[日本語] English
- 3次元電子顕微鏡データ検索 -

-
検索条件


キーワード
データベース /
Q: EM Navigatorの情報源は？
データエントリ / 週前
Q: データの更新はいつですか？
著者・登録者
解析手法
表示モード
並び順
エントリ数 / 1ページ
登録情報
文献
試料
実験
解析
データの最大数全データの場合は0
ファイル形式
  • CSV形式 (コンマ区切り, Excelなどに)
  • TSV形式 (タブ区切り)
  • JSON形式

万見検索

-
検索結果

検索 (著者・登録者: yamazaki & k)の結果全43件を表示しています

EMDB-68587:
Cryo-EM consensus map of Bovine lactoferrin in water
手法: 単粒子 / : Wada M, Yamazaki K, Wada Y, Ohga K, Ishii Y, Nakagawa A, Yoshikara H, Okuno S, Nojima T, Ochi H, Hirose M, Kato T, Katoh T

EMDB-68586:
Cryo-EM consensus map of Bovine lactoferrin in TBS buffer
手法: 単粒子 / : Wada M, Yamazaki K, Wada Y, Ohga K, Ishii Y, Nakagawa A, Yoshikawa H, Okuno S, Nojima T, Ochi H, Hirose M, Kato T, Katoh T

EMDB-63646:
I-shaped amyloid fiber (40) of Tottori (D7N) mutant
手法: らせん対称 / : Burton-Smith RN, Murata K

EMDB-63647:
V-shaped amyloid fiber (40) of Tottori (D7N) mutant (type 1)
手法: らせん対称 / : Burton-Smith RN, Murata K

EMDB-63648:
V'-shaped short pitch amyloid fiber (40) of Tottori (D7N) mutant
手法: らせん対称 / : Burton-Smith RN, Murata K

EMDB-64274:
V-shaped amyloid fiber (40) of Tottori (D7N) mutant (type 2)
手法: らせん対称 / : Burton-Smith RN, Murata K

PDB-9m5p:
I-type amyloid fibril (40) of Tottori (D7N) mutant
手法: らせん対称 / : Burton-Smith RN, Murata K

PDB-9m5q:
V-type (V1-type) amyloid fibril (40) of Tottori (D7N) mutant
手法: らせん対称 / : Burton-Smith RN, Murata K

PDB-9m5r:
ES-type (short pitch) amyloid fibril (40) of Tottori (D7N) mutant
手法: らせん対称 / : Burton-Smith RN, Murata K

PDB-9umh:
V-type (V2-type) amyloid fibril (40) of Tottori (D7N) mutant
手法: らせん対称 / : Burton-Smith RN, Murata K

EMDB-60617:
Tubular PuuE complex with C4 symmetry
手法: らせん対称 / : Noji M, Sugita Y, Suzuki Y

EMDB-60618:
Tubular PuuE complex with C5 symmetry
手法: らせん対称 / : Noji M, Sugita Y, Suzuki Y

EMDB-60619:
Tubular PuuE complex with C6 symmetry
手法: らせん対称 / : Noji M, Sugita Y, Suzuki Y

EMDB-60620:
Tubular PuuE D-loop complex with C3 symmetry
手法: らせん対称 / : Noji M, Sugita Y, Suzuki Y

EMDB-60621:
Tubular PuuE D-loop complex with C4 symmetry
手法: らせん対称 / : Noji M, Sugita Y, Suzuki Y

EMDB-60622:
Tubular PuuE D-loop complex with C5 symmetry
手法: らせん対称 / : Noji M, Sugita Y, Suzuki Y

EMDB-60623:
Tubular PuuE D-loop complex with C6 symmetry
手法: らせん対称 / : Noji M, Sugita Y, Suzuki Y

EMDB-52074:
Structure of the Xenorceptide A2-bound E. coli BAM complex (BamABCDE)
手法: 単粒子 / : Jakob RP, Modaresi SM, Maier T, Hiller S

EMDB-35535:
Human ornithine transcarbamylase expressed using mRNA lipid nanoparticles in human cells and PEGylated
手法: 単粒子 / : Kondo K, Yamazaki K, Kubara K, Ishii S, Suzuki Y, Miyazaki T, Mitsuhashi K, Ito M, Tsukahara K

EMDB-33643:
The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab816
手法: 単粒子 / : Uchikubo T, Shirouzu M

EMDB-33644:
The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab803
手法: 単粒子 / : Uchikubo T, Shirouzu M

PDB-7y6l:
The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab816
手法: 単粒子 / : Uchikubo T, Shirouzu M

PDB-7y6n:
The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab803
手法: 単粒子 / : Uchikubo T, Shirouzu M

EMDB-33065:
The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab765
手法: 単粒子 / : Kamada K, Shirouzu M

EMDB-33066:
The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab712
手法: 単粒子 / : Kamada K, Shirouzu M

EMDB-33067:
The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab709
手法: 単粒子 / : Kamada K, Shirouzu M

EMDB-33068:
The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab847
手法: 単粒子 / : Kamada K, Shirouzu M

PDB-7x93:
The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab765
手法: 単粒子 / : Kamada K, Shirouzu M

PDB-7x94:
The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab712
手法: 単粒子 / : Kamada K, Shirouzu M

PDB-7x95:
The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab709
手法: 単粒子 / : Kamada K, Shirouzu M

PDB-7x96:
The SARS-CoV-2 receptor binding domain bound with the Fab fragment of a human neutralizing antibody Ab847
手法: 単粒子 / : Kamada K, Shirouzu M

EMDB-33293:
Cryo-EM structure of Cytochrome bo3 from Escherichia coli, apo structure with DMSO
手法: 単粒子 / : Nishida Y, Shigematsu H, Iwamoto T, Takashima S, Shintani Y

EMDB-33294:
Cryo-EM structure of Cytochrome bo3 from Escherichia coli, the structure complexed with an allosteric inhibitor N4
手法: 単粒子 / : Nishida Y, Shigematsu H, Iwamoto T, Takashima S, Shintani Y

PDB-7xmc:
Cryo-EM structure of Cytochrome bo3 from Escherichia coli, apo structure with DMSO
手法: 単粒子 / : Nishida Y, Shigematsu H, Iwamoto T, Takashima S, Shintani Y

PDB-7xmd:
Cryo-EM structure of Cytochrome bo3 from Escherichia coli, the structure complexed with an allosteric inhibitor N4
手法: 単粒子 / : Nishida Y, Shigematsu H, Iwamoto T, Takashima S, Shintani Y

EMDB-32078:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P86
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J

EMDB-32079:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (3-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P86
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

EMDB-32080:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (1-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P17
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

EMDB-32081:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P17
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

PDB-7vq0:
Cryo-EM structure of the SARS-CoV-2 spike protein (2-up RBD) bound to neutralizing nanobodies P86
手法: 単粒子 / : Maeda R, Fujita J, Konishi Y, Kazuma Y, Yamazaki H, Anzai I, Yamaguchi K, Kasai K, Nagata K, Yamaoka Y, Miyakawa K, Ryo A, Shirakawa K, Makino F, Matsuura Y, Inoue T, Imura A, Namba K, Takaori-Kondo A

EMDB-2314:
Electron crystallographic studies on IP39 of Euglena gracilis
手法: 電子線結晶学 / : Suzuki H, Ito Y, Yamazaki Y, Mineta K, Uji M, Abe K, Tani K, Fujiyoshi Y, Tsukita S

EMDB-2315:
Electron crystallographic studies on IP39 of Euglena gracilis with Fab
手法: 電子線結晶学 / : Suzuki H, Ito Y, Yamazaki Y, Mineta K, Uji M, Abe K, Tani K, Fujiyoshi Y, Tsukita S

EMDB-5374:
Structural basis for broad detection of genogroup II noroviruses by a monoclonal antibody that binds to a site occluded in the viral particle
手法: 単粒子 / : Hansman GS, Taylor DW, McLellan JS, Smith TJ, Georgiev I, Tame JRH, Park SY, Yamazaki M, Gondaira F, Miki M, Katayama K, Murata K, Kwong PD

+
EMN検索について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

+
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

-
EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

他の情報も見る