5XPG

Crystal structure of T. thermophilus Argonaute protein complexed with a bulge 6'U7' on the target strand

5XPG の概要

• エントリーDOI: 10.2210/pdb5xpg/pdb
• 関連するPDBエントリー: 3DLB 3DLH 3F73
• 分子名称: Uncharacterized protein, 5'-D(P*TP*GP*AP*GP*GP*TP*AP*GP*TP*AP*GP*GP*TP*TP*GP*TP*AP*TP*A P*GP*T)-3', 5'-R(*UP*AP*U*AP*CP*AP*AP*CP*CP*UP*AP*CP*AP*UP*AP*CP*CP*UP*CP* G)-3', ... (6 entities in total)
• 機能のキーワード: argonaute, mirna, bulge, mismatch, dna binding protein
• 由来する生物種: Thermus thermophilus (strain HB27 / ATCC BAA-163 / DSM 7039); 詳細
• タンパク質・核酸の鎖数: 3
• 化学式量合計: 89804.24

構造登録者

Sheng, G.,Gogakos, T.,Wang, J.,Zhao, H.,Serganov, A.,Juranek, S.,Tuschl, T.,Patel, J.D.,Wang, Y. (登録日: 2017-06-02, 公開日: 2018-04-18, 最終更新日: 2023-11-22)

• 主引用文献: Sheng, G.,Gogakos, T.,Wang, J.,Zhao, H.,Serganov, A.,Juranek, S.,Tuschl, T.,Patel, D.J.,Wang, Y.; Structure/cleavage-based insights into helical perturbations at bulge sites within T. thermophilus Argonaute silencing complexes.; Nucleic Acids Res., 45:9149-9163, 2017; PubMed: 28911094; DOI: 10.1093/nar/gkx547

実験手法

X-RAY DIFFRACTION (2.8 Å)