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Yorodumi- PDB-3g3c: Mth0212 (WT) in complex with a 6bp dsDNA containing a single one ... -
+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 3g3c | ||||||
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Title | Mth0212 (WT) in complex with a 6bp dsDNA containing a single one nucleotide long 3'-overhang | ||||||
Components |
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Keywords | HYDROLASE/DNA / protein-DNA complex / HYDROLASE-DNA COMPLEX | ||||||
Function / homology | Function and homology information double-stranded DNA 3'-5' DNA exonuclease activity / exodeoxyribonuclease III / phosphoric diester hydrolase activity / class I DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / base-excision repair / endonuclease activity / DNA binding / metal ion binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Methanothermobacter thermautotrophicus (archaea) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / molecular replacement / Resolution: 3.04 Å | ||||||
Authors | Lakomek, K. / Dickmanns, A. / Ficner, R. | ||||||
Citation | Journal: J.Mol.Biol. / Year: 2010 Title: Crystal Structure Analysis of DNA Uridine Endonuclease Mth212 Bound to DNA Authors: Lakomek, K. / Dickmanns, A. / Ciirdaeva, E. / Schomacher, L. / Ficner, R. #1: Journal: Nucleic Acids Res. / Year: 2006 Title: The Methanothermobacter thermautotrophicus ExoIII homologue Mth212 is a DNA uridine endonuclease Authors: Georg, J. / Schomacher, L. / Chong, J.P.J. / Majernik, A.I. / Raabe, M. / Urlaub, H. / Muller, S. / Ciirdaeva, E. / Kramer, W. / Fritz, H.-J. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 3g3c.cif.gz | 130 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb3g3c.ent.gz | 97.7 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 3g3c.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 3g3c_validation.pdf.gz | 476.6 KB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 3g3c_full_validation.pdf.gz | 482.2 KB | Display | |
Data in XML | 3g3c_validation.xml.gz | 20.5 KB | Display | |
Data in CIF | 3g3c_validation.cif.gz | 27.1 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/g3/3g3c ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/g3/3g3c | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | 3fziSC 3g00C 3g0aC 3g0rC 3g1kC 3g2cC 3g2dC 3g38C 3g3yC 3g4tC 3g8vC 3g91C 3ga6C S: Starting model for refinement C: citing same article (ref.) |
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Similar structure data |
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: 1
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