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基本情報
登録情報 | データベース: EMDB / ID: EMD-11903 | |||||||||||||||
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タイトル | Staphylococcus aureus 70S after 50 minutes incubation at 37C | |||||||||||||||
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![]() | Ribosome / H68 / translation / protein synthesis | |||||||||||||||
機能・相同性 | ![]() large ribosomal subunit / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / small ribosomal subunit rRNA binding / transferase activity / 5S rRNA binding / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic small ribosomal subunit / cytosolic large ribosomal subunit ...large ribosomal subunit / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / small ribosomal subunit rRNA binding / transferase activity / 5S rRNA binding / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic small ribosomal subunit / cytosolic large ribosomal subunit / tRNA binding / cytoplasmic translation / rRNA binding / negative regulation of translation / ribosome / structural constituent of ribosome / ribonucleoprotein complex / translation / mRNA binding / RNA binding / zinc ion binding / cytoplasm / cytosol 類似検索 - 分子機能 Type-1 KH domain profile. / Ribosomal protein L25, long-form / Ribosomal protein L25, beta domain / Ribosomal protein L25, C-terminal / Ribosomal protein TL5, C-terminal domain / Ribosomal protein S14, type Z / Ribosomal protein L16 signature 1. / : / Ribosomal protein L6, conserved site / Ribosomal protein L6 signature 1. ...Type-1 KH domain profile. / Ribosomal protein L25, long-form / Ribosomal protein L25, beta domain / Ribosomal protein L25, C-terminal / Ribosomal protein TL5, C-terminal domain / Ribosomal protein S14, type Z / Ribosomal protein L16 signature 1. / : / Ribosomal protein L6, conserved site / Ribosomal protein L6 signature 1. / Ribosomal protein L16, conserved site / Ribosomal protein L16 signature 2. / Ribosomal protein L17 signature. / Ribosomal L25p family / Ribosomal protein L25 / Ribosomal protein L36 signature. / Ribosomal protein L28/L24 superfamily / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, N-terminal / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain superfamily / Ribosomal protein L28 / Ribosomal protein L35, conserved site / Ribosomal protein L35 signature. / Ribosomal protein L33, conserved site / Ribosomal protein L33 signature. / Ribosomal protein L35, non-mitochondrial / Ribosomal protein L5, bacterial-type / Ribosomal protein S14/S29 / Ribosomal protein L6, bacterial-type / Ribosomal protein L18, bacterial-type / Ribosomal protein L19, conserved site / Ribosomal protein L19 signature. / Ribosomal protein S3, bacterial-type / Ribosomal protein S6, conserved site / Ribosomal protein S6 signature. / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L36 superfamily / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L20 signature. / Ribosomal protein S7, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein S11, bacterial-type / Ribosomal protein L27, conserved site / Ribosomal protein S13, bacterial-type / Ribosomal protein L27 signature. / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein S20 superfamily / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein S9, bacterial/plastid / Ribosomal protein S4, bacterial-type / 30S ribosomal protein S17 / Ribosomal protein S5, bacterial-type / Ribosomal protein L14P, bacterial-type / Ribosomal protein L34, conserved site / Ribosomal protein L34 signature. / Ribosomal protein S6, plastid/chloroplast / Ribosomal protein L2, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein L35 / Ribosomal protein L35 superfamily / Ribosomal protein L35 / Ribosomal L28 family / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein L28/L24 / Ribosomal protein L33 superfamily / Ribosomal protein L30, bacterial-type / Ribosomal protein L18 / Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast / Ribosomal protein L16 / Ribosomal protein S18, conserved site / Ribosomal protein S18 signature. / L28p-like / Ribosomal protein L20 / Ribosomal protein L20 / Ribosomal protein L20, C-terminal / Ribosomal protein S15, bacterial-type / Ribosomal protein L21 / Ribosomal protein L27 / Ribosomal L27 protein / Ribosomal protein L19 / Ribosomal protein L19 superfamily / Ribosomal protein L19 / Ribosomal proteins 50S L24/mitochondrial 39S L24 / Ribosomal protein L17 / Ribosomal protein L17 superfamily / Ribosomal protein L17 / Ribosomal protein S6 / Ribosomal protein S6 / Ribosomal protein L21-like / L21-like superfamily / Ribosomal prokaryotic L21 protein / Ribosomal protein S6 superfamily / Ribosomal protein S12, bacterial-type / Ribosomal protein L24 / Ribosomal protein L34 / Ribosomal protein L34 / Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 / Ribosomal protein L13, bacterial-type / Ribosomal protein L3, bacterial/organelle-type / Ribosomal protein S18 / Ribosomal protein S18 / Ribosomal protein L15, bacterial-type 類似検索 - ドメイン・相同性 Large ribosomal subunit protein bL17 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein bL36 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Large ribosomal subunit protein bL35 / Large ribosomal subunit protein bL27 / Large ribosomal subunit protein bL28 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Large ribosomal subunit protein uL14 ...Large ribosomal subunit protein bL17 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein bL36 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Large ribosomal subunit protein bL35 / Large ribosomal subunit protein bL27 / Large ribosomal subunit protein bL28 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Large ribosomal subunit protein bL19 / Small ribosomal subunit protein bS18 / Large ribosomal subunit protein bL33 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein bL20 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Large ribosomal subunit protein bL25 / Small ribosomal subunit protein uS9 / 50S ribosomal protein L5 / : / : / : / : / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein bL21 / Small ribosomal subunit protein bS6 / Large ribosomal subunit protein bL34 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Small ribosomal subunit protein uS5 / Large ribosomal subunit protein uL13 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Small ribosomal subunit protein bS20 類似検索 - 構成要素 | |||||||||||||||
生物種 | ![]() ![]() | |||||||||||||||
手法 | 単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 2.86 Å | |||||||||||||||
![]() | Cimicata G / Bashan A / Yonath A | |||||||||||||||
資金援助 | 1件
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![]() | ![]() タイトル: Staphylococcus aureus 50S after 30 minutes incubation a 37C 著者: Cimicata G / Bashan A / Yonath A | |||||||||||||||
履歴 |
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構造の表示
ムービー |
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構造ビューア | EMマップ: ![]() ![]() ![]() |
添付画像 |
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ダウンロードとリンク
-EMDBアーカイブ
マップデータ | ![]() | 336.9 MB | ![]() | |
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ヘッダ (付随情報) | ![]() ![]() | 61.8 KB 61.8 KB | 表示 表示 | ![]() |
画像 | ![]() | 117.4 KB | ||
Filedesc metadata | ![]() | 11.8 KB | ||
その他 | ![]() | 395.4 MB | ||
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 534.2 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 533.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 7.6 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 8.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
-
リンク
EMDBのページ | ![]() ![]() |
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「今月の分子」の関連する項目 |
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マップ
ファイル | ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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ボクセルのサイズ | X=Y=Z: 0.85 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
密度 |
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対称性 | 空間群: 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
詳細 | EMDB XML:
CCP4マップ ヘッダ情報:
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-添付データ
-追加マップ: #1
ファイル | emd_11903_additional_1.map | ||||||||||||
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投影像・断面図 |
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密度ヒストグラム |
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試料の構成要素
+全体 : 70S
全体 | 名称: 70S |
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要素 |
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+超分子 #1: 70S
超分子 | 名称: 70S / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: all |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
+分子 #1: 23S rRNA
分子 | 名称: 23S rRNA / タイプ: rna / ID: 1 詳細: ...詳細: GAUUAAGUUAUUAAGGGCGCACGGUGGAUGCCUUGGCACUAGAAGCCGAUGAAGGACGUUACUAACGACGAUAUGCUUUGGGGAGCUGUAAGCUUUGAUCCAGAGAUUUCCGAAUGGGGAAACCCAGCAUGAGUUAUGUCAUGUUAUCGAUAUGUGAAUACAUAGCAUAUCAGAAGGCACACCCGGAGAACUGAAACAUCUUAGUACCCGGAGGAAGAGAAAGAAAAUUCGAUUCCCUUAGUAGCGGCGAGCGAAACGGGAAGAGCCCAAACCAACAAGCUUGCUUGUUGGGGUUGUAGGACACUCUGUACGGAGUUACAAAGGACGACAUUAGACGAAUCAUCUGGAAAGAUGAAUCAAAGAAGGUAAUAAUCCUGUAGUCGAAAAUGUUGUCUCUCUUGAGUGGAUCCUGAGUACGACGGAGCACGUGAAAUUCCGUCGGAAUCUGGGAGGACCAUCUCCUAAGGCUAAAUACUCUCUAGUGACCGAUAGUGAACCAGUACCGUGAGGGAAAGGUGAAAAGCACCCCGGAAGGGGAGUGAAAUAGAACCUGAAACCGUGUGCUUACAAGUAGUCAGAGCCCGUUAAUGGGUGAUGGCGUGCCUUUUGUAGAAUGAACCGGCGAGUUACGAUUUGAUGCAAGGUUAAGCAGUAAAUGUGGAGCCGUAGCGAAAGCGAGUCUGAAUAGGGCGUUUAGUAUUUGGUCGUAGACCCGAAACCAGGUGAUCUACCCUUGGUCAGGUUGAAGUUCAGGUAACACUGAAUGGAGGACCGAACCGACUUACGUUGAAAAGUGAGCGGAUGAACUGAGGGUAGCGGAGAAAUUCCAAUCGAACCUGGAGAUAGCUGGUUCUCUCCGAAAUAGCUUUAGGGCUAGCCUCAAGUGAUGAUUAUUGGAGGUAGAGCACUGUUUGGACGAGGGGCCCCUCUCGGGUUACCGAAUUCAGACAAACUCCGAAUGCCAAUUAAUUUAACUUGGGAGUCAGAACAUGGGUGAUAAGGUCCGUGUUCGAAAGGGAAACAGCCCAGACCACCAGCUAAGGUCCCAAAAUAUAUGUUAAGUGGAAAAGGAUGUGGCGUUGCCCAGACAACUAGGAUGUUGGCUUAGAAGCAGCCAUCAUUUAAAGAGUGCGUAAUAGCUCACUAGUCGAGUGACACUGCGCCGAAAAUGUACCGGGGCUAAACAUAUUACCGAAGCUGUGGAUUGUCCUUUGGACAAUGGUAGGAGAGCGUUCUAAGGGCGUUGAAGCAUGAUCGUAAGGACAUGUGGAGCGCUUAGAAGUGAGAAUGCCGGUGUGAGUAGCGAAAGACGGGUGAGAAUCCCGUCCACCGAUUGACUAAGGUUUCCAGAGGAAGGCUCGUCCGCUCUGGGUUAGUCGGGUCCUAAGCUGAGGCCGACAGGCGUAGGCGAUGGAUAACAGGUUGAUAUUCCUGUACCACCUAUAAUCGUUUUAAUCGAUGGGGGGACGCAGUAGGAUAGGCGAAGCGUGCGAUUGGAUUGCACGUCUAAGCAGUAAGGCUGAGUAUUAGGCAAAUCCGGUACUCGUUAAGGCUGAGCUGUGAUGGGGAGAAGACAUUGAGUCUUCGAGUCGUUGAUUUCACACUGCCGAGAAAAGCCUCUAGAUAGAAAAUAGGUGCCCGUACCGCAAACCGACACAGGUAGUCAAGAUGAGAAUUCUAAGGUGAGCGAGCGAACUCUCGUUAAGGAACUCGGCAAAAUGACCCCGGUAACUUCGGGAGAAGGGGUGCUCUUUAGGGUUAACGCCCAGAAGAGCCGCAGUGAAUAGGCCCAAGCGACUGUUUAUCAAAAACACAGGUCUCUGCUAAACCGUAAGGUGAUGUAUAGGGGCUGACGCCUGCCCGGUGCUGGAAGGUUAAGAGGAGUGGUUAGCUUCUGCGAAGCUACGAAUCGAAGCCCCAGUAAACGGCGGCCGUAACUAUAACGGUCCUAAGGUAGCGAAAUUCCUUGUCGGGUAAGUUCCGACCCGCACGAAAGGCGUAACGAUUUGGGCACUGUCUCAACGAGAGACUCGGUGAAAUCAUAGUACCUGUGAAGAUGCAGGUUACCCGCGACAGGACGGAAAGACCCCGUGGAGCUUUACUGUAGCCUGAUAUUGAAAUUCGGCACAGCUUGUACAGGAUAGGUAGGAGCCUUUGAAACGUGAGCGCUAGCUUACGUGGAGGCGCUGGUGGGAUACUACCCUAGCUGUGUUGGCUUUCUAACCCGCACCACUUAUCGUGGUGGGAGACAGUGUCAAGCGGGCAGUUUGACUGGGGCGGUCGCCUCCUAAAAGGUAACGGAGGCGCUCAAAGGUUCCCUCAGAAUGGUUGGAAAUCAUUCAUAGAGUGUAAAGGCAUAAGGGAGCUUGACUGCGAGACCUACAAGUCGAGCAGGGUCGAAAGACGGACUUAGUGAUCCGGUGGUUCCGCAUGGAAGGGCCAUCGCUCAACGGAUAAAAGCUACCCCGGGGAUAACAGGCUUAUCUCCCCCAAGAGUUCACAUCGACGGGGAGGUUUGGCACCUCGAUGUCGGCUCAUCGCAUCCUGGGGCUGUAGUCGGUCCCAAGGGUUGGGCUGUUCGCCCAUUAAAGCGGUACGCGAGCUGGGUUCAGAACGUCGUGAGACAGUUCGGUCCCUAUCCGUCGUGGGCGUAGGAAAUUUGAGAGGAGCUGUCCUUAGUACGAGAGGACCGGGAUGGACAUACCUCUGGUGUACCAGUUGUCGUGCCAACGGCAUAGCUGGGUAGCUAUGUGUGGACGGGAUAAGUGCUGAAAGCAUCUAAGCAUGAAGCCCCCCUCAAGAUGAGAUUUCCCAACUUCGGUUAUAAGAUCCCUCAAAGAUGAUGAGGUUAAUAGGUUCGAGGUGGAAGCAUGGUGACAUGUGGAGCUGACGAAUACUAAUCGAUCGAAGACUUAAUCAA コピー数: 1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 946.687688 KDa |
配列 | 文字列: GAUUAAGUUA UUAAGGGCGC ACGGUGGAUG CCUUGGCACU AGAAGCCAAU GAAGGACGUU ACUAACGACG AUAUGCUUUG GGGAGCUGU AAGUAAGCUU UGAUCCAGAG AUUUCCGAAU GGGGAAACCC AGCAUGAGUU AUGUCAUGUU AUCGAUAUGU G AAUACAUA ...文字列: GAUUAAGUUA UUAAGGGCGC ACGGUGGAUG CCUUGGCACU AGAAGCCAAU GAAGGACGUU ACUAACGACG AUAUGCUUUG GGGAGCUGU AAGUAAGCUU UGAUCCAGAG AUUUCCGAAU GGGGAAACCC AGCAUGAGUU AUGUCAUGUU AUCGAUAUGU G AAUACAUA GCAUAUCAGA AGGCACACCC GGAGAACUGA AACAUCUUAG UACCCGGAGG AAGAGAAAGA AAAUUCGAUU CC CUUAGUA GCGGCGAGCG AAACGGGAAG AGCCCAAACC AACAAGCUUG CUUGUUGGGG UUGUAGGACA CUCUAUACGG AGU UACAAA GGACGACAUU AGACGAAUCA UCUGGAAAGA UGAAUCAAAG AAGGUAAUAA UCCUGUAGUC GAAAAUGUUG UCUC UCUUG AGUGGAUCCU GAGUACGACG GAGCACGUGA AAUUCCGUCG GAAUCUGGGA GGACCAUCUC CUAAGGCUAA AUACU CUCU AGUGACCGAU AGUGAACCAG UACCGUGAGG GAAAGGUGAA AAGCACCCCG GAAGGGGAGU GAAAUAGAAC CUGAAA CCG UGUGCUUACA AGUAGUCAGA GCCCGUUAAU GGGUGAUGGC GUGCCUUUUG UAGAAUGAAC CGGCGAGUUA CGAUUUG AU GCAAGGUUAA GCAGUAAAUG UGGAGCCGUA GCGAAAGCGA GUCUGAAUAG GGCGUUUAGU AUUUGGUCGU AGACCCGA A ACCAGGUGAU CUACCCUUGG UCAGGUUGAA GUUCAGGUAA CACUGAAUGG AGGACCGAAC CGACUUACGU UGAAAAGUG AGCGGAUGAA CUGAGGGUAG CGGAGAAAUU CCAAUCGAAC CUGGAGAUAG CUGGUUCUCU CCGAAAUAGC UUUAGGGCUA GCCUCAAGU GAUGAUUAUU GGAGGUAGAG CACUGUUUGG ACGAGGGGCC CCUCUCGGGU UACCGAAUUC AGACAAACUC C GAAUGCCA AUUAAUUUAA CUUGGGAGUC AGAACAUGGG UGAUAAGGUC CGUGUUCGAA AGGGAAACAG CCCAGACCAC CA GCUAAGG UCCCAAAAUA UAUGUUAAGU GGAAAAGGAU GUGGCGUUGC CCAGACAACU AGGAUGUUGG CUUAGAAGCA GCC AUCAUU UAAAGAGUGC GUAAUAGCUC ACUAGUCGAG UGACACUGCG CCGAAAAUGU ACCGGGGCUA AACAUAUUAC CGAA GCUGU GGAUUGUCCU UUGGACAAUG GUAGGAGAGC GUUCUAAGGG CGUUGAAGCA UGAUCGUAAG GACAUGUGGA GCGCU UAGA AGUGAGAAUG CCGGUGUGAG UAGCGAAAGA CGGGUGAGAA UCCCGUCCAC CGAUUGACUA AGGUUUCCAG AGGAAG GCU CGUCCGCUCU GGGUUAGUCG GGUCCUAAGC UGAGGCCGAC AGGCGUAGGC GAUGGAUAAC AGGUUGAUAU UCCUGUA CC ACCUAUAAUC GUUUUAAUCG AUGGGGGGAC GCAGUAGGAU AGGCGAAGCG UGCGAUUGGA UUGCACGUCU AAGCAGUA A GGCUGAGUAU UAGGCAAAUC CGGUACUCGU UAAGGCUGAG CUGUGAUGGG GAGAAGACAU UGAGUCUUCG AGUCGUUGA UUUCACACUG CCGAGAAAAG CCUCUAGAUA GAAAAUAGGU GCCCGUACCG CAAACCGACA CAGGUAGUCA AGAUGAGAAU UCUAAGGUG AGCGAGCGAA CUCUCGUUAA GGAACUCGGC AAAAUGACCC CGUAACUUCG GGAGAAGGGG UGCUCUUUAG G GUUAACGC CCAGAAGAGC CGCAGUGAAU AGGCCCAAGC GACUGUUUAU CAAAAACACA GGUCUCUGCU AAACCGUAAG GU GAUGUAU AGGGGCUGAC GCCUGCCCGG UGCUGGAAGG UUAAGAGGAG UGGUUAGCUU CUGCGAAGCU ACGAAUCGAA GCC CCAGUA AACGGCGGCC GUAACUAUAA CGGUCCUAAG GUAGCGAAAU UCCUUGUCGG GUAAGUUCCG ACCCGCACGA AAGG CGUAA CGAUUUGGGC ACUGUCUCAA CGAGAGACUC GGUGAAAUCA UAGUACCUGU GAAGAUGCAG GUUACCCGCG ACAGG ACGG AAAGACCCCG UGGAGCUUUA CUGUAGCCUG AUAUUGAAAU UCGGCACAGC UUGUACAGGA UAGGUAGGAG CCUUUG AAA CGUGAGCGCU AGCUUACGUG GAGGCGCUGG UGGGAUACUA CCCUAGCUGU GUUGGCUUUC UAACCCGCAC CACUUAU CG UGGUGGGAGA CAGUGUCAAG CGGGCAGUUU GACUGGGGCG GUCGCCUCCU AAAAGGUAAC GGAGGCGCUC AAAGGUUC C CUCAGAAUGG UUGGAAAUCA UUCAUAGAGU GUAAAGGCAU AAGGGAGCUU GACUGCGAGA CCUACAAGUC GAGCAGGGU CGAAAGACGG ACUUAGUGAU CCGGUGGUUC CGCAUGGAAG GGCCAUCGCU CAACGGAUAA AAGCUACCCC GGGGAUAACA GGCUUAUCU CCCCCAAGAG UUCACAUCGA CGGGGAGGUU UGGCACCUCG AUGUCGGCUC AUCGCAUCCU GGGGCUGUAG U CGGUCCCA AGGGUUGGGC UGUUCGCCCA UUAAAGCGGU ACGCGAGCUG GGUUCAGAAC GUCGUGAGAC AGUUCGGUCC CU AUCCGUC GUGGGCGUAG GAAAUUUGAG AGGAGCUGUC CUUAGUACGA GAGGACCGGG AUGGACAUAC CUCUGGUGUA CCA GUUGUC GUGCCAACGG CAUAGCUGGG UAGCUAUGUG UGGACGGGAU AAGUGCUGAA AGCAUCUAAG CAUGAAGCCC CCCU CAAGA UGAGAUUUCC CAACUUCGGU UAUAAGAUCC CUCAAAGAUG AUGAGGUUAA UAGGUUCGAG GUGGAAGCAU GGUGA CAUG UGGAGCUGAC GAAUACUAAU CGAUCGAAGA CUUAAUCAA |
+分子 #2: 16S rRNA
分子 | 名称: 16S rRNA / タイプ: rna / ID: 2 詳細: ...詳細: UUUAUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGAUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAUACAUGCAAGUCGAGCGAACGGACGAGAAGCUUGCUUCUCUGAUGUUAGCGGCGGACGGGUGAGUAACACGUGGAUAACCUACCUAUAAGACUGGGAUAACUUCGGGAAACCGGAGCUAAUACCGGAUAAUAUUUUGAACCGCAUGGUUCAAAAGUGAAAGACGGUCUUGCUGUCACUUAUAGAUGGAUCCGCGCUGCAUUAGCUAGUUGGUAAGGUAACGGCUUACCAAGGCAACGAUACGUAGCCGACCUGAGAGGGUGAUCGGCCACACUGGAACUGAGACACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUAGGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGAAAGCCUGACGGAGCAACGCCGCGUGAGUGAUGAAGGUCUUCGGAUCGUAAAACUCUGUUAUUAGGGAAGAACAUAUGUGUAAGUAACUGUGCACAUCUUGACGGUACCUAAUCAGAAAGCCACGGCUAACUACGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGUAGGUGGCAAGCGUUAUCCGGAAUUAUUGGGCGUAAAGCGCGCGUAGGCGGUUUUUUAAGUCUGAUGUGAAAGCCCACGGCUCAACCGUGGAGGGUCAUUGGAAACUGGAAAACUUGAGUGCAGAAGAGGAAAGUGGAAUUCCAUGUGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAGAUAUGGAGGAACACCAGUGGCGAAGGCGACUUUCUGGUCUGUAACUGACGCUGAUGUGCGAAAGCGUGGGGAUCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGAGUGCUAAGUGUUAGGGGGUUUCCGCCCCUUAGUGCUGCAGCUAACGCAUUAAGCACUCCGCCUGGGGAGUACGACCGCAAGGUUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGACCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAAAUCUUGACAUCCUUUGACAACUCUAGAGAUAGAGCCUUCCCCUUCGGGGGACAAAGUGACAGGUGGUGCAUGGUUGUCGUCAGCUCGUGUCGUGAGAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAAGCUUAGUUGCCAUCAUUAAGUUGGGCACUCUAAGUUGACUGCCGGUGACAAACCGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAAUCAUCAUGCCCCUUAUGAUUUGGGCUACACACGUGCUACAAUGGACAAUACAAAGGGCAGCGAAACCGCGAGGUCAAGCAAAUCCCAUAAAGUUGUUCUCAGUUCGGAUUGUAGUCUGCAACUCGACUACAUGAAGCUGGAAUCGCUAGUAAUCGUAGAUCAGCAUGCUACGGUGAAUACGUUCCCGGGUAUUGUACACACCGCCCGUCACACCACGAGAGUUUGUAACACCCGAAGCCGGUGGAGUAACCUUUUAGGAGCUAGCCGUCGAAGGUGGGACAAAUGAUUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAGCCGUAUCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUU コピー数: 1 |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 502.019281 KDa |
配列 | 文字列: UUUAUGGAGA GUUUGAUCCU GGCUCAGGAU GAACGCUGGC GGCGUGCCUA AUACAUGCAA GUCGAGCGAA CGGACGAGAA GCUUGCUUC UCUGAUGUUA GCGGCGGACG GGUGAGUAAC ACGUGGAUAA CCUACCUAUA AGACUGGGAU AACUUCGGGA A ACCGUAGC ...文字列: UUUAUGGAGA GUUUGAUCCU GGCUCAGGAU GAACGCUGGC GGCGUGCCUA AUACAUGCAA GUCGAGCGAA CGGACGAGAA GCUUGCUUC UCUGAUGUUA GCGGCGGACG GGUGAGUAAC ACGUGGAUAA CCUACCUAUA AGACUGGGAU AACUUCGGGA A ACCGUAGC UAAUACCGGA UAAUAUUUUG AACCGCAUGG UUCAAAAGUG AAAGACGGUC UUGCUGUCAC UUAUAGAUGG AU CCGCGCU GCAUUAGCUA GUUGGUAAGG UAACGGCUUA CCAAGGCAAC GAUGCAUAGC CGACCUGAGA GGGUGAUCGG CCA CACUGG AACUGAGACA CGGUCCAGAC UCCUACGGGA GGCAGCAGUA GGGAAUCUUC CGCAAUGGGC GAAAGCCUGA CGGA GCAAC GCCGCGUGAG UGAUGAAGGU CUUCGGAUCG UAAAACUCUG UUAUUAGGGA AGAACAUAUG UGUAAGUAAC UGUGC ACAU CUUGACGGUA CCUAAUCAGA AAGCCACGGC UAACUACGUG CCAGCAGCCG CGGUAAUACG UAGGUGGCAA GCGUUA UCC GGAAUUAUUG GGCGUAAAGC GCGCGUAGGC GGUUUUUUAA GUCUGAUGUG AAAGCCCACG GCUCAACCGU GGAGGGU CA UUGGAAACUG GAAAACUUGA GUGCAGAAGA GGAAAGUGGA AUUCCAUGUG UAGCGGUGAA AUGCGCAGAG AUAUGGAG G AACACCAGUG GCGAAGGCGA CUUUCUGGUC UGUAACUGAC GCUGAUGUGC GAAAGCGUGG GGAUCAAACA GGAUUAGAU ACCCUGGUAG UCCACGCCGU AAACGAUGAG UGCUAAGUGU UAGGGGGUUU CCGCCCCUUA GUGCUGCAGC UAACGCAUUA AGCACUCCG CCUGGGGAGU ACGACCGCAA GGUUGAAACU CAAAGGAAUU GACGGGGACC CGCACAAGCG GUGGAGCAUG U GGUUUAAU UCGAAGCAAC GCGAAGAACC UUACCAAAUC UUGACAUCCU UUGACAACUC UAGAGAUAGA GCCUUCCCCU UC GGGGGAC AAAGUGACAG GUGGUGCAUG GUUGUCGUCA GCUCGUGUCG UGAGAUGUUG GGUUAAGUCC CGCAACGAGC GCA ACCCUU AAGCUUAGUU GCCAUCAUUA AGUUGGGCAC UCUAAGUUGA CUGCCGGUGA CAAACCGGAG GAAGGUGGGG AUGA CGUCA AAUCAUCAUG CCCCUUAUGA UUUGGGCUAC ACACGUGCUA CAAUGGACAA UACAAAGGGC AGCGAAACCG CGAGG UCAA GCAAAUCCCA UAAAGUUGUU CUCAGUUCGG AUUGUAGUCU GCAACUCGAC UACAUGAAGC UGGAAUCGCU AGUAAU CGU AGAUCAGCAU GCUACGGUGA AUACGUUCCC GGGUCUUGUA CACACCGCCC GUCACACCAC GAGAGUUUGU AACACCC GA AGCCGGUGGA GUAACCUUUU AGGAGCUAGC CGUCGAAGGU GGGACAAAUG AUUGGGGUGA AGUCGUAACA AGGUAGCC G UAUCGGAAGG UGCGGCUGGA UCACCUCCUU U |
+分子 #3: 5S rRNA
分子 | 名称: 5S rRNA / タイプ: rna / ID: 3 / コピー数: 1 |
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由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 36.692801 KDa |
配列 | 文字列: UCUGGUGACU AUAGCAAGGA GGUCACACCU GUUCCCAUGC CGAACACAGA AGUUAAGGUC UUUAGCGACG AUGGUAGCCA ACUUACGUU CCGCUAGAGU AGAACGUUGC CAGGC |
+分子 #4: 50S ribosomal protein L33,50S ribosomal protein L30
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L33,50S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 12.101037 KDa |
配列 | 文字列: RVNVTLACTE CGDRNYITTK NKRNNPERIE MKKYCPRLNK YTLHRETAKL QITLTRSVIG RPETQRKTVE ALGLKKTNSS VVVEDNPAI RGQINKVKHL VTVEEK UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL33, Large ribosomal subunit protein uL30 |
+分子 #5: 50S ribosomal protein L34
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 5.252369 KDa |
配列 | 文字列: VKRTYQPNKR KHSKVHGFRK RMSTKNGRKV LARRRRKGRK VLS UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL34 |
+分子 #6: 50S ribosomal protein L35
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 7.461992 KDa |
配列 | 文字列: PKMKTHRGAA KRVKRTASGQ LKRSRAFTSH LFANKSTKQK RQLRKARLVS KSDMKRVKQL LAYK UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL35 |
+分子 #7: 50S ribosomal protein L36
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 4.318422 KDa |
配列 | 文字列: MKVRPSVKPI CEKCKVIKRK GKVMVICENP KHKQRQG UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL36 |
+分子 #8: 30S ribosomal protein S10
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 9.24361 KDa |
配列 | 文字列: IRIRLKAYDH RVIDQSAEKI VETAKRSGAD VSGPIPLPTE KSVYTIIRAV HKYKDSREQF EQRTHKRLID IVNPTPKTVD UniProtKB: UNIPROTKB: A0A6H0HKY4 |
+分子 #9: 30S ribosomal protein S11
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 12.047609 KDa |
配列 | 文字列: NIENGVAHIR STFNNTIVTI TDEFGNALSW SSAGALGFKG SKKSTPFAAQ MASETASKSA MEHGLKTVEV TVKGPGPGRE SAIRALQSA GLEVTAIRDV TPVPHNGCRP PKRRR UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS11 |
+分子 #10: 30S ribosomal protein S12
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 15.189673 KDa |
配列 | 文字列: PTINQLVRKP RQSKIKKSDS PALNKGFNSK KKKFTDLNSP QKRGVCTRVG TMTPKKPNSA LRKYARVRLS NNIEINAYIP GIGHNLQEH SVVLVRGGRV KDLPGVRYHI VRGALDTSGV DGRRQGRSLY GTKKPKN UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS12 |
+分子 #11: 50S ribosomal protein L2
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 29.827607 KDa |
配列 | 文字列: AIKKYKPITN GRRNMTSLDF AEITKTTPEK SLLKPLPKKA GRNNQGKLTV RHHGGGHKRQ YRVIDFKRNK DGINAKVDSI QYDPNRSAN IALVVYADGE KRYIIAPKGL EVGQIVESGA EADIKVGNAL PLQNIPVGTV VHNIELKPGK GGQIARSAGA S AQVLGKEG ...文字列: AIKKYKPITN GRRNMTSLDF AEITKTTPEK SLLKPLPKKA GRNNQGKLTV RHHGGGHKRQ YRVIDFKRNK DGINAKVDSI QYDPNRSAN IALVVYADGE KRYIIAPKGL EVGQIVESGA EADIKVGNAL PLQNIPVGTV VHNIELKPGK GGQIARSAGA S AQVLGKEG KYVLIRLRSG EVRMILSTCR ATIGQVGNLQ HELVNVGKAG RSRWKGIRPT VRGSVMNPND HPHGGGEGRA PI GRPSPMS PWGKPTLGKK TRRGKKSSDK LIVRGRK UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2 |
+分子 #12: 30S ribosomal protein S13
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 12.843768 KDa |
配列 | 文字列: ARIAGVDIPR EKRVVISLTY IYGIGTSTAQ KILEEANVSA DTRVKDLTDD ELGRIREVVD GYKVEGDLRR ETNLNIKRLM EISSYRGIR HRRGLPVRGQ KTKNNARTRK GPVK UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13 |
+分子 #13: 50S ribosomal protein L3
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 23.199545 KDa |
配列 | 文字列: TKGILGRKIG MTQVFGENGE LIPVTVVEAK ENVVLQKKTV EVDGYNAIQV GFEDKKAYKK DAKSNKYANK PAEGHAKKAD AAPKRFIRE FRNVDVDAYE VGQEVSVDTF VAGDVIDVTG VSKGKGFQGA IKRHGQSRGP MSHGSHFHRA PGSVGMASDA S RVFKGQKM ...文字列: TKGILGRKIG MTQVFGENGE LIPVTVVEAK ENVVLQKKTV EVDGYNAIQV GFEDKKAYKK DAKSNKYANK PAEGHAKKAD AAPKRFIRE FRNVDVDAYE VGQEVSVDTF VAGDVIDVTG VSKGKGFQGA IKRHGQSRGP MSHGSHFHRA PGSVGMASDA S RVFKGQKM PGRMGGNTVT VQNLEVVQVD TENKVILVKG NVPGPKKGLV EIRTSIK UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3 |
+分子 #14: 50S ribosomal protein L4
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 22.364504 KDa |
配列 | 文字列: ANYDVLKLDG TKSGSIELSD AVFGIEPNNS VLFEAINLQR ASLRQGTHAV KNRSAVSGGG RKPWKQKGTG RARQGTIRAP QWRGGGIVF GPTPRSYAYK MPKKMRRLAL RSALSFKAQE NGLTVVDAFN FEAPKTKEFK NVLSTLEQPK KVLVVTENED V NVELSARN ...文字列: ANYDVLKLDG TKSGSIELSD AVFGIEPNNS VLFEAINLQR ASLRQGTHAV KNRSAVSGGG RKPWKQKGTG RARQGTIRAP QWRGGGIVF GPTPRSYAYK MPKKMRRLAL RSALSFKAQE NGLTVVDAFN FEAPKTKEFK NVLSTLEQPK KVLVVTENED V NVELSARN IPGVQVTTAQ GLNVLDITNA DSLVITEAAA KKVEEVLG UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4 |
+分子 #15: 30S ribosomal protein S14 type Z
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S14 type Z / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 7.186573 KDa |
配列 | 文字列: AKTSMVAKQQ KKQKYAVREY TRCERCGRPH SVYRKFKLCR ICFRELAYKG QIPGVRKASW UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14 |
+分子 #16: 30S ribosomal protein S15
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 10.503135 KDa |
配列 | 文字列: AISQERKNEI IKEYRVHETD TGSPEVQIAV LTAEINAVNE HLRTHKKDHH SRRGLLKMVG RRRHLLNYLR SKDIQRYREL IKSLGIRR UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15 |
+分子 #17: 30S ribosomal protein S16
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 9.291743 KDa |
配列 | 文字列: AVKIRLTRLG SKRNPFYRIV VADARSPRDG RIIEQIGTYN PTSANAPEIK VDEALALKWL NDGAKPTDTV HNILSKEGIM KKF UniProtKB: UNIPROTKB: A0A6K3WEJ9 |
+分子 #18: 50S ribosomal protein L6
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 19.501154 KDa |
配列 | 文字列: SRVGKKIIDI PSDVTVTFDG NHVTVKGPKG ELSRTLNERM TFKQEENTIE VVRPSDSKED RTNHGTTRAL LNNMVQGVSQ GYVKVLELV GVGYRAQMQG KDLILNVGYS HPVEIKAEEN ITFSVEKNTV VKVEGISKEQ VGALASNIRS VRPPEPYKGK G IRYQGEYV RRKEGKT UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6 |
+分子 #19: 50S ribosomal protein L13
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 16.359427 KDa |
配列 | 文字列: MRQTFMANES NIERKWYVID AEGQTLGRLS SEVASILRGK NKVTYTPHVD TGDYVIVINA SKIEFTGNKE TDKVYYRHSN HPGGIKSIT AGELRRTNPE RLIENSIKGM LPSTRLGEKQ GKKLFVYGGA EHPHAAQQPE NYELRG UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL13 |
+分子 #20: 30S ribosomal protein S17
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 9.36686 KDa |
配列 | 文字列: NDRKVYVGKV VSDKMDKTIT VLVETYKTHK LYGKRVKYSK KYKTHDENNS AKLGDIVKIQ ETRPLSATKR FRLVEIVEES UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17 |
+分子 #21: 50S ribosomal protein L14
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 13.157342 KDa |
配列 | 文字列: MIQQETRLKV ADNSGAREVL TIKVLGGSGR KTANIGDVIV CTVKNATPGG VVKKGDVVKA VIVRTKSGVR RNDGSYIKFD ENACVIIRD DKGPRGTRIF GPVARELREG NFMKIVSLAP EVL UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14 |
+分子 #22: 30S ribosomal protein S18
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 6.574833 KDa |
配列 | 文字列: GITHIDYKDT ELLKRFISER GKILPRRVTG TSAKYQRMLT TAIKRSRHMA LLPYVK UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS18 |
+分子 #23: 30S ribosomal protein S20
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 8.480758 KDa |
配列 | 文字列: KSAIKRVKTT EKAEARNISQ KSAMRTAVKN AKTAVSNNAD NKNELVSLAV KLVDKAAQSN LIHSNKADRI KSQLMTAN UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS20 |
+分子 #24: 50S ribosomal protein L15
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 15.62889 KDa |
配列 | 文字列: MKLHELKPAE GSRKERNRVG RGVATGNGKT SGRGHKGQKA RSGGGVRPGF EGGQLPLFRR LPKRGFTNIN RKEYAIVNLD QLNKFEDGT EVTPALLVES GVVKNEKSGI KILGNGSLDK KLTVKAHKFS ASAAEAIDAK GGAHEVI UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15 |
+分子 #25: 30S ribosomal protein S3
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 22.684201 KDa |
配列 | 文字列: GQKINPIGLR VGIIRDWEAK WYAEKDFASL LHEDLKIRKF IDNELKEASV SHVEIERAAN RINIAIHTGK PGMVIGKGGS EIEKLRNKL NALTDKKVHI NVIEIKKVDL DARLVAENIA RQLENRASFR RVQKQAITRA MKLGAKGIKT QVSGRLGGAD I ARAEQYSE ...文字列: GQKINPIGLR VGIIRDWEAK WYAEKDFASL LHEDLKIRKF IDNELKEASV SHVEIERAAN RINIAIHTGK PGMVIGKGGS EIEKLRNKL NALTDKKVHI NVIEIKKVDL DARLVAENIA RQLENRASFR RVQKQAITRA MKLGAKGIKT QVSGRLGGAD I ARAEQYSE GTVPLHTLRA DIDYAHAEAD TTYGKLGVKV WIYR UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3 |
+分子 #26: 50S ribosomal protein L16
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 15.599435 KDa |
配列 | 文字列: MLLPKRVKYR RQHRPKTTGR SKGGNYVTFG EFGLQATTTS WITSRQIESA RIAMTRYMKR GGKVWIKIFP HTPYTKKPLE VRMGAGKGA VEGWIAVVKP GRILFEVAGV SEEVAREALR LASHKLPVKT KFVKREEL UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16 |
+分子 #27: 50S ribosomal protein L17
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 13.583523 KDa |
配列 | 文字列: YRKLGRTSDQ RKAMLRDLAT SLIISERIET TEARAKEVRS VVEKLITLGK KGDLASRRNA AKTLRNVEIL NEDETTQTAL QKLFGEIAE RYTERQGGYT RILKQGPRRG DGAESVIIEL V UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL17 |
+分子 #28: 30S ribosomal protein S4
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 22.849145 KDa |
配列 | 文字列: RFRGSNWKKS RRLGISLSGT GKELEKRPYA PGQHGPNQRK KLSEYGLQLR EKQKLRYLYG MTERQFRNTF DIAGKKFGVH GENFMILLA SRLDAVVYSL GLARTRRQAR QLVNHGHILV DGKRVDIPSY SVKPGQTISV REKSQKLNII VESVEINNFV P EYLNFDAD ...文字列: RFRGSNWKKS RRLGISLSGT GKELEKRPYA PGQHGPNQRK KLSEYGLQLR EKQKLRYLYG MTERQFRNTF DIAGKKFGVH GENFMILLA SRLDAVVYSL GLARTRRQAR QLVNHGHILV DGKRVDIPSY SVKPGQTISV REKSQKLNII VESVEINNFV P EYLNFDAD SLTGTFVRLP ERSELPAEIN EQLIVEYYSR UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4 |
+分子 #29: 30S ribosomal protein S5
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 16.522119 KDa |
配列 | 文字列: EFEERVVTIN RVAKVVKGGR RFRFTALVVV GDKNGRVGFG TGKAQEVPEA IKKAVEAAKK DLVVVPRVEG TTPHTITGRY GSGSVFMKP AAPGTGVIAG GPVRAVLELA GITDILSKSL GSNTPINMVR ATIDGLQNLK NAEDVAKLRG KTVEELY UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS5 |
+分子 #30: 50S ribosomal protein L18
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 13.124093 KDa |
配列 | 文字列: MISKIDKNKV RLKRHARVRT NLSGTAEKPR LNVYRSNKHI YAQIIDDNKG VTLAQASSKD SDIATTATKV ELATKVGEAI AKKAADKGI KEIVFDRGGY LYHGRVKALA EAARESGLEF UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18 |
+分子 #31: 30S ribosomal protein S6
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 11.239766 KDa |
配列 | 文字列: MRTYEVMYIV RPNIEEDAKK ALVERFNGIL ATEGAEVLEA KDWGKRRLAY EINDFKDGFY NIVRVKSDNN KATDEFQRLA KISDDIIRY MVIRED UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS6 |
+分子 #32: 50S ribosomal protein L19
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 13.104381 KDa |
配列 | 文字列: TNHKLIEAVT KSQLRTDLPS FRPGDTLRVH VRIIEGTRER IQVFEGVVIK RRGGGVSETF TVRKISSGVG VERTFPLHTP KIEKIEVKR RGKVRRAKLY YLRSLRGKAA RIQEI UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL19 |
+分子 #33: 30S ribosomal protein S8
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 14.622014 KDa |
配列 | 文字列: MTDPIADMLT RVRNANMVRH EKLELPASNI KKEIAEILKS EGFIKNVEYV EDDKQGVLRL FLKYGQNDER VITGLKRISK PGLRVYAKA SEMPKVLNGL GIALVSTSEG VITDKEARKR NVGGEIIAYV W UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8 |
+分子 #34: 50S ribosomal protein L20
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 13.459919 KDa |
配列 | 文字列: PRVKGGTVTR ARRKKTIKLA KGYFGSKHTL YKVAKQQVMK SGQYAFRDRR QRKRDFRKLW ITRINAAARQ HEMSYSRLMN GLKKAGIDI NRKMLSEIAI SDEKAFAQLV TKAKDAL UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL20 |
+分子 #35: 30S ribosomal protein S7
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 17.695357 KDa |
配列 | 文字列: PRKGSVPKRD VLPDPIHNSK LVTKLINKIM LDGKRGTAQR ILYSAFDLVE QRSGRDALEV FEEAINNIMP VLEVKARRVG GSNYQVPVE VRPERRTTLG LRWLVNYARL RGEKTMEDRL ANEILDAANN TGGAVKKRED THKMAEANKA FAHYRW UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7 |
+分子 #36: 50S ribosomal protein L21
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 11.354081 KDa |
配列 | 文字列: MFAIIETGGK QIKVEEGQEI FVEKLDVNEG DTFTFDKVLF VGGDSVKVGA PTVEGATVTA TVNKQGRGKK ITVFTYKRRK NSKRKKGHR QPYTKLTIDK INA UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21 |
+分子 #37: 30S ribosomal protein S9
分子 | 名称: 30S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 14.312321 KDa |
配列 | 文字列: VEYRGTGRRK NSVARVRLVP GEGNITVNNR DVREYLPFES LILDLNQPFD VTETKGNYDV LVNVHGGGFT GQAQAIRHGI ARALLEADP EYRGSLKRAG LLTRDPRMKE RKKPGLKAAR RSPQFSKR UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9 |
+分子 #38: 50S ribosomal protein L22
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 12.328358 KDa |
配列 | 文字列: MEAKAVARTI RIAPRKVRLV LDLIRGKNAA EAIAILKLTN KASSPVIEKV LMSALANAEH NYDMNTDELV VKEAYANEGP TLKRFRPRA QGRASAINKR TSHITIVVSD GKE UniProtKB: UNIPROTKB: A0A6I4H7Y4 |
+分子 #39: 50S ribosomal protein L23
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 10.3801 KDa |
配列 | 文字列: EARDILKRPV ITEKSSEAMA EDKYTFDVDT RVNKTQVKMA VEEIFNVKVA SVNIMNYKPK KKRMGRYQGY TNKRRKAIVT LKEGSIDLF UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23 |
+分子 #40: 50S ribosomal protein L24
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 11.316205 KDa |
配列 | 文字列: HIKKGDNVKV IAGKDKGKEG KVIATLPKKD RVVVEGVNIM KKHQKPTQLN PEGGILETEA AIHVSNVQLL DPKTNEPTRV GYKFVDGKK VRIAKKSGEE IKSN UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24 |
+分子 #41: 50S ribosomal protein L25
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 10.4622 KDa |
配列 | 文字列: ASLKSIIRQG KQTRSDLKQL RKSGKVPAVV YGYGTKNVSV KVDEVEFIKV IREVGRNGVI ELGVGSKTIK VMVADYQFDP LKNQITHID FLAIN UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL25 |
+分子 #42: 50S ribosomal protein L27
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 8.595688 KDa |
配列 | 文字列: VSSTKNGRDS ESKRLGAKRA DGQFVTGGSI LYRQRGTKIY PGENVGRGGD DTLFAKIDGV VKFERKGRDK KQVSVYAVA UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL27 |
+分子 #43: 50S ribosomal protein L28
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 5.499432 KDa |
配列 | 文字列: ASTGNRRSHA LNSTKRRWNA NLQKVRILVD GKPKKVWVSA RALKSGKVT UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL28 |
+分子 #44: 50S ribosomal protein L29
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 7.845942 KDa |
配列 | 文字列: KAKEIRDLTT SEIEEQIKSS KEELFNLRFQ LATGQLEETA RIRTVRKTIA RLKTVARERE IEQSKAN UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29 |
+分子 #45: 50S ribosomalprotein L32p
分子 | 名称: 50S ribosomalprotein L32p / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 5.406392 KDa |
配列 | 文字列: AVPKRRTSKT RKNKRRTHFK ISVPGMTECP NCGEYKLSHR VCKNCGS UniProtKB: UNIPROTKB: A0A6K0ZQ16 |
+分子 #46: 50S ribosomal protein L5
分子 | 名称: 50S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO |
---|---|
由来(天然) | 生物種: ![]() ![]() |
分子量 | 理論値: 17.651479 KDa |
配列 | 文字列: KFNYSSVMEV PKIDKIVVNM GVGDAVQNSK VLDNAVEELE LITGQKPLVT KAKKSIATFR LREGMPIGAK VTLRGERMYE FLDKLISVS LPRVRDFQGV SKKAFDGRGN YTLGVKEQLI FPEIDYDKVS KVRGMDIVIV TTANTDEEAR ELLANFGMP UniProtKB: 50S ribosomal protein L5 |
-実験情報
-構造解析
手法 | クライオ電子顕微鏡法 |
---|---|
![]() | 単粒子再構成法 |
試料の集合状態 | particle |
-
試料調製
緩衝液 | pH: 7.6 |
---|---|
グリッド | モデル: Quantifoil R1.2/1.3 / 材質: COPPER / メッシュ: 200 |
凍結 | 凍結剤: ETHANE / チャンバー内湿度: 100 % / チャンバー内温度: 277 K / 装置: FEI VITROBOT MARK IV |
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電子顕微鏡法
顕微鏡 | FEI TITAN KRIOS |
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撮影 | フィルム・検出器のモデル: GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 平均電子線量: 47.0 e/Å2 |
電子線 | 加速電圧: 300 kV / 電子線源: ![]() |
電子光学系 | 照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD |
実験機器 | ![]() モデル: Titan Krios / 画像提供: FEI Company |
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画像解析
粒子像選択 | 選択した数: 383752 |
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初期モデル | モデルのタイプ: PDB ENTRY |
最終 再構成 | 解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 2.86 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 192105 |
初期 角度割当 | タイプ: NOT APPLICABLE |
最終 角度割当 | タイプ: NOT APPLICABLE |
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万見について
-お知らせ
-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました
EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました
- EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
- これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。
関連情報:EMDBヘッダ
-2020年8月12日: 新型コロナ情報
新型コロナ情報
![](../emnavi/img/about_covid19.jpg)
URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php
新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。
関連情報:Covid-19情報 /
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ
+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ
新型コロナウイルスの構造データ
- 国際ウイルス分類委員会(ICTV)は、新型コロナウイルス感染症(COVID-19)の病原ウイルスの略称を「SARS-CoV-2」と決定しました。
- 万見で扱っている構造データベースでは、"COVID-19 virus"、"2019-nCoV"といった別称・仮称でも登録されています。こちらでウイルスの詳細と構造データの一覧を見られます。
関連情報:万見生物種 /
2020年8月12日: 新型コロナ情報
+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更
EMDBのIDの桁数の変更
- EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
- EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。
関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? /
万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記
+2017年7月12日: PDB大規模アップデート
PDB大規模アップデート
- 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
- 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
- このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
- EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。
外部リンク:wwPDB Remediation /
OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。
-万見 (Yorodumi)
幾万の構造データを、幾万の視点から
- 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
- EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。
関連情報:EMDB /
PDB /
SASBDB /
3つのデータバンクの比較 /
万見検索 /
2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 /
万見文献 /
Jmol/JSmol /
機能・相同性情報 /
新しいEM Navigatorと万見の変更点