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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 113d | ||||||||||||||||||
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タイトル | THE STRUCTURE OF GUANOSINE-THYMIDINE MISMATCHES IN B-DNA AT 2.5 ANGSTROMS RESOLUTION | ||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / B-DNA / DOUBLE HELIX / MISMATCHED | 機能・相同性 | DNA / DNA (> 10) | ![]() 手法 | ![]() ![]() Hunter, W.N. / Brown, T. / Kneale, G. / Anand, N.N. / Rabinovich, D. / Kennard, O. | ![]() ![]() タイトル: The structure of guanosine-thymidine mismatches in B-DNA at 2.5-A resolution. 著者: Hunter, W.N. / Brown, T. / Kneale, G. / Anand, N.N. / Rabinovich, D. / Kennard, O. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 21.2 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 13.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 323.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 329.5 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 2.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 3.3 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 3678.403 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.35 Å3/Da / 溶媒含有率: 47.59 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 温度: 281 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 7.4 詳細: pH 7.40, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 281.00K | ||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 |
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 279 K |
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検出器 | タイプ: SYNTEX P21 / 検出器: DIFFRACTOMETER |
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.5→8 Å / Num. obs: 2497 / Observed criterion σ(I): 0 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / 最低解像度: 8 Å / % possible obs: 60 % |
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解析
ソフトウェア | 名称: NUCLSQ / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.5→8 Å / σ(I): 1 /
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Refine Biso |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.5→8 Å
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.5 Å / 最低解像度: 8 Å / Num. reflection obs: 2004 / Rfactor obs: 0.18 / σ(I): 1 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |