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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1pal | ||||||
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タイトル | IONIC INTERACTIONS WITH PARVALBUMINS. CRYSTAL STRUCTURE DETERMINATION OF PIKE 4.10 PARVALBUMIN IN FOUR DIFFERENT IONIC ENVIRONMENTS | ||||||
![]() | PARVALBUMIN | ||||||
![]() | CALCIUM BINDING PROTEIN | ||||||
機能・相同性 | ![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() | ||||||
![]() | Declercq, J.P. / Tinant, B. / Parello, J. / Rambaud, J. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Ionic interactions with parvalbumins. Crystal structure determination of pike 4.10 parvalbumin in four different ionic environments. 著者: Declercq, J.P. / Tinant, B. / Parello, J. / Rambaud, J. #1: ![]() タイトル: Crystal Structure Determination and Refinement of Pike 4.10 Parvalbumin (Minor Component from Esox Lucius) 著者: Declercq, J.-P. / Tinant, B. / Parello, J. / Etienne, G. / Huber, R. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 35.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 23.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 420 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 431 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 8.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 10.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 11429.834 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() | ||||||
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#2: 化合物 | #3: 化合物 | ChemComp-NH4 / | #4: 水 | ChemComp-HOH / | Has protein modification | Y | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.04 Å3/Da / 溶媒含有率: 39.6 % |
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結晶化 | *PLUS 温度: 20 ℃ / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 |
溶液の組成 | *PLUS 濃度: 3 mM / 一般名: sodium azide |
-データ収集
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
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放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 1.65 Å / 最低解像度: 9999 Å / Num. obs: 11782 / % possible obs: 74 % / Observed criterion σ(I): 1 / Num. measured all: 29643 / Rmerge(I) obs: 0.101 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 1.65 Å / 最低解像度: 1.8 Å / % possible obs: 53 % |
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解析
ソフトウェア | 名称: PROLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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精密化 | Rfactor obs: 0.197 / 最高解像度: 1.65 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 最高解像度: 1.65 Å
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拘束条件 |
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精密化 | *PLUS 最低解像度: 7 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
LS精密化 シェル | *PLUS 最高解像度: 1.65 Å / 最低解像度: 1.8 Å / Rfactor obs: 0.255 |