3O0J

PDE4B In complex with ligand an2898

GO（遺伝子オントロジー）由来の情報

鎖名	GO（遺伝子オントロジー）id	名前空間	内容
A	0004114	molecular_function	3',5'-cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity
A	0007165	biological_process	signal transduction
A	0008081	molecular_function	phosphoric diester hydrolase activity

PDBデータベースに由来する情報

site_id	AC1
残基数	6
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE ZN A 1

鎖名	残基
A	HOH78
A	HIS238
A	HIS274
A	ASP275
A	ASP392
A	3OJ485

---

site_id	AC2
残基数	6
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 2

鎖名	残基
A	3OJ485
A	HOH495
A	HOH496
A	HOH77
A	HOH78
A	ASP275

---

site_id	AC3
残基数	11
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE 3OJ A 485

鎖名	残基
A	ZN1
A	MG2
A	HOH78
A	HIS234
A	HIS238
A	ASP275
A	MET347
A	ASP392
A	MET431
A	PHE446
A	HOH496

---

site_id	AC4
残基数	6
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE EDO A 486

鎖名	残基
A	EDO18
A	THR208
A	PHE209
A	ASN325
A	LEU326
A	GLN330

---

site_id	AC5
残基数	10
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE EDO A 487

鎖名	残基
A	EDO11
A	ARG210
A	ILE211
A	SER212
A	THR215
A	ASP321
A	ILE322
A	MET324
A	ASN325
A	HOH490

---

site_id	AC6
残基数	2
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE EDO A 5

鎖名	残基
A	SER251
A	ASP256

---

site_id	AC7
残基数	5
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE EDO A 6

鎖名	残基
A	LEU249
A	THR252
A	TRP458
A	ASP465
A	ILE469

---

site_id	AC8
残基数	3
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE EDO A 7

鎖名	残基
A	ASP340
A	LYS349
A	ARG385

---

site_id	AC9
残基数	3
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE EDO A 8

鎖名	残基
A	LEU293
A	TYR297
A	HIS306

---

site_id	BC1
残基数	5
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE EDO A 9

鎖名	残基
A	GLY280
A	VAL281
A	GLU413
A	PHE414
A	GLN417

---

site_id	BC2
残基数	5
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE EDO A 11

鎖名	残基
A	SER212
A	ASP214
A	THR215
A	HIS319
A	EDO487

---

site_id	BC3
残基数	3
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE EDO A 12

鎖名	残基
A	HOH109
A	ARG331
A	ARG335

---

site_id	BC4
残基数	2
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE EDO A 14

鎖名	残基
A	GLU202
A	SER251

---

site_id	BC5
残基数	6
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE EDO A 16

鎖名	残基
A	HOH55
A	LEU250
A	LEU255
A	ALA257
A	VAL258
A	PHE259

---

site_id	BC6
残基数	7
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE EDO A 17

鎖名	残基
A	ARG203
A	ASP204
A	LEU205
A	THR208
A	ASP261
A	ILE264
A	HOH493

---

site_id	BC7
残基数	5
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE EDO A 18

鎖名	残基
A	HOH101
A	THR208
A	ASP261
A	GLN330
A	EDO486

---

site_id	BC8
残基数	2
詳細	BINDING SITE FOR RESIDUE EDO A 19

鎖名	残基
A	GLU300
A	LYS349

---

UniProtにおけるモチーフ・データベースPROSITEからの機能情報

site_id	PS00126
残基数	12
詳細	PDEASE_I_1 3'5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase domain signature. HDVdHpGvsNqF

鎖名	残基	詳細
A	HIS274-PHE285

---

SwissProt/UniProtに記載されている蛋白質分子機能情報

site_id	SWS_FT_FI1
残基数	1
詳細	ACT_SITE: Proton donor => ECO:0000305|PubMed:15003452, ECO:0007744|PDB:1ROR

鎖名	残基	詳細
A	HIS234

---

site_id	SWS_FT_FI2
残基数	2
詳細	BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:15003452, ECO:0000269|PubMed:15260978, ECO:0007744|PDB:1ROR, ECO:0007744|PDB:1TB5

鎖名	残基	詳細
A	HIS234
A	GLN443

---

site_id	SWS_FT_FI3
残基数	1
詳細	BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:15003452, ECO:0000269|PubMed:15260978, ECO:0000269|PubMed:15576036, ECO:0000269|PubMed:15685167, ECO:0000269|PubMed:17727341, ECO:0000269|PubMed:18539455, ECO:0007744|PDB:1RO6, ECO:0007744|PDB:1RO9, ECO:0007744|PDB:1ROR, ECO:0007744|PDB:1TB5, ECO:0007744|PDB:1XLX, ECO:0007744|PDB:1XLZ, ECO:0007744|PDB:1XM4, ECO:0007744|PDB:1XM6, ECO:0007744|PDB:1XMU, ECO:0007744|PDB:1XMY, ECO:0007744|PDB:1XN0, ECO:0007744|PDB:1XOS, ECO:0007744|PDB:1XOT, ECO:0007744|PDB:1Y2H, ECO:0007744|PDB:1Y2J, ECO:0007744|PDB:2QYL, ECO:0007744|PDB:3D3P

鎖名	残基	詳細
A	HIS238

---

site_id	SWS_FT_FI4
残基数	1
詳細	BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:10846163, ECO:0000269|PubMed:15003452, ECO:0000269|PubMed:15576036, ECO:0000269|PubMed:15685167, ECO:0000269|PubMed:17727341, ECO:0000269|PubMed:18539455, ECO:0007744|PDB:1F0J, ECO:0007744|PDB:1RO6, ECO:0007744|PDB:1RO9, ECO:0007744|PDB:1ROR, ECO:0007744|PDB:1XLX, ECO:0007744|PDB:1XLZ, ECO:0007744|PDB:1XM4, ECO:0007744|PDB:1XM6, ECO:0007744|PDB:1XMU, ECO:0007744|PDB:1XMY, ECO:0007744|PDB:1XN0, ECO:0007744|PDB:1XOS, ECO:0007744|PDB:1XOT, ECO:0007744|PDB:1Y2H, ECO:0007744|PDB:1Y2J, ECO:0007744|PDB:2QYL, ECO:0007744|PDB:3D3P

鎖名	残基	詳細
A	HIS274

---

site_id	SWS_FT_FI5
残基数	1
詳細	BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:15003452, ECO:0007744|PDB:1ROR

鎖名	残基	詳細
A	ASP275

---

site_id	SWS_FT_FI6
残基数	1
詳細	BINDING: BINDING => ECO:0000269|PubMed:10846163, ECO:0000269|PubMed:15003452, ECO:0000269|PubMed:15260978, ECO:0000269|PubMed:15576036, ECO:0000269|PubMed:15685167, ECO:0000269|PubMed:18539455, ECO:0007744|PDB:1F0J, ECO:0007744|PDB:1RO6, ECO:0007744|PDB:1RO9, ECO:0007744|PDB:1ROR, ECO:0007744|PDB:1TB5, ECO:0007744|PDB:1XLX, ECO:0007744|PDB:1XLZ, ECO:0007744|PDB:1XM4, ECO:0007744|PDB:1XM6, ECO:0007744|PDB:1XMU, ECO:0007744|PDB:1XMY, ECO:0007744|PDB:1XN0, ECO:0007744|PDB:1XOS, ECO:0007744|PDB:1XOT, ECO:0007744|PDB:1Y2H, ECO:0007744|PDB:1Y2J, ECO:0007744|PDB:3D3P

鎖名	残基	詳細
A	ASP392

---

site_id	SWS_FT_FI7
残基数	1
詳細	BINDING: BINDING => ECO:0000305|PubMed:15003452, ECO:0000305|PubMed:15260978, ECO:0007744|PDB:1ROR, ECO:0007744|PDB:1TB5

鎖名	残基	詳細
A	PHE446

---