温度: 294 K / 手法: ハンギングドロップ法 / pH: 7.6 詳細: PEG3350, Ammonium Sulfate, HEPES, pH 7.6, hanging drop, temperature 294K
-
データ収集
放射光源
由来: シンクロトロン / サイト: CHESS / ビームライン: F1 / 波長: 0.917 Å
検出器
タイプ: ADSC QUANTUM 210 / 検出器: CCD / 日付: 2009年9月30日
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.917 Å / 相対比: 1
Reflection
冗長度: 13.2 % / Av σ(I) over netI: 60.92 / 数: 365152 / Rmerge(I) obs: 0.13 / Χ2: 8.13 / D res high: 1.81 Å / D res low: 50 Å / Num. obs: 27686 / % possible obs: 98.3
Diffraction reflection shell
最高解像度 (Å)
最低解像度 (Å)
% possible obs (%)
ID
Rmerge(I) obs
Chi squared
Redundancy
3.9
50
97
1
0.087
9.06
12.5
3.09
3.9
96.2
1
0.102
8.487
12.3
2.7
3.09
99.9
1
0.135
9.434
13.7
2.46
2.7
100
1
0.166
9.452
13.8
2.28
2.46
100
1
0.19
9.416
13.7
2.15
2.28
100
1
0.213
9.07
13.7
2.04
2.15
100
1
0.238
8.294
13.7
1.95
2.04
100
1
0.278
6.835
13.7
1.87
1.95
100
1
0.32
5.704
13.4
1.81
1.87
89.8
1
0.377
4.534
11.2
反射
解像度: 1.81→50 Å / Num. obs: 27686 / % possible obs: 98.3 % / 冗長度: 13.2 % / Rmerge(I) obs: 0.13 / Χ2: 8.132 / Net I/σ(I): 14.5
反射 シェル
解像度 (Å)
冗長度 (%)
Rmerge(I) obs
Num. unique all
Χ2
Diffraction-ID
% possible all
1.81-1.87
11.2
0.377
2479
4.534
1
89.8
1.87-1.95
13.4
0.32
2803
5.704
1
100
1.95-2.04
13.7
0.278
2766
6.835
1
100
2.04-2.15
13.7
0.238
2777
8.294
1
100
2.15-2.28
13.7
0.213
2794
9.07
1
100
2.28-2.46
13.7
0.19
2802
9.416
1
100
2.46-2.7
13.8
0.166
2803
9.452
1
100
2.7-3.09
13.7
0.135
2831
9.434
1
99.9
3.09-3.9
12.3
0.102
2756
8.487
1
96.2
3.9-50
12.5
0.087
2875
9.06
1
97
-
位相決定
位相決定
手法: 分子置換
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
NB
DENZO
データ削減
SCALEPACK
データスケーリング
MOLREP
位相決定
PHENIX
1.7.3_928
精密化
PDB_EXTRACT
3.11
データ抽出
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.817→41.852 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.61 / FOM work R set: 0.7891 / SU ML: 0.25 / σ(F): 1.33 / 位相誤差: 26.87 / 立体化学のターゲット値: ML
Rfactor
反射数
%反射
Rfree
0.2421
1370
5.03 %
Rwork
0.2144
-
-
obs
0.2158
27254
97.02 %
溶媒の処理
減衰半径: 0.86 Å / VDWプローブ半径: 1.1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 42.389 Å2 / ksol: 0.404 e/Å3