PDB: 284 件ウェブページステータス検索Chemie searchBIRD

---

4ECU	Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: Reaction in the AT crystal at pH 7.0 for 200 sec 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... 著者 Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. 登録日 2012-03-26 公開日 2012-07-11 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.949 Å) 主引用文献 Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
4ED6	Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: Reaction in the AT crystal at pH 6.7 for 15 hr, Sideway translocation 分子名称: DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*TP*A)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), DNA polymerase eta, ... 著者 Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. 登録日 2012-03-27 公開日 2012-07-11 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.211 Å) 主引用文献 Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
4ECR	Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: Reaction in the AT crystal at pH 7.0 for 40 sec 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... 著者 Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. 登録日 2012-03-26 公開日 2012-07-11 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.892 Å) 主引用文献 Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
4ECY	Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: AT crystal at pH 6.0 (Na+ MES) with 1 Ca2+ ion 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... 著者 Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. 登録日 2012-03-26 公開日 2012-07-11 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.943 Å) 主引用文献 Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
4ED2	Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: AT crystal at pH 7.2 (Na+ HEPES) with 1 Ca2+ ion 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... 著者 Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. 登録日 2012-03-26 公開日 2012-07-11 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.711 Å) 主引用文献 Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
4ED3	Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: AT crystal at pH 7.5 (Na+ HEPES) with 1 Ca2+ ion 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... 著者 Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. 登録日 2012-03-26 公開日 2012-07-11 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.791 Å) 主引用文献 Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
4ECZ	Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: AT crystal at pH 6.5 (Na+ MES) with 1 Ca2+ ion 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... 著者 Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. 登録日 2012-03-26 公開日 2012-07-11 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.834 Å) 主引用文献 Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
4ECT	Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: Reaction in the AT crystal at pH 7.0 for 140 sec 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... 著者 Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. 登録日 2012-03-26 公開日 2012-07-11 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.795 Å) 主引用文献 Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
4ED0	Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: AT crystal at pH 6.8 (Na+ MES) with 1 Ca2+ ion 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... 著者 Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. 登録日 2012-03-26 公開日 2012-07-11 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.653 Å) 主引用文献 Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
4DL2	Human DNA polymerase eta inserting dCMPNPP opposite CG template (GG0a) 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, DNA (5'-D(*AP*CP*GP*GP*CP*TP*CP*AP*CP*AP*CP*T)-3'), DNA (5'-D(*TP*AP*GP*TP*GP*TP*GP*AP*G)-3'), ... 著者 Zhao, Y, Biertumpfel, C, Gregory, M, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. 登録日 2012-02-05 公開日 2012-05-09 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.15 Å) 主引用文献 Structural Basis for Chemoresistance to Cisplatin Mediated by DNA Polymerase eta Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 109, 2012
4DL6	Human DNA polymerase eta extending primer immediately after cisplatin crosslink (Pt-GG3). 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]guanosine, Cisplatin, DNA (5'-D(*TP*AP*GP*TP*GP*TP*GP*CP*C)-3'), ... 著者 Zhao, Y, Biertumpfel, C, Gregory, M, Hua, Y, Hanaoka, F, Yang, W. 登録日 2012-02-05 公開日 2012-05-09 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Structural Basis for Chemoresistance to Cisplatin Mediated by DNA Polymerase eta Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 109, 2012
4DL4	Human DNA polymerase eta inserting dCMPNPP opposite the 3'G of cisplatin crosslinked Gs (Pt-GG1). 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]cytidine, Cisplatin, DNA (5'-D(*TP*AP*GP*TP*GP*TP*GP*AP*G)-3'), ... 著者 Zhao, Y, Biertumpfel, C, Gregory, M, Hua, Y.-J, Hanaoka, F, Yang, W. 登録日 2012-02-05 公開日 2012-05-09 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2 Å) 主引用文献 Structural Basis for Chemoresistance to Cisplatin Mediated by DNA Polymerase eta Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 109, 2012
4ECS	Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: Reaction in the AT crystal at pH 7.0 for 80 sec 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... 著者 Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. 登録日 2012-03-26 公開日 2012-07-11 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.951 Å) 主引用文献 Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
4ECX	Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: Reaction in the AT crystal at pH 7.0 for 300 sec 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... 著者 Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. 登録日 2012-03-26 公開日 2012-07-11 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.744 Å) 主引用文献 Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
4ECW	Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: Reaction in the AT crystal at pH 7.0 for 250 sec 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... 著者 Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. 登録日 2012-03-26 公開日 2012-07-11 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.896 Å) 主引用文献 Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
4EEY	Crystal structure of human DNA polymerase eta in ternary complex with a cisplatin DNA adduct 分子名称: 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE, 5'-D(*CP*TP*TP*GP*GP*TP*CP*TP*CP*CP*TP*CP*C)-3', 5'-D(*TP*GP*GP*AP*GP*GP*AP*GP*A)-3', ... 著者 Ummat, A, Rechkoblit, O, Jain, R, Choudhury, J.R, Johnson, R.E, Silverstein, T.D, Buku, A, Lone, S, Prakash, L, Prakash, S, Aggarwal, A.K. 登録日 2012-03-28 公開日 2012-05-09 最終更新日 2023-09-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.32 Å) 主引用文献 Structural basis for cisplatin DNA damage tolerance by human polymerase {eta} during cancer chemotherapy. Nat.Struct.Mol.Biol., 19, 2012
4ECQ	Human DNA polymerase eta- DNA ternary complex: AT crystal at pH6.8(K+ MES) with 1 Ca2+ ion 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*TP*A)-3'), ... 著者 Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. 登録日 2012-03-26 公開日 2012-07-11 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.5 Å) 主引用文献 Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
4ED1	Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: AT crystal at pH 7.0 (Na+ MES) with 1 Ca2+ ion 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... 著者 Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. 登録日 2012-03-26 公開日 2012-07-11 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.806 Å) 主引用文献 Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
4ED8	Human DNA polymerase eta - DNA ternary complex: Reaction in the TG crystal at pH 7.0, Normal translocation 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*CP*AP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*G)-3'), ... 著者 Nakamura, T, Zhao, Y, Yang, W. 登録日 2012-03-27 公開日 2012-07-11 最終更新日 2024-03-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.521 Å) 主引用文献 Watching DNA polymerase eta make a phosphodiester bond Nature, 487, 2012
7LCD	Crystal structure of human polymerase eta complexed with syn N7-acetophenoneguanine 分子名称: DNA (5'-D(*AP*GP*TP*GP*TP*GP*AP*G)-3'), DNA (5'-D(*CP*AP*T*(T0P)P*CP*TP*CP*AP*CP*AP*CP*T)-3'), DNA polymerase eta 著者 Jung, H, Lee, S. 登録日 2021-01-10 公開日 2022-02-09 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.98 Å) 主引用文献 Crystal structure of human polymerase eta complexed with syn N7-acetophenoneguanine To Be Published
7M7R	Human DNA Pol eta S113A with rA-ended primer and dAMPNPP 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, DNA (5'-D(*CP*AP*TP*TP*TP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), DNA polymerase eta, ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-28 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.81 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
7M87	Human DNA Pol eta S113A with dA-ended primer and dATP: in crystallo reaction for 230 s 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-29 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
7M7Q	Human DNA Pol eta S113A with dT-ended primer and dAMPNPP 分子名称: 2'-deoxy-5'-O-[(R)-hydroxy{[(R)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]amino}phosphoryl]adenosine, DNA (5'-D(*CP*AP*TP*TP*AP*TP*GP*AP*CP*GP*CP*T)-3'), DNA (5'-D(*TP*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*T)-3'), ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-28 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.27 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
7M81	Human DNA Pol eta with dA-ended primer and dATP: in crystallo reaction for 100 s 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DIPHOSPHATE, ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-29 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.05 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021
7M85	Human DNA Pol eta S113A with dA-ended primer and dATP: in crystallo reaction for 80 s 分子名称: 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE, CALCIUM ION, DNA (5'-D(*AP*GP*CP*GP*TP*CP*AP*A)-3'), ... 著者 Gregory, M.T, Gao, Y, Yang, W. 登録日 2021-03-29 公開日 2021-06-02 最終更新日 2023-10-18 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.75 Å) 主引用文献 Multiple deprotonation paths of the nucleophile 3'-OH in the DNA synthesis reaction. Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 118, 2021

<123456789101112>