2ZKD

Crystal structure of the SRA domain of mouse Np95 in complex with hemi-methylated CpG DNA

2ZKD の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb2zkd/pdb
• 関連するPDBエントリー: 2ZKE 2ZKF 2ZKG
• 分子名称: DNA (5'-D(*DCP*DTP*DAP*DCP*DCP*DGP*DGP*DAP*DTP*DTP*DGP*DC)-3'), DNA (5'-D(*DGP*DCP*DAP*DAP*DTP*DCP*(5CM)P*DGP*DGP*DTP*DAP*DG)-3'), E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: protein-dna complex, cell cycle, developmental protein, dna damage, dna repair, dna-binding, ligase, metal-binding, nucleus, phosphoprotein, transcription, transcription regulation, ubl conjugation pathway, zinc-finger
• 由来する生物種: Mus musculus (Mouse); 詳細
• 細胞内の位置: Nucleus: Q8VDF2
• タンパク質・核酸の鎖数: 6
• 化学式量合計: 61614.98

構造登録者

Arita, K.,Ariyoshi, M.,Tochio, H.,Nakamura, Y.,Shirakawa, M. (登録日: 2008-03-19, 公開日: 2008-09-09, 最終更新日: 2023-11-01)

• 主引用文献: Arita, K.,Ariyoshi, M.,Tochio, H.,Nakamura, Y.,Shirakawa, M.; Recognition of hemi-methylated DNA by the SRA protein UHRF1 by a base-flipping mechanism; Nature, 455:818-821, 2008; PubMed: 18772891; DOI: 10.1038/nature07249

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (1.6 Å)