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- EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース -

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構造論文のリスト

全データ111,166件中、1から20件目までを表示しています

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Poc1 bridges basal body inner junctions to promote triplet microtubule integrity and connections.

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Structural basis for lipid transfer by the ATG2A-ATG9A complex

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Poliovirus 3C protease in H32 spacegroup

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An image processing pipeline for electron cryo-tomography in RELION-5

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Improved correlations with score, hit-rate, and affinity as docking library and testing scale increase

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Structural Characterization of Disulfide-Linked, p53-Derived Peptide Dimers

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Structure and function of FAP47 in the central pair apparatus of Chlamydomonas flagella

Cytoskeleton,
Tani Y / Yanagisawa H / Yagi T / Kikkawa M
手法: EM (サブトモグラム平均)

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Cryo-EM structure of GPR119-Gs complex

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Crystal structure of outer membrane lipoprotein carrier protein (LolA) from Ehrlichia chaffeensis

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Centrolobium microchaete seed lectin (CML) complexed with Man1-3Man-OMe

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High-affinity PQQ import is widespread in Gram-negative bacteria.

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PomX filament from Myxococcus xanthus

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Mechanism for drastic reduction in catalytic activity of Trp89Phe-mutated glutamate dehydrogenase revealed by cryoEM-sampling metastable conformation in action

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Oligomerization-mediated autoinhibition and cofactor binding of a plant NLR.

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Domain-swapping promoted by the introduction of a charge in the hydrophobic interior of a protein

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Acute inhibition of clathrin-mediated endocytosis by next-generation small molecule inhibitors of clathrin function

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Structure of GDP-bound Rab7 Q67L in complex with ORP1L.

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Structure of scFv76 in complex with SARS-CoV-2 Omicron Spike protein

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Structure of scFv76-77 in complex with SARS-CoV-2 Spike protein

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Structure of scFv76-77 in complex with SARS-CoV-2 Omicron Spike protein

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万見文献について

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月:コロナウイルスプロテーアーゼ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

EMDBのIDの桁数の変更

  • EMDBエントリに付与されているアクセスコード(EMDB-ID)は4桁の数字(例、EMD-1234)でしたが、間もなく枯渇します。これまでの4桁のID番号は4桁のまま変更されませんが、4桁の数字を使い切った後に発行されるIDは5桁以上の数字(例、EMD-12345)になります。5桁のIDは2019年の春頃から発行される見通しです。
  • EM Navigator/万見では、接頭語「EMD-」は省略されています。

関連情報:Q: 「EMD」とは何ですか? / 万見/EM NavigatorにおけるID/アクセスコードの表記

外部リンク:EMDB Accession Codes are Changing Soon! / PDBjへお問い合わせ

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

PDB大規模アップデート

  • 新バージョンのPDBx/mmCIF辞書形式に基づくデータがリリースされました。
  • 今回の更新はバージョン番号が4から5になる大規模なもので、全エントリデータの書き換えが行われる「Remediation」というアップデートに該当します。
  • このバージョンアップで、電子顕微鏡の実験手法に関する多くの項目の書式が改定されました(例:em_softwareなど)。
  • EM NavigatorとYorodumiでも、この改定に基づいた表示内容になります。

外部リンク:wwPDB Remediation / OneDepデータ基準に準拠した、より強化された内容のモデル構造ファイルが、PDBアーカイブで公開されました。

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万見文献

EMDB/PDB/SASBDBから引用されている文献のデータベース

  • EMDB/PDB/SASBDBのエントリから引用されている文献のデータベースです
  • Pubmedのデータを利用しています

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 万見 (Yorodumi) / EMN文献 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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