PDB: 1544 件ウェブページステータス検索Chemie searchBIRD

---

2WX1	TAB2 NZF DOMAIN IN COMPLEX WITH Lys63-linked tri-ubiquitin, P212121 分子名称: MITOGEN-ACTIVATED PROTEIN KINASE KINASE KINASE 7-INTERACTING PROTEIN 2, UBIQUITIN, ZINC ION 著者 Kulathu, Y, Akutsu, M, Bremm, A, Hofmann, K, Komander, D. 登録日 2009-10-30 公開日 2009-11-24 最終更新日 2011-07-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3 Å) 主引用文献 Two-Sided Ubiquitin Binding Explains Specificity of the Tab2 Nzf Domain Nat.Struct.Mol.Biol., 16, 2009
2ZCB	Crystal Structure of ubiquitin P37A/P38A 分子名称: Ubiquitin, ZINC ION 著者 Kitahara, R, Tanaka, T, Sakata, E, Yamaguchi, Y, Kato, K, Yokoyama, S. 登録日 2007-11-08 公開日 2007-11-20 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.6 Å) 主引用文献 Crystal Structure of ubiquitin P37A/P38A To be published
4GOC	Crystal structure of the Get5 ubiquitin-like domain 分子名称: Golgi to ER traffic protein 5 著者 Chartron, J.W, VanderVelde, D.G, Clemons Jr, W.M. 登録日 2012-08-19 公開日 2012-11-21 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.4 Å) 主引用文献 Structures of the Sgt2/SGTA Dimerization Domain with the Get5/UBL4A UBL Domain Reveal an Interaction that Forms a Conserved Dynamic Interface. Cell Rep, 2, 2012
3A9J	Crystal structure of the mouse TAB2-NZF in complex with Lys63-linked di-ubiquitin 分子名称: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7-interacting protein 2, Ubiquitin, ZINC ION 著者 Sato, Y, Yoshikawa, A, Yamashita, M, Yamagata, A, Fukai, S. 登録日 2009-10-29 公開日 2009-12-08 最終更新日 2021-11-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.18 Å) 主引用文献 Structural basis for specific recognition of Lys 63-linked polyubiquitin chains by NZF domains of TAB2 and TAB3 Embo J., 28, 2009
4GSW	Crystal structure of ubiquitin from Entamoeba histolytica to 2.15 Angstrom 分子名称: SULFATE ION, Ubiquitin 著者 Bosch, D.E, Siderovski, D.P. 登録日 2012-08-28 公開日 2012-12-12 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.15 Å) 主引用文献 Structural Determinants of Ubiquitin Conjugation in Entamoeba histolytica. J.Biol.Chem., 288, 2013
4XKL	Crystal structure of NDP52 ZF2 in complex with mono-ubiquitin 分子名称: ACETATE ION, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, GLYCEROL, ... 著者 Xie, X, Li, F, Wang, Y, Lin, Z, Chen, X, Liu, J, Pan, L. 登録日 2015-01-12 公開日 2015-11-11 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 Molecular basis of ubiquitin recognition by the autophagy receptor CALCOCO2 Autophagy, 11, 2015
4XOK	Observing the overall rocking motion of a protein in a crystal. 分子名称: Ubiquitin, ZINC ION 著者 Coquelle, N, Ma, P, Schanda, P, Colletier, J.P. 登録日 2015-01-16 公開日 2015-10-14 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) 主引用文献 Observing the overall rocking motion of a protein in a crystal. Nat Commun, 6, 2015
4Y1H	Crystal structure of K33 linked tri-Ubiquitin 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a 著者 Kristariyanto, Y.A, Abdul Rehman, S.A, Choi, S.Y, Ritorto, S, Campbell, D.G, Morrice, N.A, Toth, R, Kulathu, Y. 登録日 2015-02-07 公開日 2015-03-18 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.4 Å) 主引用文献 Assembly and structure of Lys33-linked polyubiquitin reveals distinct conformations. Biochem.J., 467, 2015
4XKH	CRYSTAL STRUCTURE OF THE AIRAPL TANDEM UIMS IN COMPLEX WITH A LYS48-LINKED TRI-UBIQUITIN 分子名称: AN1-type zinc finger protein 2B, Polyubiquitin-C 著者 Rahighi, S, Kawasaki, M, Stanhill, A, Wakatsuki, S. 登録日 2015-01-11 公開日 2016-02-17 最終更新日 2024-02-28 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3 Å) 主引用文献 Selective Binding of AIRAPL Tandem UIMs to Lys48-Linked Tri-Ubiquitin Chains. Structure, 24, 2016
4XYZ	Crystal structure of K33 linked di-Ubiquitin 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, ACETATE ION, IODIDE ION, ... 著者 Kristariyanto, Y.A, Abdul Rehman, S.A, Choi, S.Y, Ritorto, S, Campbell, D.G, Morrice, N.A, Toth, R, Kulathu, Y. 登録日 2015-02-03 公開日 2015-03-18 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.65 Å) 主引用文献 Assembly and structure of Lys33-linked polyubiquitin reveals distinct conformations. Biochem.J., 467, 2015
4XOL	Observing the overall rocking motion of a protein in a crystal - Cubic Ubiquitin crystals. 分子名称: Ubiquitin, ZINC ION 著者 Coquelle, N, Peixiang, M, Schanda, P, Colletier, J.P. 登録日 2015-01-16 公開日 2015-10-14 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.91 Å) 主引用文献 Observing the overall rocking motion of a protein in a crystal. Nat Commun, 6, 2015
4XOF	Observing the overall rocking motion of a protein in a crystal - Orthorhombic Ubiquitin crystals without Zinc. 分子名称: Ubiquitin 著者 Coquelle, N, Ma, P, Schanda, P, Colletier, J.P. 登録日 2015-01-16 公開日 2015-10-14 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.15 Å) 主引用文献 Observing the overall rocking motion of a protein in a crystal. Nat Commun, 6, 2015
4ZPZ	Crystal Structure of Semi-synthetic Ubiquitin with Phospho-Ser65 and Ala46Cys 分子名称: Polyubiquitin-B 著者 Han, C, Virdee, S. 登録日 2015-05-08 公開日 2015-06-10 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.54 Å) 主引用文献 A Versatile Strategy for the Semisynthetic Production of Ser65 Phosphorylated Ubiquitin and Its Biochemical and Structural Characterisation. Chembiochem, 16, 2015
4ZQS	New compact conformation of linear Ub2 structure 分子名称: ubiquitin 著者 Thach, T.T, Shin, D, Han, S, Lee, S. 登録日 2015-05-11 公開日 2016-04-20 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.804 Å) 主引用文献 New conformations of linear polyubiquitin chains from crystallographic and solution-scattering studies expand the conformational space of polyubiquitin. Acta Crystallogr D Struct Biol, 72, 2016
4Z9S	Non-covalent assembly of monoubiquitin that mimics K11 poly-ubiquitin 分子名称: MALONIC ACID, THIOCYANATE ION, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a 著者 Levin-Kravets, O, Prag, G. 登録日 2015-04-11 公開日 2015-07-29 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 Tetrameric Assembly of Monoubiquitin Accurately Mimics the Lys11 Polyubiquitin Chain Structure. Biochemistry, 54, 2015
4WZP	Ser65 phosphorylated ubiquitin, major conformation 分子名称: SULFATE ION, ubiquitin 著者 Wauer, T, Wagstaff, J, Freund, S.M.V, Komander, D. 登録日 2014-11-20 公開日 2015-01-14 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 Ubiquitin Ser65 phosphorylation affects ubiquitin structure, chain assembly and hydrolysis. Embo J., 34, 2015
5AF5	Structure of Lys33-linked triUb S.G. P 212121 分子名称: POLYUBIQUITIN-C 著者 Michel, M.A, Elliott, P.R, Swatek, K.N, Simicek, M, Pruneda, J.N, Wagstaff, J.L, Freund, S.M.V, Komander, D. 登録日 2015-01-19 公開日 2015-03-25 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.68 Å) 主引用文献 Assembly and Specific Recognition of K29- and K33-Linked Polyubiquitin. Mol.Cell, 58, 2015
3B08	Crystal structure of the mouse HOIL1-L-NZF in complex with linear di-ubiquitin 分子名称: Polyubiquitin-C, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, ZINC ION, ... 著者 Sato, Y, Fujita, H, Yoshikawa, A, Yamashita, M, Yamagata, A, Kaiser, S.E, Iwai, K, Fukai, S. 登録日 2011-06-07 公開日 2011-12-14 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.701 Å) 主引用文献 Specific recognition of linear ubiquitin chains by the Npl4 zinc finger (NZF) domain of the HOIL-1L subunit of the linear ubiquitin chain assembly complex Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 108, 2011
3B1L	Crystal Structure of parkin ubiquitin-like domain R33Q mutant 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase parkin 著者 Tomoo, K, Ikemiya, A, Amami, Y, In, Y, Ishida, T. 登録日 2011-07-04 公開日 2012-07-04 最終更新日 2024-03-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Crystal Structure of parkin ubiquitin-like domain R33Q mutant to be published
3AUL	Crystal structure of wild-type Lys48-linked diubiquitin in an open conformation 分子名称: Polyubiquitin-C 著者 Hirano, T, Olivier, S, Yagi, M, Takemoto, E, Hiromoto, T, Satoh, T, Mizushima, T, Kato, K. 登録日 2011-02-09 公開日 2011-09-07 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.39 Å) 主引用文献 Conformational dynamics of wild-type Lys48-linked diubiquitin in solution J.Biol.Chem., 286, 2011
3EHV	X-ray structure of human ubiquitin Zn(II) adduct 分子名称: Ubiquitin, ZINC ION 著者 Falini, G, Fermani, S, Tosi, G. 登録日 2008-09-15 公開日 2009-03-17 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.81 Å) 主引用文献 Structural probing of Zn(II), Cd(II) and Hg(II) binding to human ubiquitin. Chem.Commun.(Camb.), 45, 2008
3A9K	Crystal structure of the mouse TAB3-NZF in complex with Lys63-linked di-ubiquitin 分子名称: Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 7-interacting protein 3, Ubiquitin, ZINC ION 著者 Sato, Y, Yoshikawa, A, Yamashita, M, Yamagata, A, Fukai, S. 登録日 2009-10-29 公開日 2009-12-08 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.4 Å) 主引用文献 Structural basis for specific recognition of Lys 63-linked polyubiquitin chains by NZF domains of TAB2 and TAB3 Embo J., 28, 2009
3EFU	X-ray structure of human ubiquitin-Hg(II) adduct 分子名称: MERCURY (II) ION, Ubiquitin 著者 Falini, G, Fermani, S, Tosi, G. 登録日 2008-09-10 公開日 2008-12-09 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.84 Å) 主引用文献 Structural probing of Zn(ii), Cd(ii) and Hg(ii) binding to human ubiquitin. Chem.Commun.(Camb.), 45, 2008
3ALB	Cyclic Lys48-linked tetraubiquitin 分子名称: SULFATE ION, ubiquitin 著者 Satoh, T, Sakata, E, Yamamoto, S, Yamaguchi, Y, Sumiyoshi, A, Wakatsuki, S, Kato, K. 登録日 2010-07-29 公開日 2010-08-25 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Crystal structure of cyclic Lys48-linked tetraubiquitin Biochem.Biophys.Res.Commun., 2010
3AXC	Crystal structure of linear diubiquitin 分子名称: GLYCEROL, Ubiquitin 著者 Rohaim, A, Kawasaki, M, Kato, R, Dikic, I, Wakatsuki, S. 登録日 2011-04-01 公開日 2012-01-25 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.19 Å) 主引用文献 Structure of a compact conformation of linear diubiquitin Acta Crystallogr.,Sect.D, 68, 2012

<12345678910111213141516>