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1G2D	STRUCTURE OF A CYS2HIS2 ZINC FINGER/TATA BOX COMPLEX (CLONE #2) 分子名称: 5'-D(*GP*AP*CP*GP*CP*TP*AP*TP*AP*AP*AP*AP*GP*GP*AP*G)-3', 5'-D(*TP*CP*CP*TP*TP*TP*TP*AP*TP*AP*GP*CP*GP*TP*CP*C)-3', TATA BOX ZINC FINGER PROTEIN, ... 著者 Wolfe, S.A, Grant, R.A, Elrod-Erickson, M, Pabo, C.O. 登録日 2000-10-18 公開日 2001-09-07 最終更新日 2024-04-03 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) 主引用文献 Beyond the "recognition code": structures of two Cys2His2 zinc finger/TATA box complexes. Structure, 9, 2001
4IS1	Crystal structure of ZNF217 bound to DNA 分子名称: 5'-D(*AP*AP*TP*GP*CP*AP*GP*AP*AP*TP*CP*GP*AP*TP*TP*CP*TP*GP*CP*A)-3', 5'-D(*TP*TP*TP*GP*CP*AP*GP*AP*AP*TP*CP*GP*AP*TP*TP*CP*TP*GP*CP*A)-3', CHLORIDE ION, ... 著者 Vandevenne, M.S, Jacques, D.A, Guss, J.M, Mackay, J.P. 登録日 2013-01-16 公開日 2013-02-27 最終更新日 2023-11-08 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 New insights into DNA recognition by zinc fingers revealed by structural analysis of the oncoprotein ZNF217. J.Biol.Chem., 288, 2013
7MC1	Solution structure of Miz-1 Zinc finger 10 分子名称: Isoform 2 of Zinc finger and BTB domain-containing protein 17, ZINC ION 著者 Boisvert, O, Lavigne, P. 登録日 2021-04-01 公開日 2021-04-28 最終更新日 2023-06-14 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Zinc Fingers 10 and 11 of Miz-1 undergo conformational exchange to achieve specific DNA binding. Structure, 30, 2022
1NCS	NMR STUDY OF SWI5 ZINC FINGER DOMAIN 1 分子名称: TRANSCRIPTIONAL FACTOR SWI5, ZINC ION 著者 Dutnall, R.N, Neuhaus, D, Rhodes, D. 登録日 1996-02-26 公開日 1996-06-10 最終更新日 2022-02-23 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 The solution structure of the first zinc finger domain of SWI5: a novel structural extension to a common fold. Structure, 4, 1996
6E93	Crystal Structure of ZBTB38 C-terminal Zinc Fingers 6-9 in complex with methylated DNA 分子名称: DNA (5'-D(*GP*CP*AP*CP*TP*CP*AP*TP*(DCM)P*GP*GP*(DCM)P*GP*CP*AP*GP*AP*C)-3'), DNA (5'-D(*GP*TP*CP*TP*GP*(DCM)P*GP*CP*(DCM)P*GP*AP*TP*GP*AP*GP*TP*GP*C)-3'), ZINC ION, ... 著者 Hudson, N.O, Whitby, F.G, Buck-Koehntop, B.A. 登録日 2018-07-31 公開日 2018-11-07 最終更新日 2024-03-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.747 Å) 主引用文献 Structural insights into methylated DNA recognition by the C-terminal zinc fingers of the DNA reader protein ZBTB38. J. Biol. Chem., 293, 2018
6E94	Crystal Structure of ZBTB38 C-terminal Zinc Fingers 6-9 K1055R in complex with methylated DNA 分子名称: DNA (5'-D(*GP*CP*AP*CP*TP*CP*AP*TP*(DCM)P*GP*GP*(DCM)P*GP*CP*AP*GP*AP*C)-3'), DNA (5'-D(*GP*TP*CP*TP*GP*(DCM)P*GP*CP*(DCM)P*GP*AP*TP*GP*AP*GP*TP*GP*C)-3'), ZINC ION, ... 著者 Hudson, N.O, Whitby, F.G, Buck-Koehntop, B.A. 登録日 2018-07-31 公開日 2018-11-07 最終更新日 2024-03-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.594 Å) 主引用文献 Structural insights into methylated DNA recognition by the C-terminal zinc fingers of the DNA reader protein ZBTB38. J. Biol. Chem., 293, 2018
1P47	Crystal Structure of tandem Zif268 molecules complexed to DNA 分子名称: 5'-D(*CP*AP*CP*GP*CP*CP*CP*AP*CP*GP*CP*CP*GP*CP*CP*CP*AP*CP*GP*CP*CP*A)-3', 5'-D(*GP*TP*GP*GP*CP*GP*TP*GP*GP*GP*CP*GP*GP*CP*GP*TP*GP*GP*GP*CP*GP*T)-3', Early growth response protein 1, ... 著者 Peisach, E, Pabo, C.O. 登録日 2003-04-21 公開日 2003-06-24 最終更新日 2023-08-16 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) 主引用文献 Constraints for Zinc Finger Linker Design as Inferred from X-ray Crystal Structure of Tandem Zif268-DNA Complexes J.Mol.Biol., 330, 2003
1P7A	Solution Structure of the Third Zinc Finger from BKLF 分子名称: Kruppel-like factor 3, ZINC ION 著者 Simpson, R.J.Y, Cram, E.D, Czolij, R, Matthews, J.M, Crossley, M, Mackay, J.P. 登録日 2003-04-30 公開日 2003-12-30 最終更新日 2016-12-28 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 CCHX zinc finger derivatives retain the ability to bind Zn(II) and mediate protein-DNA interactions. J.Biol.Chem., 278, 2003
1PAA	STRUCTURE OF A HISTIDINE-X4-HISTIDINE ZINC FINGER DOMAIN: INSIGHTS INTO ADR1-UAS1 PROTEIN-DNA RECOGNITION 分子名称: YEAST TRANSCRIPTION FACTOR ADR1, ZINC ION 著者 Bernstein, B.E, Hoffman, R.C, Horvath, S.J, Herriott, J.R, Klevit, R.E. 登録日 1994-07-15 公開日 1994-10-15 最終更新日 2017-11-29 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Structure of a histidine-X4-histidine zinc finger domain: insights into ADR1-UAS1 protein-DNA recognition. Biochemistry, 33, 1994
5KE7	mouse Klf4 ZnF1-3 and TpG/MpA sequence DNA complex structure 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, DNA (5'-D(*GP*AP*GP*GP*TP*GP*TP*GP*GP*C)-3'), DNA (5'-D(*GP*CP*CP*AP*(5CM)P*AP*CP*CP*TP*C)-3'), ... 著者 Hashimoto, H, Cheng, X. 登録日 2016-06-09 公開日 2016-09-14 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.06 Å) 主引用文献 Distinctive Klf4 mutants determine preference for DNA methylation status. Nucleic Acids Res., 44, 2016
5K5I	Homo sapiens CCCTC-binding factor (CTCF) ZnF5-8 and DNA complex structure in space group P65 分子名称: DNA (5'-D(*CP*CP*CP*TP*GP*CP*TP*GP*GP*CP*AP*CP*C)-3'), DNA (5'-D(*GP*TP*GP*CP*CP*AP*GP*CP*AP*GP*GP*GP*G)-3'), SULFATE ION, ... 著者 Hashimoto, H, Cheng, X. 登録日 2016-05-23 公開日 2017-05-24 最終更新日 2024-03-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.19 Å) 主引用文献 Structural Basis for the Versatile and Methylation-Dependent Binding of CTCF to DNA. Mol. Cell, 66, 2017
5KE6	mouse Klf4 ZnF1-3 and TpG/CpA sequence DNA complex structure 分子名称: DNA (5'-D(*GP*AP*GP*GP*TP*GP*TP*GP*GP*C)-3'), DNA (5'-D(*GP*CP*CP*AP*CP*AP*CP*CP*TP*C)-3'), Krueppel-like factor 4, ... 著者 Hashimoto, H, Cheng, X. 登録日 2016-06-09 公開日 2016-09-14 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.99 Å) 主引用文献 Distinctive Klf4 mutants determine preference for DNA methylation status. Nucleic Acids Res., 44, 2016
5KEB	mouse Klf4 ZnF1-3 (E446D) and CpG/CpG sequence DNA complex structure: Form II 分子名称: DNA (5'-D(*GP*AP*GP*GP*CP*GP*TP*GP*GP*C)-3'), DNA (5'-D(*GP*CP*CP*AP*CP*GP*CP*CP*TP*C)-3'), Krueppel-like factor 4, ... 著者 Hashimoto, H, Cheng, X. 登録日 2016-06-09 公開日 2016-09-14 最終更新日 2023-09-27 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.453 Å) 主引用文献 Distinctive Klf4 mutants determine preference for DNA methylation status. Nucleic Acids Res., 44, 2016
5K5L	Homo sapiens CCCTC-binding factor (CTCF) ZnF6-8 and H19 sequence DNA complex structure 分子名称: DNA (5'-D(*GP*TP*TP*GP*CP*CP*GP*CP*GP*TP*G)-3'), DNA (5'-D(P*AP*CP*GP*CP*GP*GP*CP*AP*AP*C)-3'), Transcriptional repressor CTCF, ... 著者 Hashimoto, H, Cheng, X. 登録日 2016-05-23 公開日 2017-05-24 最終更新日 2024-03-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.125 Å) 主引用文献 Structural Basis for the Versatile and Methylation-Dependent Binding of CTCF to DNA. Mol. Cell, 66, 2017
6U9Q	Crystal Structure Analysis of DNA-BCL11A Znf domain complex 分子名称: B-cell lymphoma/leukemia 11A, DNA3, DNA5, ... 著者 Seo, H.-S, Dhe-Paganon, S. 登録日 2019-09-09 公開日 2020-09-16 最終更新日 2024-03-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.83 Å) 主引用文献 Crystal Structure Analysis of TAF1 Bromodomain To Be Published
7MC3	Solution structure of Miz-1 zinc finger 12 分子名称: Isoform 2 of Zinc finger and BTB domain-containing protein 17, ZINC ION 著者 Boisvert, O, Lavigne, P. 登録日 2021-04-01 公開日 2021-04-21 最終更新日 2023-06-14 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Zinc Fingers 10 and 11 of Miz-1 undergo conformational exchange to achieve specific DNA binding. Structure, 30, 2022
7MC2	Solution structure of Miz-1 Zinc finger 11 H586Y 分子名称: Isoform 2 of Zinc finger and BTB domain-containing protein 17, ZINC ION 著者 Boisvert, O, Lavigne, P. 登録日 2021-04-01 公開日 2021-04-28 最終更新日 2023-06-14 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Zinc Fingers 10 and 11 of Miz-1 undergo conformational exchange to achieve specific DNA binding. Structure, 30, 2022
6UCP	Zinc finger 2 from the transcription factor Sp1 DNA binding domain 分子名称: Transcription factor Sp1, ZINC ION 著者 Rao, S.R, Horne, W.S. 登録日 2019-09-17 公開日 2020-06-24 最終更新日 2023-11-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Proteomimetic Zinc Finger Domains with Modified Metal-binding beta-Turns. Pept Sci (Hoboken), 112, 2020
7N5T	ZBTB7A Zinc Finger Domain Bound to -200 Site of Fetal Globin Promoter (Oligo 5) 分子名称: DNA Strand I, DNA Strand II, ZINC ION, ... 著者 Horton, J.R, Ren, R, Cheng, X. 登録日 2021-06-06 公開日 2021-08-25 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.9 Å) 主引用文献 Structural basis for human ZBTB7A action at the fetal globin promoter. Cell Rep, 36, 2021
7N5S	ZBTB7A Zinc Finger Domain Bound to -200 Site of Fetal Globin Promoter (Oligo 6) 分子名称: DNA Strand I, DNA Strand II, ZINC ION, ... 著者 Horton, J.R, Ren, R, Cheng, X. 登録日 2021-06-06 公開日 2021-08-25 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.86 Å) 主引用文献 Structural basis for human ZBTB7A action at the fetal globin promoter. Cell Rep, 36, 2021
5T0U	CTCF ZnF2-7 and DNA complex structure 分子名称: DNA (5'-D(*CP*CP*TP*CP*AP*CP*TP*AP*GP*CP*GP*CP*CP*CP*CP*CP*TP*GP*CP*TP*GP*GP*C)-3'), DNA (5'-D(*GP*CP*CP*AP*GP*CP*AP*GP*GP*GP*GP*GP*CP*GP*CP*TP*AP*GP*TP*GP*AP*GP*G)-3'), Transcriptional repressor CTCF, ... 著者 Hashimoto, H, Wang, D, Cheng, X. 登録日 2016-08-16 公開日 2017-05-24 最終更新日 2024-03-06 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.199 Å) 主引用文献 Structural Basis for the Versatile and Methylation-Dependent Binding of CTCF to DNA. Mol. Cell, 66, 2017
5T00	Human CTCF ZnF3-7 and methylated DNA complex 分子名称: DNA (5'-GCCAGCAGGGGG(5CM)GCTA-3'), DNA (5'-TAG(5CM)GCCCCCTGCTGGC-3'), Transcriptional repressor CTCF, ... 著者 Hashimoto, H, Wang, D, Cheng, X. 登録日 2016-08-15 公開日 2017-05-24 最終更新日 2023-10-04 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.19 Å) 主引用文献 Structural Basis for the Versatile and Methylation-Dependent Binding of CTCF to DNA. Mol. Cell, 66, 2017
6UCO	Backbone-modified variant of zinc finger 2 from the transcription factor Sp1 DNA binding domain: BTD in the metal-binding turn 分子名称: Transcription factor Sp1, ZINC ION 著者 Rao, S.R, Horne, W.S. 登録日 2019-09-17 公開日 2020-06-24 最終更新日 2023-11-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Proteomimetic Zinc Finger Domains with Modified Metal-binding beta-Turns. Pept Sci (Hoboken), 112, 2020
7N5U	ZBTB7A Zinc Finger Domain Bound to DNA Duplex Containing GGACCC (Oligo 21) 分子名称: DNA Strain II, DNA Strand I, ZINC ION, ... 著者 Horton, J.R, Ren, R, Cheng, X. 登録日 2021-06-06 公開日 2022-06-08 最終更新日 2023-02-15 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.86 Å) 主引用文献 Structural basis for transcription factor ZBTB7A recognition of DNA and effects of ZBTB7A somatic mutations that occur in human acute myeloid leukemia. J.Biol.Chem., 299, 2023
7N5V	ZBTB7A Zinc Finger Domain Bound to DNA Duplex Containing GGACCC (Oligo 20) 分子名称: DNA Strand I, DNA Strand II, ZINC ION, ... 著者 Horton, J.R, Ren, R, Cheng, X. 登録日 2021-06-06 公開日 2022-06-08 最終更新日 2023-10-25 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.08 Å) 主引用文献 Structural basis for transcription factor ZBTB7A recognition of DNA and effects of ZBTB7A somatic mutations that occur in human acute myeloid leukemia. J.Biol.Chem., 299, 2023

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