登録情報 データベース : PDB / ID : 2v4q 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Post-insertion complex of the Y-family DNA polymerase Dpo4 with M1dG containing template DNA 要素5'-D(*GP*GP*GP*GP*GP*AP*AP*GP*GP*AP *TP*TP*CP*C)-3'5'-D(*TP*CP*AP*C M1GP*GP*AP*AP*TP*CP*CP *TP*TP*CP*CP*CP*CP*C)-3'DNA POLYMERASE IV 詳細キーワード TRANSFERASE / DNA-DIRECTED DNA POLYMERASE / DNA-BINDING / METAL-BINDING / DNA REPLICATION / MUTATOR PROTEIN / NUCLEOTIDYLTRANSFERASE / DNA ADDUCT / DNA DAMAGE / DNA REPAIR / DPO4 / M1DG / CYTOPLASM / MAGNESIUM / POLYMERASE機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
SOS response / error-prone translesion synthesis / DNA-templated DNA replication / damaged DNA binding / DNA-directed DNA polymerase / DNA-directed DNA polymerase activity / magnesium ion binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 DNA polymerase type-Y, HhH motif / IMS family HHH motif / DNA polymerase IV / DNA polymerase, Y-family, little finger domain / MutS, DNA mismatch repair protein, domain I - #60 / MutS, DNA mismatch repair protein, domain I / DNA polymerase, Y-family, little finger domain / impB/mucB/samB family C-terminal domain / UmuC domain / DNA polymerase, Y-family, little finger domain superfamily ... DNA polymerase type-Y, HhH motif / IMS family HHH motif / DNA polymerase IV / DNA polymerase, Y-family, little finger domain / MutS, DNA mismatch repair protein, domain I - #60 / MutS, DNA mismatch repair protein, domain I / DNA polymerase, Y-family, little finger domain / impB/mucB/samB family C-terminal domain / UmuC domain / DNA polymerase, Y-family, little finger domain superfamily / impB/mucB/samB family / UmuC domain profile. / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / Dna Ligase; domain 1 / 5' to 3' exonuclease, C-terminal subdomain / DNA polymerase; domain 1 / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / Alpha-Beta Plaits / DNA/RNA polymerase superfamily / 2-Layer Sandwich / Orthogonal Bundle / 3-Layer(aba) Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / DNA / DNA (> 10) / DNA polymerase IV 類似検索 - 構成要素生物種 SULFOLOBUS SOLFATARICUS (古細菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.6 Å 詳細データ登録者 Eoff, R.L. / Stafford, J.B. / Szekely, J. / Rizzo, C.J. / Egli, M. / Guengerich, F.P. / Marnett, L.J. 引用ジャーナル : Biochemistry / 年 : 2009タイトル : Structural and Functional Analysis of Sulfolobus Solfataricus Y-Family DNA Polymerase Dpo4-Catalyzed Bypass of the Malondialdehyde-Deoxyguanosine Adduct.著者 : Eoff, R.L. / Stafford, J.B. / Szekely, J. / Rizzo, C.J. / Egli, M. / Guengerich, F.P. / Marnett, L.J. 履歴 登録 2008年9月26日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2009年6月16日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2011年5月8日 Group : Version format compliance改定 1.2 2011年7月13日 Group : Version format compliance改定 1.3 2023年12月13日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Other / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_conn_type / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn_type.id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
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