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検索 (著者・登録者: cavadini & s)の結果124件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-54078:
Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2
手法: 単粒子 / : Vecchia L, Weiss J, Cavadini S, Kempf G, Kater L, Pathare G, Thoma NH

EMDB-54157:
Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 (Consensus map)
手法: 単粒子 / : Vecchia L, Weiss J, Cavadini S, Kempf G, Kater L, Pathare GR, Thoma NH

EMDB-54158:
Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2 (Focused refinement of BAF part)
手法: 単粒子 / : Vecchia L, Weiss J, Cavadini S, Kempf G, Kater L, Pathare GR, Thoma NH

PDB-9rn2:
Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 2
手法: 単粒子 / : Vecchia L, Weiss J, Cavadini S, Kempf G, Kater L, Pathare G, Thoma NH

EMDB-54156:
Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 (Focused refinement of BAF)
手法: 単粒子 / : Domjan D, Weiss J, Cavadini S, Vecchia L, Kempf G, Kater L, Pathare GR, Thoma NH

EMDB-54056:
Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1
手法: 単粒子 / : Vecchia L, Weiss J, Cavadini S, Kempf G, Kater L, Pathare G, Thoma NH

PDB-9rmc:
Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL+6 class 1
手法: 単粒子 / : Vecchia L, Weiss J, Cavadini S, Kempf G, Kater L, Pathare G, Thoma NH

EMDB-54155:
Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 (Consensus map)
手法: 単粒子 / : Domjan D, Weiss J, Cavadini S, Vecchia L, Kempf G, Kater L, Pathare GR, Thoma NH

EMDB-54030:
Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6
手法: 単粒子 / : Vecchia L, Weiss J, Cavadini S, Kempf G, Kater L, Pathare G, Thoma NH

EMDB-54143:
Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 (Focus refinement of ARP module)
手法: 単粒子 / : Vecchia L, Weiss J, Cavadini S, Kempf G, Kater L, Pathare GR, Thoma NH

EMDB-54144:
Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 (ATPase part)
手法: 単粒子 / : Vecchia L, Weiss J, Cavadini S, Kempf G, Kater L, Pathare GR, Thoma NH

EMDB-54145:
Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 (Focus refinement of BAF BASE+ARM+HEAD)
手法: 単粒子 / : Vecchia L, Weiss J, Cavadini S, Kempf G, Kater L, Pathare GR, Thoma NH

EMDB-54146:
Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 (Focus refinement of nucleosome part)
手法: 単粒子 / : Vecchia L, Weiss J, Cavadini S, Kempf G, Kater L, Pathare GR, Thoma NH

EMDB-54152:
Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 (Focus refinement of nucleosome+OCT4/SOX2 part)
手法: 単粒子 / : Vecchia L, Weiss J, Cavadini S, Kempf G, Kater L, Pathare GR, Thoma NH

EMDB-54153:
Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 (Consensus map)
手法: 単粒子 / : Vecchia L, Weiss J, Cavadini S, Kempf G, Kater L, Pathare GR, Thoma NH

EMDB-54159:
Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6 (Focused refinement of nucleosome+OCT4/SOX2 part)
手法: 単粒子 / : Vecchia L, Weiss J, Cavadini S, Kempf G, Kater L, Pathare GR, Thoma NH

PDB-9rl4:
Structure of BAF in complex with OCT4-SOX2-bound nucleosome - SHL-6
手法: 単粒子 / : Vecchia L, Weiss J, Cavadini S, Kempf G, Kater L, Pathare G, Thoma NH

EMDB-54154:
Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2 (Focused refinement of nucleosome and ATPase lobes)
手法: 単粒子 / : Domjan D, Weiss J, Cavadini S, Vecchia L, Kempf G, Kater L, Pathare GR, Thoma NH

EMDB-54077:
Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2
手法: 単粒子 / : Domjan D, Weiss J, Cavadini S, Veccia L, Kempf G, Kater L, Pathare G, Thoma NH

PDB-9rn1:
Structure of BAF-nucleosome complex with OCT4-SOX2 at SHL+6 in ADP-bound state, BAF47 bound to ATPase lobe 2
手法: 単粒子 / : Domjan D, Weiss J, Cavadini S, Veccia L, Kempf G, Kater L, Pathare G, Thoma NH

EMDB-53534:
p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (non-crosslinked sample, full map)
手法: 単粒子 / : Chakraborty D, Kater L, Kempf G, Cavadini S, Thoma NH

EMDB-53532:
p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (non-crosslinked sample, composite map)
手法: 単粒子 / : Chakraborty D, Kater L, Kempf G, Cavadini S, Thoma NH

PDB-9r2m:
p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (non-crosslinked sample, composite map)
手法: 単粒子 / : Chakraborty D, Kater L, Kempf G, Cavadini S, Thoma NH

EMDB-53478:
p53 bound to the nucleosome at position SHL-5.7 (crosslinked sample)
手法: 単粒子 / : Chakraborty D, Michael AK, Kempf G, Cavadini S, Kater L, Thoma NH

PDB-9r04:
p53 bound to the nucleosome at position SHL-5.7 (crosslinked sample)
手法: 単粒子 / : Chakraborty D, Michael AK, Kempf G, Cavadini S, Kater L, Thoma NH

EMDB-53517:
USP7 bound to a nucleosome/p53 complex
手法: 単粒子 / : Chakraborty D, Kater L, Kempf G, Cavadini S, Thoma NH

EMDB-53535:
p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (non-crosslinked sample, focus refined map of p53)
手法: 単粒子 / : Chakraborty D, Kater L, Kempf G, Cavadini S, Thoma NH

EMDB-53537:
p53 bound to nucleosome at position SHL-5.7 (non-crosslinked sample)
手法: 単粒子 / : Chakraborty D, Michael AK, Kempf G, Cavadini S, Kater L, Thoma NH

PDB-9r2q:
p53 bound to nucleosome at position SHL-5.7 (non-crosslinked sample)
手法: 単粒子 / : Chakraborty D, Michael AK, Kempf G, Cavadini S, Kater L, Thoma NH

EMDB-53536:
p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (crosslinked sample)
手法: 単粒子 / : Chakraborty D, Kater L, Kempf G, Cavadini S, Thoma NH

PDB-9r2p:
p53 bound to nucleosome at position SHL+5.9 (crosslinked sample)
手法: 単粒子 / : Chakraborty D, Kater L, Kempf G, Cavadini S, Thoma NH

EMDB-17582:
Cryo-EM structure of Caenorhabditis elegans DPF-3 (apo)
手法: 単粒子 / : Gudipati RK, Cavadini S, Kempf G, Grosshans H

PDB-8pba:
Cryo-EM structure of Caenorhabditis elegans DPF-3 (apo)
手法: 単粒子 / : Gudipati RK, Cavadini S, Kempf G, Grosshans H

EMDB-19767:
Structure of a 2873 Scaffold Base DNA Origami V1
手法: 単粒子 / : Ali K, Georg K, Volodymyr M, Johanna G, Maximilian NH, Lukas K, Simone C, Hendrik D

EMDB-19769:
Structure of a 2873 Scaffold Base DNA Origami V2
手法: 単粒子 / : Ali K, Georg K, Volodymyr M, Johanna G, Maximilian NH, Lukas K, Simone C, Hendrik D

EMDB-19770:
Structure of a 2873 Scaffold Base DNA Origami V3
手法: 単粒子 / : Ali K, Georg K, Volodymyr M, Johanna G, Maximilian NH, Lukas K, Simone C, Hendrik D

EMDB-19775:
Structure of a 1033 Scaffold Base DNA Origami Nanostructure V4 with Desalted Purified Staples
手法: 単粒子 / : Ali K, Georg K, Volodymyr M, Johanna G, Maximilian NH, Lukas K, Simone C, Hendrik D

EMDB-19776:
Structure of a 1033 Scaffold Base DNA Origami Nanostructure V4 with HPLC Purified Staples
手法: 単粒子 / : Ali K, Georg K, Volodymyr M, Johanna G, Maximilian NH, Lukas K, Simone C, Hendrik D

EMDB-19867:
Cryo-EM Structure of a 1033 Scaffold Base DNA Origami Nanostructure V4 and TBA
手法: 単粒子 / : Ali K, Georg K, Volodymyr M, Johanna G, Maximilian NH, Lukas K, Simone C, Hendrik D

EMDB-19874:
Refinement Focused on the 1st Body of a 1033 Scaffold-Based DNA Origami Nanostructure V4 with TBA
手法: 単粒子 / : Ali K, Georg K, Volodymyr M, Johanna G, Maximilian NH, Lukas K, Simone C, Hendrik D

EMDB-19875:
Refinement Focused on the 2nd Body of a 1033 Scaffold-Based DNA Origami Nanostructure V4 with TBA
手法: 単粒子 / : Ali K, Georg K, Volodymyr M, Johanna G, Maximilian NH, Lukas K, Simone C, Hendrik D

EMDB-19876:
Refinement Focused on the 3rd Body of a 1033 Scaffold-Based DNA Origami Nanostructure V4 with TBA
手法: 単粒子 / : Ali K, Georg K, Volodymyr M, Johanna G, Maximilian NH, Lukas K, Simone C, Hendrik D

PDB-9eoq:
Cryo-EM Structure of a 1033 Scaffold Base DNA Origami Nanostructure V4 and TBA
手法: 単粒子 / : Ali K, Georg K, Volodymyr M, Johanna G, Maximilian NH, Lukas K, Simone C, Hendrik D

EMDB-17539:
Cryo-EM structure of dimeric UBR5
手法: 単粒子 / : Aguirre JD, Kater L, Kempf G, Cavadini S, Thoma NH

EMDB-17540:
Cryo-EM structure of full-length human UBR5 (homotetramer)
手法: 単粒子 / : Aguirre JD, Kater L, Kempf G, Cavadini S, Thoma NH

PDB-8p82:
Cryo-EM structure of dimeric UBR5
手法: 単粒子 / : Aguirre JD, Kater L, Kempf G, Cavadini S, Thoma NH

PDB-8p83:
Cryo-EM structure of full-length human UBR5 (homotetramer)
手法: 単粒子 / : Aguirre JD, Kater L, Kempf G, Cavadini S, Thoma NH

EMDB-17542:
Negative stain map of UBR5 (dimer) in complex with RARA/RXRA
手法: 単粒子 / : Aguirre JD, Cavadini S, Kempf G, Kater L, Thoma NH

EMDB-17154:
Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to a nucleosomal E-box at position SHL+5.8 (consensus and constituent map 1)
手法: 単粒子 / : Stoos L, Michael AK, Kempf G, Cavadini S, Thoma NH

EMDB-17155:
Cryo-EM structure of CLOCK-BMAL1 bound to a nucleosomal E-box at position SHL-6.2 (DNA conformation 1)
手法: 単粒子 / : Michael AK, Stoos L, Kempf G, Cavadini S, Thoma NH

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EMN検索について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
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EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

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EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

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