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2MRE	NMR structure of the Rad18-UBZ/ubiquitin complex 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, Polyubiquitin-C, ZINC ION 著者 Rizzo, A.A, Salerno, P.E, Bezsonova, I, Korzhnev, D.M. 登録日 2014-07-03 公開日 2014-10-22 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 NMR Structure of the Human Rad18 Zinc Finger in Complex with Ubiquitin Defines a Class of UBZ Domains in Proteins Linked to the DNA Damage Response. Biochemistry, 53, 2014
2N4F	EC-NMR Structure of Arabidopsis thaliana At2g32350 Determined by Combining Evolutionary Couplings (EC) and Sparse NMR Data. Northeast Structural Genomics Consortium target AR3433A 分子名称: uncharacterized protein AR3433A 著者 Tang, Y, Huang, Y.J, Hopf, T.A, Sander, C, Marks, D, Montelione, G.T, Northeast Structural Genomics Consortium (NESG) 登録日 2015-06-17 公開日 2015-07-01 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Protein structure determination by combining sparse NMR data with evolutionary couplings. Nat.Methods, 12, 2015
2N2K	Ensemble structure of the closed state of Lys63-linked diubiquitin in the absence of a ligand 分子名称: S-[(1-oxyl-2,2,5,5-tetramethyl-2,5-dihydro-1H-pyrrol-3-yl)methyl] methanesulfonothioate, ubiquitin 著者 Liu, Z, Gong, Z, Tang, C. 登録日 2015-05-10 公開日 2015-07-08 最終更新日 2024-11-13 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Lys63-linked ubiquitin chain adopts multiple conformational states for specific target recognition. Elife, 4, 2015
2MWS	Structure of the complex of ubiquitin and the ubiquitin-like (UBL) domain of Ddi1 分子名称: DNA damage-inducible protein 1, Ubiquitin 著者 Fushman, D, Nowicka, U, Walker, O. 登録日 2014-11-23 公開日 2015-03-25 最終更新日 2023-06-14 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 DNA-Damage-Inducible 1 Protein (Ddi1) Contains an Uncharacteristic Ubiquitin-like Domain that Binds Ubiquitin. Structure, 23, 2015
2NBE	Solution structure of V26A mutant of Ubiquitin at pH 2.0 分子名称: entity 著者 Surana, P, Das, R. 登録日 2016-02-04 公開日 2016-05-18 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Observing a late folding intermediate of Ubiquitin at atomic resolution by NMR Protein Sci., 25, 2016
2NBD	Solution structure of V26A mutant of Ubiquitin at pH 6.0 分子名称: entity 著者 Surana, P, Das, R. 登録日 2016-02-04 公開日 2016-05-18 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Observing a late folding intermediate of Ubiquitin at atomic resolution by NMR Protein Sci., 25, 2016
2NBU	Solution structure of the Rad23 ubiquitin-like (UBL) domain 分子名称: UV excision repair protein RAD23 著者 Chen, X, Walters, K.J. 登録日 2016-03-12 公開日 2016-07-20 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structures of Rpn1 T1:Rad23 and hRpn13:hPLIC2 Reveal Distinct Binding Mechanisms between Substrate Receptors and Shuttle Factors of the Proteasome. Structure, 24, 2016
2N7K	Unveiling the structural determinants of KIAA0323 binding preference for NEDD8 分子名称: NEDD8, Protein KHNYN 著者 Santonico, E, Nepravishta, R, Mattioni, A, Valentini, E, Mandaliti, W, Procopio, R, Iannuccelli, M, Castagnoli, L, Polo, S, Paci, M, Cesareni, G. 登録日 2015-09-14 公開日 2016-09-14 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Unveiling the structural determinants of KIAA0323 binding preference for NEDD8 To be Published
2N13	Complex structure of MyUb (1080-1122) of human Myosin VI with K63-diUb 分子名称: Ubiquitin, Unconventional myosin-VI 著者 He, F, Walters, K. 登録日 2015-03-20 公開日 2016-03-09 最終更新日 2024-10-30 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Myosin VI Contains a Compact Structural Motif that Binds to Ubiquitin Chains. Cell Rep, 14, 2016
2MQJ	Solution structure of ubiquitin-like protein from Caldiarchaeum subterraneum 分子名称: Ubiquitin-like protein 著者 Ye, K. 登録日 2014-06-22 公開日 2015-06-24 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution structure of ubiquitin-like protein from Caldiarchaeum subterraneum To be Published
2MSG	Solid-state NMR structure of ubiquitin 分子名称: Ubiquitin 著者 Lakomek, N, Habenstein, B, Loquet, A, Shi, C, Giller, K, Wolff, S, Becker, S, Fasshuber, H, Lange, A. 登録日 2014-08-04 公開日 2015-02-18 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLID-STATE NMR 主引用文献 Structural heterogeneity in microcrystalline ubiquitin studied by solid-state NMR. Protein Sci., 24, 2015
2N7D	Solution structure of the UBL domain of human Ddi2 分子名称: Protein DDI1 homolog 2 著者 Siva, M, Grantz Saskova, K, Veverka, V. 登録日 2015-09-08 公開日 2016-07-20 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Human DNA-Damage-Inducible 2 Protein Is Structurally and Functionally Distinct from Its Yeast Ortholog. Sci Rep, 6, 2016
5CHF	Crystal structure of murine ISG15 in space group P21212 分子名称: GLYCEROL, SULFATE ION, Ubiquitin-like protein ISG15 著者 Fritz, G, Basters, A. 登録日 2015-07-10 公開日 2016-09-28 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.3 Å) 主引用文献 Crystal structure of murine ISG15 in space group P21212 To Be Published
2PE9	NMR Based Structure of the Open Conformation of LYS48-Linked Di-UBiquitin Using Experimental Global Rotational Diffusion Tensor from NMR Relaxation Measurements 分子名称: Ubiquitin 著者 Ryabov, Y, Fushman, D. 登録日 2007-04-02 公開日 2007-07-10 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structural assembly of multidomain proteins and protein complexes guided by the overall rotational diffusion tensor. J.Am.Chem.Soc., 129, 2007
5AF4	Structure of Lys33-linked diUb 分子名称: GLYCEROL, SULFATE ION, UBIQUITIN 著者 Michel, M.A, Elliott, P.R, Swatek, K.N, Simicek, M, Pruneda, J.N, Wagstaff, J.L, Freund, S.M.V, Komander, D. 登録日 2015-01-19 公開日 2015-03-25 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Assembly and Specific Recognition of K29- and K33-Linked Polyubiquitin. Mol.Cell, 58, 2015
6V5D	EROS3 RDC and NOE Derived Ubiquitin Ensemble 分子名称: Ubiquitin 著者 Lange, O.F, Lakomek, N.A, Smith, C.A, Griesinger, C, de Groot, B.L. 登録日 2019-12-04 公開日 2020-01-01 最終更新日 2024-05-01 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Enhancing NMR derived ensembles with kinetics on multiple timescales. J.Biomol.Nmr, 74, 2020
5AF5	Structure of Lys33-linked triUb S.G. P 212121 分子名称: POLYUBIQUITIN-C 著者 Michel, M.A, Elliott, P.R, Swatek, K.N, Simicek, M, Pruneda, J.N, Wagstaff, J.L, Freund, S.M.V, Komander, D. 登録日 2015-01-19 公開日 2015-03-25 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.68 Å) 主引用文献 Assembly and Specific Recognition of K29- and K33-Linked Polyubiquitin. Mol.Cell, 58, 2015
2O6V	Crystal structure and solution NMR studies of Lys48-linked tetraubiquitin at neutral pH 分子名称: 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID, SULFATE ION, Ubiquitin 著者 Eddins, M.J, Wolberger, C. 登録日 2006-12-08 公開日 2007-02-13 最終更新日 2024-11-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) 主引用文献 Crystal Structure and Solution NMR Studies of Lys48-linked Tetraubiquitin at Neutral pH J.Mol.Biol., 367, 2007
2NR2	The MUMO (minimal under-restraining minimal over-restraining) method for the determination of native states ensembles of proteins 分子名称: Ubiquitin 著者 Richter, B, Gsponer, J, Varnai, P, Salvatella, X, Vendruscolo, M. 登録日 2006-11-01 公開日 2007-05-08 最終更新日 2023-12-27 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 The MUMO (minimal under-restraining minimal over-restraining) method for the determination of native state ensembles of proteins J.Biomol.Nmr, 37, 2007
6W9R	Crystal structure of an OTU deubiquitinase from Wolbachia pipientis wMel bound to ubiquitin 分子名称: CITRATE ANION, OTU domain-containing protein wMelOTU, Ubiquitin 著者 Schubert, A.F, Pruneda, J.N, Komander, D. 登録日 2020-03-23 公開日 2020-07-01 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.82 Å) 主引用文献 Identification and characterization of diverse OTU deubiquitinases in bacteria. Embo J., 39, 2020
5CHW	Structure of ISG15 in space group P212121 分子名称: GLYCEROL, SULFATE ION, Ubiquitin-like protein ISG15 著者 Fritz, G, Basters, A. 登録日 2015-07-10 公開日 2016-09-28 最終更新日 2024-01-10 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 Structure of ISG15 in space group P212121 To Be Published
2OJR	Structure of ubiquitin solved by SAD using the Lanthanide-Binding Tag 分子名称: TERBIUM(III) ION, Ubiquitin 著者 Silvaggi, N.R, Allen, K.N. 登録日 2007-01-13 公開日 2007-06-12 最終更新日 2023-12-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.6 Å) 主引用文献 Double-Lanthanide-Binding Tags for Macromolecular Crystallographic Structure Determination. J.Am.Chem.Soc., 129, 2007
2PEA	NMR Based Structure of the Closed Conformation of LYS48-Linked Di-Ubiquitin Using Experimental Global Rotational Diffusion Tensor from NMR Relaxation Measurements 分子名称: Ubiquitin 著者 Ryabov, Y, Fushman, D. 登録日 2007-04-02 公開日 2007-07-10 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structural assembly of multidomain proteins and protein complexes guided by the overall rotational diffusion tensor. J.Am.Chem.Soc., 129, 2007
2OOB	crystal structure of the UBA domain from Cbl-b ubiquitin ligase in complex with ubiquitin 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase CBL-B, Ubiquitin 著者 Kozlov, G, Gehring, K. 登録日 2007-01-25 公開日 2007-02-06 最終更新日 2023-08-30 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 Structural basis for ubiquitin-mediated dimerization and activation of the ubiquitin protein ligase Cbl-b. Mol.Cell, 27, 2007
8CMR	Linear specific OTU-type DUB SnOTU from the pathogen S. negenvensis in complex with linear di-ubiquitin 分子名称: OTU domain-containing protein, Polyubiquitin-B 著者 Uthoff, M, Hermanns, T, Boll, V, Hofmann, K, Baumann, U. 登録日 2023-02-21 公開日 2023-11-22 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.24 Å) 主引用文献 Functional and structural diversity in deubiquitinases of the Chlamydia-like bacterium Simkania negevensis. Nat Commun, 14, 2023

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