PDB-5iyz: Tubulin-MMAE complex

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5iyz

タイトル

Tubulin-MMAE complex

要素

Stathmin-4スタスミン
TUBULIN-TYROSINE LIGASETubulin—tyrosine ligase
Tubulin alpha-1B chain
Tubulin beta-2B chain

キーワード

CELL CYCLE (細胞周期) /

CYTOSKELETON (細胞骨格) / TUBULIN FOLD /

MICROTUBULE (微小管)

機能・相同性

機能・相同性情報

tubulin-tyrosine ligase activity / positive regulation of axon guidance / microtubule depolymerization / regulation of microtubule polymerization or depolymerization / cytoplasmic microtubule / microtubule-based process / cellular response to interleukin-4 /

tubulin binding / spindle microtubule /

加水分解酵素; 酸無水物に作用; GTPに作用・細胞または細胞小器官の運動に関与 ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Rattus norvegicus (ドブネズミ)

Gallus gallus (ニワトリ)

Bos taurus (ウシ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

フーリエ合成 / 解像度: 1.8 Å

データ登録者

Waight, A.B. / Bargsten, K. / Doronina, S. / Steinmetz, M.O. / Sussman, D. / Prota, A.E.

資金援助

スイス, 1件

引用

ジャーナル: Plos One / 年: 2016
タイトル: Structural Basis of Microtubule Destabilization by Potent Auristatin Anti-Mitotics.
著者: Waight, A.B. / Bargsten, K. / Doronina, S. / Steinmetz, M.O. / Sussman, D. / Prota, A.E.

履歴

登録	2016年3月24日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2016年8月17日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2016年8月24日	Group: Database references
改定 1.2	2016年10月19日	Group: Database references
改定 1.3	2016年12月21日	Group: Non-polymer description
改定 1.4	2024年1月10日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5iyz.cif.gz	939.7 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5iyz.ent.gz	770.4 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5iyz.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/iy/5iyz ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/iy/5iyz	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	5j2tC 5j2uC 4i4tS S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	5ca0-d 6fkl-d 4zhq-d 5la6-d 4tv9-d 5kx5-d 5nfz-d 5ezy-d 5lxt-d 5yls-d 4tuy-d 4o4h-d 6o5m-d 6br1-d 6fkj-d 5jvd-d 5m8g-d 5h7o-d 5cb4-d 6d88-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#175 - 2014年7月微小管 (Microtubules) 類似性 (28) #176 - 2014年8月ダイニン (Dynein) 類似性 (19) #241 - 2020年1月 20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules) 類似性 (19) #118 - 2009年10月ナトリウム・カリウムポンプ (Sodium-Potassium Pump) 類似性 (1) #168 - 2013年12月 DNAヘリカーゼ (DNA Helicase) 類似性 (1) #195 - 2016年3月 RAFタンパク質キナーゼ (RAF Protein Kinases) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#175 - 2014年7月
微小管 (Microtubules)
類似性 (28)
#176 - 2014年8月
ダイニン (Dynein)
類似性 (19)
#241 - 2020年1月
20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules)
類似性 (19)
#118 - 2009年10月
ナトリウム・カリウムポンプ (Sodium-Potassium Pump)
類似性 (1)
#168 - 2013年12月
DNAヘリカーゼ (DNA Helicase)
類似性 (1)
#195 - 2016年3月
RAFタンパク質キナーゼ (RAF Protein Kinases)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Tubulin alpha-1B chain

B: Tubulin beta-2B chain

C: Tubulin alpha-1B chain

D: Tubulin beta-2B chain

E: Stathmin-4

F: TUBULIN-TYROSINE LIGASE

ヘテロ分子

266 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	104.510, 156.610, 182.420
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

-
タンパク質 , 4種, 6分子 ACBDEF

#1: タンパク質	Tubulin alpha-1B chain / Alpha-tubulin ubiquitous / Tubulin K-alpha-1 / Tubulin alpha-ubiquitous chain 分子量: 50204.445 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 組織: Brain脳 / 参照: UniProt: P81947
#2: タンパク質	Tubulin beta-2B chain 分子量: 49999.887 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Bos taurus (ウシ) / 参照: UniProt: Q6B856
#3: タンパク質	Stathmin-4 / スタスミン / Stathmin-like protein B3 / RB3 分子量: 16844.162 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Rattus norvegicus (ドブネズミ) / 遺伝子: Stmn4 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P63043
#4: タンパク質	TUBULIN-TYROSINE LIGASE / Tubulin—tyrosine ligase 分子量: 44378.496 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Gallus gallus (ニワトリ) / 遺伝子: TTL / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: E1BQ43

-
非ポリマー , 8種, 1368分子

#5: 化合物	ChemComp-GTP / GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / GTP / グアノシン三リン酸分子量: 523.180 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₆N₅O₁₄P₃ / コメント: GTP, エネルギー貯蔵分子*YM
#6: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#7: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
#8: 化合物	ChemComp-GDP / GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / GDP / グアノシン二リン酸タイプ: RNA linking / 分子量: 443.201 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₅N₅O₁₁P₂ / コメント: GDP, エネルギー貯蔵分子*YM
#9: 化合物	ChemComp-MES / 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID / 2-モルホリノエタンスルホン酸 / MES (緩衝剤) 分子量: 195.237 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₃NO₄S / コメント: pH緩衝剤*YM
#10: 化合物	ChemComp-4Q5 / N-methyl-L-valyl-N-[(3R,4S,5S)-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-3-{[(1S,2R)-1-hydroxy-1-phenylpropan-2-yl]amino}-1-methoxy-2-methyl-3-oxopropyl]pyrrolidin-1-yl}-3-methoxy-5-methyl-1-oxoheptan-4-yl]-N-methyl-L-valinamide / モノメチルアウリスタチンE / モノメチルアウリスタチンE タイプ: peptide-likeペプチド, Peptide-likeペプチドクラス: 阻害剤 / 分子量: 717.979 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃₉H₆₇N₅O₇ 参照: N-methyl-L-valyl-N-[(3R,4S,5S)-1-{(2S)-2-[(1R,2R)-3-{[(1S,2R)-1-hydroxy-1-phenylpropan-2-yl]amino}-1-methoxy-2-methyl-3-oxopropyl]pyrrolidin-1-yl}-3-methoxy-5-methyl-1-oxoheptan-4-yl]-N-methyl-L-valinamide コメント: 抗腫瘍剤*YM
#11: 化合物	ChemComp-ACP / PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENYLATE ESTER / ADENOSINE-5'-[BETA, GAMMA-METHYLENE]TRIPHOSPHATE / β,γ-メチレンATP 分子量: 505.208 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₁H₁₈N₅O₁₂P₃ コメント: AMP-PCP, エネルギー貯蔵分子類似体*YM
#12: 水	ChemComp-HOH / water / 水分子量: 18.015 Da / 分子数: 1353 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.85 Å³/Da / 溶媒含有率: 56.89 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.7 詳細: 5% PEG, 12% glycerol, 30 mM magnesium chloride, 30 mM calcium chloride, 0.1M MES/0.1M imidazole

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: SLS / ビームライン: X10SA / 波長: 0.98 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS3 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2013年9月4日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.98 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.8→71.956 Å / Num. obs: 275542 / % possible obs: 99.9 % / 冗長度: 6.7 % / R_sym value: 0.056 / Net I/σ(I): 17.3
反射シェル	解像度: 1.8→1.85 Å / 冗長度: 6.2 % / Mean I/σ(I) obs: 0.84 / R_sym value: 2.45 / % possible all: 99.5

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.9_1692	精密化
XDS		データ削減
XSCALE		データスケーリング
PHENIX		位相決定

精密化

構造決定の手法:

フーリエ合成
開始モデル: 4I4T

4i4t

解像度: 1.8→71.956 Å / SU ML: 0.23 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.33 / 位相誤差: 22.56

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2015	13781	5 %
R_work	0.1669	-	-
obs	0.1686	275542	99.92 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.8→71.956 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	17294	0	272	1353	18919

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.009	18216
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.157	24777
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	15.502	6835
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.054	2728
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	3205

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.8-1.8204	0.3976	452	0.3521	8581	X-RAY DIFFRACTION	99
1.8204-1.8419	0.3303	454	0.3212	8633	X-RAY DIFFRACTION	100
1.8419-1.8643	0.3285	457	0.3097	8694	X-RAY DIFFRACTION	100
1.8643-1.8879	0.3392	453	0.2993	8606	X-RAY DIFFRACTION	100
1.8879-1.9128	0.3028	454	0.2839	8631	X-RAY DIFFRACTION	100
1.9128-1.939	0.3118	458	0.2838	8691	X-RAY DIFFRACTION	100
1.939-1.9667	0.2996	457	0.2688	8668	X-RAY DIFFRACTION	100
1.9667-1.996	0.2848	454	0.2518	8633	X-RAY DIFFRACTION	100
1.996-2.0272	0.251	459	0.2338	8711	X-RAY DIFFRACTION	100
2.0272-2.0605	0.252	454	0.2208	8634	X-RAY DIFFRACTION	100
2.0605-2.096	0.2358	460	0.2106	8712	X-RAY DIFFRACTION	100
2.096-2.1341	0.2374	456	0.2015	8676	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1341-2.1752	0.2183	456	0.1946	8672	X-RAY DIFFRACTION	100
2.1752-2.2196	0.2188	459	0.1854	8708	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2196-2.2678	0.229	457	0.1848	8688	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2678-2.3206	0.2178	457	0.184	8667	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3206-2.3786	0.2351	458	0.1789	8715	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3786-2.4429	0.2085	458	0.1756	8694	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4429-2.5148	0.2064	457	0.1718	8684	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5148-2.596	0.2118	460	0.1684	8738	X-RAY DIFFRACTION	100
2.596-2.6888	0.2072	460	0.1741	8734	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6888-2.7964	0.2124	460	0.1721	8741	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7964-2.9237	0.2158	461	0.1734	8745	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9237-3.0779	0.2153	462	0.1688	8780	X-RAY DIFFRACTION	100
3.0779-3.2707	0.2118	461	0.1654	8751	X-RAY DIFFRACTION	100
3.2707-3.5232	0.1846	461	0.155	8768	X-RAY DIFFRACTION	100
3.5232-3.8778	0.1728	466	0.1428	8837	X-RAY DIFFRACTION	100
3.8778-4.4388	0.1581	466	0.1264	8848	X-RAY DIFFRACTION	100
4.4388-5.5921	0.1602	471	0.1306	8931	X-RAY DIFFRACTION	100
5.5921-72.0133	0.1946	483	0.1608	9190	X-RAY DIFFRACTION	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.1496	-0.1685	-0.4138	3.7942	0.3151	0.1234	0.0909	0.1051	0.5374	-0.6159	0.2299	-0.4011	-1.0601	0.3594	-0.2508	0.9663	-0.1905	0.1693	0.4784	-0.1232	0.4647	28.912	98.6167	55.2612
2	3.9896	-0.9898	0.6181	6.8881	0.5992	3.3544	-0.2561	0.5339	0.3209	-1.3886	0.5042	0.2803	-0.7444	0.129	-0.2009	0.849	-0.2391	0.0974	0.452	-0.0696	0.3827	27.1175	89.3302	43.8292
3	1.1227	0.24	0.3497	0.8715	0.5534	0.6274	0.0276	0.1882	0.1256	-0.3642	0.5346	-0.5712	-0.7258	0.731	-0.4059	0.5303	-0.2202	0.1779	0.6185	-0.2706	0.5167	37.2346	80.6135	50.7734
4	0.7551	-0.3241	-0.2026	2.4232	0.9172	2.5345	0.0103	0.0579	-0.0232	0.0335	0.1506	0.014	-0.1663	0.1685	-0.1446	0.3293	-0.0139	0.0371	0.3198	-0.1003	0.2876	22.0731	78.7041	59.8242
5	1.3001	0.0682	-0.0239	2.8294	0.9428	3.5179	0.0445	-0.043	0.0912	0.1862	0.0724	0.1236	-0.2257	-0.0069	-0.1139	0.4206	0.0114	0.0629	0.3105	-0.0952	0.3342	18.5084	84.5214	72.1736
6	0.6154	0.3207	0.3289	3.2873	1.7042	2.733	-0.0308	-0.0715	0.1442	0.4665	0.067	0.1134	-0.1558	-0.0137	-0.0383	0.4225	0.0086	0.0724	0.3642	-0.0742	0.3623	18.9256	82.8728	73.8172
7	1.1378	-0.0394	-0.1289	2.8484	2.2574	3.1796	0.0262	-0.0448	-0.1733	0.5784	0.4816	-0.4089	0.5145	0.9185	-0.4215	0.3709	0.1095	-0.092	0.4481	-0.1584	0.4339	32.4268	61.4797	61.1753
8	3.8282	-0.9311	0.1916	4.4001	1.2042	3.0064	-0.0667	0.064	0.7413	-0.4009	0.0389	-0.0107	-0.9371	-0.0445	0.0184	0.5204	0.0105	0.0023	0.2695	-0.0157	0.4188	15.8548	72.7254	22.6569
9	2.016	-0.5063	-0.1011	5.3273	0.3398	2.7066	0.0996	0.3162	0.1585	-0.5878	-0.0649	0.033	-0.5359	0.2449	-0.0408	0.3928	-0.046	0.0283	0.4332	-0.0452	0.3003	24.3634	58.6496	13.2821
10	1.3628	0.2462	-0.344	2.7437	1.1511	2.3312	0.0215	-0.1362	0.1271	-0.001	0.0696	-0.1326	-0.1716	0.2511	-0.0886	0.1848	0.0041	0.0148	0.2909	-0.0788	0.2498	23.8967	52.9775	26.0545
11	0.5954	0.0714	0.6116	1.1448	1.0486	2.9538	-0.0295	-0.0906	0.0568	0.0169	-0.0415	0.1695	-0.1545	-0.2052	0.0687	0.2116	0.0184	0.0265	0.2919	-0.0927	0.3484	11.8793	57.968	32.9203
12	5.0296	-2.7558	-1.971	5.3871	2.6598	1.6986	0.3167	0.2805	0.0122	-0.6976	-0.3441	0.5834	-0.2318	-1.2054	0.0295	0.4939	0.1278	-0.043	0.6796	-0.1517	0.5606	-4.223	63.2051	35.1747
13	0.4164	-0.2759	0.0868	1.8417	1.2516	2.3634	-0.0806	-0.1133	0.0506	0.3813	-0.0462	0.1855	0.1518	-0.2506	0.1028	0.2242	-0.0117	0.0225	0.3241	-0.0567	0.3039	13.4425	50.5518	38.8487
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17	3.9731	-0.7498	0.3312	4.2493	1.0902	3.2934	-0.1513	0.6426	0.292	-0.4435	0.1082	0.2055	-0.154	-0.2764	0.0413	0.4432	-0.1021	0.0083	0.5979	-0.0029	0.2696	15.2049	11.7584	-41.5241
18	1.6324	-0.273	-0.6628	2.4425	-0.0575	1.9078	-0.1333	0.4724	-0.1729	-0.3639	0.1171	-0.1921	0.4197	0.1638	-0.0219	0.5789	-0.066	0.107	0.5971	-0.1963	0.406	27.7536	-2.5571	-39.524
19	2.7421	0.5194	2.3162	1.844	1.4753	2.605	-0.067	0.4219	-0.4707	-0.3546	-0.0321	0.197	0.8026	-0.2862	-0.1088	0.8424	-0.2806	0.0507	0.6744	-0.2383	0.4878	8.9916	-11.3834	-34.1772
20	1.0341	-0.2107	-0.1532	1.8925	0.5326	2.0315	-0.1716	0.2333	-0.0411	-0.2636	0.1518	0.0838	0.0992	-0.3006	-0.008	0.4356	-0.0925	0.0274	0.4767	-0.0904	0.3516	15.1264	2.8292	-27.5048
21	0.0903	-0.0023	0.2233	1.0337	0.9112	1.4031	-0.0612	0.3574	-0.4071	-0.356	-0.2905	0.5648	0.6678	-0.61	0.2097	0.5496	-0.2093	0.0576	0.646	-0.2159	0.4972	2.39	-6.2604	-24.9467
22	1.972	-0.3578	-0.4433	1.6829	0.2485	2.0214	-0.233	0.3824	-0.2666	-0.0457	0.0405	0.2249	0.3317	-0.3257	0.2213	0.4415	-0.1389	0.0351	0.3899	-0.122	0.3166	8.3363	-2.6553	-20.8501
23	2.2988	-0.6933	-0.7698	2.2354	0.6642	1.5481	-0.2465	0.1593	-0.7167	-0.0604	0.0203	-0.2796	0.664	0.2609	-0.0306	0.7578	0.0603	0.1169	0.4286	-0.1947	0.5902	29.5647	-17.5001	-24.0925
24	1.4367	-0.0978	0.3723	2.0792	-0.1058	1.4292	-0.0268	-0.0391	0.1607	0.9409	0.1828	-0.0881	-0.0039	0.3906	-0.1479	0.9034	-0.0665	-0.0264	0.6006	-0.155	0.5466	27.4821	92.5411	82.1659
25	0.3794	-0.3043	-0.5029	0.2859	0.2873	0.5325	-0.0509	-0.0602	-0.0026	0.3106	0.3565	-0.3179	0.4294	0.5636	-0.4213	0.3901	0.0724	0.0159	0.5857	-0.1893	0.4928	42.3236	27.2169	3.9536
26	2.0315	1.0034	-1.2845	3.2835	-0.0176	2.574	-0.4643	0.3773	-0.4616	-0.1973	0.1335	0.0208	1.1524	-0.4904	0.2264	0.8539	-0.0987	0.1024	0.4557	-0.1278	0.4933	6.3127	54.2491	70.1955
27	4.9669	0.6784	-0.6178	3.3472	-4.361	5.7877	0.027	-0.4959	0.07	0.6928	-0.1329	-0.3206	-0.3497	0.9884	0.0835	0.6931	0.0175	-0.028	0.6026	0.0179	0.4719	11.7392	65.1203	97.6285
28	1.5785	-0.0942	1.3549	2.3948	-0.0952	1.1984	-0.376	-1.1162	0.6095	0.6231	0.1763	-1.1515	0.0108	0.8502	0.1507	0.9457	0.0701	-0.3488	1.5534	0.1161	1.098	23.0375	61.0042	108.9752
29	4.3723	-0.1575	-0.5075	2.513	-0.6641	0.5627	0.2431	-0.4728	-0.8505	0.8345	-0.2452	-1.2049	0.4197	1.4911	-0.014	1.033	0.3201	-0.1296	1.2262	0.4559	1.1678	20.8613	51.6449	109.2954
30	4.4916	1.8704	-1.6947	2.5697	-0.2921	4.6218	-0.234	-0.4883	-0.755	0.3004	0.0258	-0.1728	0.8973	0.8409	0.179	1.0516	0.27	0.1028	0.7258	0.2377	0.771	7.4233	49.2391	108.4363
31	0.6306	0.6621	-0.4607	1.2257	-0.7946	1.0519	-0.4122	-0.1327	-0.7065	0.1467	0.1416	-0.1543	1.1025	-0.0009	-0.0741	1.1672	0.1057	0.2442	0.4492	0.1442	0.7819	-2.4155	47.145	99.2907
32	5.1987	2.5343	-6.4871	2.4766	-3.2615	8.9413	0.0542	-0.0641	0.0992	0.4249	0.2883	0.116	-0.3606	0.1019	-0.3936	0.618	0.0991	0.0637	0.3225	0.0205	0.4064	0.9252	66.0169	93.4622
33	2.1807	0.475	-2.0236	0.7029	-0.1489	4.4711	-0.2598	-0.1835	-0.377	0.1995	0.147	-0.0526	0.5622	0.0043	0.0603	0.6736	0.0863	0.0832	0.3477	0.0367	0.4332	3.5952	58.8573	91.2686
34	3.9499	-1.0463	-0.6089	2.2196	-2.3986	6.3198	-0.3827	0.6025	-0.2847	-0.1316	0.2398	0.2709	0.759	-0.9103	0.1138	0.6154	-0.2044	0.0343	0.5659	-0.0666	0.5217	-6.8416	55.6574	80.2893

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 1 through 64 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 65 through 88 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 89 through 160 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 161 through 243 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 244 through 311 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 312 through 401 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 402 through 437 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 1 through 64 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 65 through 127 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 128 through 197 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 198 through 273 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 274 through 295 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 296 through 438 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 1 through 197 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 198 through 311 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 312 through 440 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resid 1 through 64 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'D' and (resid 65 through 197 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resid 198 through 223 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resid 224 through 268 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resid 269 through 311 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 312 through 400 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 401 through 441 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'E' and (resid 6 through 46 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'E' and (resid 47 through 143 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'F' and (resid 1 through 66 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'F' and (resid 67 through 96 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'F' and (resid 97 through 139 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'F' and (resid 140 through 174 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'F' and (resid 175 through 198 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'F' and (resid 199 through 283 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'F' and (resid 284 through 302 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'F' and (resid 303 through 339 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'F' and (resid 340 through 380 )

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