登録情報 | データベース: PDB / ID: 4hv7 |
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タイトル | Structure of ricin A chain bound with N-(N-(pterin-7-yl)carbonylglycyl)glycine |
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要素 | Ricin |
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キーワード | HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR / RICIN / PROTEIN-LIGAND COMPLEX / PTERIN / HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR COMPLEX / TOXIN / HYDROLASE / RIBOSOME-INACTIVATING PROTEIN / N-GLYCOSIDASE |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
rRNA N-glycosylase / rRNA N-glycosylase activity / AMP binding / defense response / toxin activity / carbohydrate binding / killing of cells of another organism / negative regulation of translation類似検索 - 分子機能 Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A subunit); domain 1 / Ricin (A subunit), domain 1 / Ribosome-inactivating protein conserved site / Shiga/ricin ribosomal inactivating toxins active site signature. / Ricin-type beta-trefoil lectin domain / Ribosome-inactivating protein type 1/2 / Ribosome-inactivating protein / Ribosome-inactivating protein, subdomain 1 ...Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A Subunit), domain 2 / Ricin (A subunit); domain 1 / Ricin (A subunit), domain 1 / Ribosome-inactivating protein conserved site / Shiga/ricin ribosomal inactivating toxins active site signature. / Ricin-type beta-trefoil lectin domain / Ribosome-inactivating protein type 1/2 / Ribosome-inactivating protein / Ribosome-inactivating protein, subdomain 1 / Ribosome-inactivating protein, subdomain 2 / Ribosome-inactivating protein superfamily / Ribosome inactivating protein / Ricin-type beta-trefoil / Lectin domain of ricin B chain profile. / Ricin B, lectin domain / Ricin B-like lectins / Few Secondary Structures / Irregular / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Ricinus communis (トウゴマ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.869 Å |
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データ登録者 | Jasheway, K.R. / Monzingo, A.F. / Saito, R. / Pruet, J.M. / Manzano, L.A. / Wiget, P.A. / Anslyn, E.V. / Robertus, J.D. |
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引用 | ジャーナル: J.Med.Chem. / 年: 2013 タイトル: Peptide-conjugated pterins as inhibitors of ricin toxin A. 著者: Saito, R. / Pruet, J.M. / Manzano, L.A. / Jasheway, K. / Monzingo, A.F. / Wiget, P.A. / Kamat, I. / Anslyn, E.V. / Robertus, J.D. |
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履歴 | 登録 | 2012年11月5日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2012年12月26日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2013年3月6日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2015年4月29日 | Group: Non-polymer description |
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改定 1.3 | 2016年12月14日 | Group: Structure summary |
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改定 1.4 | 2023年9月20日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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