PDB-6rj4: Molybdenum storage protein - P6422, ADP

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6rj4

タイトル

Molybdenum storage protein - P6422, ADP

要素

(Molybdenum storage protein subunit ...) x 2

キーワード

METAL BINDING PROTEIN /

Mo storage (光磁気ディスク) /

ATP hydrolysis / polyoxomolybdate clusters /

amino acid kinase

機能・相同性

機能・相同性情報

nutrient reservoir activity / molybdenum ion binding /

細胞質
類似検索 - 分子機能

生物種

Azotobacter vinelandii (窒素固定)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.9 Å

データ登録者

Ermler, U. / Bruenle, S.

引用

ジャーナル: Proc Natl Acad Sci U S A / 年: 2019
タイトル: Molybdate pumping into the molybdenum storage protein via an ATP-powered piercing mechanism.
著者: Steffen Brünle / Martin L Eisinger / Juliane Poppe / Deryck J Mills / Julian D Langer / Janet Vonck / Ulrich Ermler /

要旨: The molybdenum storage protein (MoSto) deposits large amounts of molybdenum as polyoxomolybdate clusters in a heterohexameric (αβ) cage-like protein complex under ATP consumption. Here, we suggest ...

履歴

登録	2019年4月26日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2019年12月18日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2024年1月24日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / refine / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _refine.pdbx_diffrn_id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6rj4.cif.gz	609.4 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6rj4.ent.gz	502.3 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6rj4.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rj/6rj4 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/rj/6rj4	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	4907C 6risC 6rkdC 6rkeC 4ndoS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6ynd-d 5nnj-d 6ro0-d 4xq2-d 6dk7-d 2a8y-d 1prt-d 1bcp-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

B: Molybdenum storage protein subunit beta

A: Molybdenum storage protein subunit alpha

D: Molybdenum storage protein subunit beta

C: Molybdenum storage protein subunit alpha

F: Molybdenum storage protein subunit beta

E: Molybdenum storage protein subunit alpha

ヘテロ分子

176 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

B: Molybdenum storage protein subunit beta

A: Molybdenum storage protein subunit alpha

D: Molybdenum storage protein subunit beta

C: Molybdenum storage protein subunit alpha

F: Molybdenum storage protein subunit beta

E: Molybdenum storage protein subunit alpha

ヘテロ分子

B: Molybdenum storage protein subunit beta

A: Molybdenum storage protein subunit alpha

D: Molybdenum storage protein subunit beta

C: Molybdenum storage protein subunit alpha

F: Molybdenum storage protein subunit beta

E: Molybdenum storage protein subunit alpha

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: native gel electrophoresis
352 kDa, 12 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	188.680, 188.680, 188.630
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 120.00
Int Tables number	181
Space group name H-M	P6₄22

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	D-523- HOH
2	1	C-488- HOH

-
Molybdenum storage protein subunit ... , 2種, 6分子 BDFACE

#1: タンパク質	Molybdenum storage protein subunit beta / MoSto subunit beta 分子量: 28247.582 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Azotobacter vinelandii (strain DJ / ATCC BAA-1303) (窒素固定) 株: DJ / ATCC BAA-1303 / 遺伝子: mosB, Avin_43210 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P84253
#2: タンパク質	Molybdenum storage protein subunit alpha / Mo storage protein subunit alpha / MoSto subunit alpha 分子量: 29245.582 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Azotobacter vinelandii (strain DJ / ATCC BAA-1303) (窒素固定) 株: DJ / ATCC BAA-1303 / 遺伝子: mosA, Avin_43200 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P84308

#1: タンパク質

Molybdenum storage protein subunit beta / MoSto subunit beta

分子量: 28247.582 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Azotobacter vinelandii (strain DJ / ATCC BAA-1303) (窒素固定)
株: DJ / ATCC BAA-1303 / 遺伝子: mosB, Avin_43210 / 発現宿主:

Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P84253

#2: タンパク質

Molybdenum storage protein subunit alpha / Mo storage protein subunit alpha / MoSto subunit alpha

分子量: 29245.582 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Azotobacter vinelandii (strain DJ / ATCC BAA-1303) (窒素固定)
株: DJ / ATCC BAA-1303 / 遺伝子: mosA, Avin_43200 / 発現宿主:

Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / 参照: UniProt: P84308

-
非ポリマー , 6種, 815分子

#3: 化合物	ChemComp-ADP / ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP / アデノシン二リン酸分子量: 427.201 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₅N₅O₁₀P₂ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION / コメント: ADP, エネルギー貯蔵分子*YM
#4: 化合物	ChemComp-PO4 / PHOSPHATE ION / ホスファ-ト / リン酸塩分子量: 94.971 Da / 分子数: 6 / 由来タイプ: 合成 / 式: PO₄
#5: 化合物	ChemComp-NA / SODIUM ION / ナトリウムカチオン分子量: 22.990 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Na
#6: 化合物	ChemComp-ATP / ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / ATP / アデノシン三リン酸分子量: 507.181 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₆N₅O₁₃P₃ / コメント: ATP, エネルギー貯蔵分子*YM
#7: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#8: 水	ChemComp-HOH / water / 水分子量: 18.015 Da / 分子数: 798 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.81 Å³/Da / 溶媒含有率: 56.22 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法 / pH: 8.5 / 詳細: 1.2 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X10SA / 波長: 1 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2017年11月14日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.9→50 Å / Num. obs: 154099 / % possible obs: 99.8 % / 冗長度: 6.6 % / R_sym value: 0.07 / Net I/σ(I): 16.4
反射シェル	解像度: 1.9→2 Å / Num. unique obs: 21666 / R_sym value: 1.032

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.14_3260: ???)	精密化
XDS		データ削減
XSCALE		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 4ndo

4ndo

解像度: 1.9→47.167 Å / SU ML: 0.19 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 21.27 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2003	7787	5.05 %
R_work	0.1716	-	-
obs	0.1731	154075	99.82 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.9→47.167 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	11507	0	209	798	12514

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.007	12112
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.943	16566
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	15.155	7304
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.054	1933
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	2154

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.9-1.9216	0.3091	267	0.302	4783	X-RAY DIFFRACTION	100
1.9216-1.9442	0.2885	271	0.2556	4806	X-RAY DIFFRACTION	100
1.9442-1.968	0.2913	232	0.2548	4818	X-RAY DIFFRACTION	100
1.968-1.9929	0.2919	237	0.2439	4824	X-RAY DIFFRACTION	100
1.9929-2.0191	0.25	250	0.2332	4822	X-RAY DIFFRACTION	100
2.0191-2.0467	0.2929	260	0.2216	4836	X-RAY DIFFRACTION	100
2.0467-2.076	0.2676	236	0.2316	4815	X-RAY DIFFRACTION	100
2.076-2.107	0.2441	265	0.208	4839	X-RAY DIFFRACTION	100
2.107-2.1399	0.2181	259	0.2037	4778	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1399-2.175	0.2388	252	0.1977	4855	X-RAY DIFFRACTION	100
2.175-2.2125	0.2296	250	0.1869	4800	X-RAY DIFFRACTION	99
2.2125-2.2527	0.249	255	0.1991	4824	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2527-2.296	0.2346	276	0.1935	4825	X-RAY DIFFRACTION	100
2.296-2.3429	0.2285	260	0.1821	4876	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3429-2.3939	0.1996	266	0.1734	4816	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3939-2.4495	0.2306	261	0.1804	4871	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4495-2.5108	0.2394	277	0.1801	4814	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5108-2.5787	0.2098	257	0.1735	4866	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5787-2.6545	0.2293	252	0.175	4883	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6545-2.7402	0.2147	253	0.1868	4885	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7402-2.8381	0.2272	239	0.1775	4892	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8381-2.9518	0.2177	279	0.1829	4852	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9518-3.0861	0.2096	260	0.1814	4891	X-RAY DIFFRACTION	100
3.0861-3.2487	0.2194	264	0.1854	4902	X-RAY DIFFRACTION	100
3.2487-3.4522	0.2006	264	0.1684	4890	X-RAY DIFFRACTION	100
3.4522-3.7187	0.1676	262	0.1534	4944	X-RAY DIFFRACTION	100
3.7187-4.0927	0.1777	269	0.1486	4975	X-RAY DIFFRACTION	100
4.0927-4.6845	0.1493	261	0.1253	4967	X-RAY DIFFRACTION	100
4.6845-5.9001	0.1546	281	0.1445	5044	X-RAY DIFFRACTION	100
5.9001-47.1814	0.1719	272	0.1596	5295	X-RAY DIFFRACTION	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	8.5253	6.7083	1.0657	9.2707	3.2489	4.1374	-0.0596	0.3395	-0.7013	-0.5156	0.4634	-1.2137	-0.0911	1.0917	-0.4339	0.3127	0.0444	0.0478	0.5159	-0.0067	0.2991	80.5185	-12.7699	-42.1466
2	5.1542	1.1953	-0.3569	2.7835	1.6173	4.7234	-0.062	0.0791	-0.1042	-0.2584	-0.0087	0.1139	0.2373	-0.1856	0.0735	0.2669	0.0035	-0.0386	0.2447	0.01	0.1457	42.5966	-22.8528	-47.7106
3	0.6857	0.3816	-0.046	2.6257	0.801	0.6022	0.0005	0.036	-0.0647	0.0619	0.0712	-0.192	0.1024	0.138	-0.0748	0.2609	0.0323	-0.0254	0.2984	-0.0172	0.2008	49.3409	-14.3959	-36.9095
4	1.9093	0.4888	-0.1182	1.4358	-0.8132	2.2896	0.0172	0.1318	0.0573	-0.1699	0.048	0.0906	-0.1682	0.007	-0.0536	0.3392	0.0057	-0.0076	0.3041	-0.0521	0.2146	52.3277	-11.0624	-54.811
5	8.7317	-3.0504	0.2392	5.587	2.3448	2.6528	-0.0107	0.0198	0.7765	-0.3185	-0.2475	0.0964	-0.3034	-0.1234	0.2564	0.2665	-0.0149	-0.0002	0.2713	-0.0059	0.2321	59.9363	5.2145	-21.1369
6	8.7405	-4.5172	-0.7499	7.2137	5.0258	6.9151	0.1257	-0.1767	0.3117	0.1566	0.3259	-0.7697	-0.0218	0.7211	-0.498	0.1942	-0.075	-0.0092	0.308	-0.0207	0.2856	79.5026	-2.2955	-13.629
7	0.5653	-0.4933	-0.5713	0.8868	0.8382	1.366	0.0578	0.0636	-0.0244	-0.0695	0.0132	-0.1486	-0.0009	0.0579	-0.0725	0.2135	0.0025	0.0042	0.3593	-0.0476	0.2772	72.9175	-10.4819	-23.8615
8	8.8488	-3.013	0.8847	4.9439	-1.333	5.26	0.2095	0.4601	-0.3682	-0.4144	-0.1933	0.3811	0.2429	-0.3064	-0.0061	0.1886	-0.0244	-0.0023	0.2034	-0.0241	0.2325	58.88	-7.6995	-15.9576
9	0.876	-0.1942	-0.8161	1.7851	2.4952	4.5012	-0.0215	-0.0392	-0.0042	-0.0495	0.0526	-0.0067	0.2176	0.2029	-0.0243	0.1694	0.0229	-0.0119	0.2448	-0.0148	0.1779	66.4169	-7.8501	-29.9917
10	0.5574	-0.4104	0.9448	1.813	0.144	1.7315	0.0403	0.2953	0.1112	-0.1951	0.0522	-0.3257	0.0039	0.4575	-0.0861	0.21	-0.0258	0.0376	0.3465	-0.0472	0.2276	74.2893	3.9365	-28.0878
11	3.6954	-2.4607	2.9969	6.8361	-0.7384	5.8151	-0.1659	0.7766	0.6979	-0.7375	-0.017	-0.8545	-0.1338	0.8796	0.138	0.3943	-0.0584	0.1209	0.475	0.0041	0.3584	80.0639	12.1528	-35.3263
12	3.2388	-0.0259	2.2706	1.9663	0.7755	3.4532	0.0364	0.2288	0.2069	-0.2687	-0.0065	-0.2269	-0.183	0.4425	-0.0364	0.2055	-0.0482	0.0566	0.2675	-0.0031	0.2233	71.9787	7.2124	-27.9481
13	5.3536	6.1179	5.4897	9.7466	4.61	2.1268	-0.4055	-0.0257	0.8703	-0.8408	0.065	0.3341	-0.8388	-0.7816	0.2313	0.3374	0.0401	0.0475	0.4993	-0.0237	0.2684	69.0628	15.2566	-27.3849
14	6.1189	2.5933	-3.2099	5.3787	3.8343	2.0345	0.1266	0.9826	0.1206	-0.939	0.0945	0.648	-0.4986	-0.6589	-0.2117	0.3614	0.0628	-0.1202	0.4085	0.0031	0.3818	21.3623	-15.0207	-33.7259
15	1.7919	-2.6454	2.9371	5.9975	-4.7599	5.5459	0.0986	0.1241	-0.1341	-0.2649	0.041	-0.017	0.2894	0.0796	-0.156	0.1537	-0.0167	-0.014	0.2058	-0.0463	0.2228	43.1907	-46.035	-23.1196
16	1.4054	-1.3978	-2.9704	3.5541	4.8863	8.3232	0.033	-0.1364	-0.0358	-0.0533	0.0375	-0.031	0.0917	0.088	-0.0537	0.1869	0.0009	-0.049	0.1709	0.0115	0.1873	46.0483	-37.5357	-12.0408
17	9.0492	0.1231	4.9843	5.7379	-5.0501	7.2622	0.0661	0.1841	0.7527	-0.0427	-0.0437	0.078	-0.5169	-0.1698	0.0381	0.2278	0.0675	0.0327	0.2967	0.0068	0.2853	49.8778	-36.0516	-30.0273
18	0.3083	0.4198	0.1861	1.8216	-0.3003	0.5065	0.0232	-0.0322	0.0046	0.0682	0.0357	0.0009	0.0641	0.0248	-0.0556	0.1853	0.0198	-0.0196	0.212	-0.0245	0.1741	35.5857	-37.874	-16.8917
19	2.9587	-0.4144	-0.7088	2.3431	-0.1987	2.3181	0.0422	-0.0242	0.0386	0.0863	-0.0606	0.1186	0.0602	-0.2966	0.0128	0.2503	-0.0086	-0.0219	0.2636	-0.0361	0.2211	27.8523	-47.1605	-18.3097
20	0.1839	-0.2751	0.3094	2.798	-1.2007	3.0342	0.0351	-0.0462	0.0486	0.1011	0.0645	0.1189	-0.1963	-0.2249	-0.13	0.1783	0.0359	0.0155	0.2929	-0.0481	0.274	36.3176	-2.9802	-13.0383
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23	3.9269	4.9115	3.7331	7.0079	4.9884	4.2649	-0.1265	0.215	-0.1062	-0.1459	0.209	-0.2194	0.0437	0.2989	-0.1065	0.1623	0.0138	0.012	0.2051	0.0062	0.1492	35.877	-18.088	-19.5485
24	0.4067	0.7946	-0.7922	2.2595	-1.2407	1.7315	0.0035	-0.0666	-0.0839	0.0143	-0.0037	0.1227	-0.0057	-0.0031	-0.0059	0.1705	0.0001	-0.0096	0.2431	-0.0499	0.2373	32.4363	-12.1439	-10.2455
25	4.8291	3.8972	-6.0447	6.9963	-2.0757	9.5519	-0.2704	0.3523	0.224	-0.8725	0.2232	0.7856	0.0703	-1.0168	0.0275	0.3053	0.061	-0.0854	0.3669	0.0054	0.3614	16.903	-3.7821	-22.3835
26	9.3884	-2.9187	1.203	5.8102	-5.2727	9.2541	-0.0183	0.361	-0.1853	-0.2964	0.1515	0.8357	-0.0482	-0.9411	-0.2255	0.258	0.0116	-0.0351	0.4562	-0.1089	0.4258	13.5315	-8.1893	-14.6339
27	0.519	0.2247	0.0501	5.5073	-0.5627	2.5498	-0.0118	-0.1225	0.1338	-0.0349	-0.045	0.4266	0.0211	-0.3929	0.0664	0.1242	0.0291	0.0222	0.3014	-0.0497	0.2953	25.4046	-8.768	-11.2815
28	8.9756	1.6637	0.2328	6.2597	-2.9517	7.5354	0.1398	-1.0448	0.1192	1.0837	0.026	0.2182	-0.0074	-0.5173	-0.1822	0.3183	0.0211	-0.0122	0.4556	-0.068	0.2371	22.1504	-8.0522	-3.5632
29	7.6676	-1.3281	-3.0916	2.0435	1.6341	3.1241	-0.0817	-0.6794	-0.9438	0.8882	0.0958	-0.1212	1.002	-0.0617	-0.0352	0.5568	0.0542	-0.0722	0.3947	0.0625	0.3998	60.4293	-49.7492	2.6845
30	0.6403	0.2025	-0.6354	0.929	0.1966	0.8169	-0.0027	0.1079	-0.2345	-0.1336	0.0735	-0.3031	0.0912	0.178	-0.0839	0.2476	0.0806	-0.0259	0.3928	-0.0601	0.3707	76.1551	-32.8977	-28.0267
31	4.4581	1.6067	4.0713	0.9382	1.3675	3.153	0.0177	-0.3658	0.044	0.0378	-0.183	0.0735	0.0887	-0.4064	0.2293	0.2166	0.0607	0.0121	0.3295	-0.057	0.3032	69.4866	-27.0234	-28.0028
32	0.6212	1.2952	-0.4291	2.7953	1.39	2.7807	-0.0152	-0.0776	-0.0872	-0.0248	0.0211	-0.1386	-0.0478	0.0628	-0.0296	0.2078	0.0768	-0.0249	0.3051	-0.0438	0.2756	71.4873	-31.4084	-18.446
33	3.037	-0.3242	-0.8126	1.9236	-0.7139	3.0268	-0.0564	-0.1674	-0.188	0.0508	0.0151	-0.6334	0.2683	0.6883	0.0503	0.2874	0.1502	-0.044	0.4561	-0.1006	0.477	84.6637	-42.1546	-22.1936
34	2.0566	-1.989	2.7847	0.9533	0.3009	3.8261	-0.0524	-0.2178	-0.0317	0.2584	-0.2493	0.4872	-0.1204	-0.3021	0.3797	0.3563	0.0046	-0.1177	0.7057	-0.0348	0.5981	95.2977	-18.49	8.1299
35	0.1553	0.4281	0.3088	1.7936	1.054	1.1435	0.0516	-0.0407	-0.0449	0.1976	0.0047	-0.1489	0.1178	0.0682	-0.0496	0.2175	0.0365	-0.0433	0.3011	-0.0155	0.2392	57.222	-26.8793	3.3891
36	0.465	-0.3386	-0.0995	0.7794	0.1864	0.2217	0.0997	0.1393	-0.0428	-0.0857	-0.0601	-0.0322	0.0363	-0.0025	-0.0386	0.2048	0.0303	-0.0451	0.2972	-0.0337	0.2186	58.9721	-26.2954	-5.292
37	2.1821	1.5095	-0.8884	2.0303	-0.2027	1.588	0.1165	-0.1172	-0.3175	0.1913	-0.151	-0.2974	0.2111	0.0833	0.0262	0.2785	0.0545	-0.0933	0.4023	-0.0183	0.3152	65.6134	-31.3496	8.6536
38	4.9274	2.8789	-5.4727	3.8499	-1.6033	9.6968	0.1947	-0.783	-1.1514	0.3562	-0.1339	-0.448	0.7835	0.7127	0.0257	0.5104	0.0796	-0.216	0.4773	0.0916	0.5751	71.9662	-38.194	16.8919
39	1.9064	0.5395	-1.1345	1.7894	0.3595	2.5972	0.1573	-0.1342	-0.2002	0.157	-0.0326	-0.293	0.2044	0.3515	-0.1228	0.2876	0.0602	-0.1087	0.4092	-0.0122	0.2689	68.5871	-29.2599	9.5425
40	6.1369	-2.747	-6.1349	4.8835	2.0648	6.5235	0.2926	-0.6349	0.3488	-0.0166	-0.2507	-0.5778	-0.41	0.9279	0.0079	0.3386	0.0411	-0.1334	0.4628	-0.0078	0.3355	73.3953	-23.4659	14.367

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'B' and (resid 2 through 37 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'B' and (resid 38 through 68 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'B' and (resid 69 through 168 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'B' and (resid 169 through 270 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 33 through 47 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 48 through 68 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 69 through 123 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resid 124 through 143 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'A' and (resid 144 through 169 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'A' and (resid 170 through 204 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'A' and (resid 205 through 221 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'A' and (resid 222 through 261 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'A' and (resid 262 through 276 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'D' and (resid 4 through 28 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'D' and (resid 29 through 68 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'D' and (resid 69 through 121 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resid 122 through 141 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'D' and (resid 142 through 199 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resid 200 through 270 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 33 through 68 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 69 through 123 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 124 through 143 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'C' and (resid 144 through 169 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'C' and (resid 170 through 190 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'C' and (resid 191 through 204 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'C' and (resid 205 through 221 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'C' and (resid 222 through 261 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'C' and (resid 262 through 276 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'F' and (resid 4 through 28 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'F' and (resid 29 through 95 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'F' and (resid 96 through 133 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'F' and (resid 134 through 168 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'F' and (resid 169 through 270 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'E' and (resid 18 through 33 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'E' and (resid 34 through 97 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'E' and (resid 98 through 169 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'E' and (resid 170 through 204 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'E' and (resid 205 through 221 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'E' and (resid 222 through 260 )
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'E' and (resid 261 through 276 )

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