+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5mv3 | ||||||||||||||||||
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Title | ACC1 Fab fragment in complex with CII583-591 (CG10) | ||||||||||||||||||
Components |
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Keywords | IMMUNE SYSTEM / anti-citrullinated protein antibody (ACPA) / Fab fragment / collagen type II | ||||||||||||||||||
Function / homology | Function and homology information Non-integrin membrane-ECM interactions / Extracellular matrix organization / NCAM1 interactions / Signaling by PDGF / Collagen biosynthesis and modifying enzymes / Collagen chain trimerization / collagen type II trimer / collagen type XI trimer / MET activates PTK2 signaling / anterior head development ...Non-integrin membrane-ECM interactions / Extracellular matrix organization / NCAM1 interactions / Signaling by PDGF / Collagen biosynthesis and modifying enzymes / Collagen chain trimerization / collagen type II trimer / collagen type XI trimer / MET activates PTK2 signaling / anterior head development / Collagen degradation / Assembly of collagen fibrils and other multimeric structures / embryonic skeletal joint morphogenesis / otic vesicle development / ECM proteoglycans / proteoglycan metabolic process / extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength / platelet-derived growth factor binding / Integrin cell surface interactions / cartilage development involved in endochondral bone morphogenesis / notochord development / limb bud formation / limb morphogenesis / tissue homeostasis / MHC class II protein binding / cellular response to BMP stimulus / endochondral ossification / collagen trimer / collagen fibril organization / cartilage development / skeletal system morphogenesis / proteoglycan binding / Immunoregulatory interactions between a Lymphoid and a non-Lymphoid cell / inner ear morphogenesis / cartilage condensation / roof of mouth development / inner ear development / basement membrane / negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand / chondrocyte differentiation / heart morphogenesis / extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand / visual perception / extracellular matrix / ossification / central nervous system development / skeletal system development / sensory perception of sound / bone development / regulation of gene expression / collagen-containing extracellular matrix / protein homodimerization activity / extracellular space / identical protein binding / metal ion binding / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||||||||||||||
Biological species | Mus musculus (house mouse) | ||||||||||||||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.95 Å | ||||||||||||||||||
Authors | Dobritzsch, D. / Holmdahl, R. / Ge, C. | ||||||||||||||||||
Funding support | Sweden, 5items
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Citation | Journal: JCI Insight / Year: 2017 Title: Anti-citrullinated protein antibodies cause arthritis by cross-reactivity to joint cartilage. Authors: Ge, C. / Tong, D. / Liang, B. / Lonnblom, E. / Schneider, N. / Hagert, C. / Viljanen, J. / Ayoglu, B. / Stawikowska, R. / Nilsson, P. / Fields, G.B. / Skogh, T. / Kastbom, A. / Kihlberg, J. ...Authors: Ge, C. / Tong, D. / Liang, B. / Lonnblom, E. / Schneider, N. / Hagert, C. / Viljanen, J. / Ayoglu, B. / Stawikowska, R. / Nilsson, P. / Fields, G.B. / Skogh, T. / Kastbom, A. / Kihlberg, J. / Burkhardt, H. / Dobritzsch, D. / Holmdahl, R. | ||||||||||||||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 5mv3.cif.gz | 1.3 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb5mv3.ent.gz | 1.1 MB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 5mv3.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mv/5mv3 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/mv/5mv3 | HTTPS FTP |
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-Related structure data
Related structure data | 5mu0SC 5mu2C 5mubC 5mv4C S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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