PDB-8vzk: Crystal Structure of 2-Hydroxyacyl-CoA Lyase/Synthase CfhHACS fro...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 8vzk

タイトル

Crystal Structure of 2-Hydroxyacyl-CoA Lyase/Synthase CfhHACS from Chloroflexi bacterium in the Complex with THDP and ADP

要素

Oxalyl-CoA decarboxylase

キーワード

LYASE / 2-hydroxyacyl-CoA lyase/synthase / Oxalyly-CoA decarboxylase / acyloin condensation / Structural Biology Center / eBERlight

機能・相同性

機能・相同性情報

oxalyl-CoA decarboxylase / oxalyl-CoA decarboxylase activity / fatty acid alpha-oxidation / thiamine pyrophosphate binding / peroxisome / magnesium ion binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Chloroflexi bacterium HGW-Chloroflexi-9 (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.65 Å

データ登録者

Kim, Y. / Gade, P. / Mayfield, A. / Endres, M. / Lee, S. / Yoshikuni, Y. / Gonzalez, R. / Michalska, K. / Joachimiak, A.

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: Commun Chem / 年: 2024
タイトル: Revealing reaction intermediates in one-carbon elongation by thiamine diphosphate/CoA-dependent enzyme family.
著者: Kim, Y. / Lee, S.H. / Gade, P. / Nattermann, M. / Maltseva, N. / Endres, M. / Chen, J. / Wichmann, P. / Hu, Y. / Marchal, D.G. / Yoshikuni, Y. / Erb, T.J. / Gonzalez, R. / Michalska, K. / Joachimiak, A.

履歴

登録	2024年2月11日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2024年10月2日	Provider: repository / タイプ: Initial release

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	8vzk.cif.gz	507.1 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb8vzk.ent.gz	348.1 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	8vzk.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	8vzk_validation.pdf.gz	1.4 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	8vzk_full_validation.pdf.gz	1.4 MB	表示
XML形式データ	8vzk_validation.xml.gz	42.2 KB	表示
CIF形式データ	8vzk_validation.cif.gz	53.5 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vz/8vzk ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/vz/8vzk	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	8vzaC 8vzbC 8vzcC 8vzdC 8vzeC 8vzfC 8vzhC 8vziC 8vzjC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#263 - 2021年11月アセトヒドロキシ酸合成酵素 (Acetohydroxyacid Synthase) 類似性 (11) #213 - 2017年9月サーチュイン (Sirtuins) 類似性 (1) #153 - 2012年9月ピルビン酸脱水素酵素複合体 (Pyruvate Dehydrogenase Complex) 類似性 (2) #154 - 2012年10月クエン酸回路 (Citric Acid Cycle) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Oxalyl-CoA decarboxylase

B: Oxalyl-CoA decarboxylase

ヘテロ分子

123 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Oxalyl-CoA decarboxylase

B: Oxalyl-CoA decarboxylase

ヘテロ分子

A: Oxalyl-CoA decarboxylase

B: Oxalyl-CoA decarboxylase

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
245 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	111.327, 111.327, 193.164
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 120.000
Int Tables number	152
Space group name H-M	P3₁21
Space group name Hall	P3₁2"
Symmetry operation	#1: x,y,z #2: -y,x-y,z+1/3 #3: -x+y,-x,z+2/3 #4: x-y,-y,-z+2/3 #5: -x,-x+y,-z+1/3 #6: y,x,-z

-
タンパク質 , 1種, 2分子 AB

#1: タンパク質	Oxalyl-CoA decarboxylase 分子量: 60264.629 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Chloroflexi bacterium HGW-Chloroflexi-9 (バクテリア) 遺伝子: CVU47_07430 / 発現宿主: Escherichia coli BL21(DE3) (大腸菌) / Variant (発現宿主): Gold / 参照: UniProt: A0A2N2LHX4, oxalyl-CoA decarboxylase

-
非ポリマー , 6種, 14分子

#2: 化合物	ChemComp-TPP / THIAMINE DIPHOSPHATE / チアミンピロりん酸分子量: 425.314 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₂H₁₉N₄O₇P₂S / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#3: 化合物	ChemComp-ADP / ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE / ADP 分子量: 427.201 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₅N₅O₁₀P₂ / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION / コメント: ADP, エネルギー貯蔵分子*YM
#4: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#5: 化合物	ChemComp-EDO / 1,2-ETHANEDIOL / ETHYLENE GLYCOL / エチレングリコ-ル分子量: 62.068 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂H₆O₂
#6: 化合物	ChemComp-PEG / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / ジエチレングリコ-ル分子量: 106.120 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄H₁₀O₃
#7: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

研究の焦点であるリガンドがあるか	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.87 Å³/Da / 溶媒含有率: 57.1 %
結晶化	温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: 0.2 magnesium chloride, 0.1 M hepes pH 7.5, 30 % (v/v) PEG400

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K / Serial crystal experiment: N
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 19-ID / 波長: 0.97918 Å
検出器	タイプ: DECTRIS PILATUS3 X 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2022年12月19日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.97918 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2.65→50 Å / Num. obs: 39660 / % possible obs: 97.1 % / 冗長度: 14.2 % / B_iso Wilson estimate: 59.17 Å² / CC_1/2: 1 / R_merge(I) obs: 0.162 / R_rim(I) all: 0.168 / Net I/σ(I): 13
反射シェル	解像度: 2.65→2.7 Å / 冗長度: 8.7 % / R_merge(I) obs: 0.913 / Mean I/σ(I) obs: 1 / Num. unique obs: 1347 / CC_1/2: 0.837 / R_rim(I) all: 0.952 / % possible all: 68.4

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.20.1_4487	精密化
HKL-3000		データ削減
HKL-3000		データスケーリング
HKL-3000		位相決定
MOLREP		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.65→48.23 Å / SU ML: 0.3997 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.35 / 位相誤差: 31.5897
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2444	1913	4.85 %
R_work	0.2118	37562	-
obs	0.2134	39475	96.61 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 70.22 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.65→48.23 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	8209	0	127	4	8340

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.0017	8510
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.4849	11567
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.0424	1268
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.0042	1519
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	12.1755	3118

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.65-2.72	0.3639	89	0.3706	1889	X-RAY DIFFRACTION	69.11
2.72-2.79	0.369	110	0.3767	2392	X-RAY DIFFRACTION	87.57
2.79-2.87	0.376	120	0.3509	2704	X-RAY DIFFRACTION	97.92
2.87-2.97	0.3391	110	0.3277	2764	X-RAY DIFFRACTION	99.76
2.97-3.07	0.3629	151	0.2992	2718	X-RAY DIFFRACTION	99.65
3.07-3.19	0.3492	136	0.292	2744	X-RAY DIFFRACTION	99.65
3.19-3.34	0.2755	126	0.2762	2738	X-RAY DIFFRACTION	99.69
3.34-3.52	0.2557	163	0.2282	2729	X-RAY DIFFRACTION	99.55
3.52-3.74	0.2419	154	0.2176	2782	X-RAY DIFFRACTION	99.8
3.74-4.02	0.2357	141	0.1908	2751	X-RAY DIFFRACTION	99.83
4.02-4.43	0.2239	155	0.1788	2771	X-RAY DIFFRACTION	99.76
4.43-5.07	0.1925	153	0.1614	2810	X-RAY DIFFRACTION	99.83
5.07-6.39	0.2242	142	0.1901	2829	X-RAY DIFFRACTION	100
6.39-48.23	0.1906	163	0.1507	2941	X-RAY DIFFRACTION	99.61

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.586329561764	-0.263333739249	-0.175498101039	1.30938517434	0.180279032888	1.44517172505	-0.0138218822036	0.0394382000975	-0.115208377307	0.0881283179817	-0.0978007643325	0.135039323276	0.345159544534	-0.0780093070264	0.0970679053711	0.509264929054	-0.0914811723264	0.0642002041482	0.690401769736	-0.0107536632181	0.349435448875	49.1404281576	-17.8623604963	-20.5451527488
2	2.27757074152	0.737394596437	0.492404866121	3.40459422498	0.207925347671	2.80964200459	-0.547298330386	-0.11656989903	0.0327366885184	-0.359789670035	0.099204060242	-0.29387960102	0.556937420905	0.629464668913	0.191124668279	0.627737071296	0.114063561332	0.149663794891	0.853369268365	0.0284331952448	0.443825600719	70.1145954802	-26.8622391187	-29.6285461603
3	4.3718874392	0.491761961676	3.19486369032	2.1056356185	0.144407644113	3.38282901753	0.24137762172	-0.241111669986	-0.613428774671	0.139096949869	-0.033592166512	-0.292068888101	0.784812802889	0.144072622526	-0.237900859519	0.934356749668	0.0945535088885	0.157273408985	0.788972162481	0.146137109736	0.532458838511	72.5259433309	-39.8549339755	-16.1361546545
4	2.90363718904	0.222748554054	-2.33767663938	5.71657720342	-0.371741108914	2.10695368817	-0.027152262004	-0.358238918768	-0.376874967602	0.522267200499	-0.100991563944	-0.635974787363	0.376065647243	0.822905614042	0.18874252097	0.847215973048	0.0772729687967	-0.0491004634827	0.861133906537	0.0819574860644	0.396068470883	66.9743668928	-22.3476759525	2.22514726196
5	0.738562503344	-0.714331471339	0.229087819593	1.86165590268	0.695563804294	1.55814891819	-0.244084408708	-0.109139707197	-0.134726604743	0.391912255322	0.0318688959727	0.136557970374	0.174668179173	0.152897004432	0.234969910169	0.672861474573	-0.0280885383423	0.0794617970029	0.749597134673	0.0507681887566	0.433382158306	54.6919992215	-17.4156380916	-4.48257757284
6	1.02234289253	-0.685987121107	0.0164469181036	1.90817928316	-0.423031217826	1.84664575181	-0.0633741941954	-0.190608724176	0.0221814420516	0.759033219144	-0.00858713478505	-0.435459692183	-0.0250869360762	0.606717145609	0.142957048316	0.7996177475	-0.0701194175355	-0.0233848918393	0.884513535031	0.0184190951691	0.396954629978	66.2158099913	-5.27599546296	3.64732747063
7	1.14849729192	-1.07875806037	-0.234496732902	2.1673260937	0.356057689991	1.50003299933	-0.128536265697	-0.429547353991	-0.149914757815	0.507350636757	-0.0543520119431	-0.0759880155659	0.162767263274	0.307422481375	0.04868661917	0.960909569134	-0.0897356680502	0.0654759886003	0.888070300439	0.0942661862043	0.485806774355	61.1980397871	-15.8425090897	9.4222780471
8	1.01647587583	0.696981092076	-0.064884547426	2.37286455864	0.31263877676	1.20166478813	-0.108602835103	0.111337647126	0.0332252621089	0.597798246857	0.0147830134318	-0.578435942034	-0.187221713504	0.883656746637	-0.0320745489163	0.482158249667	-0.167720756911	-0.082901508467	0.833079354176	0.0769072376681	0.451857468253	74.4751808673	8.94035442665	-14.8359079479
9	0.368102028771	0.0440992923001	0.0401417574774	1.60735132052	0.803636691426	1.26378819253	0.0301050435076	-0.0324404815545	-0.0113508473144	0.16285601035	-0.183377669062	-0.157483650123	-0.013484394326	0.262764835074	0.12145716037	0.423054962707	-0.0803590200468	-0.0358628566175	0.769476701632	0.0547986049038	0.344958272132	64.2530372747	6.02390175795	-18.7938398543
10	0.861429739495	-0.370242769563	0.362136837214	1.88275547456	0.682319395281	1.47782462978	-0.00338088625266	0.229934334177	0.0584028411158	-0.0343401644804	-0.0164428843423	-0.322969489389	-0.265093917947	0.285160045434	0.0489765325838	0.479550425271	-0.07938244701	0.001398068995	0.840997474443	0.049354856496	0.442539712835	70.0605822238	15.1284738847	-23.6887017598
11	2.69352301609	0.295992659182	-0.884764337646	2.80557562844	-0.100733879082	2.33238190694	0.118179093687	-0.266429310579	0.184773588614	0.334907454549	-0.161223471659	0.3256849135	-0.734327776711	0.112948422004	0.0897035159679	0.817641853521	0.0901366161715	-0.0376068215031	0.808179986177	-0.0885661222712	0.415346421547	40.9477015842	33.4860708677	-13.1017618655
12	2.34345828321	0.179657713354	-0.954475690821	3.01064450306	0.375764556903	2.35523877876	-0.192419893899	0.461520286427	-0.0752216661756	-0.266920333044	-0.111363530458	0.484208300527	-0.490881596837	-0.610997106361	0.22922923486	0.627747951344	0.105653722333	-0.0558548018506	0.863980155862	-0.0387476061736	0.539893430362	35.5863967926	25.0822823856	-21.4207045467
13	2.29752032449	0.0807353871492	-0.866222110087	1.95325751273	-1.20225506786	2.57936845062	0.154327837839	-0.30660260753	0.413893290411	0.531782410755	-0.109218140939	0.429826558569	-0.792466110697	-0.36460912804	0.00256556193547	1.05740181454	0.106258839099	-0.0336611769018	0.948772265599	-0.257228863489	0.723210939792	34.4957849983	36.0538140891	-8.71594541402
14	3.79246204656	1.36833391535	0.394353235251	4.37117694301	0.684812961156	1.42590387244	-0.083237838844	-0.126385201502	0.407460816943	0.695631551546	-0.0346405631673	0.41107528689	-0.689639698465	-0.447261683392	0.0956989644639	0.871512652064	0.031127413378	0.0354260119031	0.853910490977	-0.069276674402	0.452107987034	40.610921262	15.9357875487	5.43822950387
15	0.47900829278	-0.3057209436	-0.444193142045	1.30965047397	0.26440933416	2.09897712037	0.0384660223043	-0.158811177137	0.0932746052197	0.542383095936	-0.0603676280076	0.0142483605965	0.202346753407	-0.0832685571266	0.0621817624586	0.777037262168	-0.0865321210423	-0.00171418426026	0.755866410416	-0.0225889530668	0.392250635412	52.5424911353	12.3502011224	-1.85262911769
16	1.93319185239	-0.389737560228	-0.7477538301	1.8128502977	-0.152352839285	3.12659288687	-0.175941708863	-0.383035124454	-0.167892212933	0.62437730212	0.0536614910342	0.381330523961	0.259464278134	-0.569482967913	0.17231743091	0.795039915261	-0.12103993433	0.0929758834757	0.930597310974	-0.0122187589797	0.426126330823	41.0530264902	-0.957663800369	4.04433489829
17	1.45957486233	-0.854929117486	-0.423826403873	1.86031761055	-0.757301726092	1.81160764256	-0.11636256683	-0.299064854393	-0.0669838227168	0.649019510443	0.0513644001843	0.203852723282	-0.527426877997	-0.110988233786	0.0454804580079	1.10622686509	-0.0290694210671	0.0531731241562	0.888630150068	-0.0584050286093	0.435923932103	46.0818469811	8.40080396128	11.6504649466

精密化 TLSグループ

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	chain 'A' and (resid 8 through 287 )	A	A	8 - 287	1 - 280
2	2	chain 'A' and (resid 288 through 321 )	A	A	288 - 321	281 - 314
3	3	chain 'A' and (resid 322 through 365 )	A	A	322 - 365	315 - 358
4	4	chain 'A' and (resid 366 through 405 )	A	A	366 - 405	359 - 398
5	5	chain 'A' and (resid 406 through 463 )	A	A	406 - 463	399 - 456
6	6	chain 'A' and (resid 464 through 501 )	A	A	464 - 501	457 - 494
7	7	chain 'A' and (resid 502 through 550 )	A	A	502 - 550	495 - 543
8	8	chain 'B' and (resid 9 through 37 )	B	H	9 - 37	1 - 29
9	9	chain 'B' and (resid 38 through 156 )	B	H	38 - 156	30 - 148
10	10	chain 'B' and (resid 157 through 196 )	B	H	157 - 196	149 - 188
11	11	chain 'B' and (resid 197 through 262 )	B	H	197 - 262	189 - 254
12	12	chain 'B' and (resid 263 through 321 )	B	H	263 - 321	255 - 313
13	13	chain 'B' and (resid 322 through 366 )	B	H	322 - 366	314 - 358
14	14	chain 'B' and (resid 367 through 405 )	B	H	367 - 405	359 - 397
15	15	chain 'B' and (resid 406 through 463 )	B	H	406 - 463	398 - 455
16	16	chain 'B' and (resid 464 through 501 )	B	H	464 - 501	456 - 493
17	17	chain 'B' and (resid 502 through 550 )	B	H	502 - 550	494 - 542

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
タンパク質 , 1種, 2分子 AB

-
非ポリマー , 6種, 14分子

-
詳細

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-タンパク質 , 1種, 2分子 AB

-非ポリマー , 6種, 14分子

-詳細

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
タンパク質 , 1種, 2分子 AB

-
非ポリマー , 6種, 14分子

-
詳細

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)