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1YQB	Human Ubiquilin 3 分子名称: Ubiquilin 3 著者 Walker, J.R, Xue, S, Avvakumov, G.V, Newman, E.M, Mackenzie, F, Sundstrom, M, Arrowsmith, C, Edwards, A, Bochkarev, A, Dhe-Paganon, S, Structural Genomics Consortium (SGC) 登録日 2005-02-01 公開日 2005-02-08 最終更新日 2023-08-23 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2 Å) 主引用文献 The Ubiquitin-like domain of Human Ubiquilin 3 To be Published
1ZW7	Elimination of the C-cap in Ubiquitin Structure, Dynamics and Thermodynamic Consequences 分子名称: Ubiquitin 著者 Ermolenko, D.N, Dangi, B, Gronenborn, A.M, Makhatadze, G.I. 登録日 2005-06-03 公開日 2006-05-16 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Elimination of the C-cap in ubiquitin-structure, dynamics and thermodynamic consequences. Biophys.Chem., 126, 2007
1ZKH	Solution structure of a human ubiquitin-like domain in SF3A1 分子名称: Splicing factor 3 subunit 1 著者 Lukin, J.A, Dhe-Paganon, S, Guido, V, Lemak, A, Avvakumov, G.V, Xue, S, Newman, E.M, Mackenzie, F, Sundstrom, M, Edwards, A, Arrowsmith, C.H, Structural Genomics Consortium (SGC) 登録日 2005-05-02 公開日 2005-05-10 最終更新日 2024-05-22 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution structure of a human ubiquitin-like domain in SF3A1 To be Published
2BWF	Crystal structure of the UBL domain of Dsk2 from S. cerevisiae 分子名称: FORMIC ACID, UBIQUITIN-LIKE PROTEIN DSK2 著者 Lowe, E.D, Hasan, N, Trempe, J.-F, Fonso, L, Noble, M.E.M, Endicott, J.A, Johnson, L.N, Brown, N.R. 登録日 2005-07-13 公開日 2006-01-25 最終更新日 2023-12-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.15 Å) 主引用文献 Structures of the Dsk2 Ubl and Uba Domains and Their Complex. Acta Crystallogr.,Sect.D, 62, 2006
1YIW	X-ray Crystal Structure of a Chemically Synthesized Ubiquitin 分子名称: CADMIUM ION, CHLORIDE ION, Ubiquitin 著者 Bang, D, Makhatadze, G.I, Tereshko, V, Kossiakoff, A.A, Kent, S.B. 登録日 2005-01-13 公開日 2005-06-14 最終更新日 2024-02-14 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.39 Å) 主引用文献 X-ray Crystal Structure of a Chemically Synthesized [D-Gln35]Ubiquitin Angew.Chem.Int.Ed.Engl., 44, 2005
2BGF	NMR structure of Lys48-linked di-ubiquitin using chemical shift perturbation data together with RDCs and 15N-relaxation data 分子名称: DI-UBIQUITIN 著者 Van Dijk, A.D.J, Fushman, D, Bonvin, A.M.J.J. 登録日 2004-12-22 公開日 2005-08-31 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Various Strategies of Using Residual Dipolar Couplings in NMR-Driven Protein Docking: Application to Lys48-Linked Di-Ubiquitin and Validation Against 15N-Relaxation Data Proteins: Struct., Funct., Bioinf., 60, 2005
2BWE	The crystal structure of the complex between the UBA and UBL domains of Dsk2 分子名称: DSK2 著者 Lowe, E.D, Hasan, N, Trempe, J.-F, Fonso, L, Noble, M.E.M, Endicott, J.A, Johnson, L.N, Brown, N.R. 登録日 2005-07-13 公開日 2006-01-25 最終更新日 2023-12-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.1 Å) 主引用文献 Structures of the Dsk2 Ubl and Uba Domains and Their Complex. Acta Crystallogr.,Sect.D, 62, 2006
7CAP	Cyclic Lys48-linked triubiquitin 分子名称: Ubiquitin, ZINC ION 著者 Hiranyakorn, M, Yanaka, S, Satoh, T, Wilasri, T, Jityuti, B, Yagi-Utsumi, T, Kato, K. 登録日 2020-06-09 公開日 2020-08-19 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.33 Å) 主引用文献 NMR Characterization of Conformational Interconversions of Lys48-Linked Ubiquitin Chains. Int J Mol Sci, 21, 2020
7EAL	The structure of the A20-Binding Inhibitor of NF-kB 1 in complex with di-ubiquitin 分子名称: GLYCEROL, TNFAIP3-interacting protein 1, ubiquitin 著者 Lo, Y.C, Lin, S.C. 登録日 2021-03-07 公開日 2021-07-21 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.5 Å) 主引用文献 Structural and Biochemical Basis for Higher-Order Assembly between A20-Binding Inhibitor of NF-kappa B 1 (ABIN1) and M1-Linked Ubiquitins. J.Mol.Biol., 433, 2021
7EAO	The structure of the A20-binding inhibitor of NF-kB 1 in complex with tri-ubiquitin 分子名称: Polyubiquitin-C, TNFAIP3-interacting protein 1 著者 Lo, Y.C, Lin, S.C. 登録日 2021-03-07 公開日 2021-07-21 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.9 Å) 主引用文献 Structural and Biochemical Basis for Higher-Order Assembly between A20-Binding Inhibitor of NF-kappa B 1 (ABIN1) and M1-Linked Ubiquitins. J.Mol.Biol., 433, 2021
7EB9	The structure of the A20-binding inhibitor of NF-kB 1 in complex with tetra-ubiquitin 分子名称: TNFAIP3-interacting protein 1, tetra ubiquitin 著者 Lo, Y.C, Lin, S.C. 登録日 2021-03-09 公開日 2021-07-21 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (3.2 Å) 主引用文献 Structural and Biochemical Basis for Higher-Order Assembly between A20-Binding Inhibitor of NF-kappa B 1 (ABIN1) and M1-Linked Ubiquitins. J.Mol.Biol., 433, 2021
7E62	Mouse TAB2 NZF in complex with Lys6-linked diubiquitin 分子名称: 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID, TGF-beta-activated kinase 1 and MAP3K7-binding protein 2, Ubiquitin, ... 著者 Sato, Y, Li, Y, Okatsu, K, Fukai, S. 登録日 2021-02-21 公開日 2021-08-18 最終更新日 2023-11-29 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.99 Å) 主引用文献 Structural basis for specific recognition of K6-linked polyubiquitin chains by the TAB2 NZF domain. Biophys.J., 120, 2021
4A20	Crystal structure of the Ubl domain of Mdy2 (Get5) at 1.78A 分子名称: SULFATE ION, UBIQUITIN-LIKE PROTEIN MDY2 著者 Simon, A.C, Simpson, P.J, Murray, J.W, Isaacson, R.L. 登録日 2011-09-21 公開日 2012-11-14 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.78 Å) 主引用文献 Structure of the Sgt2/Get5 Complex Provides Insights Into Get-Mediated Targeting of Tail-Anchored Membrane Proteins Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 110, 2013
7BU0	Crystal structure of a OTU deubiquitinase in complex with Ub-PA 分子名称: Polyubiquitin-B, Uncharacterized protein, prop-2-en-1-amine 著者 Ouyang, S.Y, Zhen, X.K. 登録日 2020-04-03 公開日 2020-11-18 最終更新日 2023-04-05 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.43 Å) 主引用文献 Interplay between bacterial deubiquitinase and ubiquitin E3 ligase regulates ubiquitin dynamics on Legionella phagosomes. Elife, 9, 2020
6W9S	Crystal structure of an OTU deubiquitinase from Escherichia albertii bound to ubiquitin 分子名称: FORMIC ACID, OTU domain-containing protein EschOTU, Ubiquitin 著者 Schubert, A.F, Pruneda, J.N, Komander, D. 登録日 2020-03-23 公開日 2020-07-01 最終更新日 2020-08-12 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.1 Å) 主引用文献 Identification and characterization of diverse OTU deubiquitinases in bacteria. Embo J., 39, 2020
3ALB	Cyclic Lys48-linked tetraubiquitin 分子名称: SULFATE ION, ubiquitin 著者 Satoh, T, Sakata, E, Yamamoto, S, Yamaguchi, Y, Sumiyoshi, A, Wakatsuki, S, Kato, K. 登録日 2010-07-29 公開日 2010-08-25 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Crystal structure of cyclic Lys48-linked tetraubiquitin Biochem.Biophys.Res.Commun., 2010
3AXC	Crystal structure of linear diubiquitin 分子名称: GLYCEROL, Ubiquitin 著者 Rohaim, A, Kawasaki, M, Kato, R, Dikic, I, Wakatsuki, S. 登録日 2011-04-01 公開日 2012-01-25 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.19 Å) 主引用文献 Structure of a compact conformation of linear diubiquitin Acta Crystallogr.,Sect.D, 68, 2012
3B0A	Crystal structure of the mouse HOIL1-L-NZF in complex with linear di-ubiquitin 分子名称: Polyubiquitin-C, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE, ... 著者 Sato, Y, Fujita, H, Yoshikawa, A, Yamashita, M, Yamagata, A, Kaiser, S.E, Iwai, K, Fukai, S. 登録日 2011-06-07 公開日 2011-12-14 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.9 Å) 主引用文献 Specific recognition of linear ubiquitin chains by the Npl4 zinc finger (NZF) domain of the HOIL-1L subunit of the linear ubiquitin chain assembly complex Proc.Natl.Acad.Sci.USA, 108, 2011
2W9N	crystal structure of linear di-ubiquitin 分子名称: CHLORIDE ION, UBIQUITIN, ZINC ION 著者 Komander, D, Reyes-Turcu, F, Wilkinson, K.D, Barford, D. 登録日 2009-01-27 公開日 2009-04-28 最終更新日 2023-12-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.25 Å) 主引用文献 Molecular Discrimination of Structurally Equivalent Lys 63-Linked and Linear Polyubiquitin Chains. Embo Rep., 10, 2009
2WYQ	THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE UBIQUITIN-LIKE (UBL) DOMAIN OF HHR23A (HUMAN HOMOLOGUE A OF RAD23) 分子名称: SULFATE ION, UV EXCISION REPAIR PROTEIN RAD23 HOMOLOG A 著者 Chen, Y.W. 登録日 2009-11-19 公開日 2010-11-10 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.651 Å) 主引用文献 The Crystal Structure of the Ubiquitin-Like (Ubl) Domain of Human Homologue a of Rad23 (Hhr23A) Protein Protein Eng.Des.Sel., 24, 2011
3B1L	Crystal Structure of parkin ubiquitin-like domain R33Q mutant 分子名称: E3 ubiquitin-protein ligase parkin 著者 Tomoo, K, Ikemiya, A, Amami, Y, In, Y, Ishida, T. 登録日 2011-07-04 公開日 2012-07-04 最終更新日 2024-03-13 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.85 Å) 主引用文献 Crystal Structure of parkin ubiquitin-like domain R33Q mutant to be published
2XEW	Crystal structure of K11-linked diubiquitin 分子名称: 1,2-ETHANEDIOL, CHLORIDE ION, CITRATE ANION, ... 著者 Bremm, A, Freund, S.M.V, Komander, D. 登録日 2010-05-18 公開日 2010-07-14 最終更新日 2023-12-20 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.2 Å) 主引用文献 Lys11-Linked Ubiquitin Chains Adopt Compact Conformations and are Preferentially Hydrolyzed by the Deubiquitinase Cezanne Nat.Struct.Mol.Biol., 17, 2010
6XQC	UbKEKS 分子名称: Polyubiquitin-B 著者 Delattre, P, Letourneau, D, Lavigne, P, Roucou, X, Boisvert, F.M. 登録日 2020-07-09 公開日 2021-05-19 最終更新日 2024-05-15 実験手法 SOLUTION NMR 主引用文献 Solution NMR structure of UbKEKS To Be Published
3AUL	Crystal structure of wild-type Lys48-linked diubiquitin in an open conformation 分子名称: Polyubiquitin-C 著者 Hirano, T, Olivier, S, Yagi, M, Takemoto, E, Hiromoto, T, Satoh, T, Mizushima, T, Kato, K. 登録日 2011-02-09 公開日 2011-09-07 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (2.39 Å) 主引用文献 Conformational dynamics of wild-type Lys48-linked diubiquitin in solution J.Biol.Chem., 286, 2011
2ZCB	Crystal Structure of ubiquitin P37A/P38A 分子名称: Ubiquitin, ZINC ION 著者 Kitahara, R, Tanaka, T, Sakata, E, Yamaguchi, Y, Kato, K, Yokoyama, S. 登録日 2007-11-08 公開日 2007-11-20 最終更新日 2023-11-01 実験手法 X-RAY DIFFRACTION (1.6 Å) 主引用文献 Crystal Structure of ubiquitin P37A/P38A To be published

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