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- PDB-5mu0: ACC1 Fab fragment in complex with citrullinated C1 epitope of CII... -
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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5mu0 | |||||||||||||||||||||||||||
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Title | ACC1 Fab fragment in complex with citrullinated C1 epitope of CII (IA03) | |||||||||||||||||||||||||||
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![]() | IMMUNE SYSTEM / anti-citrullinated protein antibody (ACPA) Fab fragment collagen type II citrullinated C1 epitope | |||||||||||||||||||||||||||
Function / homology | ![]() Non-integrin membrane-ECM interactions / Extracellular matrix organization / NCAM1 interactions / Signaling by PDGF / Collagen biosynthesis and modifying enzymes / Collagen chain trimerization / collagen type II trimer / collagen type XI trimer / anterior head development / Collagen degradation ...Non-integrin membrane-ECM interactions / Extracellular matrix organization / NCAM1 interactions / Signaling by PDGF / Collagen biosynthesis and modifying enzymes / Collagen chain trimerization / collagen type II trimer / collagen type XI trimer / anterior head development / Collagen degradation / MET activates PTK2 signaling / Assembly of collagen fibrils and other multimeric structures / embryonic skeletal joint morphogenesis / otic vesicle development / ECM proteoglycans / proteoglycan metabolic process / platelet-derived growth factor binding / Integrin cell surface interactions / notochord development / limb bud formation / cartilage development involved in endochondral bone morphogenesis / extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength / limb morphogenesis / tissue homeostasis / MHC class II protein binding / cellular response to BMP stimulus / endochondral ossification / collagen trimer / collagen fibril organization / cartilage development / skeletal system morphogenesis / proteoglycan binding / Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell / cartilage condensation / inner ear morphogenesis / roof of mouth development / inner ear development / basement membrane / negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand / chondrocyte differentiation / heart morphogenesis / extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand / visual perception / ossification / extracellular matrix / skeletal system development / central nervous system development / sensory perception of sound / bone development / regulation of gene expression / collagen-containing extracellular matrix / protein homodimerization activity / extracellular space / identical protein binding / metal ion binding / cytoplasm Similarity search - Function | |||||||||||||||||||||||||||
Biological species | ![]() ![]() | |||||||||||||||||||||||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | |||||||||||||||||||||||||||
![]() | Dobritzsch, D. / Holmdahl, R. / Ge, C. | |||||||||||||||||||||||||||
Funding support | ![]()
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![]() | ![]() Title: Anti-citrullinated protein antibodies cause arthritis by cross-reactivity to joint cartilage. Authors: Ge, C. / Tong, D. / Liang, B. / Lonnblom, E. / Schneider, N. / Hagert, C. / Viljanen, J. / Ayoglu, B. / Stawikowska, R. / Nilsson, P. / Fields, G.B. / Skogh, T. / Kastbom, A. / Kihlberg, J. ...Authors: Ge, C. / Tong, D. / Liang, B. / Lonnblom, E. / Schneider, N. / Hagert, C. / Viljanen, J. / Ayoglu, B. / Stawikowska, R. / Nilsson, P. / Fields, G.B. / Skogh, T. / Kastbom, A. / Kihlberg, J. / Burkhardt, H. / Dobritzsch, D. / Holmdahl, R. | |||||||||||||||||||||||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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PDBx/mmJSON format | ![]() | Tree view | ![]() | |
Others | ![]() |
-Validation report
Summary document | ![]() | 577.9 KB | Display | ![]() |
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Full document | ![]() | 603.9 KB | Display | |
Data in XML | ![]() | 112.9 KB | Display | |
Data in CIF | ![]() | 157.5 KB | Display | |
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | ![]() 5mu2C ![]() 5mubC ![]() 5mv3C ![]() 5mv4C ![]() 2or9S S: Starting model for refinement C: citing same article ( |
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Similar structure data |
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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8 | ![]()
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Unit cell |
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