB-24299:
SARS-CoV-2 spike in complex with the S2D106 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the RBD and S2D106)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Veesler D

EMDB-24300:
SARS-CoV-2 spike in complex with the S2D106 neutralizing antibody Fab fragment
手法: 単粒子 / : Park YJ, Veesler D

EMDB-24301:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein ectodomain in complex with the S2H97 neutralizing antibody Fab fragment
手法: 単粒子 / : Park YJ, Veesler D

PDB-7r7n:
SARS-CoV-2 spike in complex with the S2D106 neutralizing antibody Fab fragment (local refinement of the RBD and S2D106)
手法: 単粒子 / : Park YJ, Veesler D, Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID)

EMDB-23898:
SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing Fab SARS2-38 (three down conformation)
手法: 単粒子 / : Adams LJ, Fremont DH

EMDB-23899:
SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with neutralizing Fab SARS2-38 (local refinement)
手法: 単粒子 / : Adams LJ, Fremont DH

PDB-7mkl:
SARS-CoV-2 Spike in complex with neutralizing Fab SARS2-38 (three down conformation)
手法: 単粒子 / : Adams LJ, Fremont DH, Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

PDB-7mkm:
SARS-CoV-2 Spike RBD in complex with neutralizing Fab SARS2-38 (local refinement)
手法: 単粒子 / : Adams LJ, Fremont DH, Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

EMDB-23577:
SARS-CoV-2 S/S2M11/S2X333 Local Refinement
手法: 単粒子 / : McCallum M, Veesler D

ページ:

+
EMN検索について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

+
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

-
EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

他の情報も見る