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- PDB-6dz4: Crystal structure of Salmonella typhimurium Tryptophan Synthase w... -

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登録情報
データベース: PDB / ID: 6dz4
タイトルCrystal structure of Salmonella typhimurium Tryptophan Synthase with sodium ion at the metal coordination site and (E)-N-({3-hydroxy-2-methyl-5-[(phosphonooxy)methyl]pyridin-4-yl}methylidene)-L-serine at the beta-site
要素(Tryptophan synthase ...) x 2
キーワードLYASE/LYASE Inhibitor / F9F / LYASE-LYASE Inhibitor complex
機能・相同性
機能・相同性情報


tryptophan synthase / tryptophan synthase activity / L-tryptophan biosynthetic process / identical protein binding / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
Tryptophan synthase, alpha chain / Tryptophan synthase, alpha chain, active site / Tryptophan synthase alpha chain / Tryptophan synthase alpha chain signature. / Tryptophan synthase, beta chain, conserved site / Tryptophan synthase, beta chain / Tryptophan synthase beta chain/beta chain-like / Tryptophan synthase beta chain pyridoxal-phosphate attachment site. / Rossmann fold - #1100 / Pyridoxal-phosphate dependent enzyme ...Tryptophan synthase, alpha chain / Tryptophan synthase, alpha chain, active site / Tryptophan synthase alpha chain / Tryptophan synthase alpha chain signature. / Tryptophan synthase, beta chain, conserved site / Tryptophan synthase, beta chain / Tryptophan synthase beta chain/beta chain-like / Tryptophan synthase beta chain pyridoxal-phosphate attachment site. / Rossmann fold - #1100 / Pyridoxal-phosphate dependent enzyme / Pyridoxal-phosphate dependent enzyme / Tryptophan synthase beta subunit-like PLP-dependent enzyme / Ribulose-phosphate binding barrel / Aldolase class I / Aldolase-type TIM barrel / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Rossmann fold / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta
類似検索 - ドメイン・相同性
Chem-KOU / Tryptophan synthase alpha chain / Tryptophan synthase beta chain
類似検索 - 構成要素
生物種Salmonella typhimurium (サルモネラ菌)
手法X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.45 Å
データ登録者Hilario, E. / Dunn, M.F. / Mueller, L.J. / Fan, L.
資金援助 米国, 1件
組織認可番号国
National Institutes of Health/National Human Genome Research Institute (NIH/NHGRI)2R01GM097569-06A1 米国
引用ジャーナル: To be Published
タイトル: Crystal structure of Salmonella typhimurium Tryptophan Synthase with sodium ion at the metal coordination site and (E)-N-({3-hydroxy-2-methyl-5-[(phosphonooxy)methyl]pyridin-4- ...タイトル: Crystal structure of Salmonella typhimurium Tryptophan Synthase with sodium ion at the metal coordination site and (E)-N-({3-hydroxy-2-methyl-5-[(phosphonooxy)methyl]pyridin-4-yl}methylidene)-L-serine at the beta site
著者: Hilario, E. / Dunn, M.F. / Mueller, L.J. / Fan, L.
履歴
登録2018年7月2日登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.02019年7月10日Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.12019年12月18日Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 2.02020年5月6日Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Non-polymer description / Structure summary
カテゴリ: atom_site / atom_site_anisotrop ...atom_site / atom_site_anisotrop / chem_comp / citation / entity / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / struct / struct_keywords / struct_site
Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.type_symbol / _atom_site_anisotrop.U[1][1] / _atom_site_anisotrop.U[1][2] / _atom_site_anisotrop.U[1][3] / _atom_site_anisotrop.U[2][2] / _atom_site_anisotrop.U[2][3] / _atom_site_anisotrop.U[3][3] / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_comp_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_comp_id / _atom_site_anisotrop.type_symbol / _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _chem_comp.id / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.pdbx_synonyms / _chem_comp.type / _citation.title / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.comp_id / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id / _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id / _struct.title / _struct_keywords.pdbx_keywords / _struct_keywords.text / _struct_site.details / _struct_site.pdbx_auth_comp_id
改定 3.02020年6月10日Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Author supporting evidence / Data collection / Derived calculations / Refinement description / Structure summary
カテゴリ: atom_site / atom_site_anisotrop ...atom_site / atom_site_anisotrop / computing / diffrn / entity / pdbx_entity_instance_feature / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_entry_details / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_refine_tls / pdbx_struct_assembly_prop / pdbx_struct_conn_angle / pdbx_validate_close_contact / refine / refine_hist / reflns / reflns_shell / struct_asym / struct_conn / struct_keywords / struct_site / struct_site_gen
Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_alt_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.occupancy / _atom_site.type_symbol / _diffrn.ambient_temp_details / _diffrn.pdbx_serial_crystal_experiment / _entity.formula_weight / _entity.pdbx_description / _entity.pdbx_number_of_molecules / _pdbx_entity_nonpoly.comp_id / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_nonpoly_scheme.auth_mon_id / _pdbx_nonpoly_scheme.auth_seq_num / _pdbx_nonpoly_scheme.entity_id / _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id / _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id / _pdbx_refine_tls.origin_x / _pdbx_refine_tls.origin_y / _pdbx_refine_tls.origin_z / _pdbx_struct_assembly_prop.value / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 / _refine.ls_wR_factor_R_free / _refine.ls_wR_factor_R_work / _refine.overall_FOM_work_R_set / _refine.overall_SU_R_free / _refine.pdbx_stereochemistry_target_values / _refine.solvent_model_details / _refine_hist.pdbx_B_iso_mean_ligand / _reflns.number_all / _reflns_shell.number_measured_all / _reflns_shell.pdbx_netI_over_sigmaI_obs / _struct_asym.entity_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_keywords.text / _struct_site.details / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id / _struct_site.pdbx_num_residues / _struct_site_gen.auth_asym_id / _struct_site_gen.auth_comp_id / _struct_site_gen.auth_seq_id / _struct_site_gen.label_asym_id / _struct_site_gen.label_comp_id / _struct_site_gen.label_seq_id / _struct_site_gen.pdbx_num_res / _struct_site_gen.site_id / _struct_site_gen.symmetry
解説: Model orientation/position
詳細: We have flipped the side chain of residue Q114 from chain B and the current orientation makes more sense regarding local hydrogen bonding.
Provider: author / タイプ: Coordinate replacement
改定 3.12023年10月11日Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description
カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn
Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id

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構造の表示

構造ビューア分子:
MolmilJmol/JSmol

ダウンロードとリンク

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集合体

登録構造単位
A: Tryptophan synthase alpha chain
B: Tryptophan synthase beta chain
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)73,21925
ポリマ－71,6182
非ポリマー1,60123
水13,295738
1
A: Tryptophan synthase alpha chain
B: Tryptophan synthase beta chain
ヘテロ分子

A: Tryptophan synthase alpha chain
B: Tryptophan synthase beta chain
ヘテロ分子


分子量 (理論値)分子数
合計 (水以外)146,43850
ポリマ－143,2354
非ポリマー3,20346
水724
タイプ名称対称操作数
identity operation1_555x,y,z1
crystal symmetry operation2_555-x,y,-z1
Buried area14350 Å2
ΔGint-158 kcal/mol
Surface area44610 Å2
手法PISA
単位格子
Length a, b, c (Å)182.509, 59.300, 67.325
Angle α, β, γ (deg.)90.000, 94.690, 90.000
Int Tables number5
Space group name H-MC121

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要素

-
Tryptophan synthase ... , 2種, 2分子 AB

#1: タンパク質 Tryptophan synthase alpha chain


分子量: 28698.797 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (サルモネラ菌)
株: LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720 / 遺伝子: trpA, STM1727 / プラスミド: PEBA-10 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): CB149 / 参照: UniProt: P00929, tryptophan synthase
#2: タンパク質 Tryptophan synthase beta chain


分子量: 42918.879 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現) Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720) (サルモネラ菌)
株: LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720 / 遺伝子: trpB, STM1726 / プラスミド: PEBA-10 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): CB149 / 参照: UniProt: P0A2K1, tryptophan synthase

-
非ポリマー , 5種, 761分子

#3: 化合物
ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド


分子量: 35.453 Da / 分子数: 8 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#4: 化合物
ChemComp-DMS / DIMETHYL SULFOXIDE / 2-チアプロパン2-オキシド


分子量: 78.133 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 合成 / 式: C2H6OS / コメント: DMSO, 沈殿剤*YM
#5: 化合物 ChemComp-KOU / (E)-N-({3-hydroxy-2-methyl-5-[(phosphonooxy)methyl]pyridin-4-yl}methylidene)-L-serine


分子量: 334.219 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C11H15N2O8P / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#6: 化合物 ChemComp-NA / SODIUM ION / ナトリウムカチオン


分子量: 22.990 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Na / タイプ: SUBJECT OF INVESTIGATION
#7: 水 ChemComp-HOH / water


分子量: 18.015 Da / 分子数: 738 / 由来タイプ: 天然 / 式: H2O

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詳細

研究の焦点であるリガンドがあるかY

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実験情報

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実験

実験手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶マシュー密度: 2.54 Å3/Da / 溶媒含有率: 51.48 % / 解説: Large plate-like crystal.
結晶化温度: 297 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.8
詳細: 50mM Bicine-NaOH, pH 7.8, containing 9% PEG3350, 50mM NaCl, 2mM spermine
PH範囲: 7.6-8.0

-
データ収集

回折平均測定温度: 100 K / Ambient temp details: constant / Serial crystal experiment: N
放射光源由来: シンクロトロン / サイト: ALS / ビームライン: 12.3.1 / 波長: 0.9793 Å
検出器タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2015年4月19日
放射プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長波長: 0.9793 Å / 相対比: 1
反射解像度: 1.45→30 Å / Num. all: 126505 / Num. obs: 126505 / % possible obs: 99.5 % / 冗長度: 5.6 % / CC1/2: 0.998 / Rmerge(I) obs: 0.085 / Rpim(I) all: 0.039 / Rrim(I) all: 0.094 / Rsym value: 0.085 / Net I/σ(I): 9.9 / Num. measured all: 710786
反射 シェル解像度: 1.45→1.53 Å / 冗長度: 5.3 % / Rmerge(I) obs: 0.632 / Num. measured all: 96459 / Num. unique obs: 18128 / CC1/2: 0.859 / Rpim(I) all: 0.018 / Rrim(I) all: 0.045 / Rsym value: 0.041 / Net I/σ(I) obs: 2.2 / % possible all: 98.1

-
解析

ソフトウェア
名称バージョン分類
REFMAC5.8.0230精密化
MOSFLM7.2.2データ削減
SCALA3.2.22データスケーリング
MOLREP11.6.03位相決定
精密化構造決定の手法: 分子置換
開始モデル: 4HN4

4hn4


解像度: 1.45→28.94 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.976 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.963 / WRfactor Rfree: 0.1828 / WRfactor Rwork: 0.1429 / FOM work R set: 0.8487 / SU B: 2.779 / SU ML: 0.045 / SU R Cruickshank DPI: 0.0646 / SU Rfree: 0.0609 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.065 / ESU R Free: 0.061 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: U VALUES : WITH TLS ADDED
Rfactor反射数%反射Selection details
Rfree0.1856 6241 4.9 %RANDOM
Rwork0.1469 ---
obs0.1488 120118 99.46 %-
溶媒の処理イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK
原子変位パラメータBiso max: 117.81 Å2 / Biso mean: 23.82 Å2 / Biso min: 8.51 Å2
Baniso -1Baniso -2Baniso -3
1--0.41 Å20 Å20.05 Å2
2--0.11 Å2-0 Å2
3---0.29 Å2
精密化ステップサイクル: final / 解像度: 1.45→28.94 Å
タンパク質核酸リガンド溶媒全体
原子数4922 0 80 767 5769
Biso mean--43.27 37.78 -
残基数----650
拘束条件
Refine-IDタイプDev idealDev ideal target数
X-RAY DIFFRACTIONr_bond_refined_d0.0070.0125244
X-RAY DIFFRACTIONr_angle_refined_deg1.3761.6447106
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_1_deg6.0525681
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_2_deg33.40122.124259
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_3_deg11.99715873
X-RAY DIFFRACTIONr_dihedral_angle_4_deg18.2621535
X-RAY DIFFRACTIONr_chiral_restr0.0910.2691
X-RAY DIFFRACTIONr_gen_planes_refined0.0080.023965
X-RAY DIFFRACTIONr_rigid_bond_restr1.78835244
X-RAY DIFFRACTIONr_sphericity_free27.0235463
X-RAY DIFFRACTIONr_sphericity_bonded13.01855457
LS精密化 シェル解像度: 1.45→1.488 Å / Rfactor Rfree error: 0 / Total num. of bins used: 20
Rfactor反射数%反射
Rfree0.303 509 -
Rwork0.282 8577 -
all-9086 -
obs--97.58 %
精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

IDL11 (°2)L12 (°2)L13 (°2)L22 (°2)L23 (°2)L33 (°2)S11 (Å °)S12 (Å °)S13 (Å °)S21 (Å °)S22 (Å °)S23 (Å °)S31 (Å °)S32 (Å °)S33 (Å °)T11 (Å2)T12 (Å2)T13 (Å2)T22 (Å2)T23 (Å2)T33 (Å2)Origin x (Å)Origin y (Å)Origin z (Å)
15.35761.07521.97690.338-0.31534.88840.2396-0.1172-0.14560.03140.01710.0010.2103-0.4172-0.25670.0188-0.01-0.00020.1173-0.01160.0993-59.667-21.55425.797
20.0564-0.08830.0550.327-0.49040.93210.07040.0510.0587-0.063-0.0683-0.0514-0.03430.0103-0.00210.09650.07460.06660.07670.01630.1196-41.559-12.1619.076
30.7057-0.7184-0.24560.94620.36770.19830.09190.0020.0216-0.0143-0.08010.0008-0.0016-0.0406-0.01180.0539-0.00650.02320.0809-0.01080.0646-41.664-24.09827.57
40.5082-0.17790.50521.6122-0.77420.8120.0980.0765-0.1225-0.09960.02760.11330.0774-0.0491-0.12560.04610.0656-0.04930.1546-0.0380.0781-52.122-32.29513.462
53.08352.0421.14892.03570.37110.68040.1030.05070.0262-0.0402-0.0590.0650.04710.0145-0.0440.10340.11820.03930.14020.04040.0584-48.787-13.259.411
64.58913.60011.90534.31381.41860.90610.00460.13770.3377-0.0623-0.08810.2349-0.0923-0.04540.08360.10710.11190.02340.14310.06480.1004-51.809-4.89512.807
70.85220.0345-0.52380.02970.02460.408-0.00460.0793-0.07890.029-0.0492-0.00230.0378-0.16070.05380.0474-0.026-0.01160.1645-0.01990.0363-30.482-42.63413.985
80.18340.0041-0.21040.12120.15470.4594-0.05170.0309-0.01650.01740.03390.01430.07260.04580.01780.0598-0.0039-0.01520.0901-0.0070.0461-3.965-47.115.706
90.0985-0.03710.07550.01730.0030.42130.01690.04670.0024-0.0075-0.0179-0.00540.0216-0.00030.00090.0573-0.0026-0.01120.0893-0.00750.0444-8.765-41.5035.789
100.12250.07640.13720.50870.17680.90060.07750.0229-0.032-0.04740.0405-0.0898-0.1793-0.139-0.1180.13340.0480.0220.10250.00950.0276-17.435-26.6330.82
110.07280.0994-0.20190.1519-0.33320.82610.0430.07860.01850.05060.0730.0353-0.042-0.1515-0.1160.06880.0431-0.00890.17940.02040.035-27.006-31.5437.907
120.22290.0051-0.03220.0280.07990.25090.0069-0.02040.0214-0.0006-0.00350.00830.01040.0019-0.00340.0562-0.0005-0.00370.0756-0.00060.0528-8.115-36.28720.313
130.2869-0.2423-0.19080.2885-0.0050.59120.1006-0.00970.0324-0.06970.03330.0067-0.08820.0686-0.13390.0717-0.01470.02330.1039-0.0290.03834.35-30.33315.503
精密化 TLSグループ
IDRefine-IDRefine TLS-IDAuth asym-IDAuth seq-ID
1X-RAY DIFFRACTION1A1 - 13
2X-RAY DIFFRACTION2A14 - 77
3X-RAY DIFFRACTION3A78 - 159
4X-RAY DIFFRACTION4A160 - 216
5X-RAY DIFFRACTION5A217 - 247
6X-RAY DIFFRACTION6A248 - 267
7X-RAY DIFFRACTION7B2 - 37
8X-RAY DIFFRACTION8B38 - 70
9X-RAY DIFFRACTION9B71 - 100
10X-RAY DIFFRACTION10B101 - 165
11X-RAY DIFFRACTION11B166 - 196
12X-RAY DIFFRACTION12B197 - 364
13X-RAY DIFFRACTION13B365 - 396

+
万見について

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お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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