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検索結果

検索 (著者・登録者: murakami & k)の結果283件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-48622:
Structure of a native Drosophila melanogaster Pol II Elongation Complex with a well-defined Rpb4/Rpb7 stalk
手法: 単粒子 / : Venette-Smith NL, Vishwakarma RK, Dollinger R, Schultz J, Venkatakrishnan V, Babitzke P, Anand G, Gilmour DS, Armache JP, Murakami K

PDB-9mu7:
Structure of a native Drosophila melanogaster Pol II Elongation Complex with a well-defined Rpb4/Rpb7 stalk
手法: 単粒子 / : Venette-Smith NL, Vishwakarma RK, Dollinger R, Schultz J, Venkatakrishnan V, Babitzke P, Anand G, Gilmour DS, Armache JP, Murakami K

EMDB-49363:
Cryo-EM map of the inactive conformation of a glycoside hydrolase (CapGH2b) from the GH2 family
手法: 単粒子 / : Martins MP, Dolce LG, Santos CR, Murakami MT

EMDB-49364:
Active conformation of a redox-regulated glycoside hydrolase (CapGH2b) from the GH2 family
手法: 単粒子 / : Martins MP, Santos CR, Dolce LG, Murakami MT

PDB-9nfe:
Active conformation of a redox-regulated glycoside hydrolase (CapGH2b) from the GH2 family
手法: 単粒子 / : Martins MP, Santos CR, Dolce LG, Murakami MT

EMDB-70606:
Cryo-EM structure of filament form Acidithiobacillus caldus (Aca) short prokaryotic argonautes, HNH-associated (SPARHA) with gRNA and tDNA
手法: 単粒子 / : Murakami KS, Narwal M

PDB-9om4:
Cryo-EM structure of filament form Acidithiobacillus caldus (Aca) short prokaryotic argonautes, HNH-associated (SPARHA) with gRNA and tDNA
手法: 単粒子 / : Murakami KS, Narwal M

EMDB-49734:
Methanosarcina acetivorans 50S subunit obtained from acetate-grown cells
手法: 単粒子 / : Ghosh A, Fordjour GNR, Armache JP, Ferry JG, Murakami KS, Bevilacqua PC

EMDB-49757:
Methanosarcina acetivorans 50S subunit obtained from methanol-grown cells
手法: 単粒子 / : Ghosh A, Fordjour GNR, Armache JP, Ferry JG, Murakami KS, Bevilacqua PC

EMDB-49998:
Cryo-EM structure of Methanosarcina acetivorans 70S ribosome
手法: 単粒子 / : Ghosh A, Fordjour GNR, Armache JP, Ferry JG, Murakami KS, Bevilacqua PC

EMDB-70864:
Methanosarcina acetivorans large (50S) subunit dimer
手法: 単粒子 / : Ghosh A, Fordjour GNR, Armache JP, Ferry JG, Murakami KS, Bevilacqua PC

PDB-9nri:
Methanosarcina acetivorans 50S subunit obtained from acetate-grown cells
手法: 単粒子 / : Ghosh A, Fordjour GNR, Armache JP, Ferry JG, Murakami KS, Bevilacqua PC

PDB-9nta:
Methanosarcina acetivorans 50S subunit obtained from methanol-grown cells
手法: 単粒子 / : Ghosh A, Fordjour GNR, Armache JP, Ferry JG, Murakami KS, Bevilacqua PC

PDB-9o17:
Cryo-EM structure of Methanosarcina acetivorans 70S ribosome
手法: 単粒子 / : Ghosh A, Fordjour GNR, Armache JP, Ferry JG, Murakami KS, Bevilacqua PC

PDB-9ou7:
Methanosarcina acetivorans large (50S) subunit dimer
手法: 単粒子 / : Ghosh A, Fordjour GNR, Armache JP, Ferry JG, Murakami KS, Bevilacqua PC

EMDB-50645:
Single particle cryo-EM maps of AcrB wildtype monomers reconstituted in salipro nanodiscs
手法: 単粒子 / : Lazarova M, Frangakis A, Pos KM

EMDB-50328:
Single particle cryo-EM maps of AcrB wildtype monomer classes in DDM
手法: 単粒子 / : Lazarova M, Boernsen C, Frangakis A, Pos KM

EMDB-50329:
Single particle cryo-EM maps of AcrB V612F monomer classes in DDM
手法: 単粒子 / : Lazarova M, Boernsen C, Frangakis A, Pos KM

EMDB-50331:
Single particle cryo-EM maps of AcrB V612W monomer classes in DDM
手法: 単粒子 / : Lazarova M, Boernsen C, Frangakis A, Pos KM

EMDB-50332:
Single particle cryo-EM maps of AcrB V612F monomer classes in salipro nanodiscs
手法: 単粒子 / : Lazarova M, Frangakis A, Pos KM

EMDB-50334:
Single particle cryo-EM structure of the multidrug efflux pump OqxB from Klebsiella pneumoniae
手法: 単粒子 / : Lazarova M, Frangakis A, Pos KM

EMDB-50335:
Single particle cryo-EM maps of OqxB monomer classes in salipro nanodiscs
手法: 単粒子 / : Lazarova M, Frangakis A, Pos KM

PDB-9fdp:
Single particle cryo-EM structure of the AcrB V612W monomer in the O state
手法: 単粒子 / : Lazarova M, Boernsen C, Frangakis A, Pos KM

PDB-9fdq:
Single particle cryo-EM structure of the AcrB V612F monomer in the O state
手法: 単粒子 / : Lazarova M, Frangakis A, Pos KM

PDB-9fdz:
Single particle cryo-EM structure of the multidrug efflux pump OqxB from Klebsiella pneumoniae
手法: 単粒子 / : Lazarova M, Frangakis A, Pos KM

EMDB-48623:
Structure of a native Drosophila melanogaster Pol II Elongation Complex without Rpb4/Rpb7 stalk
手法: 単粒子 / : Venette-Smith NL, Vishwakarma RK, Dollinger R, Schultz J, Venkatakrishnan V, Babitzke P, Anand G, Gilmour DS, Armache JP, Murakami K

PDB-9mu8:
Structure of a native Drosophila melanogaster Pol II Elongation Complex without Rpb4/Rpb7 stalk
手法: 単粒子 / : Venette-Smith NL, Vishwakarma RK, Dollinger R, Schultz J, Venkatakrishnan V, Babitzke P, Anand G, Gilmour DS, Armache JP, Murakami K

EMDB-48829:
Structure of a native Drosophila melanogaster Nucleosome Elongation Complex (Pol II EC-nucleosome). Focused refinement of Pol II
手法: 単粒子 / : Venette-Smith NL, Vishwakarma RK, Dollinger R, Schultz J, Venkatakrishnan V, Babitzke P, Anand G, Gilmour DS, Armache JP, Murakami K

EMDB-48619:
Structure of a native Drosophila melanogaster octameric nucleosome
手法: 単粒子 / : Venette-Smith NL, Vishwakarma RK, Dollinger R, Schultz J, Venkatakrishnan V, Babitzke P, Anand G, Gilmour DS, Armache JP, Murakami K

EMDB-48620:
Structure of a native Drosophila melanogaster hexameric nucleosome
手法: 単粒子 / : Venette-Smith NL, Vishwakarma RK, Dollinger R, Schultz J, Venkatakrishnan V, Babitzke P, Anand G, Gilmour DS, Armache JP, Murakami K

EMDB-48621:
Structure of native Drosophila melanogaster DLST
手法: 単粒子 / : Venette-Smith NL, Vishwakarma RK, Dollinger R, Schultz J, Venkatakrishnan V, Babitzke P, Anand G, Gilmour DS, Armache JP, Murakami K

EMDB-48624:
Structure of a native Drosophila melanogaster Pol II Elongation Complex
手法: 単粒子 / : Venette-Smith NL, Vishwakarma RK, Dollinger R, Schultz J, Venkatakrishnan V, Babitzke P, Anand G, Gilmour DS, Armache JP, Murakami K

EMDB-48625:
Structure of a native Drosophila melanogaster Nucleosome Elongation Complex (Pol II EC-nucleosome). Overall structure
手法: 単粒子 / : Venette-Smith NL, Vishwakarma RK, Dollinger R, Schultz J, Venkatakrishnan V, Babitzke P, Anand G, Gilmour DS, Armache JP, Murakami K

EMDB-48626:
Structure of a native Drosophila melanogaster Nucleosome Elongation Complex (Pol II EC-nucleosome). Composite map
手法: 単粒子 / : Venette-Smith NL, Vishwakarma RK, Dollinger R, Schultz J, Venkatakrishnan V, Babitzke P, Anand G, Gilmour DS, Armache JP, Murakami K

EMDB-48823:
Structure of a native Drosophila melanogaster Nucleosome Elongation Complex (Pol II EC-nucleosome). Focused refinement of nucleosome
手法: 単粒子 / : Venette-Smith NL, Vishwakarma RK, Dollinger R, Schultz J, Venkatakrishnan V, Babitzke P, Anand G, Gilmour DS, Armache JP, Murakami K

PDB-9mu4:
Structure of a native Drosophila melanogaster octameric nucleosome
手法: 単粒子 / : Venette-Smith NL, Vishwakarma RK, Dollinger R, Schultz J, Venkatakrishnan V, Babitzke P, Anand G, Gilmour DS, Armache JP, Murakami K

PDB-9mu5:
Structure of a native Drosophila melanogaster hexameric nucleosome
手法: 単粒子 / : Venette-Smith NL, Vishwakarma RK, Dollinger R, Schultz J, Venkatakrishnan V, Babitzke P, Anand G, Gilmour DS, Armache JP, Murakami K

PDB-9mu6:
Structure of native Drosophila melanogaster DLST
手法: 単粒子 / : Venette-Smith NL, Vishwakarma RK, Dollinger R, Schultz J, Venkatakrishnan V, Babitzke P, Anand G, Gilmour DS, Armache JP, Murakami K

PDB-9mu9:
Structure of a native Drosophila melanogaster Nucleosome Elongation Complex (Pol II EC-nucleosome). Composite map
手法: 単粒子 / : Venette-Smith NL, Vishwakarma RK, Dollinger R, Schultz J, Venkatakrishnan V, Babitzke P, Anand G, Gilmour DS, Armache JP, Murakami K

EMDB-48117:
Cryo-EM structure of apo-form human DNA polymerase delta
手法: 単粒子 / : Murakami KS, Shin Y

PDB-9ekb:
Cryo-EM structure of apo-form human DNA polymerase delta
手法: 単粒子 / : Murakami KS, Shin Y

EMDB-38573:
Cryo-EM structure of human DNMT1 (aa:351-1616) in complex with ubiquitinated PAF15 and hemimethylated DNA analog
手法: 単粒子 / : Kikuchi A, Hayashi G, Kori S, Arita K

EMDB-42380:
Consensus map of PICdeltaTFIIK form1
手法: 単粒子 / : Yang C, Murakami K

PDB-8umi:
consensus map of PICdeltaTFIIK form1
手法: 単粒子 / : Yang C, Murakami K

EMDB-42379:
consensus map of PICdeltaTFIIK form2
手法: 単粒子 / : Yang C, Murakami K

PDB-8umh:
Consensus map of PICdeltaTFIIK form2
手法: 単粒子 / : Yang C, Murakami K

EMDB-42437:
Composite map of PIC_delta_TFIIK form2
手法: 単粒子 / : Yang C, Murakami K

EMDB-42438:
Composite map of PICdeltaTFIIK form1
手法: 単粒子 / : Yang C, Murakami K

PDB-8uoq:
Composite map of PIC_delta_TFIIK form2
手法: 単粒子 / : Yang C, Murakami K

PDB-8uot:
Composite map of PICdeltaTFIIK form1
手法: 単粒子 / : Yang C, Murakami K

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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