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検索結果

検索 (著者・登録者: maenaka & k)の結果93件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-39421:
Electron cryotomography of SARS-CoV-2 active virions
手法: トモグラフィー / : Dokainish HM, Maenaka K

EMDB-39422:
STA map of C3 symmetry spike protein from active SARS-CoV-2 vririons
手法: サブトモグラム平均 / : Dokainish HM, Maenaka K

EMDB-61174:
HBx fused DDB1 4M mutant
手法: 単粒子 / : Tanaka H, Kita S, Sasaki M, Maenaka K, Machida S

EMDB-61175:
HBx complexed with DDB1
手法: 単粒子 / : Tanaka H, Kita S, Sasaki M, Maenaka K, Machida S

EMDB-63366:
HBx R96E fused DDB1 4M mutant
手法: 単粒子 / : Tanaka H, Kita S, Sasaki M, Maenaka K, Machida S

PDB-9j6j:
HBx fused DDB1 4M mutant
手法: 単粒子 / : Tanaka H, Kita S, Sasaki M, Maenaka K, Machida S

PDB-9j6k:
HBx complexed with DDB1
手法: 単粒子 / : Tanaka H, Kita S, Sasaki M, Maenaka K, Machida S

EMDB-63071:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein trimer in prefusion form (1-RBD up state)
手法: 単粒子 / : Fukuhara H, Anraku Y, Kita S, Maenaka K

EMDB-39679:
A tetrameric STAT1-DNA complex
手法: 単粒子 / : Sugiyama A, Minami M, Sugita Y, Ose T

EMDB-39680:
A dimeric STAT1-DNA complex
手法: 単粒子 / : Sugiyama A, Minami M, Sugita Y, Ose T

PDB-8yyu:
A tetrameric STAT1-DNA complex
手法: 単粒子 / : Sugiyama A, Minami M, Sugita Y, Ose T

PDB-8yyv:
A dimeric STAT1-DNA complex
手法: 単粒子 / : Sugiyama A, Minami M, Sugita Y, Ose T

EMDB-39370:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with NT-108 scFv (1-up state)
手法: 単粒子 / : Anraku Y, Kita S, Onodera T, Tadokoro T, Ito S, Adachi Y, Kotaki R, Suzuki T, Hashiguchi T, Takahashi Y, Maenaka K

EMDB-39371:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with NT-108 scFv (2-up state)
手法: 単粒子 / : Anraku Y, Kita S, Onodera T, Tadokoro T, Ito S, Adachi Y, Kotaki R, Suzuki T, Hashiguchi T, Takahashi Y, Maenaka K

EMDB-39372:
SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with NT-108 scFv focused on RBD and NT-108 scFv interface
手法: 単粒子 / : Anraku Y, Kita S, Onodera T, Tadokoro T, Ito S, Adachi Y, Kotaki R, Suzuki T, Hashiguchi T, Takahashi Y, Maenaka K

PDB-8ykg:
Structure of SARS-CoV-2 spike glycoprotein in complex with NT-108 scFv (1-up state)
手法: 単粒子 / : Anraku Y, Kita S, Onodera T, Tadokoro T, Ito S, Adachi Y, Kotaki R, Suzuki T, Hashiguchi T, Takahashi Y, Maenaka K

PDB-8ykh:
Structure of SARS-CoV-2 spike RBD in complex with NT-108 scFv
手法: 単粒子 / : Anraku Y, Kita S, Onodera T, Tadokoro T, Ito S, Adachi Y, Kotaki R, Suzuki T, Hashiguchi T, Takahashi Y, Maenaka K

EMDB-37910:
Structure of the SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein (closed state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-38459:
Structure of the SARS-CoV-2 BA.2.86 spike protein (1-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-38686:
Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein in complex with ACE2 (2-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-38687:
Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein in complex with ACE2 (2-up and 1-down state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-38688:
Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike RBD in complex with ACE2 (up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-38689:
Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike RBD in complex with ACE2 (down state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-38690:
Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein in complex with ACE2 (3-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-60886:
Structure of SARS-CoV-2 JN.1 spike RBD in complex with ACE2 (up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-60904:
Structure of SARS-CoV-2 JN.1 spike glycoprotein in complex with ACE2 (2-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-60905:
Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein in complex with ACE2 (1 highly-open RBD and 1 partially-open RBD)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-60906:
Structure of SARS-CoV-2 JN.1 spike glycoprotein in complex with ACE2 (2-up and 1-down state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8wxl:
Structure of the SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein (closed state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8xux:
Structure of the SARS-CoV-2 BA.2.86 spike protein (1-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8xuy:
Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein in complex with ACE2 (2-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8xuz:
Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein in complex with ACE2 (2-up and 1-down state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8xv0:
Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike RBD in complex with ACE2 (up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8xv1:
Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike RBD in complex with ACE2 (down state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-8xvm:
Structure of SARS-CoV-2 BA.2.86 spike glycoprotein in complex with ACE2 (3-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

PDB-9iu1:
Structure of SARS-CoV-2 JN.1 spike RBD in complex with ACE2 (up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-38453:
Structure of the SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein in complex with ACE2 (1-up state)
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

EMDB-38454:
Structure of the SARS-CoV-2 EG.5.1 spike RBD in complex with ACE2
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

PDB-8xlm:
Structure of the SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein in complex with ACE2 (1-up state)
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

PDB-8xln:
Structure of the SARS-CoV-2 EG.5.1 spike RBD in complex with ACE2
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

EMDB-37648:
SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein (1-up state)
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

EMDB-37650:
SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein (closed-2 state)
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

EMDB-37651:
SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein (closed-1 state)
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

PDB-8wmd:
Structure of the SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein (closed-2 state)
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

PDB-8wmf:
Structure of the SARS-CoV-2 EG.5.1 spike glycoprotein (closed-1 state)
手法: 単粒子 / : Nomai T, Anraku Y, Kita S, Hashiguchi T, Maenaka K

EMDB-36724:
Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein (closed state 1)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-36726:
Structure of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein (closed state 2)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-36727:
Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein in complex with ACE2 (1-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-36728:
Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike glycoprotein in complex with ACE2 (2-up state)
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

EMDB-36729:
Structure of SARS-CoV-2 XBB.1.5 spike RBD in complex with ACE2
手法: 単粒子 / : Yajima H, Anraku Y, Kita S, Kimura K, Sasaki J, Sasaki-Tabata K, Maenaka K, Hashiguchi T

ページ:

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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