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- EMDB-4478: Structure of tmRNA SmpB bound past E site of E. coli 70S ribosome -

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基本情報

登録情報

データベース: EMDB / ID: EMD-4478

タイトル

Structure of tmRNA SmpB bound past E site of E. coli 70S ribosome

マップデータ

試料

複合体: Structure of tmRNA SmpB bound in state past E site of E. coli 70S ribosome
- 複合体: ribosome
  - RNA: x 4種
  - タンパク質・ペプチド: x 51種
- 複合体: nascent peptide
  - タンパク質・ペプチド: x 1種
- 複合体: SsrA-binding protein
  - タンパク質・ペプチド: x 1種
- 複合体: tmRNA
  - RNA: x 1種
リガンド: x 3種

キーワード

tmRNA SmpB trans-translation translation / RIBOSOME

機能・相同性

機能・相同性情報

trans-translation / negative regulation of cytoplasmic translational initiation / stringent response / ornithine decarboxylase inhibitor activity / transcription antitermination factor activity, RNA binding / misfolded RNA binding / Group I intron splicing / RNA folding / transcriptional attenuation / positive regulation of ribosome biogenesis ...trans-translation / negative regulation of cytoplasmic translational initiation / stringent response / ornithine decarboxylase inhibitor activity / transcription antitermination factor activity, RNA binding / misfolded RNA binding / Group I intron splicing / RNA folding / transcriptional attenuation / positive regulation of ribosome biogenesis / endoribonuclease inhibitor activity / RNA-binding transcription regulator activity / translational termination / negative regulation of cytoplasmic translation / four-way junction DNA binding / DnaA-L2 complex / translation repressor activity / negative regulation of translational initiation / regulation of mRNA stability / negative regulation of DNA-templated DNA replication initiation / mRNA regulatory element binding translation repressor activity / assembly of large subunit precursor of preribosome / positive regulation of RNA splicing / ribosome assembly / transcription elongation factor complex / regulation of DNA-templated transcription elongation / cytosolic ribosome assembly / response to reactive oxygen species / DNA endonuclease activity / transcription antitermination / translational initiation / regulation of cell growth / DNA-templated transcription termination / response to radiation / maintenance of translational fidelity / mRNA 5'-UTR binding / regulation of translation / ribosome biogenesis / large ribosomal subunit / transferase activity / ribosome binding / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / ribosomal large subunit assembly / cytosolic small ribosomal subunit / large ribosomal subunit rRNA binding / small ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic large ribosomal subunit / cytoplasmic translation / tRNA binding / negative regulation of translation / rRNA binding / ribosome / structural constituent of ribosome / translation / response to antibiotic / negative regulation of DNA-templated transcription / mRNA binding / DNA binding / RNA binding / zinc ion binding / membrane / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

SsrA-binding protein / SsrA-binding protein, conserved site / Small protein B / SmpB protein / SsrA-binding protein. / Ribosomal protein L10, eubacterial, conserved site / Ribosomal protein L10 signature. / Ribosomal protein L10 / : / Ribosomal protein S21, conserved site ...SsrA-binding protein / SsrA-binding protein, conserved site / Small protein B / SmpB protein / SsrA-binding protein. / Ribosomal protein L10, eubacterial, conserved site / Ribosomal protein L10 signature. / Ribosomal protein L10 / : / Ribosomal protein S21, conserved site / Ribosomal protein S21 signature. / Ribosomal protein L11, bacterial-type / Ribosomal protein L25, short-form / Ribosomal protein S14, bacterial/plastid / Ribosomal protein L31 type A / Ribosomal protein S21 superfamily / Ribosomal protein S16, conserved site / Ribosomal protein S16 signature. / Ribosomal protein S21 / Ribosomal protein L31 signature. / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L31 superfamily / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein S21 / Ribosomal protein L11, conserved site / Ribosomal protein L11 signature. / Ribosomal protein L10-like domain superfamily / Ribosomal protein L10P / Ribosomal protein L10 / : / Ribosomal protein L16 signature 1. / Ribosomal protein L21, conserved site / Ribosomal protein L21 signature. / Ribosomal protein L16 signature 2. / Ribosomal protein L16, conserved site / Ribosomal protein L6, conserved site / Ribosomal protein L6 signature 1. / : / Ribosomal protein L9 signature. / Ribosomal protein L9, bacteria/chloroplast / Ribosomal protein L9, C-terminal / Ribosomal protein L9, C-terminal domain / Ribosomal protein L9, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11, N-terminal / Ribosomal protein L11, N-terminal domain / Ribosomal protein L17 signature. / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L11, C-terminal / Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L11/L12 / Ribosomal protein L11, RNA binding domain / Ribosomal L25p family / Ribosomal protein L25 / Ribosomal protein L36 signature. / Ribosomal protein L32p, bacterial type / Ribosomal protein L28/L24 superfamily / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, N-terminal / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain superfamily / Ribosomal protein L9, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L9 / Ribosomal protein L9, N-terminal / Ribosomal protein L9, N-terminal domain / Ribosomal protein L33, conserved site / Ribosomal protein L33 signature. / Ribosomal protein L35, conserved site / Ribosomal protein L35 signature. / Ribosomal protein L28 / Ribosomal protein L35, non-mitochondrial / : / Ribosomal protein L5, bacterial-type / Ribosomal protein L18, bacterial-type / : / Ribosomal protein S19, bacterial-type / Ribosomal protein S3, bacterial-type / Ribosomal protein L6, bacterial-type / Ribosomal protein S13, bacterial-type / Ribosomal protein S6, conserved site / Ribosomal protein S6 signature. / Ribosomal protein S7, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / Ribosomal protein S9, bacterial/plastid / Ribosomal protein S11, bacterial-type / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein S20 superfamily / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein S4, bacterial-type / Ribosomal protein L36 superfamily / Ribosomal protein L36 / 30S ribosomal protein S17 / Ribosomal protein S5, bacterial-type / Ribosomal protein L19, conserved site / Ribosomal protein L19 signature. / Ribosomal protein L27, conserved site / Ribosomal protein L27 signature. / Ribosomal protein L20 signature. / Ribosomal protein L22, bacterial/chloroplast-type / Ribosomal protein L14P, bacterial-type / Ribosomal protein L34, conserved site
類似検索 - ドメイン・相同性

SsrA-binding protein / 30S ribosomal protein S12 / Small ribosomal subunit protein bS6 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein uL10 / Large ribosomal subunit protein uL11 / Large ribosomal subunit protein bL19 / Large ribosomal subunit protein bL20 / Large ribosomal subunit protein bL27 ...SsrA-binding protein / 30S ribosomal protein S12 / Small ribosomal subunit protein bS6 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein uL10 / Large ribosomal subunit protein uL11 / Large ribosomal subunit protein bL19 / Large ribosomal subunit protein bL20 / Large ribosomal subunit protein bL27 / Large ribosomal subunit protein bL28 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Large ribosomal subunit protein bL31 / Large ribosomal subunit protein bL32 / Large ribosomal subunit protein bL33 / Large ribosomal subunit protein bL34 / Large ribosomal subunit protein bL35 / Large ribosomal subunit protein bL36A / Large ribosomal subunit protein bL9 / Small ribosomal subunit protein uS10 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Small ribosomal subunit protein bS16 / Small ribosomal subunit protein bS18 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Small ribosomal subunit protein bS20 / Small ribosomal subunit protein uS2 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Small ribosomal subunit protein uS5 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein uS9 / SsrA-binding protein / Large ribosomal subunit protein uL13 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Small ribosomal subunit protein uS15 / Large ribosomal subunit protein bL17 / Large ribosomal subunit protein bL21 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Small ribosomal subunit protein bS21 / Large ribosomal subunit protein bL25
類似検索 - 構成要素

生物種

Escherichia coli (大腸菌)

手法

単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.7 Å

データ登録者

Rae CD

資金援助

英国, 2件

引用

ジャーナル: Science / 年: 2019
タイトル: How a circularized tmRNA moves through the ribosome.
著者: Christopher D Rae / Yuliya Gordiyenko / V Ramakrishnan /

要旨: During trans-translation, transfer-messenger RNA (tmRNA) and small protein B (SmpB) together rescue ribosomes stalled on a truncated mRNA and tag the nascent polypeptide for degradation. We used cryo- ...

履歴

登録	2018年12月17日	-
ヘッダ(付随情報) 公開	2019年4月17日	-
マップ公開	2019年4月17日	-
更新	2025年3月12日	-
現状	2025年3月12日	処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー	表面図（断面を密度値に従い着色）表面レベル: 0.05 UCSF Chimeraによる作画ダウンロード表面図（高さに従い着色）表面レベル: 0.05 UCSF Chimeraによる作画ダウンロードあてはめたモデルとの重ね合わせ原子モデル: PDB-6q9a 表面レベル: 0.05 UCSF Chimeraによる作画ダウンロードムービービューア
構造ビューア	EMマップ: SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像	emd_4478.png

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ダウンロードとリンク

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EMDBアーカイブ

マップデータ	emd_4478.map.gz	15.3 MB		EMDBマップデータ形式
ヘッダ (付随情報)	emd-4478-v30.xml emd-4478.xml	80.6 KB 80.6 KB	表示表示	EMDBヘッダ
画像	emd_4478.png	72.2 KB
Filedesc metadata	emd-4478.cif.gz	15.6 KB
アーカイブディレクトリ	http://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-4478 ftp://ftp.pdbj.org/pub/emdb/structures/EMD-4478	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	6q9aMC 4475C 4476C 4477C 6q95C 6q97C 6q98C M: このマップから作成された原子モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	21470 30598 5234 21494 2696 21468 1615 10073 0656 0101 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

EMDBのページ	EMDB (EBI/PDBe) / EMDataResource
「今月の分子」の関連する項目	#253 - 2021年1月エクスプレソーム (Expressome) 類似性 (86) #157 - 2013年1月転移伝令RNA (Transfer-Messenger RNA) 類似性 (85) #262 - 2021年10月 PDB構造への50年間のオープンアクセス (Fifty Years of Open Access to PDB Structures ) 類似性 (79) #121 - 2010年1月 70Sリボソーム (70S Ribosomes) 類似性 (19) #10 - 2000年10月リボソーム (Ribosome) 類似性 (1) #266 - 2022年2月オリゴ糖転移酵素 (Oligosaccharyltransferase) 類似性 (4) #161 - 2013年5月リシン (Ricin) 類似性 (3)

EMDBのページ

EMDB (EBI/PDBe) /

EMDataResource

「今月の分子」の関連する項目

#253 - 2021年1月
エクスプレソーム (Expressome)
類似性 (86)
#157 - 2013年1月
転移伝令RNA (Transfer-Messenger RNA)
類似性 (85)
#262 - 2021年10月
PDB構造への50年間のオープンアクセス (Fifty Years of Open Access to PDB Structures )
類似性 (79)
#121 - 2010年1月
70Sリボソーム (70S Ribosomes)
類似性 (19)
#10 - 2000年10月
リボソーム (Ribosome)
類似性 (1)
#266 - 2022年2月
オリゴ糖転移酵素 (Oligosaccharyltransferase)
類似性 (4)
#161 - 2013年5月
リシン (Ricin)
類似性 (3)

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マップ

ファイル

ダウンロード / ファイル: emd_4478.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 209.3 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)

投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他	反転上下逆

軸	Z (Sec.)	Y (Row.)	X (Col.)
	1.15 Å/pix. x 380 pix. = 437. Å	1.15 Å/pix. x 380 pix. = 437. Å	1.15 Å/pix. x 380 pix. = 437. Å
表面
投影像
断面 (1/3)
断面 (1/2)
断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズ

X=Y=Z: 1.15 Å

密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)

表面レベル	登録者による: 0.05 / ムービー #1: 0.05
最小 - 最大	-0.32681113 - 0.5167752
平均 (標準偏差)	0.0022349136 (±0.01764924)

対称性

空間群: 1

詳細

EMDB XML:

マップ形状

Axis order	X	Y	Z
Origin	0	0	0
サイズ	380	380	380
Spacing	380	380	380

セル

A=B=C: 437.0 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップヘッダ情報:

mode	Image stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z	1.15	1.15	1.15
M x/y/z	380	380	380
origin x/y/z	0.000	0.000	0.000
length x/y/z	437.000	437.000	437.000
α/β/γ	90.000	90.000	90.000
MAP C/R/S	1	2	3
start NC/NR/NS	0	0	0
NC/NR/NS	380	380	380
D min/max/mean	-0.327	0.517	0.002

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : Structure of tmRNA SmpB bound in state past E site of E. coli 70S...

全体	名称: Structure of tmRNA SmpB bound in state past E site of E. coli 70S ribosome
要素	複合体: Structure of tmRNA SmpB bound in state past E site of E. coli 70S ribosome 複合体: ribosome RNA: 23S ribosomal RNA RNA: 16S ribosomal RNA RNA: 5S ribosomal RNA RNA: P-site tRNA タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L2 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L3 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L4 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L5 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L6 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L9 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L10 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L11 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L13 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L14 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L15 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L16 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L17 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L18 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L19 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L20 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L21 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L22 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L23 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L24 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L25 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L27 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L28 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L29 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L30 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L31 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L32 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L33 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L34 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L35 タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L36 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S2 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S3 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S4 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S5 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S6 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S7 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S8 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S9 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S10 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S11 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S12 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S13 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S14 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S15 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S16 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S17 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S18 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S19 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S20 タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S21 複合体: nascent peptide タンパク質・ペプチド: Nascent peptide 複合体: SsrA-binding protein タンパク質・ペプチド: SsrA-binding protein 複合体: tmRNA RNA: tmRNA リガンド: MAGNESIUM ION リガンド: ZINC ION リガンド: water

全体

名称: Structure of tmRNA SmpB bound in state past E site of E. coli 70S ribosome

要素

複合体: Structure of tmRNA SmpB bound in state past E site of E. coli 70S ribosome
- 複合体: ribosome
  - RNA: 23S ribosomal RNA
  - RNA: 16S ribosomal RNA
  - RNA: 5S ribosomal RNA
  - RNA: P-site tRNA
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L2
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L3
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L4
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L5
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L6
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L9
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L10
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L11
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L13
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L14
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L15
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L16
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L17
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L18
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L19
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L20
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L21
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L22
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L23
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L24
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L25
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L27
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L28
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L29
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L30
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L31
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L32
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L33
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L34
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L35
  - タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L36
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S2
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S3
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S4
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S5
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S6
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S7
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S8
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S9
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S10
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S11
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S12
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S13
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S14
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S15
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S16
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S17
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S18
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S19
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S20
  - タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S21
- 複合体: nascent peptide
  - タンパク質・ペプチド: Nascent peptide
- 複合体: SsrA-binding protein
  - タンパク質・ペプチド: SsrA-binding protein
- 複合体: tmRNA
  - RNA: tmRNA
リガンド: MAGNESIUM ION
リガンド: ZINC ION
リガンド: water

+
超分子 #1: Structure of tmRNA SmpB bound in state past E site of E. coli 70S...

超分子	名称: Structure of tmRNA SmpB bound in state past E site of E. coli 70S ribosome タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#58

+
超分子 #2: ribosome

超分子	名称: ribosome / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#3, #5-#56
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #3: nascent peptide

超分子	名称: nascent peptide / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #4
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #4: SsrA-binding protein

超分子	名称: SsrA-binding protein / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #57
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #5: tmRNA

超分子	名称: tmRNA / タイプ: complex / ID: 5 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #58
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
分子 #1: 23S ribosomal RNA

分子	名称: 23S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 941.526438 KDa
配列	文字列: GGUUAAGCGA CUAAGCGUAC ACGGUGGAUG CCCUGGCAGU CAGAGGCGAU GAAGGACGUG CUAAUCUGCG AUAAGCGUCG GUAAGGUGA UAUGAACCGU UAUAACCGGC GAUUUCCGAA UGGGGAAACC CAGUGUGUUU CGACACACUA UCAUUAACUG A AUCCAUAG ...文字列: GGUUAAGCGA CUAAGCGUAC ACGGUGGAUG CCCUGGCAGU CAGAGGCGAU GAAGGACGUG CUAAUCUGCG AUAAGCGUCG GUAAGGUGA UAUGAACCGU UAUAACCGGC GAUUUCCGAA UGGGGAAACC CAGUGUGUUU CGACACACUA UCAUUAACUG A AUCCAUAG GUUAAUGAGG CGAACCGGGG GAACUGAAAC AUCUAAGUAC CCCGAGGAAA AGAAAUCAAC CGAGAUUCCC CC AGUAGCG GCGAGCGAAC GGGGAGCAGC CCAGAGCCUG AAUCAGUGUG UGUGUUAGUG GAAGCGUCUG GAAAGGCGCG CGA UACAGG GUGACAGCCC CGUACACAAA AAUGCACAUG CUGUGAGCUC GAUGAGUAGG GCGGGACACG UGGUAUCCUG UCUG AAUAU GGGGGGACCA UCCUCCAAGG CUAAAUACUC CUGACUGACC GAUAGUGAAC CAGUACCGUG AGGGAAAGGC GAAAA GAAC CCCGGCGAGG GGAGUGAAAA AGAACCUGAA ACCGUGUACG UACAAGCAGU GGGAGCACGC UUAGGCGUGU GACUGC GUA CCUUUUGUAU AAUGGGUCAG CGACUUAUAU UCUGUAGCAA GGUUAACCGA AUAGGGGAGC CGAAGGGAAA CCGAGUC UU AACUGGGCGU UAAGUUGCAG GGUAUAGACC CGAAACCCGG UGAUCUAGCC AUGGGCAGGU UGAAGGUUGG GUAACACU A ACUGGAGGAC CGAACCGACU AAU(1MG)(PSU)(5MU)GAAA AAUUAGCGGA UGACUUGUGG CUGGGGGUGA AAGGCCA AU CAAACCGGGA GAUAGCUGGU UCUCCCCGAA AGCUAUUUAG GUAGCGCCUC GUGAAUUCAU CUCCGGGGGU AGAGCACU G UUUCGGCAAG GGGGUCAACC CGACUUACCA ACCCGAUGCA AACUGCGAAU ACCGGAGAAU GUUAUCACGG GAGACACAC GGCGGG(PSU)GCU AACGUCCGUC GUGAAGAGGG AAACAACCCA GACCGCCAGC UAAGGUCCCA AAGUCAUGGU UAAGUG GGA AACGAUGUGG GAAGGCCCAG ACAGCCAGGA UGUUGGCUUA GAAGCAGCCA UCAUUUAAAG AAAGCGUAAU AGCUCAC UG GUCGAGUCGG CCUGCGCGGA AGAUGUAACG GGGCUAAACC AUGCACCGAA GCUGCGGCAG CGACGCUUAU GCGUUGUU G GGUAGGGGAG CGUUCUGUAA GCCUGCGAAG GUGUGCUGUG AGGCAUGCUG GAGGUAUCAG AAGUGCGAAU GCUGACAUA AGUAACGAUA AAGCGGGUGA AAAGCCCGCU CGCCGGAAGA CCAAGGGUUC CUGUCCAACG UUAAUCGGGG CAGGGUGAGU CGACCCCUA AGGCGAGGCC GAAAGGCGUA GUCGAUGGGA AACAGGUUAA UAUUCCUGUA CUUGGUGUUA CUGCGAAGGG G GGACGGAG AAGGCUAUGU UGGCCGGGCG ACGGUUGUCC CGGUUUAAGC GUGUAGGCUG GUUUUCCAGG CAAAUCCGGA AA AUCAAGG CUGAGGCGUG AUGACGAGGC ACUACGGUGC UGAAGCAACA AAUGCCCUGC UUCCAGGAAA AGCCUCUAAG CAU CAGGUA ACAUCAAAUC GUACCCCAAA CCGACAC(6MZ)GG UGGUCAGGUA GAGAAUACCA AGGCGCUUGA GAGAACUCGG GUGAAGGAA CUAGGCAAAA UGGUGCCGUA ACUUCGGGAG AAGGCACGCU GAUAUGUAGG UGAGGUCCCU CGCGGAUGGA G CUGAAAUC AGUCGAAGAU ACCAGCUGGC UGCAACUGUU UAUUAAAAAC ACAGCACUGU GCAAACACGA AAGUGGACGU AU ACGGUGU GACGCCU(2MG)CC CGGUGCCGGA AGGUUAAUUG AUGGGGUUAG CGCAAGCGAA GCUCUUGAUC GAAGCCCCG GUAAACGGCG GCCG(PSU)AAC(3TD)A (PSU)AACGGUCCU AAGGUAGCGA AA(5MU)UCCUUGU CGGGUAAGUU CCGA C(5MC)UGC ACGAAUGGCG UAAUGAUGGC CAGGCUGUCU CCACCCGAGA CUCAGUGAAA UUGAACUCGC UGUG(6MZ)AG AU GCAGUGUACC CGCGGCAAGA CGGAAAGACC CCGU(G7M)AACCU UUACUAUAGC UUGACACUGA ACAUUGAGCC UUGA UGUGU AGGAUAGGUG GGAGGCUUUG AAGUGUGGAC GCCAGUCUGC AUGGAGCCGA CCUUGAAAUA CCACCCUUUA AUGUU UGAU GUUCUAACGU UGACCCGUAA UCCGGGUUGC GGACAGUGUC UGGUGGGUAG UUUGACUG(OMG)G GCGGUCUCCU CC UAAAGAG UAACGGAGGA GCACGAAGGU UGGCUAAUCC UGGUCGGACA UCAGGAGGUU AGUGCAAUGG CAUAAGCCAG CUU GACUGC GAGCGUGACG GCGCGAGCAG GUGCGAAAGC AGGUCAUAGU GAUCCGGUGG UUCUGAAUGG AAGGGCCAUC GCUC AACGG AUAAAAGGUA CUCCG(2MG)GGAU AACAGGC(PSU)GA UACCGCCCAA GAGUUCAUAU CGACGGCGGU GUUUGGC A(OMC) CUCG(2MA)(PSU)GUCG GCUCAUCACA UCCUGGGGCU GAAGUAGGUC CCAAGGGUAU GGC(OMU)GUUCGC CA UUUAAAG UGGUACGCGA GC(PSU)GGGUUUA GAACGUCGUG AGACAGU(PSU)CG GUCCCUAUCU GCCGUGGGCG CUGGA GAAC UGAGGGGGGC UGCUCCUAGU ACGAGAGGAC CGGAGUGGAC GCAUCACUGG UGUUCGGGUU GUCAUGCCAA UGGCAC UGC CCGGUAGCUA AAUGCGGAAG AGAUAAGUGC UGAAAGCAUC UAAGCACGAA ACUUGCCCCG AGAUGAGUUC UCCCUGA CC CUUUAAGGGU CCUGAAGGAA CGUUGAAGAC GACGACGUUG AUAGGCCGGG UGUGUAAGCG CAGCGAUGCG UUGAGCUA A CCGGUACUAA UGAACCGUGA GGCUUAACCU

+
分子 #2: 16S ribosomal RNA

分子	名称: 16S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 2 / コピー数: 1
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 497.405969 KDa
配列	文字列: AAAUUGAAGA GUUUGAUCAU GGCUCAGAUU GAACGCUGGC GGCAGGCCUA ACACAUGCAA GUCGAACGGU AACAGGAAGA AGCUUGCUU CUUUGCUGAC GAGUGGCGGA CGGGUGAGUA AUGUCUGGGA AACUGCCUGA UGGAGGGGGA UAACUACUGG A AACGGUAG ...文字列: AAAUUGAAGA GUUUGAUCAU GGCUCAGAUU GAACGCUGGC GGCAGGCCUA ACACAUGCAA GUCGAACGGU AACAGGAAGA AGCUUGCUU CUUUGCUGAC GAGUGGCGGA CGGGUGAGUA AUGUCUGGGA AACUGCCUGA UGGAGGGGGA UAACUACUGG A AACGGUAG CUAAUACCGC AUAACGUCGC AAGACCAAAG AGGGGGACCU UCGGGCCUCU UGCCAUCGGA UGUGCCCAGA UG GGAUUAG CUAGUAGGUG GGGUAACGGC UCACCUAGGC GACGAUCCCU AGCUGGUCUG AGAGGAUGAC CAGCCACACU GGA ACUGAG ACACGGUCCA GACUCCUACG GGAGGCAGCA GUGGGGAAUA UUGCACAAUG GGCGCAAGCC UGAUGCAGCC AUGC CGCGU GUAUGAAGAA GGCCUUCGGG UUGUAAAGUA CUUUCAGCGG GGAGGAAGGG AGUAAAGUUA AUACCUUUGC UCAUU GACG UUACCCGCAG AAGAAGCACC GGCUAACUCC G(PSU)GCCAGCAG CC(7MG)CGGUAAU ACGGAGGGUG CAAGCGUU A AUCGGAAUUA CUGGGCGUAA AGCGCACGCA GGCGGUUUGU UAAGUCAGAU GUGAAAUCCC CGGGCUCAAC CUGGGAACU GCAUCUGAUA CUGGCAAGCU UGAGUCUCGU AGAGGGGGGU AGAAUUCCAG GUGUAGCGGU GAAAUGCGUA GAGAUCUGGA GGAAUACCG GUGGCGAAGG CGGCCCCCUG GACGAAGACU GACGCUCAGG UGCGAAAGCG UGGGGAGCAA ACAGGAUUAG A UACCCUGG UAGUCCACGC CGUAAACGAU GUCGACUUGG AGGUUGUGCC CUUGAGGCGU GGCUUCCGGA GCUAACGCGU UA AGUCGAC CGCCUGGGGA GUACGGCCGC AAGGUUAAAA CUCAAAUGAA UUGACGGGGG CCCGCACAAG CGGUGGAGCA UGU GGUUUA AUUCGAU(2MG)(5MC)A ACGCGAAGAA CCUUACCUGG UCUUGACAUC CACGGAAGUU UUCAGAGAUG AGAAUG UGC CUUCGGGAAC CGUGAGACAG GUGCUGCAUG GCUGUCGUCA GCUCGUGUUG UGAAAUGUUG GGUUAAGUCC CGCAACG AG CGCAACCCUU AUCCUUUGUU GCCAGCGGUC CGGCCGGGAA CUCAAAGGAG ACUGCCAGUG AUAAACUGGA GGAAGGUG G GGAUGACGUC AAGUCAUCAU G(2MG)CCCUUACG ACCAGGGCUA CACACGUGCU ACAAUGGCGC AUACAAAGAG AAGCG ACCU CGCGAGAGCA AGCGGACCUC AUAAAGUGCG UCGUAGUCCG GAUUGGAGUC UGCAACUCGA CUCCAUGAAG UCGGAA UCG CUAGUAAUCG UGGAUCAGAA UGCCACGGUG AAUACGUUCC CGGGCCUUGU ACACACCG(4OC)C CGU(5MC)ACACC AUGGGAGUGG GUUGCAAAAG AAGUAGGUAG CUUAACCUUC GGGAGGGCGC UUACCACUUU GUGAUUCAUG ACUGGGGUGA AGUCG(UR3)AAC AAGGUAACCG UAGG(2MG)G(MA6)(MA6)CC UGCGGUUGGA UCA

+
分子 #3: 5S ribosomal RNA

分子	名称: 5S ribosomal RNA / タイプ: rna / ID: 3 / コピー数: 1
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 38.79009 KDa
配列	文字列: UGCCUGGCGG CCGUAGCGCG GUGGUCCCAC CUGACCCCAU GCCGAACUCA GAAGUGAAAC GCCGUAGCGC CGAUGGUAGU GUGGGGUCU CCCCAUGCGA GAGUAGGGAA CUGCCAGGCA U

+
分子 #5: P-site tRNA

分子	名称: P-site tRNA / タイプ: rna / ID: 5 / コピー数: 1
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 24.476531 KDa
配列	文字列: GGGGCUAUAG CUCAGCUGGG AGAGCGCCUG CUUUGCACGC AGGAGGUCUG CGGUUCGAUC CCGCAUAGCU CCACCA

+
分子 #58: tmRNA

分子	名称: tmRNA / タイプ: rna / ID: 58 / コピー数: 1
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 117.198266 KDa
配列	文字列: GGGGCUGAUU CUGGAUUCGA CGGGAUUUGC GAAACCCAAG GUGCAUGCCG AGGGGCGGUU GGCCUCGUAA AAAGCCGCAA AAAAUAGUC GCAAACGACG AAAACUACGC UUUAGCAGCU UAAUAACCUG CUUAGAGCCC UCUCUCCCUA GCCUCCGCUC U UAGGACGG ...文字列: GGGGCUGAUU CUGGAUUCGA CGGGAUUUGC GAAACCCAAG GUGCAUGCCG AGGGGCGGUU GGCCUCGUAA AAAGCCGCAA AAAAUAGUC GCAAACGACG AAAACUACGC UUUAGCAGCU UAAUAACCUG CUUAGAGCCC UCUCUCCCUA GCCUCCGCUC U UAGGACGG GGAUCAAGAG AGGUCAAACC CAAAAGAGAU CGCGUGGAAG CCCUGCCUGG GGUUGAAGCG UUAAAACUUA AU CAGGCUA GUUUGUUAGU GGCGUGUCCG UCCGCAGCUG GCAAGCGAAU GUAAAGACUG ACUAAGCAUG UAGUACCGAG GAU GUAGGA AUUUCGGACG CGGGUUCAAC UCCCGCCAGC UCCACCA GENBANK: GENBANK: CP031609.1

+
分子 #4: Nascent peptide

分子	名称: Nascent peptide / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 1.652805 KDa
組換発現	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列	文字列: AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAA

+
分子 #6: 50S ribosomal protein L2

分子	名称: 50S ribosomal protein L2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 29.663244 KDa
配列	文字列: AVVKCKPTSP GRRHVVKVVN PELHKGKPFA PLLEKNSKSG GRNNNGRITT RHIGGGHKQA YRIVDFKRNK DGIPAVVERL EYDPNRSAN IALVLYKDGE RRYILAPKGL KAGDQIQSGV DAAIKPGNTL PMRNIPVGST VHNVEMKPGK GGQLARSAGT Y VQIVARDG ...文字列: AVVKCKPTSP GRRHVVKVVN PELHKGKPFA PLLEKNSKSG GRNNNGRITT RHIGGGHKQA YRIVDFKRNK DGIPAVVERL EYDPNRSAN IALVLYKDGE RRYILAPKGL KAGDQIQSGV DAAIKPGNTL PMRNIPVGST VHNVEMKPGK GGQLARSAGT Y VQIVARDG AYVTLRLRSG EMRKVEADCR ATLGEVGNAE HMLRVLGKAG AARWRGVRPT VRGTAMNPVD HPHGGGEGRN FG KHPVTPW GVQTKGKKTR SNKRTDKFIV RRRS UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2

+
分子 #7: 50S ribosomal protein L3

分子	名称: 50S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 22.07526 KDa
配列	文字列: IGLVGKKVGM TRIFTEDGVS IPVTVIEVEA NRVTQVKDLA NDGYRAIQVT TGAKKANRVT KPEAGHFAKA GVEAGRGLWE FRLAEGEEF TVGQSISVEL FADVKKVDVT GTSKGKGFAG TVKRWNFRTQ DATHGNSLSH RVPGSIGQNQ TPGKVFKGKK M AGQMGNER ...文字列: IGLVGKKVGM TRIFTEDGVS IPVTVIEVEA NRVTQVKDLA NDGYRAIQVT TGAKKANRVT KPEAGHFAKA GVEAGRGLWE FRLAEGEEF TVGQSISVEL FADVKKVDVT GTSKGKGFAG TVKRWNFRTQ DATHGNSLSH RVPGSIGQNQ TPGKVFKGKK M AGQMGNER VTVQSLDVVR VDAERNLLLV KGAVPGATGS DLIVKPAVK UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3

+
分子 #8: 50S ribosomal protein L4

分子	名称: 50S ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 22.121566 KDa
配列	文字列: MELVLKDAQS ALTVSETTFG RDFNEALVHQ VVVAYAAGAR QGTRAQKTRA EVTGSGKKPW RQKGTGRARS GSIKSPIWRS GGVTFAARP QDHSQKVNKK MYRGALKSIL SELVRQDRLI VVEKFSVEAP KTKLLAQKLK DMALEDVLII TGELDENLFL A ARNLHKVD ...文字列: MELVLKDAQS ALTVSETTFG RDFNEALVHQ VVVAYAAGAR QGTRAQKTRA EVTGSGKKPW RQKGTGRARS GSIKSPIWRS GGVTFAARP QDHSQKVNKK MYRGALKSIL SELVRQDRLI VVEKFSVEAP KTKLLAQKLK DMALEDVLII TGELDENLFL A ARNLHKVD VRDATGIDPV SLIAFDKVVM TADAVKQVEE MLA UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4

+
分子 #9: 50S ribosomal protein L5

分子	名称: 50S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 20.073234 KDa
配列	文字列: AKLHDYYKDE VVKKLMTEFN YNSVMQVPRV EKITLNMGVG EAIADKKLLD NAAADLAAIS GQKPLITKAR KSVAGFKIRQ GYPIGCKVT LRGERMWEFF ERLITIAVPR IRDFRGLSAK SFDGRGNYSM GVREQIIFPE IDYDKVDRVR GLDITITTTA K SDEEGRAL LAAFDFPFR UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5

+
分子 #10: 50S ribosomal protein L6

分子	名称: 50S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 18.672418 KDa
配列	文字列: SRVAKAPVVV PAGVDVKING QVITIKGKNG ELTRTLNDAV EVKHADNTLT FGPRDGYADG WAQAGTARAL LNSMVIGVTE GFTKKLQLV GVGYRAAVKG NVINLSLGFS HPVDHQLPAG ITAECPTQTE IVLKGADKQV IGQVAADLRA YRRPEPYKGK G VRYADEVV RTKEAKK UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6

+
分子 #11: 50S ribosomal protein L9

分子	名称: 50S ribosomal protein L9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 15.659906 KDa
配列	文字列: MQVILLDKVA NLGSLGDQVN VKAGYARNFL VPQGKAVPAT KKNIEFFEAR RAELEAKLAE VLAAANARAE KINALETVTI ASKAGDEGK LFGSIGTRDI ADAVTAAGVE VAKSEVRLPN GVLRTTGEHE VSFQVHSEVF AKVIVNVVA UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL9

+
分子 #12: 50S ribosomal protein L10

分子	名称: 50S ribosomal protein L10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 13.981147 KDa
配列	文字列: ALNLQDKQAI VAEVSEVAKG ALSAVVADSR GVTVDKMTEL RKAGREAGVY MRVVRNTLLR RAVEGTPFEC LKDAFVGPTL IAYSMEHPG AAARLFKEFA KANAKFEVKA AAFEGELIPA SQIDRLATLP T UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL10

+
分子 #13: 50S ribosomal protein L11

分子	名称: 50S ribosomal protein L11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 14.090395 KDa
配列	文字列: QAYVKLQVAA GMANPSPPVG PALGQQGVNI MEFCKAFNAK TDSIEKGLPI PVVITVYADR SFTFVTKTPP AAVLLKKAAG IKSGSGKPN KDKVGKISRA QLQEIAQTKA ADMTGADIEA MTRSIEGTAR SMGLVV UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL11

+
分子 #14: 50S ribosomal protein L13

分子	名称: 50S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 16.050606 KDa
配列	文字列: MKTFTAKPET VKRDWYVVDA TGKTLGRLAT ELARRLRGKH KAEYTPHVDT GDYIIVLNAD KVAVTGNKRT DKVYYHHTGH IGGIKQATF EEMIARRPER VIEIAVKGML PKGPLGRAMF RKLKVYAGNE HNHAAQQPQV LDI UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL13

+
分子 #15: 50S ribosomal protein L14

分子	名称: 50S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 13.565067 KDa
配列	文字列: MIQEQTMLNV ADNSGARRVM CIKVLGGSHR RYAGVGDIIK ITIKEAIPRG KVKKGDVLKA VVVRTKKGVR RPDGSVIRFD GNACVLLNN NSEQPIGTRI FGPVTRELRS EKFMKIISLA PEVL UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14

+
分子 #16: 50S ribosomal protein L15

分子	名称: 50S ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 14.879357 KDa
配列	文字列: MRLNTLSPAE GSKKAGKRLG RGIGSGLGKT GGRGHKGQKS RSGGGVRRGF EGGQMPLYRR LPKFGFTSRK AAITAEIRLS DLAKVEGGV VDLNTLKAAN IIGIQIEFAK VILAGEVTTP VTVRGLRVTK GARAAIEAAG GKIE UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15

+
分子 #17: 50S ribosomal protein L16

分子	名称: 50S ribosomal protein L16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 15.181072 KDa
配列	文字列: MLQPKRTKFR KMHKGRNRGL AQGTDVSFGS FGLKAVGRGR LTARQIEAAR RAMTRAVKRQ GKIWIRVFPD KPITEKPLAV RMGKGKGNV EYWVALIQPG KVLYEMDGVP EELAREAFKL AAAKLPIKTT FVTKTV UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16

+
分子 #18: 50S ribosomal protein L17

分子	名称: 50S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 13.592823 KDa
配列	文字列: MRHRKSGRQL NRNSSHRQAM FRNMAGSLVR HEIIKTTLPK AKELRRVVEP LITLAKTDSV ANRRLAFART RDNEIVAKLF NELGPRFAS RAGGYTRILK CGFRAGDNAP MAYIELVDRS UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL17

+
分子 #19: 50S ribosomal protein L18

分子	名称: 50S ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 12.548383 KDa
配列	文字列: KKSARIRRAT RARRKLQELG ATRLVVHRTP RHIYAQVIAP NGSEVLVAAS TVEKAIAEQL KYTGNKDAAA AVGKAVAERA LEKGIKDVS FDRSGFQYHG RVQALADAAR EAGLQF UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18

+
分子 #20: 50S ribosomal protein L19

分子	名称: 50S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 12.913979 KDa
配列	文字列: SNIIKQLEQE QMKQDVPSFR PGDTVEVKVW VVEGSKKRLQ AFEGVVIAIR NRGLHSAFTV RKISNGEGVE RVFQTHSPVV DSISVKRRG AVRKAKLYYL RERTGKAARI KERL UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL19

+
分子 #21: 50S ribosomal protein L20

分子	名称: 50S ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 13.396828 KDa
配列	文字列: ARVKRGVIAR ARHKKILKQA KGYYGARSRV YRVAFQAVIK AGQYAYRDRR QRKRQFRQLW IARINAAARQ NGISYSKFIN GLKKASVEI DRKILADIAV FDKVAFTALV EKAKAALA UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL20

+
分子 #22: 50S ribosomal protein L21

分子	名称: 50S ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 22 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 11.515297 KDa
配列	文字列: MYAVFQSGGK QHRVSEGQTV RLEKLDIATG ETVEFAEVLM IANGEEVKIG VPFVDGGVIK AEVVAHGRGE KVKIVKFRRR KHYRKQQGH RQWFTDVKIT GIS UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21

+
分子 #23: 50S ribosomal protein L22

分子	名称: 50S ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 23 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 12.096166 KDa
配列	文字列: METIAKHRHA RSSAQKVRLV ADLIRGKKVS QALDILTYTN KKAAVLVKKV LESAIANAEH NDGADIDDLK VTKIFVDEGP SMKRIMPRA KGRADRILKR TSHITVVVSD UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22

+
分子 #24: 50S ribosomal protein L23

分子	名称: 50S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 24 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 10.66156 KDa
配列	文字列: MIREERLLKV LRAPHVSEKA STAMEKSNTI VLKVAKDATK AEIKAAVQKL FEVEVEVVNT LVVKGKVKRH GQRIGRRSDW KKAYVTLKE GQNLD UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23

+
分子 #25: 50S ribosomal protein L24

分子	名称: 50S ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 11.007797 KDa
配列	文字列: AKIRRDDEVI VLTGKDKGKR GKVKNVLSSG KVIVEGINLV KKHQKPVPAL NQPGGIVEKE AAIQVSNVAI FNAATGKADR VGFRFEDGK KVRFFKSNSE TI UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24

+
分子 #26: 50S ribosomal protein L25

分子	名称: 50S ribosomal protein L25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 10.642387 KDa
配列	文字列: MFTINAEVRK EQGKGASRRL RAANKFPAII YGGKEAPLAI ELDHDKVMNM QAKAEFYSEV LTIVVDGKEI KVKAQDVQRH PYKPKLQHI DFVR UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL25

+
分子 #27: 50S ribosomal protein L27

分子	名称: 50S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 8.146384 KDa
配列	文字列: TRNGRDSEAK RLGVKRFGGE SVLAGSIIVR QRGTKFHAGA NVGCGRDHTL FAKADGKVKF EVKGPKNRKF ISIEA UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL27

+
分子 #28: 50S ribosomal protein L28

分子	名称: 50S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 8.896354 KDa
配列	文字列: SRVCQVTGKR PVTGNNRSHA LNATKRRFLP NLHSHRFWVE SEKRFVTLRV SAKGMRVIDK KGIDTVLAEL RARGEKY UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL28

+
分子 #29: 50S ribosomal protein L29

分子	名称: 50S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 7.155267 KDa
配列	文字列: KAKELREKSV EELNTELLNL LREQFNLRMQ AASGQLQQSH LLKQVRRDVA RVKTLLNEKA GA UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29

+
分子 #30: 50S ribosomal protein L30

分子	名称: 50S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 6.223433 KDa
配列	文字列: KTIKITQTRS AIGRLPKHKA TLLGLGLRRI GHTVEREDTP AIRGMINAVS FMVKVE UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30

+
分子 #31: 50S ribosomal protein L31

分子	名称: 50S ribosomal protein L31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 7.516693 KDa
配列	文字列: MKKDIHPKYE EITASCSCGN VMKIRSTVGH DLNLDVCSKC HPFFTGKQRD VATGGRVDRF NKRFNI UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL31

+
分子 #32: 50S ribosomal protein L32

分子	名称: 50S ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 6.203069 KDa
配列	文字列: AVQQNKPTRS KRGMRRSHDA LTAVTSLSVD KTSGEKHLRH HITADGYYRG RKVIA UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL32

+
分子 #33: 50S ribosomal protein L33

分子	名称: 50S ribosomal protein L33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 5.928 KDa
配列	文字列: GIREKIKLVS SAGTGHFYTT TKNKRTKPEK LELKKFDPVV RQHVIYKEAK I UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL33

+
分子 #34: 50S ribosomal protein L34

分子	名称: 50S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 34 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 5.268283 KDa
配列	文字列: MKRTFQPSVL KRNRSHGFRA RMATKNGRQV LARRRAKGRA RLTVS UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL34

+
分子 #35: 50S ribosomal protein L35

分子	名称: 50S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 35 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 7.181835 KDa
配列	文字列: PKIKTVRGAA KRFKKTGKGG FKHKHANLRH ILTKKATKRK RHLRPKAMVS KGDLGLVIAC LPYA UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL35

+
分子 #36: 50S ribosomal protein L36

分子	名称: 50S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 4.37739 KDa
配列	文字列: MKVRASVKKL CRNCKIVKRD GVIRVICSAE PKHKQRQG UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL36A

+
分子 #37: 30S ribosomal protein S2

分子	名称: 30S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 25.072867 KDa
配列	文字列: TVSMRDMLKA GVHFGHQTRY WNPKMKPFIF GARNKVHIIN LEKTVPMFNE ALAELNKIAS RKGKILFVGT KRAASEAVKD AALSCDQFF VNHRWLGGML TNWKTVRQSI KRLKDLETQS QDGTFDKLTK KEALMRTREL EKLENSLGGI KDMGGLPDAL F VIDADHEH ...文字列: TVSMRDMLKA GVHFGHQTRY WNPKMKPFIF GARNKVHIIN LEKTVPMFNE ALAELNKIAS RKGKILFVGT KRAASEAVKD AALSCDQFF VNHRWLGGML TNWKTVRQSI KRLKDLETQS QDGTFDKLTK KEALMRTREL EKLENSLGGI KDMGGLPDAL F VIDADHEH IAIKEANNLG IPVFAIVDTN SDPDGVDFVI PGNDDAIRAV TLYLGAVAAT VREGRSQ UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS2

+
分子 #38: 30S ribosomal protein S3

分子	名称: 30S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 23.248994 KDa
配列	文字列: GQKVHPNGIR LGIVKPWNST WFANTKEFAD NLDSDFKVRQ YLTKELAKAS VSRIVIERPA KSIRVTIHTA RPGIVIGKKG EDVEKLRKV VADIAGVPAQ INIAEVRKPE LDAKLVADSI TSQLERRVMF RRAMKRAVQN AMRLGAKGIK VEVSGRLGGA E IARTEWYR ...文字列: GQKVHPNGIR LGIVKPWNST WFANTKEFAD NLDSDFKVRQ YLTKELAKAS VSRIVIERPA KSIRVTIHTA RPGIVIGKKG EDVEKLRKV VADIAGVPAQ INIAEVRKPE LDAKLVADSI TSQLERRVMF RRAMKRAVQN AMRLGAKGIK VEVSGRLGGA E IARTEWYR EGRVPLHTLR ADIDYNTSEA HTTYGVIGVK VWIFKGEILG UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3

+
分子 #39: 30S ribosomal protein S4

分子	名称: 30S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 23.383002 KDa
配列	文字列: ARYLGPKLKL SRREGTDLFL KSGVRAIDTK CKIEQAPGQH GARKPRLSDY GVQLREKQKV RRIYGVLERQ FRNYYKEAAR LKGNTGENL LALLEGRLDN VVYRMGFGAT RAEARQLVSH KAIMVNGRVV NIASYQVSPN DVVSIREKAK KQSRVKAALE L AEQREKPT ...文字列: ARYLGPKLKL SRREGTDLFL KSGVRAIDTK CKIEQAPGQH GARKPRLSDY GVQLREKQKV RRIYGVLERQ FRNYYKEAAR LKGNTGENL LALLEGRLDN VVYRMGFGAT RAEARQLVSH KAIMVNGRVV NIASYQVSPN DVVSIREKAK KQSRVKAALE L AEQREKPT WLEVDAGKME GTFKRKPERS DLSADINEHL IVELYSK UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4

+
分子 #40: 30S ribosomal protein S5

分子	名称: 30S ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 16.475037 KDa
配列	文字列: ELQEKLIAVN RVSKTVKGGR IFSFTALTVV GDGNGRVGFG YGKAREVPAA IQKAMEKARR NMINVALNNG TLQHPVKGVH TGSRVFMQP ASEGTGIIAG GAMRAVLEVA GVHNVLAKAY GSTNPINVVR ATIDGLENMN SPEMVAAKRG KSVEEIL UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS5

+
分子 #41: 30S ribosomal protein S6

分子	名称: 30S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 12.125993 KDa
配列	文字列: MRHYEIVFMV HPDQSEQVPG MIERYTAAIT GAEGKIHRLE DWGRRQLAYP INKLHKAHYV LMNVEAPQEV IDELETTFRF NDAVIRSMV MRTKHAVTEA SPMVK UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS6

+
分子 #42: 30S ribosomal protein S7

分子	名称: 30S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 16.99967 KDa
配列	文字列: PRRRVIGQRK ILPDPKFGSE LLAKFVNILM VDGKKSTAES IVYSALETLA QRSGKSELEA FEVALENVRP TVEVKSRRVG GSTYQVPVE VRPVRRNALA MRWIVEAARK RGDKSMALRL ANELSDAAEN KGTAVKKRED VHRMAEANKA FAH UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7

+
分子 #43: 30S ribosomal protein S8

分子	名称: 30S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 14.015361 KDa
配列	文字列: SMQDPIADML TRIRNGQAAN KAAVTMPSSK LKVAIANVLK EEGFIEDFKV EGDTKPELEL TLKYFQGKAV VESIQRVSRP GLRIYKRKD ELPKVMAGLG IAVVSTSKGV MTDRAARQAG LGGEIICYVA UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8

+
分子 #44: 30S ribosomal protein S9

分子	名称: 30S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 14.554882 KDa
配列	文字列: NQYYGTGRRK SSAARVFIKP GNGKIVINQR SLEQYFGRET ARMVVRQPLE LVDMVEKLDL YITVKGGGIS GQAGAIRHGI TRALMEYDE SLRSELRKAG FVTRDARQVE RKKVGLRKAR RRPQFSKR UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9

+
分子 #45: 30S ribosomal protein S10

分子	名称: 30S ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 11.254041 KDa
配列	文字列: RIRIRLKAFD HRLIDQATAE IVETAKRTGA QVRGPIPLPT RKERFTVLIS PHVNKDARDQ YEIRTHLRLV DIVEPTEKTV DALMRLDLA AGVDVQISLG UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS10

+
分子 #46: 30S ribosomal protein S11

分子	名称: 30S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 12.388068 KDa
配列	文字列: RKQVSDGVAH IHASFNNTIV TITDRQGNAL GWATAGGSGF RGSRKSTPFA AQVAAERCAD AVKEYGIKNL EVMVKGPGPG RESTIRALN AAGFRITNIT DVTPIPHNGC RPPKKRR UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS11

+
分子 #47: 30S ribosomal protein S12

分子	名称: 30S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 13.611976 KDa
配列	文字列: ATVNQLVRKP RARKVAKSNV PALEACPQKR GVCTRVYTTT PKKPNSALRK VCRVRLTNGF EVTSYIGGEG HNLQEHSVIL IRGGRVK(0TD)L PGVRYHTVRG ALDCSGVKDR KQARSKYGVK RPK UniProtKB: 30S ribosomal protein S12

+
分子 #48: 30S ribosomal protein S13

分子	名称: 30S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 12.868091 KDa
配列	文字列: ARIAGINIPD HKHAVIALTS IYGVGKTRSK AILAAAGIAE DVKISELSEG QIDTLRDEVA KFVVEGDLRR EISMSIKRLM DLGCYRGLR HRRGLPVRGQ RTKTNARTRK GPRKPIK UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13

+
分子 #49: 30S ribosomal protein S14

分子	名称: 30S ribosomal protein S14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 11.475364 KDa
配列	文字列: AKQSMKAREV KRVALADKYF AKRAELKAII SDVNASDEDR WNAVLKLQTL PRDSSPSRQR NRCRQTGRPH GFLRKFGLSR IKVREAAMR GEIPGLKKAS W UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14

+
分子 #50: 30S ribosomal protein S15

分子	名称: 30S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 10.072543 KDa
配列	文字列: LSTEATAKIV SEFGRDANDT GSTEVQVALL TAQINHLQGH FAEHKKDHHS RRGLLRMVSQ RRKLLDYLKR KDVARYTQLI ERLGLRR UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15

+
分子 #51: 30S ribosomal protein S16

分子	名称: 30S ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 9.207572 KDa
配列	文字列: MVTIRLARHG AKKRPFYQVV VADSRNARNG RFIERVGFFN PIASEKEEGT RLDLDRIAHW VGQGATISDR VAALIKEVNK AA UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS16

+
分子 #52: 30S ribosomal protein S17

分子	名称: 30S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 9.263946 KDa
配列	文字列: KIRTLQGRVV SDKMEKSIVV AIERFVKHPI YGKFIKRTTK LHVHDENNEC GIGDVVEIRE CRPLSKTKSW TLVRVVEKAV UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17

+
分子 #53: 30S ribosomal protein S18

分子	名称: 30S ribosomal protein S18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 7.734896 KDa
配列	文字列: FCRFTAEGVQ EIDYKDIATL KNYITESGKI VPSRITGTRA KYQRQLARAI KRARYLSLLP YTDRHQ UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS18

+
分子 #54: 30S ribosomal protein S19

分子	名称: 30S ribosomal protein S19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 9.421018 KDa
配列	文字列: PRSLKKGPFI DLHLLKKVEK AVESGDKKPL RTWSRRSTIF PNMIGLTIAV HNGRQHVPVF VTDEMVGHKL GEFAPTRTYR GHA UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19

+
分子 #55: 30S ribosomal protein S20

分子	名称: 30S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 9.50619 KDa
配列	文字列: ANIKSAKKRA IQSEKARKHN ASRRSMMRTF IKKVYAAIEA GDKAAAQKAF NEMQPIVDRQ AAKGLIHKNK AARHKANLTA QINKL UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS20

+
分子 #56: 30S ribosomal protein S21

分子	名称: 30S ribosomal protein S21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 8.392844 KDa
配列	文字列: PVIKVRENEP FDVALRRFKR SCEKAGVLAE VRRREFYEKP TTERKRAKAS AVKRHAKKLA RENARRTRLY UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS21

+
分子 #57: SsrA-binding protein

分子	名称: SsrA-binding protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量	理論値: 13.350365 KDa
組換発現	生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列	文字列: IALNKRARHE YFIEEEFEAG LALQGWEVKS LRAGKANISD SYVLLRDGEA FLFGANITPM AVASTHVVCD PTRTRKLLLN QRELDSLYG RVNREGYTVV ALSLYWKNAW CKVKIGVAK UniProtKB: SsrA-binding protein

+
分子 #59: MAGNESIUM ION

+
分子 #60: ZINC ION

+
分子 #61: water

-
実験情報

-
構造解析

手法	クライオ電子顕微鏡法
解析	単粒子再構成法
試料の集合状態	particle

-
試料調製

緩衝液	pH: 7.4
凍結	凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡	FEI POLARA 300
撮影	フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k) 平均電子線量: 60.0 e/Å²
電子線	加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系	照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD
実験機器	モデル: Tecnai Polara / 画像提供: FEI Company

+
画像解析

初期モデル	モデルのタイプ: PDB ENTRY
最終再構成	解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.7 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / ソフトウェア - 名称: RELION / 使用した粒子像数: 47115
初期角度割当	タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION
最終角度割当	タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION
最終 3次元分類	ソフトウェア - 名称: RELION

-
原子モデル構築 1

初期モデル	PDB ID: 5mdz Chain - Source name: PDB / Chain - Initial model type: experimental model
得られたモデル	PDB-6q9a: Structure of tmRNA SmpB bound past E site of E. coli 70S ribosome

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

分子	名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 59 / コピー数: 437 / 式: MG
分子量	理論値: 24.305 Da

分子	名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 60 / コピー数: 2 / 式: ZN
分子量	理論値: 65.409 Da

分子	名称: water / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 2 / 式: HOH
分子量	理論値: 18.015 Da
Chemical component information	ChemComp-HOH: WATER

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+全体 : Structure of tmRNA SmpB bound in state past E site of E. coli 70S...

+超分子 #1: Structure of tmRNA SmpB bound in state past E site of E. coli 70S...

+超分子 #2: ribosome

+超分子 #3: nascent peptide

+超分子 #4: SsrA-binding protein

+超分子 #5: tmRNA

+分子 #1: 23S ribosomal RNA

+分子 #2: 16S ribosomal RNA

+分子 #3: 5S ribosomal RNA

+分子 #5: P-site tRNA

+分子 #58: tmRNA

+分子 #4: Nascent peptide

+分子 #6: 50S ribosomal protein L2

+分子 #7: 50S ribosomal protein L3

+分子 #8: 50S ribosomal protein L4

+分子 #9: 50S ribosomal protein L5

+分子 #10: 50S ribosomal protein L6

+分子 #11: 50S ribosomal protein L9

+分子 #12: 50S ribosomal protein L10

+分子 #13: 50S ribosomal protein L11

+分子 #14: 50S ribosomal protein L13

+分子 #15: 50S ribosomal protein L14

+分子 #16: 50S ribosomal protein L15

+分子 #17: 50S ribosomal protein L16

+分子 #18: 50S ribosomal protein L17

+分子 #19: 50S ribosomal protein L18

+分子 #20: 50S ribosomal protein L19

+分子 #21: 50S ribosomal protein L20

+分子 #22: 50S ribosomal protein L21

+分子 #23: 50S ribosomal protein L22

+分子 #24: 50S ribosomal protein L23

+分子 #25: 50S ribosomal protein L24

+分子 #26: 50S ribosomal protein L25

+分子 #27: 50S ribosomal protein L27

+分子 #28: 50S ribosomal protein L28

+分子 #29: 50S ribosomal protein L29

+分子 #30: 50S ribosomal protein L30

+分子 #31: 50S ribosomal protein L31

+分子 #32: 50S ribosomal protein L32

+分子 #33: 50S ribosomal protein L33

+分子 #34: 50S ribosomal protein L34

+分子 #35: 50S ribosomal protein L35

+分子 #36: 50S ribosomal protein L36

+分子 #37: 30S ribosomal protein S2

+分子 #38: 30S ribosomal protein S3

+分子 #39: 30S ribosomal protein S4

+分子 #40: 30S ribosomal protein S5

+分子 #41: 30S ribosomal protein S6

+分子 #42: 30S ribosomal protein S7

+分子 #43: 30S ribosomal protein S8

+分子 #44: 30S ribosomal protein S9

+分子 #45: 30S ribosomal protein S10

+分子 #46: 30S ribosomal protein S11

+分子 #47: 30S ribosomal protein S12

+分子 #48: 30S ribosomal protein S13

+分子 #49: 30S ribosomal protein S14

+分子 #50: 30S ribosomal protein S15

+分子 #51: 30S ribosomal protein S16

+分子 #52: 30S ribosomal protein S17

+分子 #53: 30S ribosomal protein S18

+分子 #54: 30S ribosomal protein S19

+分子 #55: 30S ribosomal protein S20

+分子 #56: 30S ribosomal protein S21

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