+データを開く
-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1elg | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | NATURE OF THE INACTIVATION OF ELASTASE BY N-PEPTIDYL-O-AROYL HYDROXYLAMINE AS A FUNCTION OF PH | ||||||
要素 | PORCINE PANCREATIC ELASTASE | ||||||
キーワード | COMPLEX (HYDROLASE/INHIBITOR) / COMPLEX (HYDROLASE-INHIBITOR) / COMPLEX (HYDROLASE-INHIBITOR) complex | ||||||
機能・相同性 | 機能・相同性情報 pancreatic elastase / serine-type endopeptidase activity / タンパク質分解 / extracellular space / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | Sus scrofa (ブタ) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 1.65 Å | ||||||
データ登録者 | Ding, X. / Rasmussen, B. / Demuth, H.-U. / Ringe, D. / Steinmetz, A.C.U. | ||||||
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 1995 タイトル: Nature of the inactivation of elastase by N-peptidyl-O-aroyl hydroxylamine as a function of pH. 著者: Ding, X. / Rasmussen, B.F. / Demuth, H.U. / Ringe, D. / Steinmetz, A.C. #1: ジャーナル: Biochemistry / 年: 1994 タイトル: Direct Structural Observation of an Acyl-Enzyme Intermediate in the Hydrolysis of an Ester Substrate by Elastase 著者: Ding, X. / Rasmussen, B.F. / Petsko, G.A. / Ringe, D. #2: ジャーナル: J.Enzyme Inhib. / 年: 1991 タイトル: Inhibition of Proteases with Enkephalin-Analogue Inhibitors 著者: Demuth, H.-U. / Silberring, J. / Nyberg, F. #3: ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 1991 タイトル: Competing Redox and Inactivation Processes in the Inhibition of Cysteine Proteinases by Peptidyl O-Acylhydroxamates. 13C and 15N NMR Evidence for a Novel Sulfenamide Enzyme Adduct 著者: Robinson, V.J. / Coles, P.J. / Smith, R.A. / Krantz, A. #4: ジャーナル: J.Org.Chem. / 年: 1989 タイトル: N-O Bond Fission as the Rate-Determining Step in the Aqueous Conversion of N-Peptiyl-O-(P-Nitrobenzoyl)Hydroxylamines to P-Nitrobenzoic Acid and Peptidylhydroxamic Acids 著者: Demuth, H.-U. / Fischer, G. / Barth, A. / Schowen, R.L. #5: ジャーナル: J.Am.Chem.Soc. / 年: 1989 タイトル: Crystal Structure of the Covalent Complex Formed by a Peptidyl Difluoro Keto Amide with Porcine Pancreatic Elastase at 1.78 Angstroms Resolution 著者: Takahashi, L.H. / Radhakrishnan, R. / Rosenfield Junior, R.E. / Meyer Junior, E.F. / Trainor, D.A. | ||||||
履歴 |
| ||||||
Remark 700 | SHEET THE TWO SEVEN STRANDED SHEETS IN THIS STRUCTURE ARE REALLY SIX STRANDED BETA BARRELS. THIS IS ...SHEET THE TWO SEVEN STRANDED SHEETS IN THIS STRUCTURE ARE REALLY SIX STRANDED BETA BARRELS. THIS IS DENOTED BY THE FIRST STRAND RECURRING AS THE LAST STRAND. |
-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
---|
-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1elg.cif.gz | 59.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | pdb1elg.ent.gz | 46.8 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1elg.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/el/1elg ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/el/1elg | HTTPS FTP |
---|
-関連構造データ
-リンク
-集合体
登録構造単位 |
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
|
-要素
#1: タンパク質 | 分子量: 25928.031 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) / 参照: UniProt: P00772, pancreatic elastase |
---|---|
#2: 化合物 | ChemComp-CA / |
#3: 化合物 | ChemComp-BAA / ( |
#4: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
---|
-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.15 Å3/Da / 溶媒含有率: 42.75 % | ||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
結晶化 | *PLUS pH: 5 / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
|
-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
---|---|
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 1.65→10 Å / Num. obs: 23730 / % possible obs: 85 % / Observed criterion σ(I): 2 |
反射 | *PLUS 最低解像度: 44 Å / Num. obs: 27890 / % possible obs: 100 % / Observed criterion σ(I): 0 |
-解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | Rfactor Rwork: 0.17 / Rfactor obs: 0.17 / 最高解像度: 1.65 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.65 Å
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 |
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化 | *PLUS 最低解像度: 10 Å / Num. reflection all: 23730 / σ(I): 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |