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- PDB-6q5j: Crystal structure of a CC-Hex mutant that forms a parallel six-he... -
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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 6q5j | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Title | Crystal structure of a CC-Hex mutant that forms a parallel six-helix coiled coil CC-Hex*-L24E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | CC-Hex*![]() DE NOVO PROTEIN / coiled coil / hexamer / synthetic / parallel / cc-hex | Biological species | synthetic construct (others) | Method | ![]() ![]() ![]() ![]() Rhys, G.G. / Wood, C.W. / Beesley, J.L. / Brady, R.L. / Woolfson, D.N. | Funding support | | ![]() ![]()
![]() ![]() Title: Navigating the Structural Landscape of De Novo alpha-Helical Bundles. Authors: Rhys, G.G. / Wood, C.W. / Beesley, J.L. / Zaccai, N.R. / Burton, A.J. / Brady, R.L. / Thomson, A.R. / Woolfson, D.N. History |
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Structure visualization
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-Validation report
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-Related structure data
Related structure data | ![]() 6q5hC ![]() 6q5iC ![]() 6q5kC ![]() 6q5lC ![]() 6q5mC ![]() 6q5nC ![]() 6q5oC ![]() 6q5pC ![]() 6q5qC ![]() 6q5rC ![]() 6q5sC C: citing same article ( |
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Similar structure data |
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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1 |
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Unit cell |
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Components on special symmetry positions |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments:
NCS ensembles :
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Components
#1: Protein/peptide | Mass: 3250.827 Da / Num. of mol.: 6 / Source method: obtained synthetically / Source: (synth.) synthetic construct (others) #2: Chemical | #3: Water | ChemComp-HOH / | |
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-Experimental details
-Experiment
Experiment | Method: ![]() |
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Sample preparation
Crystal | Density Matthews: 2.83 Å3/Da / Density % sol: 56.6 % |
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Crystal grow | Temperature: 293 K / Method: vapor diffusion, sitting drop Details: 100 mM NaCl, 50 mM MES buffer and 10% w/v PEG 2000 MME at pH 6.0 |
-Data collection
Diffraction | Mean temperature: 77 K / Serial crystal experiment: N | ||||||||||||||||||||||||
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Diffraction source | Source: ![]() ![]() ![]() | ||||||||||||||||||||||||
Detector | Type: DECTRIS PILATUS 6M / Detector: PIXEL / Date: Mar 4, 2018 | ||||||||||||||||||||||||
Radiation | Protocol: SINGLE WAVELENGTH / Monochromatic (M) / Laue (L): M / Scattering type: x-ray | ||||||||||||||||||||||||
Radiation wavelength | Wavelength: 0.97628 Å / Relative weight: 1 | ||||||||||||||||||||||||
Reflection | Resolution: 1.69→46.32 Å / Num. all: 610321 / Num. obs: 24910 / % possible obs: 100 % / Redundancy: 24.5 % / CC1/2: 1 / Rmerge(I) obs: 0.193 / Rrim(I) all: 0.197 / Χ2: 0.039 / Net I/σ(I): 10.6 | ||||||||||||||||||||||||
Reflection shell | Diffraction-ID: 1
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Processing
Software |
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Refinement | Method to determine structure: ![]()
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Solvent computation | Ion probe radii: 1.1 Å / Shrinkage radii: 1.1 Å / VDW probe radii: 1.4 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Displacement parameters | Biso mean: 28.122 Å2
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Refinement step | Cycle: 1 / Resolution: 1.69→43.19 Å
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Refine LS restraints |
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