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- PDB-7rm0: Antibody 2E10.E9 in complex with P. vivax CSP peptide ANGAGNQPGAN... -

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基本情報

登録情報
データベース: PDB / ID: 7rm0
タイトルAntibody 2E10.E9 in complex with P. vivax CSP peptide ANGAGNQPGANGAGNQPG
要素
  • 2E10.E9 Fab heavy chain
  • 2E10.E9 Fab light chain
  • peptide from Circumsporozoite protein variant VK247
キーワードANTIMICROBIAL PROTEIN / antibody / malaria / Plasmodium vivax / circumsporozoite protein
機能・相同性Immunoglobulins / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta
機能・相同性情報
生物種Mus musculus (ハツカネズミ)
Plasmodium vivax (マラリア 病原虫)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.71 Å
データ登録者Kucharska, I. / Ivanochko, D. / Julien, J.P.
資金援助 カナダ, 4件
組織認可番号国
Other governmentOntario Early Researcher Awards program カナダ
Other governmentCanada Foundation for Innovation カナダ
Other governmentOntario Research Fund カナダ
Other governmentCanada Research Chairs カナダ
引用ジャーナル: Elife / 年: 2022
タイトル: Structural basis of Plasmodium vivax inhibition by antibodies binding to the circumsporozoite protein repeats.
著者: Kucharska, I. / Hossain, L. / Ivanochko, D. / Yang, Q. / Rubinstein, J.L. / Pomes, R. / Julien, J.P.
履歴
登録2021年7月26日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02022年1月26日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12023年10月18日Group: Data collection / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim
Item: _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id ..._struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id
改定 1.22024年10月16日Group: Structure summary
カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: 2E10.E9 Fab heavy chain
B: 2E10.E9 Fab light chain
P: peptide from Circumsporozoite protein variant VK247
C: 2E10.E9 Fab heavy chain
D: 2E10.E9 Fab light chain
Q: peptide from Circumsporozoite protein variant VK247
E: 2E10.E9 Fab heavy chain
F: 2E10.E9 Fab light chain
R: peptide from Circumsporozoite protein variant VK247
G: 2E10.E9 Fab heavy chain
H: 2E10.E9 Fab light chain
S: peptide from Circumsporozoite protein variant VK247


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)198,24012
ポリマ－198,24012
非ポリマー00
水1,56787
1
A: 2E10.E9 Fab heavy chain
B: 2E10.E9 Fab light chain
P: peptide from Circumsporozoite protein variant VK247


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)49,5603
ポリマ－49,5603
非ポリマー00
水543
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area4270 Å2
ΔGint-31 kcal/mol
Surface area20170 Å2
手法PISA
2
C: 2E10.E9 Fab heavy chain
D: 2E10.E9 Fab light chain
Q: peptide from Circumsporozoite protein variant VK247


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)49,5603
ポリマ－49,5603
非ポリマー00
水362
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area4480 Å2
ΔGint-30 kcal/mol
Surface area20170 Å2
手法PISA
3
E: 2E10.E9 Fab heavy chain
F: 2E10.E9 Fab light chain
R: peptide from Circumsporozoite protein variant VK247


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)49,5603
ポリマ－49,5603
非ポリマー00
水362
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area4500 Å2
ΔGint-31 kcal/mol
Surface area19910 Å2
手法PISA
4
G: 2E10.E9 Fab heavy chain
H: 2E10.E9 Fab light chain
S: peptide from Circumsporozoite protein variant VK247


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)49,5603
ポリマ－49,5603
非ポリマー00
水362
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
Buried area4300 Å2
ΔGint-26 kcal/mol
Surface area20030 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)54.520, 66.310, 142.320
Angle α, β, γ (deg.)100.453, 92.305, 91.718
Int Tables number1
Space group name H-MP1
Space group name HallP1
Symmetry operation#1: x,y,z
非結晶学的対称性 (NCS)NCSドメイン:
IDEns-ID
11
21
31
41
12
22
32
42
13
23
33
43

NCSドメイン領域:
Dom-IDComponent-IDEns-IDBeg auth comp-IDBeg label comp-IDEnd auth comp-IDEnd label comp-IDSelection detailsAuth asym-IDLabel asym-IDAuth seq-IDLabel seq-ID
111ILEILETHRTHR(chain 'A' and (resid 2 through 55 or resid 57...AA2 - 544 - 57
121PROPROGLUGLU(chain 'A' and (resid 2 through 55 or resid 57...AA57 - 6160 - 64
131PHEPHEPHEPHE(chain 'A' and (resid 2 through 55 or resid 57...AA6366
141GLYGLYSERSER(chain 'A' and (resid 2 through 55 or resid 57...AA65 - 11368 - 121
151THRTHRPROPRO(chain 'A' and (resid 2 through 55 or resid 57...AA116 - 126124 - 134
161SERSERGLUGLU(chain 'A' and (resid 2 through 55 or resid 57...AA134 - 191142 - 199
171VALVALTHRTHR(chain 'A' and (resid 2 through 55 or resid 57...AA193 - 204201 - 212
181VALVALLYSLYS(chain 'A' and (resid 2 through 55 or resid 57...AA206 - 208214 - 216
191ILEILEILEILE(chain 'A' and (resid 2 through 55 or resid 57...AA210218
211ILEILETHRTHR(chain 'C' and (resid 2 through 55 or resid 57...CD2 - 544 - 57
221PROPROGLUGLU(chain 'C' and (resid 2 through 55 or resid 57...CD57 - 6160 - 64
231PHEPHEPHEPHE(chain 'C' and (resid 2 through 55 or resid 57...CD6366
241GLYGLYSERSER(chain 'C' and (resid 2 through 55 or resid 57...CD65 - 11368 - 121
251THRTHRPROPRO(chain 'C' and (resid 2 through 55 or resid 57...CD116 - 126124 - 134
261SERSERGLUGLU(chain 'C' and (resid 2 through 55 or resid 57...CD134 - 191142 - 199
271VALVALTHRTHR(chain 'C' and (resid 2 through 55 or resid 57...CD193 - 204201 - 212
281VALVALLYSLYS(chain 'C' and (resid 2 through 55 or resid 57...CD206 - 208214 - 216
291ILEILEILEILE(chain 'C' and (resid 2 through 55 or resid 57...CD210218
311ILEILETHRTHR(chain 'E' and (resid 2 through 55 or resid 57...EG2 - 544 - 57
321PROPROGLUGLU(chain 'E' and (resid 2 through 55 or resid 57...EG57 - 6160 - 64
331PHEPHEPHEPHE(chain 'E' and (resid 2 through 55 or resid 57...EG6366
341GLYGLYSERSER(chain 'E' and (resid 2 through 55 or resid 57...EG65 - 11368 - 121
351THRTHRPROPRO(chain 'E' and (resid 2 through 55 or resid 57...EG116 - 126124 - 134
361SERSERGLUGLU(chain 'E' and (resid 2 through 55 or resid 57...EG134 - 191142 - 199
371VALVALTHRTHR(chain 'E' and (resid 2 through 55 or resid 57...EG193 - 204201 - 212
381VALVALLYSLYS(chain 'E' and (resid 2 through 55 or resid 57...EG206 - 208214 - 216
391ILEILEILEILE(chain 'E' and (resid 2 through 55 or resid 57...EG210218
411ILEILETHRTHR(chain 'G' and (resid 2 through 55 or resid 57...GJ2 - 544 - 57
421PROPROGLUGLU(chain 'G' and (resid 2 through 55 or resid 57...GJ57 - 6160 - 64
431PHEPHEPHEPHE(chain 'G' and (resid 2 through 55 or resid 57...GJ6366
441GLYGLYSERSER(chain 'G' and (resid 2 through 55 or resid 57...GJ65 - 11368 - 121
451THRTHRPROPRO(chain 'G' and (resid 2 through 55 or resid 57...GJ116 - 126124 - 134
461SERSERGLUGLU(chain 'G' and (resid 2 through 55 or resid 57...GJ134 - 191142 - 199
471VALVALTHRTHR(chain 'G' and (resid 2 through 55 or resid 57...GJ193 - 204201 - 212
481VALVALLYSLYS(chain 'G' and (resid 2 through 55 or resid 57...GJ206 - 208214 - 216
491ILEILEILEILE(chain 'G' and (resid 2 through 55 or resid 57...GJ210218
112ASPASPGLUGLU(chain 'B' and (resid 1 through 17 or resid 19...BB1 - 171 - 17
122VALVALGLNGLN(chain 'B' and (resid 1 through 17 or resid 19...BB19 - 2719 - 27
132GLNGLNPROPRO(chain 'B' and (resid 1 through 17 or resid 19...BB29 - 4035 - 46
142PROPROGLNGLN(chain 'B' and (resid 1 through 17 or resid 19...BB43 - 7949 - 85
152ASPASPSERSER(chain 'B' and (resid 1 through 17 or resid 19...BB82 - 12288 - 128
162GLNGLNLYSLYS(chain 'B' and (resid 1 through 17 or resid 19...BB124 - 142130 - 148
172ILEILEVALVAL(chain 'B' and (resid 1 through 17 or resid 19...BB144 - 146150 - 152
182TRPTRPSERSER(chain 'B' and (resid 1 through 17 or resid 19...BB148 - 153154 - 159
192GLNGLNSERSER(chain 'B' and (resid 1 through 17 or resid 19...BB156 - 168162 - 174
1102ASPASPGLUGLU(chain 'B' and (resid 1 through 17 or resid 19...BB170 - 187176 - 193
1112HISHISCYSCYS(chain 'B' and (resid 1 through 17 or resid 19...BB189 - 194195 - 200
1122ALAALAPHEPHE(chain 'B' and (resid 1 through 17 or resid 19...BB196 - 209202 - 215
1132ARGARGARGARG(chain 'B' and (resid 1 through 17 or resid 19...BB211217
212ASPASPGLUGLU(chain 'D' and (resid 1 through 17 or resid 19...DE1 - 171 - 17
222VALVALGLNGLN(chain 'D' and (resid 1 through 17 or resid 19...DE19 - 2719 - 27
232GLNGLNPROPRO(chain 'D' and (resid 1 through 17 or resid 19...DE29 - 4035 - 46
242PROPROGLNGLN(chain 'D' and (resid 1 through 17 or resid 19...DE43 - 7949 - 85
252ASPASPSERSER(chain 'D' and (resid 1 through 17 or resid 19...DE82 - 12288 - 128
262GLNGLNLYSLYS(chain 'D' and (resid 1 through 17 or resid 19...DE124 - 142130 - 148
272ILEILEVALVAL(chain 'D' and (resid 1 through 17 or resid 19...DE144 - 146150 - 152
282TRPTRPSERSER(chain 'D' and (resid 1 through 17 or resid 19...DE148 - 153154 - 159
292GLNGLNSERSER(chain 'D' and (resid 1 through 17 or resid 19...DE156 - 168162 - 174
2102ASPASPGLUGLU(chain 'D' and (resid 1 through 17 or resid 19...DE170 - 187176 - 193
2112HISHISCYSCYS(chain 'D' and (resid 1 through 17 or resid 19...DE189 - 194195 - 200
2122ALAALAPHEPHE(chain 'D' and (resid 1 through 17 or resid 19...DE196 - 209202 - 215
2132ARGARGARGARG(chain 'D' and (resid 1 through 17 or resid 19...DE211217
312ASPASPGLUGLU(chain 'F' and (resid 1 through 17 or resid 19...FH1 - 171 - 17
322VALVALGLNGLN(chain 'F' and (resid 1 through 17 or resid 19...FH19 - 2719 - 27
332GLNGLNPROPRO(chain 'F' and (resid 1 through 17 or resid 19...FH29 - 4035 - 46
342PROPROGLNGLN(chain 'F' and (resid 1 through 17 or resid 19...FH43 - 7949 - 85
352ASPASPSERSER(chain 'F' and (resid 1 through 17 or resid 19...FH82 - 12288 - 128
362GLNGLNLYSLYS(chain 'F' and (resid 1 through 17 or resid 19...FH124 - 142130 - 148
372ILEILEVALVAL(chain 'F' and (resid 1 through 17 or resid 19...FH144 - 146150 - 152
382TRPTRPSERSER(chain 'F' and (resid 1 through 17 or resid 19...FH148 - 153154 - 159
392GLNGLNSERSER(chain 'F' and (resid 1 through 17 or resid 19...FH156 - 168162 - 174
3102ASPASPGLUGLU(chain 'F' and (resid 1 through 17 or resid 19...FH170 - 187176 - 193
3112HISHISCYSCYS(chain 'F' and (resid 1 through 17 or resid 19...FH189 - 194195 - 200
3122ALAALAPHEPHE(chain 'F' and (resid 1 through 17 or resid 19...FH196 - 209202 - 215
3132ARGARGARGARG(chain 'F' and (resid 1 through 17 or resid 19...FH211217
412ASPASPGLUGLU(chain 'H' and (resid 1 through 17 or resid 19...HK1 - 171 - 17
422VALVALGLNGLN(chain 'H' and (resid 1 through 17 or resid 19...HK19 - 2719 - 27
432GLNGLNPROPRO(chain 'H' and (resid 1 through 17 or resid 19...HK29 - 4035 - 46
442PROPROGLNGLN(chain 'H' and (resid 1 through 17 or resid 19...HK43 - 7949 - 85
452ASPASPSERSER(chain 'H' and (resid 1 through 17 or resid 19...HK82 - 12288 - 128
462GLNGLNLYSLYS(chain 'H' and (resid 1 through 17 or resid 19...HK124 - 142130 - 148
472ILEILEVALVAL(chain 'H' and (resid 1 through 17 or resid 19...HK144 - 146150 - 152
482TRPTRPSERSER(chain 'H' and (resid 1 through 17 or resid 19...HK148 - 153154 - 159
492GLNGLNSERSER(chain 'H' and (resid 1 through 17 or resid 19...HK156 - 168162 - 174
4102ASPASPGLUGLU(chain 'H' and (resid 1 through 17 or resid 19...HK170 - 187176 - 193
4112HISHISCYSCYS(chain 'H' and (resid 1 through 17 or resid 19...HK189 - 194195 - 200
4122ALAALAPHEPHE(chain 'H' and (resid 1 through 17 or resid 19...HK196 - 209202 - 215
4132ARGARGARGARG(chain 'H' and (resid 1 through 17 or resid 19...HK211217
113ALAALAASNASN(chain 'P' and (resid 4 through 6 or resid 8 through 11))PC4 - 64 - 6
123PROPROASNASN(chain 'P' and (resid 4 through 6 or resid 8 through 11))PC8 - 118 - 11
213ALAALAASNASN(chain 'Q' and (resid 4 through 6 or resid 8 through 11))QF4 - 64 - 6
223PROPROASNASN(chain 'Q' and (resid 4 through 6 or resid 8 through 11))QF8 - 118 - 11
313ALAALAASNASN(chain 'R' and (resid 4 through 6 or resid 8 through 11))RI4 - 64 - 6
323PROPROASNASN(chain 'R' and (resid 4 through 6 or resid 8 through 11))RI8 - 118 - 11
413ALAALAASNASN(chain 'S' and (resid 4 through 6 or resid 8 through 11))SL4 - 64 - 6
423PROPROASNASN(chain 'S' and (resid 4 through 6 or resid 8 through 11))SL8 - 118 - 11

NCSアンサンブル:
ID
1
2
3

-
要素

#1: 抗体
2E10.E9 Fab heavy chain


分子量: 23784.713 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Mus musculus (ハツカネズミ) / 発現宿主: Mus musculus (ハツカネズミ)
#2: 抗体
2E10.E9 Fab light chain


分子量: 24223.758 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Mus musculus (ハツカネズミ) / 発現宿主: Mus musculus (ハツカネズミ)
#3: タンパク質・ペプチド
peptide from Circumsporozoite protein variant VK247


分子量: 1551.536 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) Plasmodium vivax (マラリア 病原虫)
#4: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 87 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O
Has protein modificationY

-
実験情報

-
実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶マシュー密度: 2.54 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.59 %
結晶化温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法
詳細: 0.2 M potassium sodium tartrate and 20% (w/v) PEG 3350

-
データ収集

回折平均測定温度: 80 K / Serial crystal experiment: N
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 23-ID-D / 波長: 1.0332 Å
検出器タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2018年12月14日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 1.0332 Å / 相対比: 1
反射解像度: 2.71→29.34 Å / Num. obs: 53126 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 10.4 % / Biso Wilson estimate: 59.2 Å2 / CC1/2: 0.995 / Net I/σ(I): 7.4
反射 シェル解像度: 2.71→2.81 Å / 冗長度: 10.5 % / Mean I/σ(I) obs: 1.6 / Num. unique obs: 1111 / CC1/2: 0.729 / % possible all: 100

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
PHENIX1.17.1_3660精密化
XDSデータ削減
Aimlessデータスケーリング
PHASER位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: 1uyw

1uyw


解像度: 2.71→29.34 Å / SU ML: 0.3969 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 2.01 / 位相誤差: 27.2793
立体化学のターゲット値: GeoStd + Monomer Library + CDL v1.2
Rfactor反射数%反射
Rfree0.2462 2067 3.89 %
Rwork0.2089 51059 -
obs0.2104 53126 99.96 %
溶媒の処理減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL
原子変位パラメータBiso mean: 77.67 Å2
精密化ステップサイクル: LAST / 解像度: 2.71→29.34 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数13620 0 0 87 13707
拘束条件
Refine-IDタイプDev ideal数
X-RAY DIFFRACTIONf_bond_d0.009613964
X-RAY DIFFRACTIONf_angle_d1.211919024
X-RAY DIFFRACTIONf_chiral_restr0.06432121
X-RAY DIFFRACTIONf_plane_restr0.00932427
X-RAY DIFFRACTIONf_dihedral_angle_d16.95374968
LS精密化 シェル
解像度 (Å)Rfactor RfreeNum. reflection RfreeRfactor RworkNum. reflection RworkRefine-ID% reflection obs (%)
2.71-2.770.31981440.26113414X-RAY DIFFRACTION100
2.77-2.840.32541330.27383400X-RAY DIFFRACTION100
2.84-2.920.34251430.27653408X-RAY DIFFRACTION99.97
2.92-30.33891350.27823445X-RAY DIFFRACTION99.94
3-3.10.34241360.26893339X-RAY DIFFRACTION100
3.1-3.210.31131440.25333426X-RAY DIFFRACTION100
3.21-3.340.29771390.24423372X-RAY DIFFRACTION100
3.34-3.490.31231330.25123445X-RAY DIFFRACTION99.94
3.49-3.680.30071490.22343399X-RAY DIFFRACTION100
3.68-3.910.26061320.21893408X-RAY DIFFRACTION99.97
3.91-4.210.23171310.20813410X-RAY DIFFRACTION100
4.21-4.630.21521280.17223396X-RAY DIFFRACTION100
4.63-5.30.1981310.16953404X-RAY DIFFRACTION100
5.3-6.660.21261820.18513382X-RAY DIFFRACTION100
6.66-29.340.15431070.16763411X-RAY DIFFRACTION99.63

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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