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-基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 1ghf | ||||||
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タイトル | ANTI-ANTI-IDIOTYPE GH1002 FAB FRAGMENT | ||||||
要素 | (ANTI-ANTI-IDIOTYPE GH1002 FAB FRAGMENT) x 2 | ||||||
キーワード | ANTIBODY FAB FRAGMENT | ||||||
機能・相同性 | Immunoglobulins / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta 機能・相同性情報 | ||||||
生物種 | Mus musculus (ハツカネズミ) | ||||||
手法 | X線回折 / 解像度: 2.7 Å | ||||||
データ登録者 | Ban, N. / Day, J. / Wang, X. / Ferrone, S. / McPherson, A. | ||||||
引用 | ジャーナル: J.Mol.Biol. / 年: 1996 タイトル: Crystal structure of an anti-anti-idiotype shows it to be self-complementary. 著者: Ban, N. / Day, J. / Wang, X. / Ferrone, S. / McPherson, A. | ||||||
履歴 |
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-構造の表示
構造ビューア | 分子: MolmilJmol/JSmol |
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-ダウンロードとリンク
-ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | 1ghf.cif.gz | 89.5 KB | 表示 | PDBx/mmCIF形式 |
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PDB形式 | pdb1ghf.ent.gz | 68.9 KB | 表示 | PDB形式 |
PDBx/mmJSON形式 | 1ghf.json.gz | ツリー表示 | PDBx/mmJSON形式 | |
その他 | その他のダウンロード |
-検証レポート
文書・要旨 | 1ghf_validation.pdf.gz | 375.1 KB | 表示 | wwPDB検証レポート |
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文書・詳細版 | 1ghf_full_validation.pdf.gz | 395.4 KB | 表示 | |
XML形式データ | 1ghf_validation.xml.gz | 12 KB | 表示 | |
CIF形式データ | 1ghf_validation.cif.gz | 17.6 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gh/1ghf ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/gh/1ghf | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ |
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-リンク
-集合体
登録構造単位 |
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1 |
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単位格子 |
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-要素
#1: 抗体 | 分子量: 23427.670 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Mus musculus (ハツカネズミ) |
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#2: 抗体 | 分子量: 23111.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) Mus musculus (ハツカネズミ) |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: X線回折 |
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-試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.61 Å3/Da / 溶媒含有率: 52.9 % | ||||||||||||||||||||
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結晶化 | *PLUS 手法: 蒸気拡散法 | ||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
放射光源 | 波長: 1.5418 |
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検出器 | タイプ: XUONG-HAMLIN MULTIWIRE / 検出器: AREA DETECTOR |
放射 | 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.5418 Å / 相対比: 1 |
反射 | Num. obs: 13743 / % possible obs: 97 % / Observed criterion σ(I): 1 / 冗長度: 4.5 % / Rmerge(I) obs: 0.076 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.7 Å / Num. measured all: 65132 |
反射 シェル | *PLUS 最高解像度: 2.7 Å / 最低解像度: 2.8 Å / % possible obs: 92 % |
-解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 2.7→30 Å / σ(F): 3 /
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原子変位パラメータ | Biso mean: 10.4 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.7→30 Å
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拘束条件 |
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ソフトウェア | *PLUS 名称: X-PLOR / バージョン: 3.1 / 分類: refinement | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
拘束条件 | *PLUS
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