6Z8W
X-ray structure of the complex between human alpha thrombin and a thrombin binding aptamer variant (TBA-3G), which contains 1-beta-D-glucopyranosyl residue in the side chain of Thy3 at N3.
6Z8W の概要
エントリーDOI | 10.2210/pdb6z8w/pdb |
関連するPDBエントリー | 6Z8V 6Z8X |
分子名称 | Prothrombin, TBA-3G, D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide, ... (7 entities in total) |
機能のキーワード | modified aptamer, dna-protein complex, anticoaugulant, g-quadruplex, hydrolase |
由来する生物種 | Homo sapiens (Human) 詳細 |
タンパク質・核酸の鎖数 | 3 |
化学式量合計 | 39216.95 |
構造登録者 | |
主引用文献 | Smirnov, I.,Kolganova, N.,Troisi, R.,Sica, F.,Timofeev, E. Expanding the recognition interface of the thrombin-binding aptamer HD1 through modification of residues T3 and T12. Mol Ther Nucleic Acids, 23:863-871, 2021 Cited by PubMed: 33614235DOI: 10.1016/j.omtn.2021.01.004 主引用文献が同じPDBエントリー |
実験手法 | X-RAY DIFFRACTION (1.73 Å) |
構造検証レポート
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