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1EVN	NMR OBSERVATION OF A-TETRAD 分子名称: DNA (5'-D(*AP*GP*GP*GP*T)-3') 著者 Patel, P.K, Koti, A.S.R, Hosur, R.V. 登録日 2000-04-20 公開日 2000-05-22 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 NMR studies on truncated sequences of human telomeric DNA: observation of a novel A-tetrad. Nucleic Acids Res., 27, 1999
1DV0	Refined NMR solution structure of the C-terminal UBA domain of the human homologue of RAD23A (HHR23A) 分子名称: DNA REPAIR PROTEIN HHR23A 著者 Withers-Ward, E.S, Mueller, T.D, Chen, I.S, Feigon, J. 登録日 2000-01-19 公開日 2000-02-11 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Biochemical and structural analysis of the interaction between the UBA(2) domain of the DNA repair protein HHR23A and HIV-1 Vpr Biochemistry, 39, 2000
3AL2	Crystal Structure of TopBP1 BRCT7/8 分子名称: DNA topoisomerase 2-binding protein 1, SULFATE ION 著者 Leung, C.C, Glover, J.N. 登録日 2010-07-22 公開日 2010-12-01 最終更新日 2017-10-11 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2 Å) 主引用文献 Molecular basis of BACH1/FANCJ recognition by TopBP1 in DNA replication checkpoint control J.Biol.Chem., 286, 2011
3AL3	Crystal Structure of TopBP1 BRCT7/8-BACH1 peptide complex 分子名称: DNA topoisomerase 2-binding protein 1, FORMIC ACID, Peptide of Fanconi anemia group J protein 著者 Leung, C.C, Glover, J.N. 登録日 2010-07-22 公開日 2010-12-01 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.15 Å) 主引用文献 Molecular basis of BACH1/FANCJ recognition by TopBP1 in DNA replication checkpoint control J.Biol.Chem., 286, 2011
3CWV	Crystal structure of B-subunit of the DNA gyrase from Myxococcus xanthus 分子名称: DNA gyrase, B subunit, truncated 著者 Ramagopal, U.A, Toro, R, Meyer, A.J, Burley, S.K, Almo, S.C, New York SGX Research Center for Structural Genomics (NYSGXRC) 登録日 2008-04-22 公開日 2008-05-06 最終更新日 2024-02-21 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.95 Å) 主引用文献 Crystal structure of B-subunit of the DNA gyrase from Myxococcus xanthus. To be published
5WTU	Crystal structure of DndE G21/24K mutant involved in DNA phosphorothioation 分子名称: DNA sulfur modification protein DndE 著者 Yao, P, Liu, Y, Wang, C, Cao, C. 登録日 2016-12-14 公開日 2018-02-21 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.9 Å) 主引用文献 Crystal structure of DndE G21/24K mutant involved in DNA phosphorothioation To Be Published
1EVM	NMR OBSERVATION OF A-TETRAD 分子名称: DNA (5'-D(*AP*GP*GP*GP*T)-3') 著者 Patel, P.K, Koti, A.S.R, Hosur, R.V. 登録日 2000-04-20 公開日 2000-05-22 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 NMR studies on truncated sequences of human telomeric DNA: observation of a novel A-tetrad. Nucleic Acids Res., 27, 1999
2E2W	Solution structure of the first BRCT domain of human DNA ligase IV 分子名称: DNA ligase 4 著者 Nagashima, T, Hayashi, F, Yokoyama, S, RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) 登録日 2006-11-17 公開日 2006-12-05 最終更新日 2024-05-29 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution structure of the first BRCT domain of human DNA ligase IV TO BE PUBLISHED
2M6V	Solution NMR structure of the d(GGGTTGGGTTTTGGGTGGG) quadruplex in sodium conditions 分子名称: DNA (5'-D(*GP*GP*GP*TP*TP*GP*GP*GP*TP*TP*TP*TP*GP*GP*GP*TP*GP*GP*G)-3') 著者 Karsisiotis, A.I, Webba da Silva, M. 登録日 2013-04-10 公開日 2014-07-16 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Encoding canonical DNA quadruplex structure. Sci Adv, 4, 2018
2KTF	Solution NMR structure of human polymerase iota UBM2 in complex with ubiquitin 分子名称: DNA polymerase iota, Ubiquitin 著者 Cui, G, Benirschke, R, Mer, G. 登録日 2010-02-01 公開日 2010-11-03 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structural Basis of Ubiquitin Recognition by Translesion Synthesis DNA Polymerase iota. Biochemistry, 49, 2010
1EHV	A NEW CRYSTAL STRUCTURE FOR THE DODECAMER C-G-C-G-A-A-T-T-C-G-C-G: SYMMETRY EFFECTS ON SEQUENCE-DEPENDENT DNA STRUCTURE 分子名称: DNA (5'-D(*CP*GP*CP*GP*AP*AP*TP*TP*CP*GP*CP*G)-3') 著者 Johansson, E.M. 登録日 2000-02-23 公開日 2000-07-14 最終更新日 2024-02-07 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) 主引用文献 A new crystal form for the dodecamer C-G-C-G-A-A-T-T-C-G-C-G: symmetry effects on sequence-dependent DNA structure. J.Mol.Biol., 300, 2000
2L0G	Solution NMR structure of ubiquitin-binding motif (UBM2) of human polymerase iota 分子名称: DNA polymerase iota 著者 Cui, G, Benirschke, R, Mer, G. 登録日 2010-07-01 公開日 2010-11-03 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structural Basis of Ubiquitin Recognition by Translesion Synthesis DNA Polymerase iota. Biochemistry, 49, 2010
2L0F	Solution NMR structure of human polymerase iota UBM2 (P692A mutant) in complex with ubiquitin 分子名称: DNA polymerase iota, Ubiquitin 著者 Cui, G, Benirschke, R, Mer, G. 登録日 2010-07-01 公開日 2010-11-03 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structural Basis of Ubiquitin Recognition by Translesion Synthesis DNA Polymerase iota. Biochemistry, 49, 2010
3QKU	Mre11 Rad50 binding domain in complex with Rad50 and AMP-PNP 分子名称: DNA double-strand break repair protein mre11, DNA double-strand break repair rad50 ATPase, MAGNESIUM ION, ... 著者 Williams, G.J, Williams, R.S, Arvai, A, Moncalian, G, Tainer, J.A. 登録日 2011-02-01 公開日 2011-03-30 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.3 Å) 主引用文献 ABC ATPase signature helices in Rad50 link nucleotide state to Mre11 interface for DNA repair. Nat.Struct.Mol.Biol., 18, 2011
3QKR	Mre11 Rad50 binding domain bound to Rad50 分子名称: DNA double-strand break repair protein mre11, DNA double-strand break repair rad50 ATPase, PHOSPHATE ION 著者 Williams, G.J, Williams, R.S, Arvai, A, Moncalian, G, Tainer, J.A. 登録日 2011-02-01 公開日 2011-03-30 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.4 Å) 主引用文献 ABC ATPase signature helices in Rad50 link nucleotide state to Mre11 interface for DNA repair. Nat.Struct.Mol.Biol., 18, 2011
386D	THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE AND REACTIVITY OF A PHOTOCHEMICAL CLEAVAGE AGENT BOUND TO DNA 分子名称: DNA (5'-D(*CP*GP*TP*AP*CP*G)-3'), N,N-BIS(3-AMINOPROPYL)-2-ANTHRAQUINONESULFONAMIDE 著者 Gasper, S.M, Armitage, B, Shui, X, Hu, G.G, Yu, C, Schuster, G, Williams, L.D. 登録日 1998-03-11 公開日 1998-03-12 最終更新日 2024-02-21 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.8 Å) 主引用文献 Three-Dimensional Structure and Reactivity of a Photochemical Cleavage Agent Bound to DNA J.Am.Chem.Soc., 120, 1998
3QKS	Mre11 Rad50 binding domain bound to Rad50 分子名称: DNA double-strand break repair protein mre11, DNA double-strand break repair rad50 ATPase 著者 Williams, G.J, Williams, R.S, Arvai, A, Moncalian, G, Tainer, J.A. 登録日 2011-02-01 公開日 2011-03-30 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 ABC ATPase signature helices in Rad50 link nucleotide state to Mre11 interface for DNA repair. Nat.Struct.Mol.Biol., 18, 2011
240D	EFFECT OF END BASE STEPS ON DNA FORM: CRYSTAL STRUCTURE OF THE A-DNA DECAMER D(CCGGGCCCGG) 分子名称: DNA (5'-D(*CP*CP*GP*GP*GP*CP*CP*CP*GP*G)-3') 著者 Champion, D, Kumar, C.S, Ramakrishnan, B, Gautham, N, Viswamitra, M.A. 登録日 1995-11-08 公開日 1996-06-20 最終更新日 2024-02-14 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2 Å) 主引用文献 Effect of End Base Steps on DNA Form: Crystal Structure of the A-DNA Decamer d(CCGGGCCCGG) To be Published
2QS6	Structure of a Hoogsteen antiparallel duplex with extra-helical thymines 分子名称: DNA (5'-D(*DAP*DTP*DAP*DTP*DAP*DTP*DCP*DT)-3') 著者 Pous, J, Urpi, L, Subirana, J.A, Gouyette, C, Navaza, J, Campos, J.L. 登録日 2007-07-30 公開日 2008-03-25 最終更新日 2024-04-03 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.08 Å) 主引用文献 Stabilization by extra-helical thymines of a DNA duplex with Hoogsteen base pairs. J.Am.Chem.Soc., 130, 2008
6FRG	Crystal structure of G-1F mutant of Ssp DnaB Mini-Intein variant M86 分子名称: DI(HYDROXYETHYL)ETHER, PENTAETHYLENE GLYCOL, Replicative DNA helicase, ... 著者 Popp, M.A, Blankenfeldt, W, Friedel, K, Mootz, H.D. 登録日 2018-02-15 公開日 2019-01-30 最終更新日 2024-01-17 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.535 Å) 主引用文献 A functional interplay between intein and extein sequences in protein splicing compensates for the essential block B histidine. Chem Sci, 10, 2019
2FAQ	Crystal Structure of Pseudomonas aeruginosa LigD polymerase domain with ATP and Manganese 分子名称: ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE, MANGANESE (II) ION, SULFATE ION, ... 著者 Zhu, H, Nandakumar, J, Aniukwu, J, Wang, L.K, Glickman, M.S, Lima, C.D, Shuman, S. 登録日 2005-12-07 公開日 2006-05-23 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 Atomic structure and nonhomologous end-joining function of the polymerase component of bacterial DNA ligase D Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 103, 2006
2FHD	Crystal structure of Crb2 tandem tudor domains 分子名称: DNA repair protein rhp9/CRB2, PHOSPHATE ION 著者 Lee, J, Botuyan, M.V, Thompson, J.R, Mer, G. 登録日 2005-12-23 公開日 2007-01-02 最終更新日 2011-07-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.4 Å) 主引用文献 Structural basis for the methylation state-specific recognition of histone H4-K20 by 53BP1 and Crb2 in DNA repair. Cell(Cambridge,Mass.), 127, 2006
2FAO	Crystal Structure of Pseudomonas aeruginosa LigD polymerase domain 分子名称: SULFATE ION, probable ATP-dependent DNA ligase 著者 Zhu, H, Nandakumar, J, Aniukwu, J, Wang, L.K, Glickman, M.S, Lima, C.D, Shuman, S. 登録日 2005-12-07 公開日 2006-05-23 最終更新日 2024-02-14 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.5 Å) 主引用文献 Atomic structure and nonhomologous end-joining function of the polymerase component of bacterial DNA ligase D Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 103, 2006
2FAR	Crystal Structure of Pseudomonas aeruginosa LigD polymerase domain with dATP and Manganese 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, MANGANESE (II) ION, SULFATE ION, ... 著者 Zhu, H, Nandakumar, J, Aniukwu, J, Wang, L.K, Glickman, M.S, Lima, C.D, Shuman, S. 登録日 2005-12-07 公開日 2006-05-23 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 Atomic structure and nonhomologous end-joining function of the polymerase component of bacterial DNA ligase D Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 103, 2006
1KOY	NMR structure of DFF-C domain 分子名称: DNA fragmentation factor alpha subunit 著者 Fukushima, K, Kikuchi, J, Koshiba, S, Kigawa, T, Kuroda, Y, Yokoyama, S, RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI) 登録日 2001-12-25 公開日 2002-09-04 最終更新日 2024-05-29 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution structure of the DFF-C domain of DFF45/ICAD. A structural basis for the regulation of apoptotic DNA fragmentation. J.Mol.Biol., 321, 2002

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