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検索結果

検索 (著者・登録者: nakane & t)の結果55件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-17769:
Subtomogram average of the Campylobacter jejuni motor with basal disk genes, flgPQ, expressed at very low level
手法: サブトモグラム平均 / : Cohen EJ, Beeby M

EMDB-17770:
Subtomogram average of the Campylobacter jejuni flagellar motor with the basal disk genes, flgPQ, expressed at low level
手法: サブトモグラム平均 / : Cohen EJ, Beeby M

EMDB-17771:
Subtomogram average of the Campylobacter jejuni flagellar motor with the basal disk genes, flgPQ, expressed at medium level
手法: サブトモグラム平均 / : Cohen EJ, Beeby M

EMDB-17772:
Subtomogram average of the Campylobacter jejuni motor with the basal disk genes, flgPQ, expressed at high level
手法: サブトモグラム平均 / : Cohen EJ, Beeby M

EMDB-17773:
Subtomogram average of the Campylobacter jejuni flgP S69A E157A K159A (flgP-AAA) flagellar motor
手法: サブトモグラム平均 / : Cohen EJ, Beeby M

EMDB-17774:
Subtomogram average of the Campylobacter jejuni flgP Del18-62 flagellar motor
手法: サブトモグラム平均 / : Cohen EJ, Beeby M

EMDB-17775:
Subtomogram average of the Campylobacter jejuni flgPQ deletion flagellar motor
手法: サブトモグラム平均 / : Cohen EJ, Beeby M

EMDB-17776:
Subtomogram average of the Campylobacter jejuni DflgPQ D0661 DkpsD DpglAB flagellar motor
手法: サブトモグラム平均 / : Cohen EJ, Beeby M

EMDB-18274:
Subtomogram average of the Campylobacter jejuni FlgP-Lpp55 flagellar motor
手法: サブトモグラム平均 / : Cohen EJ, Beeby M

EMDB-33349:
Cryo-EM structure of GroEL bound to unfolded substrate (UGT1A) at 2.8 Ang. resolution (Consensus Refinement)
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33350:
Cryo-EM structure of double occupied ring (DOR) of GroEL-UGT1A complex at 2.7 Ang. resolution
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33351:
Cryo-EM structure of single empty ring 2 (SER2) of GroEL-UGT1A complex at 3.2 Ang. resolution
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33352:
Cryo-EM structure of occupied ring subunit 4 (OR4) of GroEL complexed with polyalanine model of UGT1A from GroEL-UGT1A double occupied ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33353:
Cryo-EM structure of empty ring subunit 1 (ER1) from single empty ring of GroEL-UGT1A complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33354:
Cryo-EM structure of empty ring subunit 2 (ER2) from GroEL-UGT1A single empty ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33355:
Cryo-EM structure of occupied ring subunit 1 (OR1) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33356:
Cryo-EM structure of occupied ring subunit 2 (OR2) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33357:
Cryo-EM structure of occupied ring subunit 3 (OR3) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33358:
Cryo-EM structure of occupied ring subunit 4 (OR4) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-11657:
CryoEM structure of a human gamma-aminobutyric acid receptor, the GABA(A)R-beta3 homopentamer, in complex with histamine and megabody Mb25 in lipid nanodisc
手法: 単粒子 / : Nakane T, Kotecha A

PDB-7a5v:
CryoEM structure of a human gamma-aminobutyric acid receptor, the GABA(A)R-beta3 homopentamer, in complex with histamine and megabody Mb25 in lipid nanodisc
手法: 単粒子 / : Nakane T, Kotecha A, Sente A, Yamashita K, McMullan G, Masiulis S, Brown PMGE, Grigoras IT, Malinauskaite L, Malinauskas T, Miehling J, Yu L, Karia D, Pechnikova EV, de Jong E, Keizer J, Bischoff M, McCormack J, Tiemeijer P, Hardwick SW, Chirgadze DY, Murshudov G, Aricescu AR, Scheres SHW

EMDB-11638:
Cryo-EM structure of mouse heavy-chain apoferritin at 1.22 A
手法: 単粒子 / : Nakane T, Kotecha A

PDB-7a4m:
Cryo-EM structure of mouse heavy-chain apoferritin at 1.22 A
手法: 単粒子 / : Nakane T, Kotecha A, Sente A, Yamashita K, McMullan G, Masiulis S, Brown PMGE, Grigoras IT, Malinauskaite L, Malinauskas T, Miehling J, Yu L, Karia D, Pechnikova EV, de Jong E, Keizer J, Bischoff M, McCormack J, Tiemeijer P, Hardwick SW, Chirgadze DY, Murshudov G, Aricescu AR, Scheres SHW

EMDB-11493:
Subtomogram averaging of SARS-CoV-2 Spike Protein from unconcentrated virions: consensus structure of prefusion S trimers
手法: サブトモグラム平均 / : Ke Z, Oton J, Zivanov J, Lu JM, Peukes J, Cortese M, Zila V, Scheres SHW, Briggs JAG

EMDB-11494:
Subtomogram averaging of SARS-CoV-2 spike protein from unconcentrated virions: Prefusion Class (3 closed RBDs)
手法: サブトモグラム平均 / : Ke Z, Oton J, Zivanov J, Lu JM, Peukes J, Cortese M, Zila V, Scheres SHW, Briggs JAG

EMDB-11495:
Subtomogram averaging of SARS-CoV-2 spike protein from unconcentrated virions: Prefusion Class (1 open RBD)
手法: サブトモグラム平均 / : Ke Z, Oton J, Zivanov J, Lu JM, Peukes J, Cortese M, Zila V, Scheres SHW, Briggs JAG

EMDB-11496:
Subtomogram averaging of SARS-CoV-2 spike protein from unconcentrated virions: Prefusion Class (2 open RBDs)
手法: サブトモグラム平均 / : Ke Z, Oton J, Zivanov J, Lu JM, Peukes J, Cortese M, Zila V, Scheres SHW, Briggs JAG

EMDB-11497:
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike Proteins on intact virions: 3 Closed RBDs
手法: 単粒子 / : Ke Z, Qu K, Nakane T, Xiong X, Cortese M, Zila V, Scheres SHW, Briggs JAG

EMDB-11498:
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike Proteins on intact virions: 2 Closed + 1 Weak RBDs
手法: 単粒子 / : Ke Z, Qu K, Nakane T, Xiong X, Cortese M, Zila V, Scheres SHW, Briggs JAG

PDB-6zwv:
Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 Spike Proteins on intact virions: 3 Closed RBDs
手法: 単粒子 / : Ke Z, Qu K, Nakane T, Xiong X, Cortese M, Zila V, Scheres SHW, Briggs JAG

EMDB-10944:
Head segment of the S.cerevisiae condensin holocomplex in presence of ATP
手法: 単粒子 / : Merkel F, Haering CH

PDB-6yvd:
Head segment of the S.cerevisiae condensin holocomplex in presence of ATP
手法: 単粒子 / : Merkel F, Haering CH, Hassler M, Lee BG, Lowe J

EMDB-10951:
Condensin complex from S.cerevisiae ATP-free apo non-engaged state: overall map
手法: 単粒子 / : Lee BG, Cawood C, Gutierrez-Escribano P, Nakane T, Merkel F, Hassler M, Haering CH, Aragon L, Lowe J

EMDB-10952:
Condensin complex from S.cerevisiae ATP-free apo bridged state: focused refinement on head segment
手法: 単粒子 / : Lee BG, Cawood C, Gutierrez-Escribano P, Nakane T, Merkel F, Hassler M, Haering CH, Aragon L, Lowe J

EMDB-10964:
Rod-shaped arm segment of the S.cerevisiae condensin complex in presence of ATP
手法: 単粒子 / : Merkel F, Haering CH, Hassler M, Lowe J, Lee BG

PDB-6yvu:
Condensin complex from S.cerevisiae ATP-free apo non-engaged state
手法: 単粒子 / : Lee BG, Cawood C, Gutierrez-Escribano P, Nakane T, Merkel F, Hassler M, Aragon L, Haering CH, Lowe J

PDB-6yvv:
Condensin complex from S.cerevisiae ATP-free apo bridged state
手法: 単粒子 / : Lee BG, Cawood C, Gutierrez-Escribano P, Nakane T, Merkel F, Hassler M, Haering CH, Aragon L, Lowe J

EMDB-10947:
Condensin complex from S.cerevisiae ATP-free apo non-engaged state: focused refinement on arm segment
手法: 単粒子 / : Lee BG, Cawood C, Gutierrez-Escribano P, Nakane T, Merkel F, Hassler M, Haering CH, Aragon L, Lowe J

EMDB-10948:
Condensin complex from S.cerevisiae ATP-free apo non-engaged state: focused refinement on head segment
手法: 単粒子 / : Lee BG, Cawood C, Gutierrez-Escribano P, Nakane T, Merkel F, Hassler M, Haering CH, Aragon L, Lowe J

EMDB-10953:
Condensin complex from S.cerevisiae ATP-free apo bridged state: focused refinement on arm segment
手法: 単粒子 / : Lee BG, Cawood C, Gutierrez-Escribano P, Nakane T, Merkel F, Hassler M, Haering CH, Aragon L, Lowe J

EMDB-10954:
Condensin complex from S.cerevisiae ATP-free apo bridged state: overall map
手法: 単粒子 / : Lee BG, Cawood C, Gutierrez-Escribano P, Nakane T, Merkel F, Hassler M, Haering CH, Aragon L, Lowe J

EMDB-20645:
MicroED structure of a FIB-milled CypA Crystal
手法: 電子線結晶学 / : Wolff AM, Martynowycz MW, Zhao W, Gonen T, Fraser JS, Thompson MC

PDB-6u5g:
MicroED structure of a FIB-milled CypA Crystal
手法: 電子線結晶学 / : Wolff AM, Martynowycz MW, Zhao W, Gonen T, Fraser JS, Thompson MC

EMDB-0893:
Detailed structures of the gliding machinery observed by ECT
手法: トモグラフィー / : Kawamoto A, Kato T, Namba K

EMDB-9849:
LAT1-CD98hc complex bound to MEM-108 Fab
手法: 単粒子 / : Lee Y, Nishizawa T

EMDB-9850:
CD98hc extracellular domain bound to HBJ127 Fab and MEM-108 Fab
手法: 単粒子 / : Lee Y, Nishizawa T

PDB-6jmq:
LAT1-CD98hc complex bound to MEM-108 Fab
手法: 単粒子 / : Lee Y, Nishizawa T, Kusakizako T, Oda K, Ishitani R, Nakane T, Nureki O

PDB-6jmr:
CD98hc extracellular domain bound to HBJ127 Fab and MEM-108 Fab
手法: 単粒子 / : Lee Y, Nishizawa T, Kusakizako T, Oda K, Ishitani R, Yokoyama T, Nakane T, Shirouzu M, Nureki O

EMDB-9865:
The 1.54 A resolution structure of apoferritin by CRYOARM300 with Cold-FEG
手法: 単粒子 / : Kato T, Nakane T, Makino F, Terahara N, Yonekura K, Namba K

EMDB-0153:
RELION-3.0 reconstruction of beta-galactosidase particles in EMPIAR-10061
手法: 単粒子 / : Zivanov J, Nakane T, Scheres SHW

ページ:

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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