| 1/30（木）、蛋白研セミナー：PDBj・BINDSユニット連携講習会を開催します ... います。 計算機演習としては、PDBに登録されている化合物-蛋 ... 質研究所) 10:35 – 12:00 「HOMCOSによるPDB内の低分子化合物の検索と ... |
| 第23回日本蛋白質科学会年会にてランチョンセミナーを開催します ... 研究所) - 「OneDepにおけるPDB登録のポイント」 （Tips for PDB Deposition through OneDep System） 丹羽 智 ... |
| 各Chemical Component IDの分子名、分子式、化学式量、InChIKeyを得る ... 名、分子式、化学式量、InChIKeyを得る PDBエントリーに現れるすべての ... 化合物にはPDBで規定した独自のIDChemical Component IDが ... |
| 登録・編集に関するお問い合わせ ... 問い合わせください。その際、PDB ID/BMRB ID/Deposition IDを件名にご記入 ... するお問い合わせの際には、PDB ID/BMRB IDとDeposition IDを明記してく ... |
| 2016年9月30日に、従来の登録システム AutoDep、ADIT-NMR、EMDepを終了しました。 ... ノテーション・検証システム （RCSB PDB | PDBe | PDBj） を開始しました。 14000件以 ... 録システム、 AutoDep、 ADIT-NMR (BMRB |PDBj)、 EMDep は、PDBやEMDBへの登録受付を終了し ... |
| ニュース (2016年1月11日) ... 相互に連携することにより、PDBへの原子座標の登録と、EMDBへ ... きます。構造が登録されれば、PDBとEMDB、BMRBのアクセションコード ... |
| 新しいEDMapサービスを開始しました ... ダから公開されています。 - /pub/pdb/validation_reports/*/*/*_validation_fo-fc_map_coef.cif.gz - /pub ... /pdb/validation_reports/*/*/*_validation_2fo-fc_map_coef.cif.gz 一方、MTZ ... |
| ニュース (2016年6月1日) ... ノテーション・検証システム （RCSB PDB | PDBe | PDBj） を開始しました。 14000件以 ... 録システム、 AutoDep、 ADIT-NMR (BMRB |PDBj)、 EMDep は、PDBやEMDBの新しい登録の受付を ... |
| ニュース (2016年3月31日) ... ノテーション・検証システム （RCSB PDB | PDBe | PDBj） を開始しました。 14000件以 ... 録システム、 AutoDep、 ADIT-NMR (BMRB |PDBj)、 EMDep は、PDBやEMDBの新しい登録の受付を ... |
| 2019/1/28（月）All-in-one 合同講習会 2018／統合データベース講習会：AJACS 番町２ にてPDBjからも講演します ... 「タンパク質構造データバンク・PDB の使い方」鈴木 博文（早稲田大 ... の方から初学者を対象とし、PDB のデータの解説や PDBj が提供す ... |
| ニュース (2016年4月21日) ... ます。 蛋白質構造データバンク（PDB）では、生体分子の立体構造を ... 。 これらのメニューはいずれもPDBのデータを利用したものです ... |
| トーゴーの日シンポジウム2020にてPDBjからもポスター発表を行います ... （PDBj）の高度化と統合的運用 - 【50】PDB/BMRBのデータ登録システム改善 ... 及びPDBエントリーの糖鎖データ表現方 ... |
| 分子ビューア ... ス 分子ビューア jV Molmil Jmol JSmol PDBj Mine（PDBデータブラウザ）非対称単位 ○ ○ ○ ○ PDBj ... Mine（PDBデータブラウザ）生物学的単位 ... |
| 基本的な使い方 ... 行うことができます。 - 分子のPDB ID（一部でも可） - キーワード - 残基配 ... ご覧下さい。 [更に詳細な検索] （PDB検索サービス PDBj Mine）の SQL Search や XPath ... |
| 構造因子 ... ます。 各項目の説明と例は、RCSB PDBのmmCIFディクショナリを参照 ... して下さい。 http://mmcif.pdb.org/dictionaries/mmcif_pdbx.dic/Categories/refln.html (英語 ... |
| 非対称単位について ... （非結晶学的な非対称単位）でPDBへ登録することが推奨され ... 物学的集合体の詳細な説明、PDBデータにおける生物学的集合 ... |
| [wwPDB] EMDBのポリシーと処理手順に関する文書を公開しました ... の所属地域によって、EMDB、PDBe、RCSB PDB及びPDBjの各サイトが分担し ... は、全ての原子モデル座標をPDBへ、全ての電子顕微鏡再構成 ... |
| 10月28日（月）に、京都国際会館にて開催される第51回日本生物物理学会年会にて、ランチョンセミナーを実施いたします。 ... - 演者・演題： Activities of PDBj and wwPDB: A new PDB format, Data Deposition, Validation, and Data Integration 中村 春木 ... Research, Osaka University) - Activities of PDBj and wwPDB: A new PDB format, Data Deposition, Validation, and Data Integration 中村 春木 （大 ... |
| NMR距離制限情報 ... 制限情報の上部にPDBヘッダの一部、下部にPDBの水素原子座標 ... |
| PDBj Mine 検索結果 ... を指定することができます。 - PDB ID - 構造のタイトル - 登録者 - 文 ... ントリ - EMDBエントリ - 関連するPDBエントリ - 配列情報 - PDBj URL デフ ... |
| HIVカプシド − ペーパーモデル ... 。 関連情報 - Build a Paper Model of HIV Capsid…RCSB PDBの教育コンテンツサイト「PDB101 ... PDFの翻訳元（英語） - Learning Resources: HIV Capsid…RCSB PDBの教育コンテンツサイト「PDB101 ... |
| 6-4) リガンドの検証において、登録・検証サーバの初期のレポートと、 アノテーション後にスタッフから送付される最終版のレポートで、結果に多くの矛盾があるのはなぜですか？ - validation FAQ - ... サーバでは、指摘されませんが、PDBのアノテーション処理の中で ... ては、結合次数が定義された、PDBの化合物辞書が使用されま ... |
| DNA - ペーパーモデル ... きます。 関連情報 - 英語原文 - PDB-101（RCSB PDB） - DNA - 今月の分子 - PDBj - 生き物の ... |
| 口蹄疫ウイルス - ペーパーモデル ... ードできます。 関連情報 - Dengue virus - PDB-101 - RCSB PDB…デングウイルスは口蹄疫 ... |
| 登録したエントリーの公開について -FAQ ... 覧ください。 公開のご依頼は、「PDB登録・編集に関するお問い合 ... 連絡ください。 メールの件名にPDB IDとRCSB ID/Deposition IDを明記して、英 ... |
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件を2025-07-09に公開中
