- PDB-7d8q: The structure of nucleotide phosphatase Sa1684 complex with GDP a... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 7d8q
タイトル
The structure of nucleotide phosphatase Sa1684 complex with GDP analogue from Staphylococcus aureus
要素
UPF0374 protein SAB1800c
キーワード
CYTOSOLIC PROTEIN (細胞質基質) / nucleitide phosphatase
機能・相同性
Uncharacterised protein family UPF0374 / Domain of unknown function DUF402 / FomD-like superfamily / Protein of unknown function (DUF402) / Chem-GZF / UPF0374 protein SAB1800c
構造決定の手法: 単波長異常分散 / 解像度: 1.5→30.19 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.969 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.958 / WRfactor Rfree: 0.1903 / WRfactor Rwork: 0.1672 / FOM work R set: 0.8749 / SU B: 1.216 / SU ML: 0.045 / SU R Cruickshank DPI: 0.0679 / SU Rfree: 0.0678 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.068 / ESU R Free: 0.068 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : REFINED INDIVIDUALLY
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.186
1511
5 %
RANDOM
Rwork
0.1639
-
-
-
obs
0.165
28906
98.61 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK