[日本語] English
- 3次元電子顕微鏡データ検索 -

-
検索条件


キーワード
データベース /
Q: EM Navigatorの情報源は？
データエントリ / 週前
Q: データの更新はいつですか？
著者・登録者
解析手法
表示モード
並び順
エントリ数 / 1ページ
登録情報
文献
試料
実験
解析
データの最大数全データの場合は0
ファイル形式
  • CSV形式 (コンマ区切り, Excelなどに)
  • TSV形式 (タブ区切り)
  • JSON形式

万見検索

-
検索結果

検索 (著者・登録者: akagi & m)の結果77件中、1から50件目までを表示しています

EMDB-44253:
Human asparagine synthetase Arg-142 to Ile-142 (R142I) variant
手法: 単粒子 / : Coricello A, Nardone A, Lupia A, Gratteri C, Vos M, Chaptal V, Alcaro S, Zhu W, Takagi Y, Richards N

PDB-9b6c:
Human asparagine synthetase Arg-142 to Ile-142 (R142I) variant
手法: 単粒子 / : Coricello A, Nardone A, Lupia A, Gratteri C, Vos M, Chaptal V, Alcaro S, Zhu W, Takagi Y, Richards N

EMDB-40764:
Human asparagine synthetase (apo-ASNS)
手法: 単粒子 / : Coricello A, Zhu W, Lupia A, Gratteri C, Vos M, Chaptal V, Alcaro S, Takagi Y, Richards N

PDB-8sue:
Human asparagine synthetase (apo-ASNS)
手法: 単粒子 / : Coricello A, Zhu W, Lupia A, Gratteri C, Vos M, Chaptal V, Alcaro S, Takagi Y, Richards N

EMDB-35029:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2, no ACE2 binding.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35030:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2. 1 ACE2 bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35031:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2. 2 ACE2 bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35032:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2. 3 ACE2 bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35036:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy.no ACE2 decoy binding
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35037:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy. 1 ACE2 decoy bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35038:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy. 1 ACE2 decoy bound and 2 RBD up form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35039:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy. 2 ACE2 decoy bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-35040:
SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy. 3 ACE2 decoy bound form.
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-36345:
RBD of SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

PDB-8jje:
RBD of SARS-CoV2 spike protein with ACE2 decoy
手法: 単粒子 / : Kishikawa J, Hirose M, Kato T, Okamoto T

EMDB-16532:
Structure of Tau filaments Type I from Subacute Sclerosing Panencephalitis
手法: らせん対称 / : Qi C, Hasegawa M, Takao M, Sakai M, Akagi M, Iwasaki Y, Yoshida M, Scheres SHW, Goedert M

EMDB-16535:
Structure of Tau filaments Type II from Subacute Sclerosing Panencephalitis
手法: らせん対称 / : Qi C, Hasegawa M, Takao M, Sakai M, Akagi M, Iwasaki Y, Yoshida M, Scheres SHW, Goedert M

PDB-8caq:
Structure of Tau filaments Type I from Subacute Sclerosing Panencephalitis
手法: らせん対称 / : Qi C, Hasegawa M, Takao M, Sakai M, Akagi M, Iwasaki Y, Yoshida M, Scheres SHW, Goedert M

PDB-8cax:
Structure of Tau filaments Type II from Subacute Sclerosing Panencephalitis
手法: らせん対称 / : Qi C, Hasegawa M, Takao M, Sakai M, Akagi M, Iwasaki Y, Yoshida M, Scheres SHW, Goedert M

EMDB-33349:
Cryo-EM structure of GroEL bound to unfolded substrate (UGT1A) at 2.8 Ang. resolution (Consensus Refinement)
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33350:
Cryo-EM structure of double occupied ring (DOR) of GroEL-UGT1A complex at 2.7 Ang. resolution
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33351:
Cryo-EM structure of single empty ring 2 (SER2) of GroEL-UGT1A complex at 3.2 Ang. resolution
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33352:
Cryo-EM structure of occupied ring subunit 4 (OR4) of GroEL complexed with polyalanine model of UGT1A from GroEL-UGT1A double occupied ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33353:
Cryo-EM structure of empty ring subunit 1 (ER1) from single empty ring of GroEL-UGT1A complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33354:
Cryo-EM structure of empty ring subunit 2 (ER2) from GroEL-UGT1A single empty ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33355:
Cryo-EM structure of occupied ring subunit 1 (OR1) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33356:
Cryo-EM structure of occupied ring subunit 2 (OR2) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33357:
Cryo-EM structure of occupied ring subunit 3 (OR3) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-33358:
Cryo-EM structure of occupied ring subunit 4 (OR4) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

PDB-7xoj:
Cryo-EM structure of GroEL bound to unfolded substrate (UGT1A) at 2.8 Ang. resolution (Consensus Refinement)
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

PDB-7xok:
Cryo-EM structure of double occupied ring (DOR) of GroEL-UGT1A complex at 2.7 Ang. resolution
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

PDB-7xol:
Cryo-EM structure of single empty ring 2 (SER2) of GroEL-UGT1A complex at 3.2 Ang. resolution
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

PDB-7xom:
Cryo-EM structure of occupied ring subunit 4 (OR4) of GroEL complexed with polyalanine model of UGT1A from GroEL-UGT1A double occupied ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

PDB-7xon:
Cryo-EM structure of empty ring subunit 1 (ER1) from single empty ring of GroEL-UGT1A complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

PDB-7xoo:
Cryo-EM structure of empty ring subunit 2 (ER2) from GroEL-UGT1A single empty ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

PDB-7xop:
Cryo-EM structure of occupied ring subunit 1 (OR1) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

PDB-7xoq:
Cryo-EM structure of occupied ring subunit 2 (OR2) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

PDB-7xor:
Cryo-EM structure of occupied ring subunit 3 (OR3) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

PDB-7xos:
Cryo-EM structure of occupied ring subunit 4 (OR4) of GroEL from GroEL-UGT1A double occupied ring complex
手法: 単粒子 / : Stapleton K, Takagi J, Mizohata E

EMDB-26212:
mTORC2 complex with Akt
手法: 単粒子 / : Yu Z, Chen J, Pearce D

EMDB-26794:
Tomogram of platelet filopodia in presence of SARS-CoV-2 spike protein
手法: トモグラフィー / : Kuhn CC, Basnet N, Bodakuntla S, Nichols S, Martinez-Sanchez A, Agostini L, Soh YM, Takagi J, Biertumpfel C, Mizuno N

EMDB-26796:
Tomogram of platelet protrusion with microtubule in presence of SARS-CoV-2 spike protein
手法: トモグラフィー / : Kuhn CC, Basnet N, Bodakuntla S, Nichols S, Martinez-Sanchez A, Agostini L, Soh YM, Takagi J, Biertumpfel C, Mizuno N

EMDB-26798:
SARS-CoV-2 spike protein closed conformation
手法: 単粒子 / : Kuhn CC, Basnet N, Bodakuntla S, Alvarez-Brecht P, Nichols S, Martinez-Sanchez A, Agostini L, Soh YM, Takagi J, Biertumpfel C, Mizuno N

EMDB-26211:
mTORC2 complex with SGK1
手法: 単粒子 / : Yu Z, Chen J, Pearce D

EMDB-26213:
the apo structure of human mTORC2 complex
手法: 単粒子 / : Yu Z, Chen J

PDB-7tzo:
The apo structure of human mTORC2 complex
手法: 単粒子 / : Yu Z, Chen J, Pearce D

PDB-7vi4:
Electron crystallographic structure of TIA-1 prion-like domain, A381T mutant
手法: 電子線結晶学 / : Takaba K, Maki-Yonekura S, Sekiyama N, Imamura K, Kodama T, Tochio H, Yonekura K

PDB-7vi5:
Electron crystallographic structure of TIA-1 prion-like domain, wild type sequence
手法: 電子線結晶学 / : Takaba K, Maki-Yonekura S, Sekiyama N, Imamura K, Kodama T, Tochio H, Yonekura K

EMDB-24610:
Structure of RNA-dependent RNA polymerase 2 (RDR2) from Arabidopsis thaliana
手法: 単粒子 / : Fukudome A, Pikaard CS

EMDB-24635:
Arabidopsis RNA-dependent RNA polymerase 2
手法: 単粒子 / : Fukudome A, Pikaard CS

ページ:

+
EMN検索について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

  • EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
  • これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2021年10月5日: 温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

温度感受性及び、機械刺激依存性イオンチャネルに関するノーベル賞

  • 2021年のノーベル医学・生理学賞は、温度と触覚の受容体を発見したデビッド・ジュリアスとアーデム・パタポウティアンに共同で授与されました
  • EM Navigatorでは、両先駆者によるクライオEM構造データを見つけることができます

外部リンク:The Nobel Prize in Physiology or Medicine 2021 - NobelPrize.org / Structure data by Ardem Patapoutian / Structure data by David Julius

+
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

新型コロナウイルスの構造データ

関連情報:万見生物種 / 2020年8月12日: 新型コロナ情報

外部リンク:COVID-19特集ページ - PDBj / 今月の分子2020年2月：コロナウイルスプロテーアーゼ

+
2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

テキストデータのダウンロード

EM Navigatorの以下のサービスのデータが、テキスト形式でダウンロードできるようになりました。ダウンロードしたデータをExcelなどで読み込むことができます。

ページデータフォーマット
EM Navigator 検索検索結果CSV, TSV, JSON
EM Navigator 統計情報表データCSV, TSV

関連情報:EMN検索 / EMN統計情報

-
EMN検索

3次元電子顕微鏡データ検索

豊富な検索条件と表示条件で、EMDBとPDBの電子顕微鏡エントリを検索できます。

関連情報:EMDB / PDB / EM Navigator / Q: EM Navigatorの情報源は？ / 万見検索 / 2019年7月5日: テキストデータのダウンロード

他の情報も見る