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- EMDB-4475: Structure of tmRNA SmpB bound in A site of T. thermophilus 70S ri... -

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基本情報

登録情報
データベース: EMDB / ID: EMD-4475
タイトルStructure of tmRNA SmpB bound in A site of T. thermophilus 70S ribosome
マップデータ
試料
  • 複合体: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site
    • 複合体: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site
      • タンパク質・ペプチド: x 1種
      • RNA: x 1種
    • 複合体: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site
      • タンパク質・ペプチド: x 1種
    • 複合体: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site
      • タンパク質・ペプチド: x 1種
    • 複合体: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site
      • RNA: x 3種
      • タンパク質・ペプチド: x 50種
    • 複合体: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site
      • RNA: x 2種
    • 複合体: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site
      • RNA: x 1種
  • リガンド: x 2種
キーワードtmRNA SmpB trans-translation translation / RIBOSOME
機能・相同性
機能・相同性情報


trans-translation / large ribosomal subunit / regulation of translation / transferase activity / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / small ribosomal subunit rRNA binding / ribosomal large subunit assembly ...trans-translation / large ribosomal subunit / regulation of translation / transferase activity / ribosomal small subunit biogenesis / ribosomal small subunit assembly / small ribosomal subunit / 5S rRNA binding / small ribosomal subunit rRNA binding / ribosomal large subunit assembly / large ribosomal subunit rRNA binding / cytosolic small ribosomal subunit / cytosolic large ribosomal subunit / cytoplasmic translation / tRNA binding / negative regulation of translation / rRNA binding / structural constituent of ribosome / ribosome / translation / ribonucleoprotein complex / mRNA binding / zinc ion binding / metal ion binding / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能
SsrA-binding protein / SsrA-binding protein, conserved site / Small protein B / SmpB protein / SsrA-binding protein. / : / Ribosomal protein L1, bacterial-type / 30S ribosomal protein Thx / 30S ribosomal protein Thx / 30S ribosomal protein ...SsrA-binding protein / SsrA-binding protein, conserved site / Small protein B / SmpB protein / SsrA-binding protein. / : / Ribosomal protein L1, bacterial-type / 30S ribosomal protein Thx / 30S ribosomal protein Thx / 30S ribosomal protein / Ribosomal protein L25, long-form / Ribosomal protein L25, beta domain / Ribosomal protein L25, C-terminal / Ribosomal protein TL5, C-terminal domain / : / Ribosomal protein S14, type Z / Ribosomal protein L1, conserved site / Ribosomal protein L1 signature. / Ribosomal protein L1 / Ribosomal protein L1, 3-layer alpha/beta-sandwich / Ribosomal protein L1-like / Ribosomal protein L1/ribosomal biogenesis protein / Ribosomal protein L1p/L10e family / Ribosomal protein L31 type A / Ribosomal protein L31 signature. / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L31 superfamily / Ribosomal protein L31 / Ribosomal protein L9 signature. / Ribosomal protein L9, bacteria/chloroplast / Ribosomal protein L9, C-terminal / Ribosomal protein L9, C-terminal domain / Ribosomal protein L9, C-terminal domain superfamily / Ribosomal L25p family / Ribosomal protein L25 / Ribosomal protein L36 signature. / Ribosomal protein L32p, bacterial type / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, N-terminal / Ribosomal protein L25/Gln-tRNA synthetase, anti-codon-binding domain superfamily / Ribosomal protein L9, N-terminal domain superfamily / Ribosomal protein L9 / : / Ribosomal protein L9, N-terminal / Ribosomal protein L9, N-terminal domain / Ribosomal protein L33, conserved site / Ribosomal protein L33 signature. / Ribosomal protein L35, conserved site / Ribosomal protein L35 signature. / Ribosomal protein L28 / Ribosomal protein L35, non-mitochondrial / Ribosomal protein L18, bacterial-type / : / Ribosomal protein L6, bacterial-type / Ribosomal protein S19, bacterial-type / Ribosomal protein S3, bacterial-type / Ribosomal protein S13, bacterial-type / Ribosomal protein S6, conserved site / Ribosomal protein S6 signature. / Ribosomal protein L9/RNase H1, N-terminal / Ribosomal protein S7, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein S11, bacterial-type / Ribosomal protein L5, bacterial-type / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein S20 superfamily / Ribosomal protein S20 / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein L36 superfamily / Ribosomal protein L36 / Ribosomal protein S14/S29 / Ribosomal protein S4, bacterial-type / Ribosomal protein L19, conserved site / Ribosomal protein L19 signature. / 30S ribosomal protein S17 / Ribosomal protein L27, conserved site / Ribosomal protein L27 signature. / Ribosomal protein S5, bacterial-type / Ribosomal protein S6, plastid/chloroplast / Ribosomal protein L20 signature. / Ribosomal protein L22, bacterial/chloroplast-type / Ribosomal protein L14P, bacterial-type / Ribosomal protein L34, conserved site / Ribosomal protein L34 signature. / Ribosomal protein S2, bacteria/mitochondria/plastid / Ribosomal protein L2, bacterial/organellar-type / Ribosomal protein L35 / Ribosomal protein L35 superfamily / Ribosomal protein L35 / Ribosomal protein L33 / Ribosomal protein L33 / Ribosomal L28 family / Ribosomal protein L18 / Ribosomal L18 of archaea, bacteria, mitoch. and chloroplast / Ribosomal protein L33 superfamily / Ribosomal protein S9, bacterial/plastid / Ribosomal protein L16 / Ribosomal protein L28/L24 / Ribosomal protein S18, conserved site / Ribosomal protein S18 signature. / Ribosomal protein L30, bacterial-type / Ribosomal protein S16
類似検索 - ドメイン・相同性
Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Large ribosomal subunit protein bL33 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein uL13 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Large ribosomal subunit protein bL19 ...Small ribosomal subunit protein uS14 / Small ribosomal subunit protein uS17 / Large ribosomal subunit protein uL6 / Small ribosomal subunit protein uS8 / Small ribosomal subunit protein uS7 / Large ribosomal subunit protein bL33 / Large ribosomal subunit protein uL2 / Large ribosomal subunit protein uL13 / Large ribosomal subunit protein uL16 / Large ribosomal subunit protein bL19 / Large ribosomal subunit protein bL20 / Large ribosomal subunit protein bL21 / Large ribosomal subunit protein bL27 / Large ribosomal subunit protein bL28 / Large ribosomal subunit protein bL32 / Large ribosomal subunit protein bL34 / Small ribosomal subunit protein uS2 / Small ribosomal subunit protein uS3 / Small ribosomal subunit protein uS4 / Small ribosomal subunit protein uS9 / Small ribosomal subunit protein uS11 / Small ribosomal subunit protein uS13 / Small ribosomal subunit protein bS20 / Small ribosomal subunit protein uS12 / Small ribosomal subunit protein uS10 / Large ribosomal subunit protein uL3 / Large ribosomal subunit protein uL4 / Large ribosomal subunit protein uL23 / Small ribosomal subunit protein uS19 / Large ribosomal subunit protein uL22 / Large ribosomal subunit protein uL29 / Large ribosomal subunit protein uL14 / Large ribosomal subunit protein uL24 / Large ribosomal subunit protein uL5 / Large ribosomal subunit protein uL18 / Small ribosomal subunit protein uS5 / Large ribosomal subunit protein uL30 / Large ribosomal subunit protein uL15 / Large ribosomal subunit protein bL25 / Small ribosomal subunit protein bTHX / Small ribosomal subunit protein uS15 / Large ribosomal subunit protein bL31 / Small ribosomal subunit protein bS16 / Large ribosomal subunit protein bL35 / Large ribosomal subunit protein uL1 / Small ribosomal subunit protein bS6 / Small ribosomal subunit protein bS18 / Large ribosomal subunit protein bL9 / Large ribosomal subunit protein bL36 / SsrA-binding protein / Large ribosomal subunit protein bL17
類似検索 - 構成要素
生物種Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア) / Escherichia coli (大腸菌) / Thermus thermophilus HB27 (バクテリア) / Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) (バクテリア)
手法単粒子再構成法 / クライオ電子顕微鏡法 / 解像度: 3.7 Å
データ登録者Rae CD
資金援助 英国, 2件
OrganizationGrant number国
Medical Research Council (United Kingdom)MC_U105184332 英国
Wellcome TrustWT096570 英国
引用ジャーナル: Science / 年: 2019
タイトル: How a circularized tmRNA moves through the ribosome.
著者: Christopher D Rae / Yuliya Gordiyenko / V Ramakrishnan /
要旨: During trans-translation, transfer-messenger RNA (tmRNA) and small protein B (SmpB) together rescue ribosomes stalled on a truncated mRNA and tag the nascent polypeptide for degradation. We used cryo- ...During trans-translation, transfer-messenger RNA (tmRNA) and small protein B (SmpB) together rescue ribosomes stalled on a truncated mRNA and tag the nascent polypeptide for degradation. We used cryo-electron microscopy to determine the structures of three key states of the tmRNA-SmpB-ribosome complex during trans translation at resolutions of 3.7 to 4.4 angstroms. The results show how tmRNA and SmpB act specifically on stalled ribosomes and how the circularized complex moves through the ribosome, enabling translation to switch from the old defective message to the reading frame on tmRNA.
履歴
登録2018年12月17日-
ヘッダ(付随情報) 公開2019年2月27日-
マップ公開2019年2月27日-
更新2024年5月15日-
現状2024年5月15日処理サイト: PDBe / 状態: 公開

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構造の表示

ムービー
  • 表面図（断面を密度値に従い着色）
  • 表面レベル: 0.05
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • 表面図（高さに従い着色）
  • 表面レベル: 0.05
  • UCSF Chimeraによる作画
  • ダウンロード
  • あてはめたモデルとの重ね合わせ
  • 原子モデル: PDB-6q95
  • 表面レベル: 0.05
  • UCSF Chimeraによる作画
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ムービービューア
構造ビューアEMマップ:
SurfViewMolmilJmol/JSmol
添付画像

emd_4475.png

ダウンロードとリンク

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マップ

ファイルダウンロード / ファイル: emd_4475.map.gz / 形式: CCP4 / 大きさ: 178 MB / タイプ: IMAGE STORED AS FLOATING POINT NUMBER (4 BYTES)
投影像・断面図

画像のコントロール

大きさ
明度
コントラスト
その他
軸Z (Sec.)Y (Row.)X (Col.)
1.34 Å/pix.
x 360 pix.
= 482.4 Å		1.34 Å/pix.
x 360 pix.
= 482.4 Å		1.34 Å/pix.
x 360 pix.
= 482.4 Å

表面

投影像

断面 (1/3)

断面 (1/2)

断面 (2/3)

画像は Spider により作成

ボクセルのサイズX=Y=Z: 1.34 Å
密度

ヒストグラム

ヒストグラム (対数)
表面レベル登録者による: 0.05 / ムービー #1: 0.05
最小 - 最大-0.20200269 - 0.4199737
平均 (標準偏差)0.0009820506 (±0.01193797)
対称性空間群: 1
詳細

EMDB XML:

マップ形状
Axis orderXYZ
Origin000
サイズ360360360
Spacing360360360
セルA=B=C: 482.40002 Å
α=β=γ: 90.0 °

CCP4マップ ヘッダ情報:

modeImage stored as Reals
Å/pix. X/Y/Z1.341.341.34
M x/y/z360360360
origin x/y/z0.0000.0000.000
length x/y/z482.400482.400482.400
α/β/γ90.00090.00090.000
start NX/NY/NZ000
NX/NY/NZ364364364
MAP C/R/S123
start NC/NR/NS000
NC/NR/NS360360360
D min/max/mean-0.2020.4200.001

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添付データ

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試料の構成要素

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全体 : 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site

全体名称: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site
要素
  • 複合体: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site
    • 複合体: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site
      • タンパク質・ペプチド: SsrA-binding protein
      • RNA: transfer-messenger RNA (tmRNA)
    • 複合体: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site
      • タンパク質・ペプチド: Nascent peptide MET-ALA
    • 複合体: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L36
    • 複合体: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site
      • RNA: 16S RIBOSOMAL RNA
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S2
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S3
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S4
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S5
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S6
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S7
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S8
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S9
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S10
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S11
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S12
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S13
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S14 type Z
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S15
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S16
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S17
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S18
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S19
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein S20
      • タンパク質・ペプチド: 30S ribosomal protein Thx
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L27
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L28
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L29
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L30
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L31
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L32
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L33
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L34
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L35
      • RNA: 23S RIBOSOMAL RNA
      • RNA: 5S RIBOSOMAL RNA
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L1
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L2
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L3
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L4
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L5
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L6
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L9
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L13
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L14
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L15
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L16
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L17
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L18
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L19
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L20
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L21
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L22
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L23
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L24
      • タンパク質・ペプチド: 50S ribosomal protein L25
      • タンパク質・ペプチド: 50S RIBOSOMAL PROTEIN L10 AND L11
    • 複合体: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site
      • RNA: tRNA-fMet
      • RNA: tRNA-Phe
    • 複合体: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site
      • RNA: mRNA
  • リガンド: MAGNESIUM ION
  • リガンド: ZINC ION

+
超分子 #1: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site

超分子名称: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site / タイプ: complex / ID: 1 / 親要素: 0 / 含まれる分子: #1-#60

+
超分子 #2: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site

超分子名称: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site / タイプ: complex / ID: 2 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #56, #60
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)

+
超分子 #3: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site

超分子名称: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site / タイプ: complex / ID: 3 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #57
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #4: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site

超分子名称: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site / タイプ: complex / ID: 4 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #58
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus HB27 (バクテリア)

+
超分子 #5: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site

超分子名称: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site / タイプ: complex / ID: 5 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #1-#21, #25-#55, #59
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)

+
超分子 #6: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site

超分子名称: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site / タイプ: complex / ID: 6 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #22-#23
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
超分子 #7: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site

超分子名称: 70S ribosome bound by tmRNA-SmpB in the A site / タイプ: complex / ID: 7 / 親要素: 1 / 含まれる分子: #24
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)

+
分子 #1: 16S RIBOSOMAL RNA

分子名称: 16S RIBOSOMAL RNA / タイプ: rna / ID: 1 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 493.958281 KDa
配列文字列: UUUGUUGGAG AGUUUGAUCC UGGCUCAGGG UGAACGCUGG CGGCGUGCCU AAGACAUGCA AGUCGUGCGG GCCGCGGGGU UUUACUCCG UGGUCAGCGG CGGACGGGUG AGUAACGCGU GGGUGACCUA CCCGGAAGAG GGGGACAACC CGGGGAAACU C GGGCUAAU ...文字列:
UUUGUUGGAG AGUUUGAUCC UGGCUCAGGG UGAACGCUGG CGGCGUGCCU AAGACAUGCA AGUCGUGCGG GCCGCGGGGU UUUACUCCG UGGUCAGCGG CGGACGGGUG AGUAACGCGU GGGUGACCUA CCCGGAAGAG GGGGACAACC CGGGGAAACU C GGGCUAAU CCCCCAUGUG GACCCGCCCC UUGGGGUGUG UCCAAAGGGC UUUGCCCGCU UCCGGAUGGG CCCGCGUCCC AU CAGCUAG UUGGUGGGGU AAUGGCCCAC CAAGGCGACG ACGGGUAGCC GGUCUGAGAG GAUGGCCGGC CACAGGGGCA CUG AGACAC GGGCCCCACU CCUACGGGAG GCAGCAGUUA GGAAUCUUCC GCAAUGGGCG CAAGCCUGAC GGAGCGACGC CGCU UGGAG GAAGAAGCCC UUCGGGGUGU AAACUCCUGA ACCCGGGACG AAACCCCCGA CGAGGGGACU GACGGUACCG GGGUA AUAG CGCCGGCCAA CUCCGUGCCA GCAGCCGCGG UAAUACGGAG GGCGCGAGCG UUACCCGGAU UCACUGGGCG UAAAGG GCG UGUAGGCGGC CUGGGGCGUC CCAUGUGAAA GACCACGGCU CAACCGUGGG GGAGCGUGGG AUACGCUCAG GCUAGAC GG UGGGAGAGGG UGGUGGAAUU CCCGGAGUAG CGGUGAAAUG CGCAGAUACC GGGAGGAACG CCGAUGGCGA AGGCAGCC A CCUGGUCCAC CCGUGACGCU GAGGCGCGAA AGCGUGGGGA GCAAACCGGA UUAGAUACCC GGGUAGUCCA CGCCCUAAA CGAUGCGCGC UAGGUCUCUG GGUCUCCUGG GGGCCGAAGC UAACGCGUUA AGCGCGCCGC CUGGGGAGUA CGGCCGCAAG GCUGAAACU CAAAGGAAUU GACGGGGGCC CGCACAAGCG GUGGAGCAUG UGGUUUAAUU CGAAGCAACG CGAAGAACCU U ACCAGGCC UUGACAUGCU AGGGAACCCG GGUGAAAGCC UGGGGUGCCC CGCGAGGGGA GCCCUAGCAC AGGUGCUGCA UG GCCGUCG UCAGCUCGUG CCGUGAGGUG UUGGGUUAAG UCCCGCAACG AGCGCAACCC CCGCCGUUAG UUGCCAGCGG UUC GGCCGG GCACUCUAAC GGGACUGCCC GCGAAAGCGG GAGGAAGGAG GGGACGACGU CUGGUCAGCA UGGCCCUUAC GGCC UGGGC GACACACGUG CUACAAUGCC CACUACAAAG CGAUGCCACC CGGCAACGGG GAGCUAAUCG CAAAAAGGUG GGCCC AGUU CGGAUUGGGG UCUGCAACCC GACCCCAUGA AGCCGGAAUC GCUAGUAAUC GCGGAUCAGC CAUGCCGCGG UGAAUA CGU UCCCGGGCCU UGUACACACC GCCCGUCACG CCAUGGGAGC GGGCUCUACC CGAAGUCGCC GGGAGCCUAC GGGCAGG CG CCGAGGGUAG GGCCCGUGAC UGGGGCGAAG UCGUAACAAG GUAGCUGUAC CGGAAGGUGC GGCUGGAUCA CCUCCUUU C U

GENBANK: GENBANK: AP008226.1

+
分子 #22: tRNA-fMet

分子名称: tRNA-fMet / タイプ: rna / ID: 22 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 24.816811 KDa
配列文字列:
CGCGGGGUGG AGCAGCCUGG UAGCUCGUCG GGCUCAUAAC CCGAAGGUCG UCGG(5MU)UCAAA UCCGGCCCCC GCAACC A

+
分子 #23: tRNA-Phe

分子名称: tRNA-Phe / タイプ: rna / ID: 23 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 24.400418 KDa
配列文字列:
GCCCGGAUAG CUCAGUCGGU AGAGCAGGGG AUUUUUAAUC CCCGUGUCCU UGGUUCGAUU CCGAGUCCGG GCACCA

+
分子 #24: mRNA

分子名称: mRNA / タイプ: rna / ID: 24 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 1.853133 KDa
配列文字列:
UUCAUG

+
分子 #34: 23S RIBOSOMAL RNA

分子名称: 23S RIBOSOMAL RNA / タイプ: rna / ID: 34 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 947.935438 KDa
配列文字列: GGUCAAGAUG GUAAGGGCCC ACGGUGGAUG CCUCGGCACC CGAGCCGAUG AAGGACGUGG CUACCUGCGA UAAGCCAGGG GGAGCCGGU AGCGGGCGUG GAUCCCUGGA UGUCCGAAUG GGGGAACCCG GCCGGCGGGA ACGCCGGUCA CCGCGCUUUU G CGCGGGGG ...文字列:
GGUCAAGAUG GUAAGGGCCC ACGGUGGAUG CCUCGGCACC CGAGCCGAUG AAGGACGUGG CUACCUGCGA UAAGCCAGGG GGAGCCGGU AGCGGGCGUG GAUCCCUGGA UGUCCGAAUG GGGGAACCCG GCCGGCGGGA ACGCCGGUCA CCGCGCUUUU G CGCGGGGG GAACCUGGGG AACUGAAACA UCUCAGUACC CAGAGGAGAG GAAAGAGAAA UCGACUCCCU GAGUAGCGGC GA GCGAAAG GGGACCAGCC UAAACCGUCC GGCUUGUCCG GGCGGGGUCG UGGGGCCCUC GGACACCGAA UCCCCAGCCU AGC CGAAGC UGUUGGGAAG CAGCGCCAGA GAGGGUGAAA GCCCCGUAGG CGAAAGGUGG GGGGAUAGGU GAGGGUACCC GAGU ACCCC GUGGUUCGUG GAGCCAUGGG GGAAUCUGGG CGGACCACCG CCUAAGGCUA AGUACUCCGG GUGACCGAUA GCGCA CCAG UACCGUGAGG GAAAGGUGAA AAGAACCCCG GGAGGGGAGU GAAAUAGAGC CUGAAACCGU GGGCUUACAA GCAGUC ACG GCCCCGCAAG GGGUUGUGGC GUGCCUAUUG AAGCAUGAGC CGGCGACUCA CGGUCGUGGG CGAGCUUAAG CCGUUGA GG CGGAGGCGUA GGGAAACCGA GUCCGAACAG GGCGCAAGCG GGCCGCACGC GGCCCGCAAA GUCCGCGGCC GUGGACCC G AAACCGGGCG AGCUAGCCCU GGCCAGGGUG AAGCUGGGGU GAGACCCAGU GGAGGCCCGA ACCGGUGGGG GAUGCAAAC CCCUCGGAUG AGCUGGGGCU AGGAGUGAAA AGCUAACCGA GCCCGGAGAU AGCUGGUUCU CCCCGAAAUG ACUUUAGGGU CAGCCUCAG GCGCUGACUG GGGCCUGUAG AGCACUGAUA GGGCUAGGGG GCCCACCAGC CUACCAAACC CUGUCAAACU C CGAAGGGU CCCAGGUGGA GCCUGGGAGU GAGGGCGCGA GCGAUAACGU CCGCGUCCGA GCGCGGGAAC AACCGAGACC GC CAGCUAA GGCCCCCAAG UCUGGGCUAA GUGGUAAAGG AUGUGGCGCC GCGAAGACAG CCAGGAGGUU GGCUUAGAAG CAG CCAUCC UUUAAAGAGU GCGUAAUAGC UCACUGGUCG AGUGGCGCCG CGCCGAAAAU GAUCGGGGCU UAAGCCCAGC GCCG AAGCU GCGGGUCUGG GGGAUGACCC CAGGCGGUAG GGGAGCGUUC CCGAUGCCGA UGAAGGCCGA CCCGCGAGGG CGGCU GGAG GUAAGGGAAG UGCGAAUGCC GGCAUGAGUA ACGAUAAAGA GGGUGAGAAU CCCUCUCGCC GUAAGCCCAA GGGUUC CUA CGCAAUGGUC GUCAGCGUAG GGUUAGGCGG GACCUAAGGU GAAGCCGAAA GGCGUAGCCG AAGGGCAGCC GGUUAAU AU UCCGGCCCUU CCCGCAGGUG CGAUGGGGGG ACGCUCUAGG CUAGGGGGAC CGGAGCCAUG GACGAGCCCG GCCAGAAG C GCAGGGUGGG AGGUAGGCAA AUCCGCCUCC CAACAAGCUC UGCGUGGUGG GGAAGCCCGU ACGGGUGACA ACCCCCCGA AGCCAGGGAG CCAAGAAAAG CCUCUAAGCA CAACCUGCGG GAACCCGUAC CGCAAACCGA CACAGGUGGG CGGGUGCAAG AGCACUCAG GCGCGCGGGA GAACCCUCGC CAAGGAACUC UGCAAGUUGG CCCCGUAACU UCGGGAGAAG GGGUGCUCCC U GGGGUGAU GAGCCCCGGG GAGCCGCAGU GAACAGGCUC UGGCGACUGU UUACCAAAAA CACAGCUCUC UGCGAACUCG UA AGAGGAG GUAUAGGGAG CGACGCUUGC CCGGUGCCGG AAGGUCAAGG GGAGGGGUGC AAGCCCCGAA CCGAAGCCCC GGU GAACGG CGGCCGUAAC UAUAACGGUC CUAAGGUAGC GAAAUUCCUU GUCGGGUAAG UUCCGACCUG CACGAAAAGC GUAA CGACC GGAGCGCUGU CUCGGCGAGG GACCCGGUGA AAUUGAACUG GCCGUGAAGA UGCGGCCUAC CCGUGGCAGG ACGAA AAGA CCCCGUGGAG CUUUACUGCA GCCUGGUGUU GGCUCUUGGU CGCGCCUGCG UAGGAUAGGU GGGAGCCUGU GAACCC CCG CCUCCGGGUG GGGGGGAGGC GCCGGUGAAA UACCACCCUG GCGCGGCUGG GGGCCUAACC CUCGGAUGGG GGGACAG CG CUUGGCGGGC AGUUUGACUG GGGCGGUCGC CUCCUAAAAG GUAACGGAGG CGCCCAAAGG UCCCCUCAGG CGGGACGG A AAUCCGCCGG AGAGCGCAAG GGUAGAAGGG GGCCUGACUG CGAGGCCUGC AAGCCGAGCA GGGGCGAAAG CCGGGCCUA GUGAACCGGU GGUCCCGUGU GGAAGGGCCA UCGAUCAACG GAUAAAAGUU ACCCCGGGGA UAACAGGCUG AUCUCCCCCG AGCGUCCAC AGCGGCGGGG AGGUUUGGCA CCUCGAUGUC GGCUCGUCGC AUCCUGGGGC UGAAGAAGGU CCCAAGGGUU G GGCUGUUC GCCCAUUAAA GCGGCACGCG AGCUGGGUUC AGAACGUCGU GAGACAGUUC GGUCUCUAUC CGCCACGGGC GC AGGAGGC UUGAGGGGGG CUCUUCCUAG UACGAGAGGA CCGGAAGGGA CGCACCUCUG GUUUCCCAGC UGUCCCUCCA GGG GCAUAA GCUGGGUAGC CAUGUGCGGA AGGGAUAACC GCUGAAAGCA UCUAAGCGGG AAGCCCGCCC CAAGAUGAGG CCUC CCACG GCGUCAAGCC GGUAAGGACC CGGGAAGACC ACCCGGUGGA UGGGCCGGGG GUGUAAGCGC CGCGAGGCGU UGAGC CGAC CGGUCCCAAU CGUCCGAGGU CUUGACCCCU C

+
分子 #35: 5S RIBOSOMAL RNA

分子名称: 5S RIBOSOMAL RNA / タイプ: rna / ID: 35 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 38.553 KDa
配列文字列:
UCCCCCGUGC CCAUAGCGGC GUGGAACCAC CCGUUCCCAU UCCGAACACG GAAGUGAAAC GCGCCAGCGC CGAUGGUACU GGGCGGGCG ACCGCCUGGG AGAGUAGGUC GGUGCGGGGG

GENBANK: GENBANK: AP008226.1

+
分子 #60: transfer-messenger RNA (tmRNA)

分子名称: transfer-messenger RNA (tmRNA) / タイプ: rna / ID: 60 / コピー数: 1
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 112.818945 KDa
配列文字列: GGGGGUGAAA CGGUCUCGAC GGGGGUCGCC GAGGGCGUGG CUGCGCGCCG AGGUGCGGGU GGCCUCGUAA AAACCCGCAA CGGCAUAAC UGCCAACACC AACUACGCUC UCGCGGCUUA AUGACCGCGA CCUCGCCCGG UAGCCCUGCC GGGGGCUCAC C GGAAGCGG ...文字列:
GGGGGUGAAA CGGUCUCGAC GGGGGUCGCC GAGGGCGUGG CUGCGCGCCG AGGUGCGGGU GGCCUCGUAA AAACCCGCAA CGGCAUAAC UGCCAACACC AACUACGCUC UCGCGGCUUA AUGACCGCGA CCUCGCCCGG UAGCCCUGCC GGGGGCUCAC C GGAAGCGG GGACACAAAC CCGGCUAGCC CGGGGCCACG CCCUCUAACC CCGGGCGAAG CUUGAAGGGG GCUCGCUCCU GG CCGCCCG UCCGCGGGCC AAGCCAGGAG GACACGCGAA ACGCGGACUA CGCGCGUAGA GGCCCGCCGU AGGGACCUUC GGA CGGGGG UUCGACUCCC CCCACCUCCA CCA

+
分子 #2: 30S ribosomal protein S2

分子名称: 30S ribosomal protein S2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 2 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 27.116385 KDa
配列文字列: VKELLEAGVH FGHERKRWNP KFARYIYAER NGIHIIDLQK TMEELERTFR FIEDLAMRGG TILFVGTKKQ AQDIVRMEAE RAGMPYVNQ RWLGGMLTNF KTISQRVHRL EELEALFASP EIEERPKKEQ VRLKHELERL QKYLSGFRLL KRLPDAIFVV D PTKEAIAV ...文字列:
VKELLEAGVH FGHERKRWNP KFARYIYAER NGIHIIDLQK TMEELERTFR FIEDLAMRGG TILFVGTKKQ AQDIVRMEAE RAGMPYVNQ RWLGGMLTNF KTISQRVHRL EELEALFASP EIEERPKKEQ VRLKHELERL QKYLSGFRLL KRLPDAIFVV D PTKEAIAV REARKLFIPV IALADTDSDP DLVDYIIPGN DDAIRSIQLI LSRAVDLIIQ ARGGVVEPSP SYALVQE

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS2

+
分子 #3: 30S ribosomal protein S3

分子名称: 30S ribosomal protein S3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 3 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 22.975588 KDa
配列文字列: GNKIHPIGFR LGITRDWESR WYAGKKQYRH LLLEDQRIRG LLEKELYSAG LARVDIERAA DNVAVTVHVA KPGVVIGRGG ERIRVLREE LAKLTGKNVA LNVQEVQNPN LSAPLVAQRV AEQIERRFAV RRAIKQAVQR VMESGAKGAK VIVSGRIGGA E QARTEWAA ...文字列:
GNKIHPIGFR LGITRDWESR WYAGKKQYRH LLLEDQRIRG LLEKELYSAG LARVDIERAA DNVAVTVHVA KPGVVIGRGG ERIRVLREE LAKLTGKNVA LNVQEVQNPN LSAPLVAQRV AEQIERRFAV RRAIKQAVQR VMESGAKGAK VIVSGRIGGA E QARTEWAA QGRVPLHTLR ANIDYGFALA RTTYGVLGVK AYIFLGEVI

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS3

+
分子 #4: 30S ribosomal protein S4

分子名称: 30S ribosomal protein S4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 4 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 24.242254 KDa
配列文字列: GRYIGPVCRL CRREGVKLYL KGERCYSPKC AMERRPYPPG QHGQKRARRP SDYAVRLREK QKLRRIYGIS ERQFRNLFEE ASKKKGVTG SVFLGLLESR LDNVVYRLGF AVSRRQARQL VRHGHITVNG RRVDLPSYRV RPGDEIAVAE KSRNLELIRQ N LEAMKGRK ...文字列:
GRYIGPVCRL CRREGVKLYL KGERCYSPKC AMERRPYPPG QHGQKRARRP SDYAVRLREK QKLRRIYGIS ERQFRNLFEE ASKKKGVTG SVFLGLLESR LDNVVYRLGF AVSRRQARQL VRHGHITVNG RRVDLPSYRV RPGDEIAVAE KSRNLELIRQ N LEAMKGRK VGPWLSLDVE GMKGKFLRLP DREDLALPVN EQLVIEFYSR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS4

+
分子 #5: 30S ribosomal protein S5

分子名称: 30S ribosomal protein S5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 5 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 16.460193 KDa
配列文字列:
DFEEKMILIR RTARMQAGGR RFRFGALVVV GDRQGRVGLG FGKAPEVPLA VQKAGYYARR NMVEVPLQNG TIPHEIEVEF GASKIVLKP AAPGTGVIAG AVPRAILELA GVTDILTKEL GSRNPINIAY ATMEALRQLR TKADVERLRK GE

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS5

+
分子 #6: 30S ribosomal protein S6

分子名称: 30S ribosomal protein S6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 6 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 11.988753 KDa
配列文字列:
MRRYEVNIVL NPNLDQSQLA LEKEIIQRAL ENYGARVEKV EELGLRRLAY PIAKDPQGYF LWYQVEMPED RVNDLARELR IRDNVRRVM VVKSQEPFLA NA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS6

+
分子 #7: 30S ribosomal protein S7

分子名称: 30S ribosomal protein S7 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 7 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 17.919775 KDa
配列文字列:
ARRRRAEVRQ LQPDLVYGDV LVTAFINKIM RDGKKNLAAR IFYDACKIIQ EKTGQEPLKV FKQAVENVKP RMEVRSRRVG GANYQVPME VSPRRQQSLA LRWLVQAANQ RPERRAAVRI AHELMDAAEG KGGAVKKKED VERMAEANRA YAHYRW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS7

+
分子 #8: 30S ribosomal protein S8

分子名称: 30S ribosomal protein S8 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 8 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 15.86857 KDa
配列文字列:
MLTDPIADML TRIRNATRVY KESTDVPASR FKEEILRILA REGFIKGYER VDVDGKPYLR VYLKYGPRRQ GPDPRPEQVI HHIRRISKP GRRVYVGVKE IPRVRRGLGI AILSTSKGVL TDREARKLGV GGELICEVW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS8

+
分子 #9: 30S ribosomal protein S9

分子名称: 30S ribosomal protein S9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 9 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 14.298466 KDa
配列文字列:
EQYYGTGRRK EAVARVFLRP GNGKVTVNGQ DFNEYFQGLV RAVAALEPLR AVDALGRFDA YITVRGGGKS GQIDAIKLGI ARALVQYNP DYRAKLKPLG FLTRDARVVE RKKYGKHKAR RAPQYSKR

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS9

+
分子 #10: 30S ribosomal protein S10

分子名称: 30S ribosomal protein S10 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 10 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 11.398308 KDa
配列文字列:
KIRIKLRGFD HKTLDASAQK IVEAARRSGA QVSGPIPLPT RVRRFTVIRG PFKHKDSREH FELRTHNRLV DIINPNRKTI EQLMTLDLP TGVEIEIKTV

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS10

+
分子 #11: 30S ribosomal protein S11

分子名称: 30S ribosomal protein S11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 11 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 12.606369 KDa
配列文字列:
KRQVASGRAY IHASYNNTIV TITDPDGNPI TWSSGGVIGY KGSRKGTPYA AQLAALDAAK KAMAYGMQSV DVIVRGTGAG REQAIRALQ ASGLQVKSIV DDTPVPHNGC RPKKKFRKAS

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS11

+
分子 #12: 30S ribosomal protein S12

分子名称: 30S ribosomal protein S12 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 12 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 13.875388 KDa
配列文字列:
PTINQLVRKG REKVRKKSKV PALKGAPFRR GVCTVVRTVT PKKPNSALRK VAKVRLTSGY EVTAYIPGEG HNLQEHSVVL IRGGRVKDL PGVRYHIVRG VYDAAGVKDR KKSRSKYGTK KPKEAA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS12

+
分子 #13: 30S ribosomal protein S13

分子名称: 30S ribosomal protein S13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 13 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 13.62392 KDa
配列文字列:
ARIAGVEIPR NKRVDVALTY IYGIGKARAK EALEKTGINP ATRVKDLTEA EVVRLREYVE NTWKLEGELR AEVAANIKRL MDIGCYRGL RHRRGLPVRG QRTRTNARTR KGPRKTVAGK K

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS13

+
分子 #14: 30S ribosomal protein S14 type Z

分子名称: 30S ribosomal protein S14 type Z / タイプ: protein_or_peptide / ID: 14 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 7.027529 KDa
配列文字列:
ARKALIEKAK RTPKFKVRAY TRCVRCGRAR SVYRFFGLCR ICLRELAHKG QLPGVRKASW

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS14

+
分子 #15: 30S ribosomal protein S15

分子名称: 30S ribosomal protein S15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 15 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 10.447213 KDa
配列文字列:
PITKEEKQKV IQEFARFPGD TGSTEVQVAL LTLRINRLSE HLKVHKKDHH SHRGLLMMVG QRRRLLRYLQ REDPERYRAL IEKLGIRG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS15

+
分子 #16: 30S ribosomal protein S16

分子名称: 30S ribosomal protein S16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 16 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 9.995546 KDa
配列文字列:
MVKIRLARFG SKHNPHYRIV VTDARRKRDG KYIEKIGYYD PRKTTPDWLK VDVERARYWL SVGAQPTDTA RRLLRQAGVF RQEA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS16

+
分子 #17: 30S ribosomal protein S17

分子名称: 30S ribosomal protein S17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 17 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 11.880098 KDa
配列文字列:
PKKVLTGVVV SDKMQKTVTV LVERQFPHPL YGKVIKRSKK YLAHDPEEKY KLGDVVEIIE SRPISKRKRF RVLRLVESGR MDLVEKYLI RRQNYESLSK R

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS17

+
分子 #18: 30S ribosomal protein S18

分子名称: 30S ribosomal protein S18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 18 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 8.155812 KDa
配列文字列:
KAKVKATLGE FDLRDYRNVE VLKRFLSETG KILPRRRTGL SAKEQRILAK TIKRARILGL LPFTEKLVRK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS18

+
分子 #19: 30S ribosomal protein S19

分子名称: 30S ribosomal protein S19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 19 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 9.006486 KDa
配列文字列:
SLKKGVFVDD HLLEKVLELN AKGEKRLIKT WSRRSTIVPE MVGHTIAVYN GKQHVPVYIT ENMVGHKLGE FAPTRTYRG

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein uS19

+
分子 #20: 30S ribosomal protein S20

分子名称: 30S ribosomal protein S20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 20 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 10.921086 KDa
配列文字列:
RNLSALKRHR QSLKRRLRNK AKKSAIKTLS KKAIQLAQEG KAEEALKIMR KAESLIDKAA KGSTLHKNAA ARRKSRLMRK VRQLLEAAG APLIGGGLSA

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bS20

+
分子 #21: 30S ribosomal protein Thx

分子名称: 30S ribosomal protein Thx / タイプ: protein_or_peptide / ID: 21 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 3.089655 KDa
配列文字列:
GKGDRRTRRG KIWRGTYGKY RPRKK

UniProtKB: Small ribosomal subunit protein bTHX

+
分子 #25: 50S ribosomal protein L27

分子名称: 50S ribosomal protein L27 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 25 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 9.529074 KDa
配列文字列:
MAHKKGLGST RNGRDSQAKR LGVKRYEGQV VRAGNILVRQ RGTRFKPGKN VGMGRDFTLF ALVDGVVEFQ DRGRLGRYVH VRPLA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL27

+
分子 #26: 50S ribosomal protein L28

分子名称: 50S ribosomal protein L28 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 26 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 9.985846 KDa
配列文字列:
SGKRPIVANS IQRRGKAKRE GGVGKKTTGI SKRRQYPNLQ KVRVRVAGQE ITFRVAASHI PKVYELVERA KGLKLEGLSP KEIKKELLK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL28

+
分子 #27: 50S ribosomal protein L29

分子名称: 50S ribosomal protein L29 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 27 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 6.112247 KDa
配列文字列:
EARKLSPVEL EKLVREKKRE LMELRFQASI GQLSQNHKIR DLKRQIARLL T

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL29

+
分子 #28: 50S ribosomal protein L30

分子名称: 50S ribosomal protein L30 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 28 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 6.799126 KDa
配列文字列:
MPRLKVKLVK SPIGYPKDQK AALKALGLRR LQQERVLEDT PAIRGNVEKV AHLVRVEVVE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL30

+
分子 #29: 50S ribosomal protein L31

分子名称: 50S ribosomal protein L31 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 29 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 6.640646 KDa
配列文字列:
KEGIHPKLVP ARIICGCGNV IETYSTKPEI YVEVCSKCHP FYTGQQRFVD TEGRVERF

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL31

+
分子 #30: 50S ribosomal protein L32

分子名称: 50S ribosomal protein L32 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 30 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 6.590854 KDa
配列文字列:
AKHPVPKKKT SKARRDARRS HHALTPPTLV PCPECKAMKP PHTVCPECGY YAGRKVLEV

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL32

+
分子 #31: 50S ribosomal protein L33

分子名称: 50S ribosomal protein L33 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 31 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 5.602612 KDa
配列文字列:
LLLECTECKR RNYATEKNKR NTPNKLELRK YCPWCRKHTV HREVK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL33

+
分子 #32: 50S ribosomal protein L34

分子名称: 50S ribosomal protein L34 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 32 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 6.132449 KDa
配列文字列:
MKRTWQPNRR KRAKTHGFRA RMRTPGGRKV LKRRRQKGRW RLTPAVRKR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL34

+
分子 #33: 50S ribosomal protein L35

分子名称: 50S ribosomal protein L35 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 33 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 7.374981 KDa
配列文字列:
PKMKTHKGAK KRVKITASGK VVAMKTGKRH LNWQKSGKEI RQKGRKFVLA KPEAERIKLL LPYE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL35

+
分子 #36: 50S ribosomal protein L1

分子名称: 50S ribosomal protein L1 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 36 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 24.872721 KDa
配列文字列: MPKHGKRYRA LLEKVDPNKV YTIDEAARLV KELATAKFDE TVEVHAKLGI DPRRSDQNVR GTVSLPHGLG KQVRVLAIAK GEKIKEAEE AGADYVGGEE IIQKILDGWM DFDAVVATPD VMGAVGSKLG RILGPRGLLP NPKAGTVGFN IGEIIREIKA G RIEFRNDK ...文字列:
MPKHGKRYRA LLEKVDPNKV YTIDEAARLV KELATAKFDE TVEVHAKLGI DPRRSDQNVR GTVSLPHGLG KQVRVLAIAK GEKIKEAEE AGADYVGGEE IIQKILDGWM DFDAVVATPD VMGAVGSKLG RILGPRGLLP NPKAGTVGFN IGEIIREIKA G RIEFRNDK TGAIHAPVGK ASFPPEKLAD NIRAFIRALE AHKPEGAKGT FLRSVYVTTT MGPSVRINPH S

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL1

+
分子 #37: 50S ribosomal protein L2

分子名称: 50S ribosomal protein L2 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 37 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 29.985799 KDa
配列文字列: AVKKFKPYTP SRRFMTVADF SEITKTEPEK SLVKPLKKTG GRNNQGRITV RFRGGGHKRL YRIIDFKRWD KVGIPAKVAA IEYDPNRSA RIALLHYVDG EKRYIIAPDG LQVGQQVVAG PDAPIQVGNA LPLRFIPVGT VVHAVELEPK KGAKLARAAG T SAQIQGRE ...文字列:
AVKKFKPYTP SRRFMTVADF SEITKTEPEK SLVKPLKKTG GRNNQGRITV RFRGGGHKRL YRIIDFKRWD KVGIPAKVAA IEYDPNRSA RIALLHYVDG EKRYIIAPDG LQVGQQVVAG PDAPIQVGNA LPLRFIPVGT VVHAVELEPK KGAKLARAAG T SAQIQGRE GDYVILRLPS GELRKVHGEC YATVGAVGNA DHKNIVLGKA GRSRWLGRRP HVRGAAMNPV DHPHGGGEGR AP RGRPPAS PWGWQTKGLK TRKRRKPSSR FIIAR

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL2

+
分子 #38: 50S ribosomal protein L3

分子名称: 50S ribosomal protein L3 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 38 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 22.321031 KDa
配列文字列: MKGILGVKVG MTRIFRDDRA VPVTVILAGP CPVVQRRTPE KDGYTAVQLG FLPQNPKRVN RPLKGHFAKA GVEPVRILRE IRDFNPEGD TVTVEIFKPG ERVDVTGTSK GRGFAGVMKR WNFAGGPDSH GAHKIHRHPG SIGNRKTPGR VYKGKKMAGH Y GAERVTVM ...文字列:
MKGILGVKVG MTRIFRDDRA VPVTVILAGP CPVVQRRTPE KDGYTAVQLG FLPQNPKRVN RPLKGHFAKA GVEPVRILRE IRDFNPEGD TVTVEIFKPG ERVDVTGTSK GRGFAGVMKR WNFAGGPDSH GAHKIHRHPG SIGNRKTPGR VYKGKKMAGH Y GAERVTVM NLEVVDVIPE ENLLLVKGAV PGPNGGLVIV RETKKAA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL3

+
分子 #39: 50S ribosomal protein L4

分子名称: 50S ribosomal protein L4 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 39 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 23.071721 KDa
配列文字列: MKEVAVYQIP VLSPSGRREL AADLPAEINP HLLWEVVRWQ LAKRRRGTAS TKTRGEVAYS GRKIWPQKHT GRARHGDIGA PIFVGGGVV FGPKPRDYSY TLPKKVRKKG LAMAVADRAR EGKLLLVEAF AGVNGKTKEF LAWAKEAGLD GSESVLLVTG N ELVRRAAR ...文字列:
MKEVAVYQIP VLSPSGRREL AADLPAEINP HLLWEVVRWQ LAKRRRGTAS TKTRGEVAYS GRKIWPQKHT GRARHGDIGA PIFVGGGVV FGPKPRDYSY TLPKKVRKKG LAMAVADRAR EGKLLLVEAF AGVNGKTKEF LAWAKEAGLD GSESVLLVTG N ELVRRAAR NLPWVVTLAP EGLNVYDIVR TERLVMDLDA WEVFQNRIGG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL4

+
分子 #40: 50S ribosomal protein L5

分子名称: 50S ribosomal protein L5 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 40 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 20.9304 KDa
配列文字列:
PLDVALKRKY YEEVRPELIR RFGYQNVWEV PRLEKVVINQ GLGEAKEDAR ILEKAAQELA LITGQKPAVT RAKKSISNFK LRKGMPIGL RVTLRRDRMW IFLEKLLNVA LPRIRDFRGL NPNSFDGRGN YNLGLREQLI FPEITYDMVD ALRGMDIAVV T TAETDEEA RALLELLGFP FRK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL5

+
分子 #41: 50S ribosomal protein L6

分子名称: 50S ribosomal protein L6 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 41 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 17.476279 KDa
配列文字列:
PKGVSVEVAP GRVKVKGPKG ELEVPVSPEM RVVVEEGVVR VERPSDERRH KSLHGLTRTL IANAVKGVSE GYSKELLIKG IGYRARLVG RALELTVGFS HPVVVEPPEG ITFEVPEPTR VRVSGIDKQK VGQVAANIRA IRKPSAYHEK GIYYAGEPVR L

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL6

+
分子 #42: 50S ribosomal protein L9

分子名称: 50S ribosomal protein L9 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 42 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 6.536709 KDa
配列文字列:
MKVILLEPLE NLGDVGQVVD VKPGYARNYL LPRGLAVLAT ESNLKALEAR IRAQAKRLAA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL9

+
分子 #43: 50S ribosomal protein L13

分子名称: 50S ribosomal protein L13 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 43 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 15.828771 KDa
配列文字列:
MKTYVPKQVE PRWVLIDAEG KTLGRLATKI ATLLRGKHRP DWTPNVAMGD FVVVVNADKI RVTGKKLEQK IYTRYSGYPG GLKKIPLEK MLATHPERVL EHAVKGMLPK GPLGRRLFKR LKVYAGPDHP HQAQRPEKLE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL13

+
分子 #44: 50S ribosomal protein L14

分子名称: 50S ribosomal protein L14 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 44 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 13.323612 KDa
配列文字列:
MIQPQTYLEV ADNTGARKIM CIRVLKGSNA KYATVGDVIV ASVKEAIPRG AVKEGDVVKA VVVRTKKEIK RPDGSAIRFD DNAAVIINN QLEPRGTRVF GPVARELREK GFMKIVSLAP EVL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL14

+
分子 #45: 50S ribosomal protein L15

分子名称: 50S ribosomal protein L15 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 45 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 15.858526 KDa
配列文字列:
DLRPNPGANK RRKRVGRGPG SGHGKTATRG HKGQKSRSGG LKDPRRFEGG RSTTLMRLPK RGMQGQVPGE IKRPRYQGVN LKDLARFEG EVTPELLVRA GLLKKGYRLK ILGEGEAKPL KVVAHAFSKS ALEKLKAAGG EPVLLEA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL15

+
分子 #46: 50S ribosomal protein L16

分子名称: 50S ribosomal protein L16 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 46 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 15.36405 KDa
配列文字列:
RMKYRKQQRG RLKGATKGGD YVAFGDYGLV ALEPAWITAQ QIEAARVAMV RHFRRGGKIF IRIFPDKPYT KKPLEVRMGK GKGNVEGYV AVVKPGRVMF EVAGVTEEQA MEALRIAGHK LPIKTKIVRR DAYDEAQ

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL16

+
分子 #47: 50S ribosomal protein L17

分子名称: 50S ribosomal protein L17 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 47 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 13.618952 KDa
配列文字列:
RHLKSGRKLN RHSSHRLALY RNQAKSLLTH GRITTTVPKA KELRGFVDHL IHLAKRGDLH ARRLVLRDLQ DVKLVRKLFD EIAPRYRDR QGGYTRVLKL AERRRGDGAP LALVELVE

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL17

+
分子 #48: 50S ribosomal protein L18

分子名称: 50S ribosomal protein L18 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 48 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 10.998918 KDa
配列文字列:
KFRVRNRIKR TGRLRLSVFR SLKHIYAQII DDEKGVTLVS ASSLALKLKG NKTEVARQVG RALAEKALAL GIKQVAFDRG PYKYHGRVK ALAEGAREGG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL18

+
分子 #49: 50S ribosomal protein L19

分子名称: 50S ribosomal protein L19 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 49 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 16.289891 KDa
配列文字列:
MNRGALIKLV ESRYVRTDLP EFRPGDTVRV SYKVKEGNRT RIQDFEGIVI RIRRNGFNTT FTVRKVSYGV GVERIFPLHS PLIQKIDIV QRGRARRAKL YFIRNLSDRE IRRKLRADRK RIDQDRAAER AAKEEAQKA

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL19

+
分子 #50: 50S ribosomal protein L20

分子名称: 50S ribosomal protein L20 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 50 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 13.648081 KDa
配列文字列:
PRAKTGVVRR RKHKKILKLA KGYWGLRSKS FRKARETLFA AGNYAYAHRK RRKRDFRRLW IVRINAACRQ HGLNYSTFIH GLKKAGIEV DRKNLADLAV REPQVFAELV ERAKAAQG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL20

+
分子 #51: 50S ribosomal protein L21

分子名称: 50S ribosomal protein L21 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 51 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 11.069153 KDa
配列文字列:
MFAIVKTGGK QYRVEPGLKL RVEKLDAEPG ATVELPVLLL GGEKTVVGTP VVEGASVVAE VLGHGRGKKI LVSKFKAKVQ YRRKKGHRQ PYTELLIKEI RG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL21

+
分子 #52: 50S ribosomal protein L22

分子名称: 50S ribosomal protein L22 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 52 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 12.808055 KDa
配列文字列:
MEAKAIARYV RISPRKVRLV VDLIRGKSLE EARNILRYTN KRGAYFVAKV LESAAANAVN NHDMLEDRLY VKAAYVDEGP ALKRVLPRA RGRADIIKKR TSHITVILGE KHGK

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL22

+
分子 #53: 50S ribosomal protein L23

分子名称: 50S ribosomal protein L23 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 53 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 10.386274 KDa
配列文字列:
TAYDVILAPV LSEKAYAGFA EGKYTFWVHP KATKTEIKNA VETAFKVKVV KVNTLHVRGK KKRLGRYLGK RPDRKKAIVQ VAPGQKIEA LEGL

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL23

+
分子 #54: 50S ribosomal protein L24

分子名称: 50S ribosomal protein L24 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 54 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 11.181658 KDa
配列文字列:
RVKMHVKKGD TVLVASGKYK GRVGKVKEVL PKKYAVIVEG VNIVKKAVRV SPKYPQGGFI EKEAPLHASK VRPICPACGK PTRVRKKFL ENGKKIRVCA KC

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein uL24

+
分子 #55: 50S ribosomal protein L25

分子名称: 50S ribosomal protein L25 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 55 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 10.954641 KDa
配列文字列:
YRLKAYYREG EKPSALRRAG KLPGVMYNRH LNRKVYVDLV EFDKVFRQAS IHHVIVLELP DGQSLPTLVR QVNLDKRRRR PEHVDFFVL SDD

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL25

+
分子 #56: SsrA-binding protein

分子名称: SsrA-binding protein / タイプ: protein_or_peptide / ID: 56 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 16.78549 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
MAPVLENRRA RHDYEILETY EAGIALKGTE VKSLRAGKVD FTGSFARFED GELYLENLYI APYEKGSYAN VDPRRKRKLL LHKHELRRL LGKVEQKGLT LVPLKIYFNE RGYAKVLLGL ARGKKAYEKR REDKKEAVRR ALEEL

UniProtKB: SsrA-binding protein

+
分子 #57: Nascent peptide MET-ALA

分子名称: Nascent peptide MET-ALA / タイプ: protein_or_peptide / ID: 57 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Escherichia coli (大腸菌)
分子量理論値: 220.289 Da
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
MA

+
分子 #58: 50S ribosomal protein L36

分子名称: 50S ribosomal protein L36 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 58 / コピー数: 1 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039) (バクテリア)
分子量理論値: 4.435411 KDa
組換発現生物種: Escherichia coli (大腸菌)
配列文字列:
MKVRASVKRI CDKCKVIRRH GRVYVICENP KHKQRQG

UniProtKB: Large ribosomal subunit protein bL36

+
分子 #59: 50S RIBOSOMAL PROTEIN L10 AND L11

分子名称: 50S RIBOSOMAL PROTEIN L10 AND L11 / タイプ: protein_or_peptide / ID: 59 / コピー数: 2 / 光学異性体: LEVO
由来(天然)生物種: Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579) (バクテリア)
分子量理論値: 11.932701 KDa
配列文字列: (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) ...文字列:
(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)

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分子 #61: MAGNESIUM ION

分子名称: MAGNESIUM ION / タイプ: ligand / ID: 61 / コピー数: 637 / 式: MG
分子量理論値: 24.305 Da

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分子 #62: ZINC ION

分子名称: ZINC ION / タイプ: ligand / ID: 62 / コピー数: 3 / 式: ZN
分子量理論値: 65.409 Da

-
実験情報

-
構造解析

手法クライオ電子顕微鏡法
解析単粒子再構成法
試料の集合状態particle

-
試料調製

緩衝液pH: 7.5
凍結凍結剤: ETHANE

-
電子顕微鏡法

顕微鏡FEI POLARA 300
撮影フィルム・検出器のモデル: FEI FALCON II (4k x 4k)
平均電子線量: 42.0 e/Å2
電子線加速電圧: 300 kV / 電子線源: FIELD EMISSION GUN
電子光学系照射モード: FLOOD BEAM / 撮影モード: BRIGHT FIELD
実験機器
モデル: Tecnai Polara / 画像提供: FEI Company

-
画像解析

初期モデルモデルのタイプ: EMDB MAP
EMDB ID:

3493

最終 再構成解像度のタイプ: BY AUTHOR / 解像度: 3.7 Å / 解像度の算出法: FSC 0.143 CUT-OFF / 使用した粒子像数: 24400
初期 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION
最終 角度割当タイプ: MAXIMUM LIKELIHOOD / ソフトウェア - 名称: RELION

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万見について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか？ / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例：em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

  • 万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
  • EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る